Infiammazione e fibrillazione atriale postoperatoria in cardiochirurgia

Fibrillazione atriale postoperatoria (POAF) dopo intervento di cardiochirurgia La fibrillazione atriale postoperatoria è una complicanza comune dopo un intervento di cardiochirurgia, caratterizzata da frequenza cardiaca irregolare e spesso rapida. È associato a un aumento della morbilità, a degenze ospedaliere prolungate e a costi sanitari più elevati. La fisiopatologia della POAF è complessa e multifattoriale e coinvolge il rimodellamento strutturale ed elettrico atriale, l’infiammazione e la disregolazione autonomica.

Infiammazione e grasso epicardico L'infiammazione gioca un ruolo significativo nello sviluppo della POAF. Il trauma chirurgico e il bypass cardiopolmonare innescano una risposta infiammatoria sistemica, rilasciando citochine e altri mediatori infiammatori. Il grasso epicardico, il deposito di grasso viscerale attorno al cuore, è un organo endocrino attivo che secerne citochine e adipochine proinfiammatorie. L’aumento dello spessore del grasso epicardico è associato a livelli più elevati di infiammazione ed è stato implicato nella patogenesi della fibrillazione atriale.

Isolamento e sequenziamento dell'RNA Il sequenziamento dell'RNA (RNA-seq) può essere utilizzato per studiare l'espressione genica nel grasso epicardico in diversi modi di grande impatto. L'RNA-seq può profilare l'espressione genica per identificare i geni attivi nel grasso epicardico e i loro livelli di espressione, rivelando geni chiave coinvolti nell'infiammazione e nel metabolismo. Confrontando l'espressione genica tra gruppi, come pazienti con e senza POAF, RNA-seq può identificare geni espressi in modo differenziale associati alla fibrillazione atriale.

Analisi RNA-seq I file di dati di sequenziamento dell'RNA sono stati allineati al genoma di riferimento hg38 utilizzando l'allineamento delle trascrizioni giuntate a un riferimento (STAR) e i conteggi delle letture nei geni sono stati quantificati. La matrice di dati risultante con conteggi non normalizzati è stata caricata in RStudio insieme alle informazioni sui metadati del paziente (ad esempio età, sesso, BMI, fumo). Le analisi dell'espressione differenziale sono state condotte con DESeq2 utilizzando aggiustamenti per diverse variabili, tra cui tipo di tessuto, età dei pazienti, sesso e BMI.

Ipotesi Ipotizziamo che la POAF possa essere influenzata da un'infiammazione preesistente nel grasso epicardico, oltre all'infiammazione causata dal trauma chirurgico.

Obbiettivo:

Confrontare l'espressione genica infiammatoria nel grasso epicardico tra i pazienti che sviluppano POAF e quelli che non sviluppano la malattia dopo un intervento di chirurgia cardiaca elettiva.

Progettazione dello studio:

Uno studio prospettico di coorte che include pazienti sottoposti per la prima volta a un intervento di cardiochirurgia elettiva.

Partecipanti:

Criteri di inclusione: Pazienti sottoposti per la prima volta a un intervento di cardiochirurgia elettiva. Criteri di esclusione: pazienti con precedenti interventi cardiaci o interventi chirurgici d'urgenza.

Gruppi:

Gruppo POAF: pazienti che sviluppano POAF. Gruppo non POAF: pazienti che non sviluppano POAF.

Raccolta campioni:

Campioni di grasso epicardico verranno raccolti durante il periodo dell'intervento.

Isolamento e sequenziamento dell'RNA:

Omogeneizzare il tessuto adiposo in TRIzol utilizzando perline di ceramica (Fastprep 24, MPBio). Purificare l'RNA utilizzando le colonne EconoSpin (Epoch). Preparare le librerie di RNA con il kit di preparazione delle librerie di RNA NEBNext Ultra II per Illumina. Eseguire il sequenziamento accoppiato sulla piattaforma NovaSeq 6000 (Illumina).

Analisi dei dati:

Allinea i dati RNA-seq al genoma hg38 utilizzando l'allineatore STAR. Quantificare il conteggio dei geni ed eseguire l'analisi dell'espressione differenziale utilizzando DESeq2. Regolare per variabili quali tipo di tessuto, età, sesso e BMI.

Misure di risultato:

Confrontare i profili di espressione genica infiammatoria tra i gruppi POAF e non POAF al momento dell'intervento.