Analisi molecolare del DNA microbico nella pancreatite necrotizzante infetta

In questo studio, i pazienti con pancreatite necrotizzante grave saranno seguiti in modo prospettico durante tutto il loro decorso ospedaliero (durata prevista del ricovero compresa tra 4 e 8 settimane). Se si sospetta che i pazienti abbiano un'infezione da necrosi pancreatica, saranno acconsentiti all'arruolamento. I pazienti saranno determinati dal loro medico curante a richiedere un intervento chirurgico o il drenaggio radiologico guidato della necrosi pancreatica e del liquido peripancreatico infetto. Al momento della procedura o dell'intervento di drenaggio, un campione di fluido peripancreatico verrà inviato al dipartimento di microbiologia dell'ospedale per l'identificazione standard della colorazione di Gram e della coltura batterica e un secondo campione verrà congelato per l'analisi del DNA batterico. I pazienti saranno seguiti per tutta la durata del loro ricovero per gli esiti ospedalieri, la mortalità e i risultati finali della coltura microbiologica. I campioni verranno quindi elaborati a sei mesi e un anno dopo la raccolta del campione per l'analisi di sequenziamento profondo del DNA batterico e saranno confrontati con i batteri identificati utilizzando la tecnica di coltura standard.