Salivary Microbiota and Antimicrobial Resistance in Relation to Chlorhexidine Use (SMARCH)
Study Protocol for 16S rRNA Sequencing of Healthy Oral Microbiota
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Intervento / Trattamento
Intervento / Trattamento
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Iscrizione
Fase
Fase
- Non applicabile
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
-
-
-
Brno, Cechia, 62500
- Department of Public Health, Faculty of Medicine, Masaryk University
-
Brno, Cechia, 62500
- Skydent s.r.o.
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Adulto
Accetta volontari sani
Descrizione
Inclusion Criteria:
- Age: Between 25-44 years.
- General Health: Good systemic health (absence of chronic inflammatory diseases or conditions affecting oral tissues).
- Oral Hygiene Routine: Participants must perform toothbrushing twice a day and use interdental cleaning aids once a day.
- Plaque Index (PI): A score of 0.0-0.2 according to Silness and Löe.
- Gingival Index (GI): A score of 0.0-0.143 according to Silness and Löe.
Exclusion Criteria:
Systemic and Lifestyle Factors:
- Presence of any chronic systemic disease (e.g., diabetes mellitus, autoimmune disorders)
- Regular use of medications that may affect gingival status or saliva production.
- Use of antibiotics within the last 6 months prior to the study.
- Current pregnancy or lactation.
- Current smokers or users of other tobacco/nicotine products.
Oral and Dental Factors:
- Active dental disease: Presence of untreated tooth decay, gingivitis (GI > 0.143), or any form of periodontitis.
- Prosthetics and Implants: Presence of dental implants, dentures, or significant tooth loss (excluding extracted third molars).
- Ongoing fixed or removable orthodontic treatment.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Scopo principale: Ricerca sui servizi sanitari
- Assegnazione: N / A
- Modello interventistico: Assegnazione di gruppo singolo
- Mascheramento: Nessuno (etichetta aperta)
Numero di armi
Armi e interventi
Gruppo di partecipanti / ArmGruppo di partecipanti / Arm |
Intervento / TrattamentoIntervento / Trattamento |
|---|---|
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Sperimentale: Experimental: Chlorhexidine group
A single group of 11 healthy volunteers.
The study consists of three consecutive phases: baseline (4 weeks), intervention with 0.06% chlorhexidine toothpaste (12 weeks), and washout (12 weeks).
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Participants used the toothpaste twice daily for 12 weeks.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Change in Salivary Microbial Alpha Diversity (Shannon and Simpson Indices)
Lasso di tempo: Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).
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Evaluation of microbial richness and evenness within individual saliva samples.
Alpha diversity is quantified using the Shannon and Simpson indices based on 16S rRNA gene sequencing data.
Differences between study phases (baseline, intervention, washout) are assessed using the Kruskal-Wallis test or Mann-Whitney U test, as appropriate, with a significance threshold of p < 0.05.
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Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).
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Change in Salivary Microbial Beta Diversity (Community Structure)
Lasso di tempo: Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).
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Evaluation of differences in microbial community composition between study phases.
Calculated using Bray-Curtis dissimilarity on Centered Log-Ratio (CLR) normalized data and assessed via PERMANOVA to detect significant shifts (p < 0.05).
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Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).
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Misure di risultato secondarie
Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Differential Abundance of Salivary Bacterial Taxa
Lasso di tempo: Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).
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Evaluation of shifts in the relative abundance of bacterial taxa (at phylum, family, genus, and species levels) using 16S rRNA sequencing (V3-V4 region).
Statistical analysis is performed using DESeq2 and edgeR to identify significant differences between study phases, with multiple testing corrections applied using the Benjamini-Hochberg (FDR) method (FDR < 0.05).
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Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).
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Changes in Predicted Antimicrobial Resistance Genes (ARGs)
Lasso di tempo: Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).
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Functional prediction of the salivary microbiota conducted using PICRUSt2.
Assessment of metabolic potential and antimicrobial resistance pathways with significance assessed using adjusted p-values (p-adj < 0.05).
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Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).
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Gingival Index (GI) for Clinical Stability Assessment
Lasso di tempo: Screening (Week -4) and after washout (Week 24).
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Assessment of gingival health using the Silness and Löe Gingival Index (scale 0-3).
This measure is used to verify that participants maintain optimal oral health throughout the study.
Eligibility is strictly limited to participants with a maximum GI of 0.143 at screening to ensure a healthy baseline and to monitor that no gingival inflammation occurs during the study period.
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Screening (Week -4) and after washout (Week 24).
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Plaque Index (PI) for Clinical Stability Assessment
Lasso di tempo: Screening (Week -4) and after washout (Week 24).
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Assessment of dental plaque accumulation using the Silness and Löe Plaque Index (scale 0-3).
This measure is used to ensure consistent oral hygiene.
Eligibility is strictly limited to participants with a maximum PI of 0.2 at screening.
The index is monitored to confirm that participants adhere to the required oral hygiene protocol throughout the study.
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Screening (Week -4) and after washout (Week 24).
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
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Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
Inizio studio
Completamento primario (Effettivo)
Completamento primario
Completamento dello studio (Effettivo)
Completamento dello studio
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Primo Inserito
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento pubblicato
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Altri numeri di identificazione dello studio
Altri numeri di identificazione dello studio
- 68/2020
- MUNI/A/1807/2025 (Altro numero di sovvenzione/finanziamento: Masaryk University)
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