Odżywianie, mikroflora jelitowa i zdrowie: Zbieranie próbek kału u uczestników Nutrinet-Santé (NUTRIGUT)

Mikrobiota jelitowa przyciąga obecnie coraz większą uwagę społeczności naukowej, a także ogółu społeczeństwa, ponieważ podkreślono dowody jej roli w fizjologii człowieka. Sygnatury drobnoustrojowe były również powiązane z różnymi patologii (np. Otyłość, cukrzyca, zaburzenia przewodu pokarmowego, choroby neurodegeneracyjne), ale przyczynowość tych powiązań jest nadal niepewna. Wśród czynników, które mogą wpływać na skład mikroflory jelitowej (np. Styl życia, higiena, leki, genetyka, środowisko), odżywianie byłaby ważną rolą. Główne zmiany w stylu życia i diecie obserwowane w ciągu ostatnich dziesięcioleci są silnie podejrzane o rozrywkę równowagi mikroflory gospodarza.

Oprócz zawartości składników odżywczych nasze diety zawierają również inne bioaktywne związki (np. polifenole) i podnoszą nowe problemy (np. Struktura czasowa diety, przetwarzanie żywności, obecność dodatków lub zanieczyszczeń, takich jak pozostałości pestycydowe, spożycie suplementów diety, wykluczenia dietetyczne, wskaźnik glikemii), która jest niezbędna do uwzględnienia. Zatem obowiązkowe jest odkrywanie i scharakteryzowanie w bardziej precyzyjnym sposobie, w dużych próbkach składających się z osób o różnorodnych cechach, sposób, w jaki na skład mikroflory jelitowej wpływa dieta gospodarza i jej konsekwencje zdrowotne.

Celem tych badań jest zatem zbadanie powiązań między odżywianiem, profilem mikroflory jelit i zdrowia. Aby to zrobić, badania wdroży na dużą skalę kolekcję próbek stołka od uczestników kohorty Nutrinet-Santé („Nutrinauty”), stanowiąc w ten sposób pod-kohortę „Mikrobiota”.

Cel n = 10 000 uczestników w kohorcie Nutrinet-Santé będzie rekrutowany na zasadzie dobrowolności. Następnie zostanie dokonana selekcja wśród odżywczych gotowych uczestniczyć w badaniach (które mogą być liczniejsze niż to konieczne), aby zmaksymalizować różnorodność profili. Uczestnicy zostaną poinformowani o ich selekcji lub braku selekcji pocztą elektroniczną. Druga próbka kału zostanie również zebrana 2-3 miesiące po pierwszej dla podpróbki n = 300 w celu oceny zmienności wewnątrzosobowej w profilach mikroflory. Wybrani uczestnicy otrzymają zestaw do samodzielnego próbkowania kału ze szczegółowymi instrukcjami według postu na adres domowy. Pseudonimizowane próbki zostaną zwrócone pocztą przez uczestnika do laboratorium przetwórczego, które określi ich charakterystykę mikroflory jelitowej za pomocą sekwencjonowania 16S RDNA i/lub sekwencjonowania „strzelby”. Profile mikroflory jelitowej będą następnie analizowane w sposób pseudonimizowany w związku z dietą i zdrowiem, wykorzystując dane zebrane w ramach obserwacji kohorty Nutrinet-Santé (np. Spożycie żywności, rozpowszechnienie i występowanie patologii, dane biologiczne, cechy antropometryczne, spożycie leków, cechy społeczno-demograficzne, styl życia).