Phénotypes associés aux variantes pathogènes constitutionnelles de l'EGFR (EGFRench)

Une petite proportion de cancers du poumon, notamment les adénocarcinomes, est héréditaire. Les cancers du poumon héréditaires surviennent chez les individus présentant une prédisposition génétique à la maladie. Il est important de rappeler qu'une proportion de cancers du poumon non à petites cellules se développent chez les non-fumeurs, illustrant l'importance d'autres facteurs de risque, comme la pollution, le radon ou les facteurs génétiques. La proportion globale d'adénocarcinomes pulmonaires héréditaires est faible, probablement autour de 1 %. À l'échelle nationale française, cela représente encore quelques centaines de cas par an.

L'EGFR est désormais un gène de susceptibilité établi. Les variantes de l'EGFR sont mieux connues sous le nom de variantes somatiques, en tant que marqueurs de sensibilité ou de résistance aux inhibiteurs de la tyrosine kinase (ITK). L'EGFR T790M, en particulier, est généralement une variante acquise observée chez les patients exposés aux inhibiteurs de la tyrosine kinase de 1ère et 2ème génération (erlotinib, géfitinib, afatinib). Mais elle est aussi parfois constitutionnelle, auquel cas elle est observée somatiquement au moment du diagnostic, alors qu'on n'a pas encore prescrit d'ITK au patient. Notre recherche vise à rassembler des données sur les porteurs français du variant pathogène de l'EGFR, c'est-à-dire les cas index et les apparentés (affectés et non affectés), et à décrire les phénotypes associés.

Une étude de cohorte rétrospective et multicentrique sera réalisée. L’étude vise à inclure 20 à 25 porteurs de variantes pathogènes de l’EGFR identifiés comme tels entre 2018 et 2024. Les données seront collectées à partir des dossiers patients papier ou électroniques de la clinique ou du laboratoire d'oncogénétique. Les patients éligibles seront informés et auront la possibilité de se désinscrire, conformément aux exigences légales françaises. Il convient de noter que tous ont déjà signé un formulaire de consentement pour les tests génétiques. . Chaque centre participant sera chargé de transcrire les données pseudonymisées des dossiers médicaux de ses patients dans un fichier Excel sécurisé unique à chaque centre. Les données anonymisées obtenues à partir des dossiers des patients seront stockées électroniquement dans un document sécurisé accessible uniquement au chercheur principal et à un maximum de deux proches collaborateurs impliqués dans l'étude. Les données seront envoyées par les centres participants aux enquêteurs du Service de Génétique Médicale de l'APHP Sorbonne via la plateforme nationale sécurisée RENATER.

Des statistiques descriptives seront effectuées pour décrire les caractéristiques de la cohorte, par ex. âge moyen/médian, proportion et type de changements somatiques, prévalence du tabagisme afin de mieux caractériser les phénotypes associés à l'EGFR.