Bakteerien useiden lääkkeiden sietokyvyn analyysi potilailla, jotka ovat alttiita virtsatietulehduksille

Joissakin tapauksissa antibioottihoito ei riitä poistamaan bakteeri-infektioita. Syynä tähän on usein patogeenien vähentynyt herkkyys annetulle antibiootille. Tämän herkkyyden määrää suurelta osin geneettisesti koodattu antibioottiresistenssi. Lisäksi bakteeripopulaatioissa on myös pieni osa fenotyyppisistä varianteista, jotka ovat tilapäisesti epäherkkiä antibioottien tappaville vaikutuksille. Nämä niin kutsutut persisterisolut muodostuvat fenotyyppisessä siirtymässä antibioottiherkästä "normaalista" solusta antibioottisietokykyiseen lepotilaan. Toisaalta pysyvät solut voivat myös palata "normaaliin" tilaan ja jatkaa kasvuaan, mikä saa aikaan uuden populaation muodostumisen. Persistorit ovat tärkeä, mutta huonosti ymmärretty kliininen ongelma. Niillä on esimerkiksi aliarvostettu rooli kroonisten infektioiden antimikrobisen hoidon epäonnistumisessa. Lisäksi persisterit edistävät antibioottiresistenssin kehittymistä.

Vain vähän tiedetään siitä, kuinka pysyvyys kehittyy, kun bakteerit kohtaavat jatkuvan tai toistuvan antibioottipaineen. In silico -ennusteet ja aiemmat in vitro -työt ovat osoittaneet, että pysyvien aineiden tasot nousevat toistuvan antibioottialtistuksen myötä ja että sietoaika määräytyy hoidon keston mukaan. Oletamme, että samanlainen evoluutiostrategia esiintyy in vivo ja että tämä myötävaikuttaa monien infektioiden krooniseen luonteeseen. Tämän hypoteesin tukemiseksi ehdotamme, että kerätään pitkittäisiä isolaatteja potilailta, joilla on toistuvia tai kroonisia virtsatieinfektioita. Koska nämä potilaat käyvät sairaalassa epäsäännöllisin ja arvaamattomin aikavälein, keräämme myös isolaatteja potilailta, joilla on suprapubinen katetri. Nämä potilaat eivät välttämättä kärsi kroonisista infektioista, mutta suprapubiset katetrit ovat yleensä kolonisoituneita mikrobien biofilmeillä. Keräämme myös isolaatteja potilailta, joilla on nefrostomiakatetri. Kuten potilaat, joilla on suprapubinen katetri, nämä potilaat käyvät säännöllisesti (± 6 viikon välein) sairaalassa rutiininomaisissa katetrin vaihdoissa, ja näiden konsultaatioiden aikana virtsanäytteet ja katetrin kärjet otetaan helposti. Lisäksi monet näistä potilaista altistuvat useille antibioottihoito-ohjelmille (mukaan lukien munuaisleikkauspotilaiden tapauksessa suuriannoksinen kefatsoliini tai keftriaksoni katetrin vaihdon yhteydessä), mikä luo ainutlaatuisen mahdollisuuden tutkia antibioottikestävyyden kehitystä kliinisessä tutkimuksessa. asetusta.