Profilage du microbiome intratumoral de l'adénocarcinome canalaire pancréatique sur la base d'échantillons de tissus EUS-FNB et exploration de son impact sur le diagnostic et le pronostic des tumeurs.

Le but de cette étude observationnelle est d'utiliser la biopsie endoscopique à l'aiguille fine guidée par échographie (EUS-FNB) pour étudier le profil du microbiome intratumoral chez les patients atteints d'adénocarcinome canalaire pancréatique (PDAC) et d'évaluer son impact potentiel sur le diagnostic et le pronostic de la tumeur. Le PDAC est le type de cancer du pancréas le plus courant et le plus mortel, représentant plus de 85 % de tous les cas de cancer du pancréas. Étant donné que la plupart des patients sont diagnostiqués à un stade avancé lorsque la chirurgie n’est plus une option, l’EUS-FNB constitue une méthode cruciale et peu invasive pour accéder et analyser le microbiome au sein de la tumeur.

Les principales questions auxquelles cette étude vise à répondre sont :

L’EUS-FNB peut-il détecter de manière fiable et précise le microbiome dans les tumeurs PDAC ?

Les chercheurs analyseront des échantillons de tissus obtenus via EUS-FNB pour confirmer sa capacité à capturer avec précision la diversité et la composition du microbiome tumoral.

Existe-t-il des microbes ou des métabolites spécifiques dans le microbiome tumoral PDAC qui sont liés au pronostic du patient ou à sa réponse à la chimiothérapie ?

L'étude détectera et identifiera les principales espèces microbiennes ou métabolites associés aux résultats du traitement et à la survie des patients dans la PDAC.

Pour garantir la fiabilité des résultats EUS-FNB, les chercheurs compareront systématiquement les données du microbiome obtenues à partir d’échantillons EUS-FNB avec celles provenant de biopsies chirurgicales de tissus cancéreux du pancréas. Cette comparaison aidera à valider la cohérence et l'exactitude des deux méthodes pour identifier la diversité et la composition du microbiome, confirmant ainsi l'utilité clinique et de recherche de l'EUS-FNB.

Conditions requises pour les participants :

Les participants seront des patients diagnostiqués avec PDAC qui nécessitent EUS-FNB dans le cadre de leur évaluation clinique et de leur parcours de traitement.

Au cours de la procédure EUS-FNB, les chercheurs utiliseront les tissus restants après une évaluation rapide sur site (ROSE) pour effectuer le séquençage du microbiome, garantissant ainsi la qualité des échantillons.

Tous les participants fourniront leur consentement éclairé, permettant l'utilisation des restes de tissus pour l'analyse du microbiome, et leur vie privée sera strictement protégée tout au long de l'étude.

Procédures d'étude :

Les participants subiront une procédure EUS-FNB standard dans le cadre de leurs soins cliniques de routine, sans aucune procédure supplémentaire requise pour l'étude.

Les chercheurs compareront les caractéristiques du microbiome des échantillons EUS-FNB avec celles des échantillons de biopsie chirurgicale pour vérifier la cohérence.

L’étude utilisera la technologie de séquençage métagénomique 2bRAD-M, qui est rentable et adaptée aux échantillons de microbiome à faible biomasse, contaminés par l’hôte et dégradés. Cette méthode génère un profil taxonomique précis au niveau de l’espèce pour analyse.

En identifiant les composants microbiens ou métabolites clés liés au pronostic du patient ou à la réponse au traitement, cette étude vise à fournir des preuves scientifiques pour des stratégies de détection précoce et des plans de traitement efficaces pour les patients PDAC, apportant potentiellement des avantages cliniques significatifs.