Profilování intratumorálního mikrobiomu pankreatického duktálního adenokarcinomu na základě vzorků tkáně EUS-FNB a zkoumání jeho dopadu na diagnostiku a prognózu nádoru.

Cílem této observační studie je pomocí endoskopické ultrazvukem naváděné biopsie tenkou jehlou (EUS-FNB) prozkoumat profil intratumorálního mikrobiomu u pacientů s pankreatickým duktálním adenokarcinomem (PDAC) a zhodnotit jeho potenciální vliv na diagnostiku a prognózu nádoru. PDAC je nejběžnějším a smrtelným typem rakoviny slinivky břišní, představuje více než 85 % všech případů rakoviny slinivky břišní. Vzhledem k tomu, že většina pacientů je diagnostikována v pokročilém stadiu, kdy chirurgický zákrok již nepřichází v úvahu, slouží EUS-FNB jako klíčová a minimálně invazivní metoda pro přístup a analýzu mikrobiomu v nádoru.

Hlavní otázky, na které má tato studie odpovědět, jsou:

Dokáže EUS-FNB spolehlivě a přesně detekovat mikrobiom v nádorech PDAC?

Výzkumníci budou analyzovat vzorky tkání získané prostřednictvím EUS-FNB, aby potvrdili jeho schopnost přesně zachytit rozmanitost a složení mikrobiomu nádoru.

Existují v nádorovém mikrobiomu PDAC specifické mikroby nebo metabolity, které jsou spojeny s prognózou pacienta nebo odpovědí na chemoterapii?

Studie bude zkoumat a identifikovat klíčové mikrobiální druhy nebo metabolity spojené s výsledky léčby a přežitím pacientů v PDAC.

Aby byla zajištěna spolehlivost výsledků EUS-FNB, budou výzkumníci systematicky porovnávat mikrobiomová data získaná ze vzorků EUS-FNB s těmi z chirurgických biopsií tkáně rakoviny slinivky břišní. Toto srovnání pomůže ověřit konzistenci a přesnost těchto dvou metod při identifikaci diverzity a složení mikrobiomu a potvrdí klinickou a výzkumnou užitečnost EUS-FNB.

Požadavky na účastníka:

Účastníky budou pacienti s diagnózou PDAC, kteří vyžadují EUS-FNB jako součást jejich klinického hodnocení a léčebné cesty.

Během postupu EUS-FNB vědci použijí zbývající tkáň po rychlém vyhodnocení na místě (ROSE) k provedení sekvenování mikrobiomu, čímž se zajistí kvalita vzorku.

Všichni účastníci poskytnou informovaný souhlas, který umožní použití zbylé tkáně pro analýzu mikrobiomu, a jejich soukromí bude po celou dobu studie přísně chráněno.

Studijní postupy:

Účastníci podstoupí standardní proceduru EUS-FNB jako součást své běžné klinické péče, přičemž studie nevyžaduje žádné další procedury.

Výzkumníci budou porovnávat charakteristiky mikrobiomu ze vzorků EUS-FNB s těmi ze vzorků chirurgické biopsie, aby ověřili konzistenci.

Studie bude využívat technologii metagenomického sekvenování 2bRAD-M, která je nákladově efektivní a vhodná pro vzorky mikrobiomů s nízkou biomasou, kontaminované hostitelem a degradované. Tato metoda generuje přesný taxonomický profil na úrovni druhu pro analýzu.

Identifikací klíčových mikrobiálních složek nebo metabolitů spojených s prognózou pacienta nebo léčebnou odpovědí si tato studie klade za cíl poskytnout vědecké důkazy pro strategie včasné detekce a účinné léčebné plány pro pacienty s PDAC, které mohou přinést významné klinické výhody.