Perustuslaillisiin EGFR:n patogeenisiin muunnelmiin liittyvät fenotyypit (EGFRench)

Pieni osa keuhkosyövistä, erityisesti adenokarsinoomista, on perinnöllistä. Perinnöllisiä keuhkosyöpiä esiintyy yksilöillä, joilla on geneettinen taipumus sairauteen. On tärkeää muistaa, että osa ei-pienisoluisista keuhkosyövistä kehittyy tupakoimattomille, mikä kuvaa muiden riskitekijöiden, kuten saastumisen, radonin tai geneettisten tekijöiden, merkitystä. Perinnöllisten keuhkojen adenokarsinoomien kokonaisosuus on pieni, luultavasti noin 1 %. Ranskan kansallisessa mittakaavassa tämä on edelleen muutama sata tapausta vuodessa.

EGFR on nyt vakiintunut herkkyysgeeni. EGFR-variantit tunnetaan parhaiten somaattisina variantteina, herkkyyden tai resistenssin markkereina tyrosiinikinaasin estäjille (TKI:t). Erityisesti EGFR T790M on yleensä hankittu variantti potilailla, jotka ovat altistuneet 1. ja 2. sukupolven tirosiinikinaasi-inhibiittoreille (erlotinibi, gefitinibi, afatinibi). Mutta se on joskus myös perustuslaillista, jolloin se havaitaan somaattisesti diagnoosin yhteydessä, kun potilaalle ei ole vielä määrätty TKI:tä. Tutkimuksemme tavoitteena on kerätä tietoa ranskalaisista EGFR:n patogeenisten varianttien kantajista eli indeksitapauksista ja sukulaisista (sairastuneista ja ei-sairaista) ja kuvata niihin liittyviä fenotyyppejä.

Tehdään retrospektiivinen, monikeskuskohorttitutkimus. Tutkimukseen on tarkoitus sisällyttää 20–25 EGFR-patogeenisen muunnelman kantajaa, jotka tunnistettiin sellaisiksi vuosina 2018–2024. Tiedot kerätään joko paperista tai sähköisistä potilastiedostoista Onkogenetiikan klinikalta tai laboratoriosta, ja tukikelpoisille potilaille tiedotetaan ja heille annetaan mahdollisuus kieltäytyä Ranskan lain vaatimusten mukaisesti. Huomaa, että kaikki allekirjoittivat aiemmin suostumuslomakkeen geenitestaukseen. . Kukin osallistuva keskus on vastuussa potilaiden potilastietojen pseudonyymitietojen transkriptiosta suojattuun Excel-tiedostoon, joka on yksilöllinen kullekin keskukselle. Potilastiedostoista saadut anonymisoidut tiedot tallennetaan sähköisesti suojattuun asiakirjaan, joka on vain päätutkijan ja enintään kahden tutkimukseen osallistuvan läheisen yhteistyökumppanin saatavilla. Osallistuvat keskukset lähettävät tiedot APHP Sorbonnen lääketieteellisen genetiikan osaston tutkijoille suojatun kansallisen RENATER-alustan kautta.

Kuvailevia tilastoja tehdään kuvaamaan kohortin ominaisuuksia, esim. keskimääräinen/mediaani-ikä, somaattisten muutosten osuus ja tyyppi, tupakoinnin yleisyys EGFR:ään liittyvien fenotyyppien kuvaamiseksi paremmin.