Analyse de la tolérance bactérienne à plusieurs médicaments chez les patients sujets aux infections des voies urinaires

Dans certains cas, l’antibiothérapie ne suffit pas à éliminer les infections bactériennes. La raison en est souvent une sensibilité réduite des agents pathogènes à l’antibiotique administré. Cette sensibilité est largement déterminée par la résistance aux antibiotiques génétiquement codée. En outre, les populations bactériennes hébergent également une petite fraction de variantes phénotypiques temporairement insensibles aux effets mortels des antibiotiques. Ces cellules dites persistantes sont formées par transition phénotypique d'une cellule « normale » sensible aux antibiotiques à un état dormant tolérant aux antibiotiques. D'un autre côté, les cellules persistantes peuvent également revenir à l'état « normal » et reprendre leur croissance, donnant lieu à la formation d'une nouvelle population. Les persistances représentent un problème clinique important mais mal compris. Par exemple, ils jouent un rôle sous-estimé dans l’échec du traitement antimicrobien des infections chroniques. De plus, les persistants contribuent au développement de la résistance aux antibiotiques.

On sait peu de choses sur l’évolution de la persistance lorsque les bactéries sont confrontées à une pression antibiotique continue ou répétée. Les prévisions in silico et les travaux in vitro antérieurs ont montré que les niveaux de persistance augmentent avec une exposition fréquente aux antibiotiques et que la période dans l'état de tolérance est déterminée par la durée du traitement. Nous émettons l’hypothèse qu’une stratégie évolutive similaire se produit in vivo et que cela contribue au caractère chronique de nombreuses infections. Pour étayer cette hypothèse, nous proposons de collecter des isolats longitudinaux de patients atteints d'infections urinaires récurrentes ou chroniques. Étant donné que ces patients visitent l'hôpital à des intervalles de temps irréguliers et imprévisibles, nous collecterons également des isolats de patients porteurs d'un cathéter sus-pubien. Ces patients ne souffrent pas nécessairement d’infections chroniques, mais les cathéters sus-pubiens sont généralement colonisés par des biofilms microbiens. Nous collecterons également des isolats de patients porteurs d'un cathéter de néphrostomie. Semblables aux patients porteurs de cathéters sus-pubiens, ces patients se rendent régulièrement à l'hôpital (intervalle de ± 6 semaines) pour des changements de cathéter de routine et lors de ces consultations, des échantillons d'urine et des embouts de cathéter sont facilement collectés. De plus, bon nombre de ces patients sont exposés à de multiples traitements antibiotiques (y compris, dans le cas des patients néphrostomisés, de la céfazoline ou de la ceftriaxone à forte dose au moment du changement du cathéter), créant ainsi une opportunité unique d'étudier l'évolution de la tolérance aux antibiotiques dans un contexte clinique. paramètre.