Nutrition, microbiote intestinal et santé: collection d'échantillons de matières fécales dans les participants à Nutrinet-Santé (NUTRIGUT)

Le microbiote intestinal attire actuellement l'attention croissante de la communauté scientifique et également du grand public, car la preuve de son rôle dans la physiologie humaine a été soulignée. Les signatures microbiennes ont également été associées à diverses pathologies (par ex. obésité, diabète, troubles gastro-intestinaux, maladies neurodégénératives), mais la causalité de ces associations est encore incertaine. Parmi les facteurs qui peuvent influencer la composition du microbiote intestinal (par ex. style de vie, hygiène, médicaments, génétique, environnement), la nutrition serait un rôle majeur. Les principaux changements de style de vie et de régime observés au cours des dernières décennies sont fortement soupçonnés de déshabiller l'équilibre du microbiote de l'intestin hôte.

En plus de leur teneur en nutriments, notre régime alimentaire contienne également d'autres composés bioactifs (par exemple Polyphénols) et soulevez de nouveaux problèmes (par ex. Structure temporelle des régimes alimentaires, transformation des aliments, présence d'additifs ou de contaminants tels que les résidus de pesticides, l'apport de compléments alimentaires, les exclusions alimentaires, l'indice glycémique) qui est nécessaire pour prendre en compte. Ainsi, il est obligatoire d'explorer et de caractériser de manière plus précise, dans de grands échantillons composés d'individus ayant des caractéristiques variées, la manière dont la composition du microbiote intestinal est influencée par l'alimentation de l'hôte et ses conséquences sur la santé.

Le but de cette recherche est donc d'étudier les liens entre la nutrition, les profils de microbiote intestinal et la santé. Pour ce faire, la recherche mettra en œuvre la collection d'échantillons de selles à grande échelle des participants à la cohorte Nutrinet-Santé ("Nutrinats"), constituant ainsi un sous-cohorte "microbiote".

Un objectif de n = 10 000 participants à la cohorte de Nutrinet-Santé sera recruté sur une base volontaire. Une sélection sera ensuite faite parmi les Nutrinats disposés à participer à la recherche (qui peut être plus nombreux que nécessaire) pour maximiser la diversité des profils. Les participants seront informés de leur sélection ou de leur non-sélection par e-mail. Un deuxième échantillon de selles sera également prélevé 2 à 3 mois après le premier pour un sous-échantillon de n = 300 pour évaluer la variabilité intra-individuelle des profils de microbiote. Les participants sélectionnés recevront un kit d'auto-échantillonnage des selles avec des instructions détaillées par message sur leur adresse personnelle. Les échantillons pseudonymisés seront retournés par courrier par le participant au laboratoire de traitement, qui déterminera leurs caractéristiques de microbiote intestinal par séquençage d'ADNr 16S et / ou séquençage "fusil de chasse". Les profils du microbiote intestinal seront ensuite analysés de manière pseudonyée en association avec le régime alimentaire et la santé, en utilisant des données collectées dans le cadre du suivi de la cohorte de Nutrinet-Santé (par exemple (par ex. Consommation alimentaire, prévalence et incidence des pathologies, données biologiques, caractéristiques anthropométriques, consommation de médicaments, caractéristiques sociodémographiques, mode de vie).