TRACE-BTC. Biomarkkerien ja potilaiden raportoiman elämänlaadun suhde sappiteiden syöpäpotilaiden hoitotuloksiin: reaalimaailman kohorttitutkimus (TRACE-BTC)

Tämä prospektiivinen, ei-interventiivinen havainnointitutkimus tutkii kiertävän kasvaimen DNA:n (ctDNA), kiertävien biomarkkerien ja potilasarvioihin perustuvien tulosten pitkittäisdynamiikkaa sappitieräpäissä (BTC) sairastavilla potilailla, jotka saavat standardionkologista hoitoa rutiinikliinisessä käytännössä. Tutkimusta toteutetaan osallistuvissa onkologian keskuksissa, ja se integroi translatiiviset laboratorioanalyysit rakenteellisen kliinisen ja potilasarvioihin perustuvan tiedonkeruun kanssa.

# Tutkimuksen suunnittelu ja väestö

Osallistujat rekrytoidaan peräkkäin kliinisestä potilasväestöstä, jolla on diagnosoitu BTC ja joka on arvioitu parantavaan tarkoitukseen (mukaan lukien adjuvantti- tai alas-asteistusstrategiat) tai palliatiiviseen onkologiseen hoitoon. Sisällyttäminen tapahtuu rutiinihoidon polkujen puitteissa, ja tutkimukseen osallistuminen ei vaikuta hoitokohdistukseen, kliiniseen päätöksentekoon tai seuranta-aikatauluihin. Kaikki terapeuttiset toimenpiteet toteutetaan laitoksen standardien ja kansallisten suositusten mukaisesti.

# Pitkittäisnäytteenottokehys

Perifeerisiä verinäytteitä kerätään ennalta määritellyissä kliinisesti merkityksellisissä virstanpylväissä hoidon kulkua pitkin, mukaan lukien lähtötaso, systemaattisen hoidon aikana, perioperatiiviset jaksot (jos sovellettavissa), vastearviointi ja seuranta. Näytteenottosuunnitelmat on protokolloitettu, ja niitä voidaan nollata, jos hoitostrategia muuttuu, varmistaen ajoituksen kliinisen kulun mukaisesti. Jokaisessa näytteenotossa voidaan kerätä jopa 40 ml verta, ja osallistujaa kohden tutkimusjakson aikana otetaan enintään 20 tutkimukseen liittyvää näytettä.

Näytteet käsitellään standardoiduilla esianalyyttisillä työnkuluilla ja varastoidaan -80 °C:ssa keskitetyssä tutkimusbiopankissa. Väliaikainen paikallinen varastointi osallistuvissa yksiköissä (enintään 5–7 päivää) on sallittua ennen lähetystä keskitettyyn biopankkiin valvotuissa olosuhteissa. Kaikki näytteet pseudonymisoidaan käyttämällä yksilöllisiä tutkimustunnisteita.

# Translatiivinen tutkimusohjelma

Retrospektiiviset eräanalyysit suoritetaan keskitetysti varastoiduille plasmanäytteille varmistaakseen menetelmällisen yhtenäisyyden ja vähentääkseen analyyttistä vaihtelua. Translatiivinen laboratorio-ohjelma sisältää:

• Kasvaimen tiedon perusteella ja ilman kasvaimen tietoa tehtävät ctDNA-testit
• Yksittäisten nukleotidimuutosten, inserioiden/deletioiden, kopiolukumuutosten ja geenifuusioiden havaitseminen
• Kohdennettujen metylaatiomarkkerien analyysit
• Vertailuanalyysit plasmapohjaisten biomarkkerien ja arkistoidun kasvainkudoksen välillä
• Kasvainkudoksen immunohistokemiallinen karakterisointi, kun saatavilla
• Lisäkiertävien biomarkkerien, jotka liittyvät kasvainkuormaan, tulehdukseen ja immuunistatukseen, tutkiva arviointi

Koko genomin ja koko eksomin sekvensointia ei suoriteta. Kaikki laboratorioanalyysit noudattavat validoituja, standardoituja työnkulkuja ja toteutetaan akkredioiduissa akateemisissa laboratorioissa, mukaan lukien Aarhusin yliopistosairaala ja yhteistyössä olevat molekyylidiagnostiikan laboratoriot.

# Potilasarvioihin perustuvat tulokset

Terveyteen liittyvää elämänlaatua (HRQoL) arvioidaan pitkittäisesti käyttämällä validoituja tanskankielisiä mittareita ennalta määritellyissä ajanhetkissä, jotka on linjattu hoidon ja seurantakäyntien kanssa. Kyselytaakkaa pyritään minimoimaan samalla säilyttäen menetelmällinen robustisuus. PROM-tiedot integroidaan kliinisten ja biomarkkeritietojen kanssa mahdollistaen tutkivia analyysejä biologisten markkerien ja potilasarvioihin perustuvien tulosten välisistä yhteyksistä.

• Tiedonkeruu ja hallinta

Kliininen data poimitaan sähköisistä potilastiedoista ja syötetään Aarhusin yliopiston isännöimään suojattuun, keskitettyyn REDCap-tietokantaan. Tietokanta sisältää roolipohjaisen käyttöoikeushallinnan, tarkistuslokit, ennalta määritellyt validointisäännöt ja rakenteelliset sähköiset tapausraportointilomakkeet. Kaikki tiedot pseudonymisoidaan, eikä tutkimustietoja tallenneta ennen kirjallista tietoista suostumusta.

Tietolähteet sisältävät rutiinikliinistä dokumentaatiota, laboratoriotietueita ja PROM-kyselylomakkeita. Ennalta määritelty tietosanakirja varmistaa standardoidut muuttujamääritelmät, yhtenäistetyn terminologian ja toistettavuuden eri yksiköiden välillä.

# Laadunvarmistus ja hallinta

Tutkimusta koordinoidaan keskitetysti ja toteutetaan standardoitujen toimintamenetelmien mukaisesti, jotka kattavat suostumusmenettelyt, biologisten näytteiden käsittelyn, laboratoriotyönkulut, tietojen syötön ja poikkeamien hallinnan. Automaattiset validointisäännöt, loogiset yhtenäisyystarkistukset ja säännölliset sisäiset tietojen arvioinnit toteutetaan varmistaakseen tietojen laadun ja täydellisyyden. Lähdetietojen varmennusta tukevat tarkistuslokit ja valvottu pääsy potilastietoihin valtuutetulle henkilöstölle.

# Tilastollinen ja analyyttinen lähestymistapa

Analyysit keskittyvät ctDNA-dynamiikan, kliinisten muuttujien ja tulosten väliseen yhteyteen. Tilastollinen viitekehys sisältää kuvailevia analyysejä, korrelaatioanalyysit, eloonjäämismallinnuksen Kaplan-Meier-menetelmillä ja monimuuttuja-Cox-regression relevanttien kliinisten sekoittavien tekijöiden huomioimiseksi. Vertailuanalyysit plasmapohjaisten biomarkkerien ja kasvainkudostulosten välillä suoritetaan saatavilla ollessa. Biomarkkeritietojen integrointi pitkittäisiin PROM-tietoihin on tutkivaa.

Otoskoot perustuvat toteutettavuuteen ja ennalta määriteltyihin translatiivisiin tavoitteisiin parantavan hoidon seurannassa, perustason ctDNA-havaitsemisessa edenneessä sairaudessa ja varhaisessa ctDNA-dynamiikassa hoidon aikana.

# Eettiset näkökohdat ja turvallisuus

Tutkimus sisältää vähäistä riskiä, sillä ainoa tutkimukseen erityisesti liittyvä toimenpide on lisäperifeerinen verinäytteenotto. Mahdolliset riskit rajoittuvat ohimeneviin epämukavuustiloihin tai lieviin mustelmiin. Osallistuminen ei häiritse standardikliinistä hoitoa, ja potilaat voivat peruuttaa suostumuksen milloin tahansa ilman seuraamuksia hoidolle.

Kaikkia biologisia materiaaleja ja tutkimustietoja käsitellään sovellettavan tietosuojalainsäädännön ja eettisten säädösten mukaisesti. Jäännösbiologinen materiaali voidaan varastoida tulevaa eettisesti hyväksyttyä tutkimusta varten, jos annetaan erillinen suostumus; muuten ylimääräinen materiaali tuhotaan tutkimukseen erityisten analyysien valmistuttua.

# Tutkimuksen aikataulu

Potilaiden sisällyttäminen on suunniteltu vuodesta 2026 vuoteen 2030, ja pitkittäisseuranta sekä lopulliset analyysit odotetaan valmistuvan vuonna 2031. Tuloksia levitetään vertaisarvioitujen julkaisujen ja tieteellisten konferenssien kautta riippumatta tutkimustuloksista.