Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Embolism in COVID-19 Positive Patients

14 februari 2022 bijgewerkt door: Semiha Orhan, Afyonkarahisar Health Sciences University

Examining the Genetic Predisposition of Individuals Who Aggravated by Embolism in COVID-19 Positive Patients

Covid-19 outbreak has caused death of millions of people because of not only the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection itself but also infection dependent complications. Abnormalities in thrombotic events leads to some of these complications which eventually result in emboli. The endothelial damage caused by the virus interacting with ACE2 on the host cells leads to the activation of coagulation cascade. Accumulation of byproducts of the cascade might have some roles in embolism inducing risk of organ damage, other life-threatening problems, and even death. To enlighten the factors triggering embolism, the investigators have focused on genetic changes such as polymorphisms and mutations in certain genes in DNA samples coming from intensive care unit (ICU) patients.

Studie Overzicht

Toestand

Aanmelden op uitnodiging

Conditie

Gedetailleerde beschrijving

This study has conducted to find the possible links between genetic make up of ICU patients with severe Covid-19 and embolism. 13 polymorphisms and mutations that the investigators targeted are located on Factor II, Factor V, Factor XIII, MTHFR, angiotensin converting enzyme (ACE), endothelial cell protein C receptor (EPCR), and FGB. The investigators have found significant changes in the mutant allele frequencies in most of the factors.

The main workflow to study a point change on DNA sequence begins with DNA isolation from a biological material. In this case, we received blood samples in ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) tubes from ICU patients with severe Covid-19. The investigators hypothesis claims that genetic factors triggering thrombotic events might increase the severity of the diseases by inducing the risk of emboli.

After DNA isolation, desired loci on DNA were amplified via Polymerase Chain Reaction (PCR). Amplicons including the mutations and polymorphisms need to be purified before next generation sequencing (NGS).

The investigators analyze the data using Integrative Genomics Viewer (IGV) program and check the genetic profile (wt, het, mut). Some of the changes are meaningful by themselves while some other need to be considered as combinations. Compound heterozygosity and diagnosis for thrombophilia require cooccurrence of the changes.

To compare allelic frequencies, the investigators include the average of the data coming from more than 2000 individuals with no know thrombophilia cases. In the investigators focus cohort, the investigators have the data of 47 Covid-19 patients in ICU.

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Verwacht)

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studie Locaties

Kalkoen
- Cankaya
  - Ankara, Cankaya, Kalkoen, 06510
    - INTERGEN Genetics and Rare Diseases Diagnosis Research & Application Center

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

18 jaar tot 95 jaar (Volwassen, Oudere volwassene)

Accepteert gezonde vrijwilligers

Geslachten die in aanmerking komen voor studie

Allemaal

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

Groups were assigned to determine the genetic factors that explain severity of COVID-19 infections. These genetic factors play role in thrombotic events in the body.

Case group involves ICU patients with emboli that suffer from severe COVID-19. The investigators expect to see some deviations from normal population regarding the mutations and polymorphisms related to thrombophilia. Control group is normal population representing the normal allelic frequencies of the determinant genetic factors.

Beschrijving

Inclusion Criteria:

being tested positive for Covid-19
ICU patients developing severe pneumonia upon Covid-19 infection

Exclusion Criteria:

previously tested positive for genetic factors increasing thrombosis risk
ICU patients developing severe emboli regardless of Covid-19 infection

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

Aantal groepen / cohorten

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
ICU patients with severe COVID-19 pneumonia Without using any intervention, this group has been included in the study to research certain genetic dispositions determining the severity of the COVID-19 pneumonia
Random population This group has been included as a control group to compare the genetic predisposition of ICU patients with severe COVID-19 pneumonia with the normal population.

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat	Maatregel Beschrijving	Tijdsspanne
Changes in allelic frequencies in predetermined loci which are known to be related with thrombosis Tijdsspanne: 15.03.2021- 30.04.2021	In the first 28 samples the investigators received, we expected a predictive result revealing the genetic background and embolism in Covid-19. Deviations from allelic frequencies of healthy population regarding some of the factors will support the hypothesis of the study.	15.03.2021- 30.04.2021
An increase in thrombophilia cases in the study group Tijdsspanne: 01.05.2021- 20.05.2021	Thrombophilia is a complex state with the contribution of several factors. Clinical picture and the mutations enable the diagnosis. With an expanded study group consisting of 47 patients, we determined the patients with thrombophilia.	01.05.2021- 20.05.2021

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

Afyonkarahisar Health Sciences University

Onderzoekers

Studie directeur: Serdar Ceylaner, Assoc. Prof., INTERGEN Genetics and Rare Diseases Diagnosis Research & Application Center

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

5 maart 2021

Primaire voltooiing (Werkelijk)

8 mei 2021

Studie voltooiing (Verwacht)

30 augustus 2022

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

31 mei 2021

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

31 mei 2021

Eerst geplaatst (Werkelijk)

2 juni 2021

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

15 februari 2022

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

14 februari 2022

Laatst geverifieerd

1 februari 2022

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Trefwoorden

Andere studie-ID-nummers

2021-1

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .