Analisi della tolleranza batterica multifarmaco in pazienti soggetti a infezioni del tratto urinario

In alcuni casi, la terapia antibiotica non è sufficiente per eliminare le infezioni batteriche. La ragione di ciò è spesso una ridotta sensibilità degli agenti patogeni all'antibiotico somministrato. Questa sensibilità è in gran parte determinata dalla resistenza agli antibiotici geneticamente codificata. Inoltre, le popolazioni batteriche ospitano anche una piccola frazione di varianti fenotipiche temporaneamente insensibili agli effetti letali degli antibiotici. Queste cosiddette cellule persistenti si formano attraverso la transizione fenotipica da una cellula "normale" sensibile agli antibiotici a uno stato dormiente tollerante agli antibiotici. D'altro canto, le cellule persistenti possono anche ritornare allo stato “normale” e riprendere la crescita, dando luogo alla formazione di una nuova popolazione. I persistenti rappresentano un problema clinico importante ma poco compreso. Ad esempio, svolgono un ruolo sottovalutato nel fallimento della terapia antimicrobica nelle infezioni croniche. Inoltre, i batteri persistenti contribuiscono allo sviluppo della resistenza agli antibiotici.

Si sa poco su come si evolve la persistenza quando i batteri si confrontano con una pressione antibiotica continua o ripetuta. Le previsioni in silico e precedenti lavori in vitro hanno dimostrato che i livelli persistenti aumentano con la frequente esposizione agli antibiotici e che il periodo nello stato tollerante è determinato dalla durata del trattamento. Ipotizziamo che una strategia evolutiva simile avvenga in vivo e che ciò contribuisca alla natura cronica di molte infezioni. Per supportare questa ipotesi, proponiamo di raccogliere isolati longitudinali da pazienti con UTI ricorrenti o croniche. Poiché questi pazienti visitano l'ospedale a intervalli di tempo irregolari e imprevedibili, raccoglieremo anche isolati da pazienti con catetere sovrapubico. Questi pazienti non soffrono necessariamente di infezioni croniche, ma i cateteri sovrapubici sono solitamente colonizzati da biofilm microbici. Raccoglieremo anche isolati da pazienti con catetere per nefrostomia. Analogamente ai pazienti con cateteri sovrapubici, questi pazienti si recano regolarmente in ospedale (intervallo di ± 6 settimane) per i cambi di routine del catetere e durante queste consultazioni vengono facilmente raccolti campioni di urina e punte del catetere. Inoltre, molti di questi pazienti sono esposti a più regimi antibiotici (inclusi, nel caso di pazienti nefrostomici, cefazolina o ceftriaxone ad alte dosi al momento del cambio del catetere), creando un'opportunità unica per studiare l'evoluzione della tolleranza agli antibiotici in un contesto clinico. collocamento.