Vuodenaikojen vaikutuksen arviointi biologiseen ikään aikuisilla (SeasonAGE)

Laadunmittaukset: tutkija varmistaa osallistujan henkilötietojen suojelun ja että kaikki raportit, julkaisut, osallistujien näytteet ja muut tiedonantot, paitsi missä lait edellyttävät. Henkilö- ja terveystietojen käsittely noudattaa Sveitsin tietosuojalainsäädäntöä ja on ORH:n (Ihmistutkimusasetus) asetuksen mukainen, art. 5. Osallistujat tunnistetaan vain osallistujatunnuksella ja tutkimuspaikan tunnuksella osallistujan luottamuksellisuuden säilyttämiseksi. CRF-lomakkeilla ja muissa projektiin liittyvissä asiakirjoissa osallistujat tunnistetaan vain heidän yksilöllisellä osallistujanumerollaan. Kaikki osallistujien tutkimustiedot säilytetään turvallisesti pääsynvalvotulla alueella. Tunnistuskoodiluettelot, jotka yhdistävät osallistujien nimet osallistujatunnuksiin, säilytetään erillään osallistujatiedoista. Tiedot koodataan. Osallistujatunnusluetteloon pääsevät käsiksi vain tutkimuspaikan tiimi ja tunnistettavat tiedot säilytetään vain tutkijan tiedostoissa. Tutkijan tiedosto on turvallinen ja sertifioitu elektroninen järjestelmä (Veeva Vault), joka on suunniteltu suojaamaan tutkimustietoja luvattomalta tai vahingonalaiselta paljastumiselta, muuttamiselta, poistamiselta, kopioimiselta ja varkaudelta.

Koodatut tiedot tallennetaan elektroniseen tiedonkeruujärjestelmään (EDC), Medidata RAVE varmistaa jäljitettävyyden (audit trail). EDC:hen tallennettuihin tietoihin pääsevät käsiksi vain datanhallinnoija, tutkimuspaikan henkilöstö ja tutkimuksen jäsenet.

Biologisten näytteiden analyysien jälkeen tulokset tallennetaan toiseen järjestelmään nimeltä LabKey salasanasuojatusti ja niihin pääsevät käsiksi vain analyyseistä vastaavat laboratoriotechnikot. Lopulliset laboratoriotiedot lähetetään sitten LabKeystä määrättyyn datanhallinnoijaan suojatun SharePointin kautta, joka sisältää audit trailin. RAVE ja LabKey sekä ulkoiset tulokset integroidaan LSAF:ään, tilastoanalyysiin erikoistuneeseen ohjelmistoon, joka on salasanasuojattu ja johon pääsevät käsiksi vain tilastotieteilijä ja datanhallinnoija. Kunkin ohjelmiston palvelimet ja niiden varmuuskopiopalvelimet sijaitsevat mm. Yhdysvalloissa (Medidata RAVE), Saksassa (LSAF) ja Sveitsissä (LabKey). Tämän projektin biologista materiaalia ei tunnisteta osallistujan nimellä vaan yksilöllisellä osallistujanumerolla. Biologinen materiaali säilytetään asianmukaisesti rajoitetulla alueella, jonne pääsevät vain valtuutetut henkilöt.

Tietojen siirron tapauksessa Société des Produits Nestlé S.A. ylläpitää korkeita luottamuksellisuus- ja osallistujien henkilötietojen suojastandardeja. Kliinistä tietoa ei luovuteta ilman osallistujan kirjallista lupaa, paitsi sääntelyviranomaisten tai tutkimuksen rahoittajan valvonnassa. Päävastuullinen tutkija tai hänen määräämänsä henkilö toteuttaa ja ylläpitää asianmukaisia teknis- ja organisatorisia toimenpiteitä varmistaakseen osallistujien pääsyn henkilötietoihinsa ja biologisen analyysin tuloksiinsa, jotka on kerätty tutkimuksen aikana. Pyynnöstä päävastuullinen tutkija tai hänen määräämänsä henkilö varmistaa henkilötietojen poimintojen antamisen osallistujille. Päävastuullinen tutkija tai hänen määräämänsä henkilö toteuttaa asianmukaiset menettelyt tiedottaakseen välittömästi rahoittajalle mistä tahansa osallistujan pyynnöstä korjata tai poistaa henkilötietonsa tai biologiset näytteensä tutkimuksen aikana. Tutkimuspaikan tiedostot, mukaan lukien koodiluettelot, säilytetään ja arkistoidaan erikseen turvallisessa säilytyspaikassa, joka on Nestlén tietosuojaan liittyvien käytäntöjen mukainen, tutkimustiimin toimesta 25 vuoden ajan, vaikka hakija ei olisi mukana tutkimushankkeessa. Trial Master -tiedosto säilytetään erikseen 25 vuoden ajan Nestlén käytännön mukaisesti.

Nykyisen tutkimuksen lisäksi osallistujilta pyydetään suostumusta heidän biologisten näytteidensä ja tietojensa "jälleenkäytölle" laajemmassa Nestlé Center of Biological Resources (NCBR) -kontekstissa; jos he antavat suostumuksen tähän, näytteitä ja terveyteen liittyviä tietoja käsitellään biopankkien sääntöjen mukaisesti (CERVD:n lausunto - Req. 2020-00307).

Jos he eivät anna suostumusta, tietoja käytetään vain tässä tutkimuksessa. Tietoja ei käytetä ilman eettisen komitean hyväksyntää ja osallistujien suostumusta.

Otoskoko:

Tämän tutkimuksen otoskoko perustuu kolmeen tietolähteeseen. Koncevičius (2024) osoitti, että biologisen ikäkellon kiihtyvyys on alttiina ympärivuorokautiseen rytmiin liittyvälle vaihtelulle (päivän aikana) 1 vuoden amplitudilla. Reed (2022) osoitti, että sisäinen korrelaatio epigeneettisen kellon osalta on korkea (jopa 0,93 korrelaatio) toistoja välillä, joiden välimatka on jopa 15 vuotta. Jokai (2023) osoitti, että PhenoAge-kellon kiihtyvyyden vaihtelu keskikuntoisilla terveillä henkilöillä molemmilta sukupuolilta oli noin 5,4 vuotta (keskimääräinen havaittu miesten ja naisten välillä).

Jotta voitaisiin osoittaa 1 vuoden vaihtelu talven ja kesän välillä biologisessa iässä olettaen vaihteluväli (keskihajonta) 5,4 vuotta ja sisäinen korrelaatio 0,93, käyttäen paritettua t-testiä, 80 %:n testivoima ja alpha asetettu 0,0166:een (0,05/3) moninaisuuden huomioimiseksi, joka johtuu toistosta kolmella kellolla (PhenoAge, GrimAge ja DuneDinPace – Bonferronin korjaus), tarvitaan 46 koehenkilöä Full Analysis Set -populaatiossa (FAS). Ottaen huomioon 20 %:n keskeytysprosentin (rekrytoidut henkilöt, joilta ei ole laskettu biologista ikää millään aikavälillä), tarvitaan 46/0,8=58 koehenkilöä (pyöristettynä 60 koehenkilöön).

Laskelmiin käytettiin SAS 9.4 (LSAF v5.2.1) PROC POWER -ohjelmaa.

Tilastoanalyysisuunnitelma:

Pääasiallinen päätepisteen analyysi arvioidaan Full Analysis Set -populaatiossa. Herkkyysanalyysi suoritetaan toistamalla pääanalyysi Per Protocol -populaatiossa.

PhenoAge:lle ja GrimAge:lle biologisen iän kiihtyvyys lasketaan yksilötasolla käyttäen lineaarista sekamallia, jossa biologinen ikä (vuosina) on vastemuuttuja ja kronologinen ikä (vuosina) on sekoittava tekijä. Koehenkilötunnus sisällytetään satunnaisvaikutukseen huomioimaan biologisen iän peräkkäisten mittausten välinen korrelaatio koehenkilön sisällä. Kenward-Roger -menetelmää käytetään vapausasteiden laskentaan. Tietylle yksilölle tietyllä kronologisella iällä biologisen iän kiihtyvyys on kiinteä regressiojäämä.

DuneDinPace mittaa jo ikäkiihtyvyyttä, joten edellä mainittu muunnos ei ole sovellettavissa.

Oletetaan, että biologisen iän kiihtyvyys noudattaa normaalijakaumaa. Biologisen iän kiihtyvyyden eroa vuodenaikojen välillä arvioidaan lineaarisen sekamallin avulla huomioimaan tiedon pitkittäinen luonne ja koehenkilöiden sisäinen korrelaatio. Biologisen iän kiihtyvyyttä käytetään tuloksen muuttujana, ja näytteenottoon liittyvä vuodenaika, BMI, sukupuoli, fyysinen aktiivisuus, tupakointistatus ja etnisyys käytetään kiinteinä sekoittavina tekijöinä. Koehenkilötunnusta käytetään satunnaisvaikutuksena huomioimaan tuloksen koehenkilöiden sisäinen korrelaatio. Kenward-Roger -menetelmää käytetään vapausasteiden laskentaan.

Satunnaistamisen puuttuessa mallin arviot vuodenaikavaikutuksesta voivat olla harhaisia sekoittavien tekijöiden vuoksi, jotka korreloivat vahvasti vuodenaikaan, kuten fyysinen aktiivisuus. Mahdollisen harhan vähentämiseksi muuttujanvalintamenetelmää (elastic net) sovelletaan lineaariseen sekamalliin. Satunnainen 5-kertainen ristivalidointi käytetään supistetun mallin valitsemiseen ja ridge-regression parametrin asianmukaisen arvon valitsemiseen.

Jos vuodenaikan kiinteä vaikutus säilyy, biologisen iän kiihtyvyyden pienimmän neliösumman keskiarvot kullakin vuodenaikalla johdetaan edellä mainitusta supistetusta mallista, ja pienimmän neliösumman keskiarvojen parierot (talvi - kesä) lasketaan.

Parieroon liittyvät p-arvot, jotka ovat alle 0,05/3 (Bonferronin korjaus), tulkitaan osoittavan eron biologisen iän kiihtyvyydessä talven ja kesän välillä käytetyn kellon osalta.

Jos vuodenaikan kiinteää vaikutusta ei säilytetä supistetussa mallissa, tämä tulkitaan vuodenaikaan liittyvän eron puuttumiseksi biologisen iän kiihtyvyydessä käytetyn kellon osalta.

Jokaisessa vaiheessa sekalineaarinen malli sovitetaan käyttäen rajoitettua suurimman uskottavuuden algoritmia, sallien osatietojen käytön (kokeen henkilöt, joilla on epätäydellinen aikajana, esim. 1 vuodenaika saatavilla kahdesta tarvittavasta). Tämä menetelmä on harhaton, jos puuttuvat tiedot puuttuvat satunnaisesti.

Poikkeavien havaintojen tapauksessa suoritetaan herkkyysanalyysi sulkemalla havainto(t) pois. Johdonmukaisuus johtopäätöksissä tämän herkkyysanalyysin ja pääasiallisen päätepisteen pääanalyysin välillä osoittaa poikkeavien havaintojen vaikutuksen puuttumisen johtopäätöksiin.