Vyhodnocení vlivu sezónnosti na biologický věk u dospělých (SeasonAGE)

Kvalitativní opatření: vyšetřovatel zajistí ochranu osobních údajů účastníka a že všechny zprávy, publikace, vzorky účastníků a jakákoli jiná zveřejnění, kromě případů vyžadovaných zákony. Zpracování osobních a lékařských údajů bude probíhat v souladu se švýcarskými předpisy v oblasti ochrany osobních údajů a v souladu s nařízením ORH (Nařízení o výzkumu na lidech), čl. 5. Účastníci jsou identifikováni pouze identifikačním číslem účastníka a identifikačním číslem místa, aby byla zachována důvěrnost účastníků. Na CRF a dalších projektech specifických dokumentech jsou účastníci identifikováni pouze svým jedinečným číslem účastníka. Všechny záznamy o studii účastníků budou bezpečně uloženy v oblasti s řízeným přístupem. Seznamy identifikačních kódů spojující jména účastníků s identifikačními čísly účastníků budou uloženy odděleně od záznamů účastníků. Data budou kódována. Seznam identifikace účastníků bude přístupný pouze týmu na místě a identifikovatelné informace budou uchovávány pouze ve vyšetřovatelském souboru. Vyšetřovatelský soubor je bezpečný a certifikovaný elektronický systém (Veeva Vault) určený k ochraně těchto studií informací před neoprávněným nebo náhodným zveřejněním, změnou, odstraněním, kopírováním a krádeží.

Zakódovaná data jsou zachycena do elektronického sběru dat (EDC), Medidata RAVE zajišťuje sledovatelnost (auditní stopa). Data zaznamenaná do EDC jsou přístupná pouze správci dat, personálu na místě a členům studie.

Po analýzách biologických vzorků jsou výsledky zachyceny do jiného systému nazvaného LabKey chráněným heslem a přístupné pouze laboratorním technikům zodpovědným za analýzy. Konečná laboratorní data budou poté odeslána z LabKey přidělenému správci dat prostřednictvím zabezpečeného SharePointu obsahujícího auditní stopu. RAVE a LabKey, stejně jako externí výsledky jsou integrovány do LSAF, softwaru určeného pro statistickou analýzu, který je chráněn heslem a přístupný pouze statistikovi a správci dat. Servery každého softwaru a jejich záložní servery jsou hostovány, tj. ve Spojených státech (Medidata RAVE), Německu (LSAF) a Švýcarsku (LabKey). Biologický materiál v tomto projektu není identifikován jménem účastníka, ale jedinečným číslem účastníka. Biologický materiál je vhodně uložen v omezené oblasti přístupné pouze autorizovanému personálu.

V případě přenosu dat společnost Société des Produits Nestlé S.A. zachová vysoké standardy důvěrnosti a ochrany osobních údajů účastníků. Klinické informace nebudou zveřejněny bez písemného souhlasu účastníka, s výjimkou monitorování regulačními orgány nebo sponzorem studie. Hlavní vyšetřovatel nebo zástupce zavedou a udržují vhodná technická a organizační opatření k zajištění přístupnosti účastníkům jejich osobních údajů a výsledků biologické analýzy shromážděných během studie. Na žádost hlavní vyšetřovatel nebo zástupce zajistí poskytnutí výpisů osobních údajů účastníkům. Hlavní vyšetřovatel nebo zástupce zavedou vhodné postupy k okamžitému informování sponzora o jakékoli žádosti účastníka o opravu nebo smazání jejich osobních údajů nebo biologických vzorků během studie. Vyšetřovatelské soubory místa, včetně seznamu kódů, budou uchovávány a archivovány odděleně v bezpečném úložišti vyhovujícím politikám Nestlé týkajícím se ochrany osobních údajů výzkumným týmem po dobu 25 let, i když kandidát není zahrnut do výzkumného projektu. Hlavní soubor studie bude odděleně uchováván po dobu 25 let podle politiky Nestlé.

Kromě současné studie bude účastníkům navrženo, aby zvážili poskytnutí souhlasu pro "další opětovné použití" jejich biologických vzorků a dat v širším rozsahu Nestlé Center of Biological Resources (NCBR); pokud k tomu dají souhlas, vzorky a zdravotní data budou zpracovány podle předpisů biobanky (stanovisko CERVD - Req. 2020-00307).

Pokud nesouhlasí, data budou použita pouze v rámci tohoto výzkumu. Žádná data nebudou dále použita bez schválení etické komise a souhlasu účastníků.

Výpočet velikosti vzorku:

Velikost vzorku pro tuto studii je založena na třech zdrojích informací. Koncevičius (2024) ukázal, že zrychlení biologického věkového hodin podléhá variaci související s cirkadiánním rytmem (během dne) o amplitudě 1 roku. Reed (2022) ukázal, že korelace epigenetických hodin u subjektu je vysoká (až do korelace 0,93) napříč opakováními vzdálenými až 15 let. Jokai (2023) ukázal, že variabilita zrychlení hodin PhenoAge u zdravých jedinců středního věku obou pohlaví byla asi 5,4 roku (průměrně pozorováno mezi muži a ženami).

Za účelem prokázání 1 roku variace mezi zimou a létem v biologickém věku za předpokladu variability (směrodatná odchylka) 5,4 roku a korelace uvnitř účastníků 0,93, pomocí párového t-testu, 80% síly a alfa nastavené na 0,0166 (0,05/3) za účelem zohlednění multiplicity indukované opakováním napříč 3 hodinami (PhenoAge, GrimAge a DuneDinPace -- Bonferroniho korekce), je třeba skončit s 46 subjekty v úplné analytické sadě (FAS). Při zohlednění 20% míry odpadu (subjekty zařazené, ale bez vypočteného biologického věku v jakémkoli časovém okamžiku), je třeba rekrutovat 46/0,8=58 subjektů (zaokrouhleno na 60 subjektů).

Pro výpočty byl použit SAS 9.4 (LSAF v5.2.1) PROC POWER.

Plán statistických analýz:

Hlavní analýza primárního koncového bodu bude vyhodnocena na populaci úplné analytické sady. Bude provedena senzitivní analýza replikující hlavní analýzu na sadě Per Protocol.

Pro PhenoAge a GrimAge bude zrychlení biologického věku vypočteno na individuální úrovni pomocí lineárního smíšeného modelu s biologickým věkem (roky) jako odpovědí a chronologickým věkem (roky) jako rušivým faktorem. Identifikátor subjektu bude zahrnut jako náhodný efekt, aby se zohlednila korelace mezi po sobě jdoucími měřeními biologického věku u subjektu. Pro výpočet stupňů volnosti bude použita metoda Kenward-Roger. Pro daného jedince, v daném chronologickém věku, bude zrychlení biologického věku fixním regresním reziduálem.

DuneDinPace již měří zrychlení věku, proto výše uvedená transformace není použitelná.

Předpokládá se, že zrychlení biologického věku sleduje normální rozdělení. Rozdíl v zrychlení biologického věku mezi ročními obdobími bude vyhodnocen lineárním smíšeným modelem, aby se zohlednila longitudinální povaha dat a intra-subjektová korelace. Jako výsledná proměnná bude použito zrychlení biologického věku a roční období spojené s odběrem, BMI, pohlaví, fyzická aktivita, kuřácký status a etnicita použity jako fixní rušivé faktory. Identifikátor subjektu bude použit jako náhodný efekt, aby se zohlednila intra-subjektová korelace výsledku. Pro výpočet stupňů volnosti bude použita metoda Kenward-Roger.

Při absenci randomizace mohou být odhady sezónního efektu modelu zkresleny přítomností rušivých faktorů vysoce korelovaných s ročním obdobím, jako je fyzická aktivita. Pro zmírnění potenciálního zkreslení bude na lineární smíšený model aplikována metoda výběru proměnných (elastic net). Pro výběr redukovaného modelu a vhodné hodnoty parametru ridge regrese bude použita náhodná 5-násobná křížová validace.

Pokud je fixní efekt ročního období zachován, budou z výše uvedeného redukovaného modelu odvozeny nejmenší čtvercové průměry zrychlení biologického věku v každém ročním období a budou vypočteny párové rozdíly nejmenších čtvercových průměrů (zima - léto).

P-hodnoty spojené s párovým rozdílem menším než 0,05/3 (Bonferroniho korekce) budou interpretovány jako indikace rozdílu v zrychlení biologického věku mezi zimou a létem pro použité hodiny.

Pokud fixní efekt ročního období není v redukovaném modelu zachován, bude to interpretováno jako absence rozdílu v zrychlení biologického věku spojeného s ročním obdobím pro použité hodiny.

V každé fázi bude smíšený lineární model přizpůsoben pomocí algoritmu omezené maximální věrohodnosti, umožňující použití částečných informací (subjekty s neúplnou trajektorií, např. 1 roční období dostupné ze dvou potřebných). Tato metoda je nezaujatá, pokud chybějící data chybí náhodně.

V přítomnosti výrazných odlehlých hodnot bude provedena senzitivní analýza vylučující pozorování. Konzistence v závěrech mezi touto senzitivní analýzou a hlavní analýzou primárního koncového bodu bude indikovat absenci dopadu odlehlých hodnot na závěry.