Riclassificazione molecolare per trovare biomarcatori clinicamente utili per le malattie autoimmuni sistemiche: caso-controllo (PRECISESADST)
22 maggio 2018 aggiornato da: Fundación Pública Andaluza Progreso y Salud
Le malattie del tessuto connettivo (CTD) o malattie autoimmuni sistemiche (SAD) come sono conosciute oggi sono un gruppo di condizioni infiammatorie croniche con eziologia autoimmune con poche opzioni di trattamento e diagnosi difficili. Il team di Brest contribuisce a eseguire una nuova classificazione delle seguenti malattie autoimmuni sistemiche nel Settimo programma quadro dell'Unione europea.
Lo scopo di questa ricerca è quello di costituire una coorte di Volontari Sani da confrontare con la coorte di malattie autoimmuni sistemiche in cluster molecolari invece che in entità cliniche attraverso la determinazione di profili molecolari utilizzando diverse tecniche "Omics".
Panoramica dello studio
Stato
Completato
Condizioni
Descrizione dettagliata
L'obiettivo principale del progetto PRECISESADS è quello di riclassificare gli individui affetti da SAD in cluster molecolari invece che in entità cliniche attraverso la determinazione dei profili molecolari utilizzando diverse tecniche "-omiche".
Gli obiettivi specifici di questo studio trasversale e sottostudio sono:
- Identificare una tassonomia sistemica per i pazienti con SAD producendo i seguenti dati in individui con SAD e controlli: genetica, epigenomica, trascrittomica, citometria a flusso (da cellule mononucleate e polimorfonucleate del sangue periferico (PBMC)), metabolomica e proteomica nel plasma e nelle urine, analisi degli esosomi, sierologia classica (anticorpi e autoanticorpi) e dati clinici.
- Caratterizzare meglio i singoli SAD a livello omico.
- Effettuare analisi di clustering per determinare i gruppi di individui che, diversamente da altri gruppi, condividono specifiche caratteristiche molecolari (medicina di precisione).
- Per identificare l'espressione genica, i profili di metilazione attraverso metodi di deconvoluzione confrontando una miscela di cellule con sottopopolazioni determinate mediante citometria a flusso con cellule separate, profili di citochine e metabolomica plasmatica utilizzando la spettrometria di massa, in un sottostudio di 288 individui.
Il processo di clustering sarà guidato dai dati con l'obiettivo di trovare i cluster più omogenei e differenziati di malattie che separano chiaramente gli individui sulla base di, sierologico, genetico, epigenomico, cellulare (proporzioni cellulari), metabolomico, proteomico (citochine, autoanticorpi) e caratteristiche del trascrittoma e differenziarle dai controlli e da altri gruppi di pazienti.
Nello studio saranno inclusi un totale di 2000 pazienti e 666 controlli.
Tipo di studio
Osservativo
Iscrizione (Effettivo)
649
Contatti e Sedi
Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.
Luoghi di studio
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Vienna, Austria
- Medical University of Vienna
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Leuven, Belgio
- UZ Leuven - KU Leuven, Department of Rheumatology (KU LEUVEN)
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Brest, Francia, 29609
- CHRU de Brest
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Berlin, Germania
- Deutsches Rheuma-Forschungszentrum Berlin (DRFZ)
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Hannover, Germania
- Medizinische Hochschule Hannover
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Milan, Italia
- Fondazione IRCCS Ca Granda Ospedale Maggiore Policlinico (IRCCS)
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Milan, Italia
- UNIMI, Istituto Ortopedico Getano Pini
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Porto, Portogallo
- Centro Hospitalar do Porto
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Barcelona, Spagna
- Hospital Clinic I Provicia- Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS)
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Cordoba, Spagna
- Hospital Universitario Reina Sofía Andaluz de Salud
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Granada, Spagna
- Hospital Universitario San Cecilio Servicio Andaluz de Salud
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Granada, Spagna
- Hospital Virgen de las Nieves Granada
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Granada, Spagna
- Biobanco del Sistema Sanitario Público de Andalucía (SSPA)
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Malaga, Spagna
- Hospital Regional de Málaga Servicio Andaluz de Salud
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Santander, Spagna
- Hospital Universitario Marqués de Valdecilla, Servicio Cántabro de Salud
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Geneve, Svizzera
- Hospitaux Universitaires de Geneve
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Szeged, Ungheria
- University of Szeged
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Criteri di partecipazione
I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
18 anni e precedenti (Adulto, Adulto più anziano)
Accetta volontari sani
No
Sessi ammissibili allo studio
Tutto
Metodo di campionamento
Campione di probabilità
Popolazione di studio
Volontari sani
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Di età pari o superiore a 18 anni al momento del consenso
- Firmato il modulo di consenso informato
Criteri di esclusione:
- Individui che assumono farmaci cronici.
- Individui affetti da qualsiasi condizione infiammatoria, autoimmune, allergica o infettiva e, se possibile, senza una storia di malattia autoimmune, in particolare malattie della tiroide o altre malattie che possono modificare i profili cellulari nel sangue.
- Donne incinte.
Piano di studio
Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Coorte
- Prospettive temporali: Prospettiva
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Espressione genica nel sangue totale
Lasso di tempo: 2 anni
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L'espressione genica sarà eseguita utilizzando microarray di espressione genica commerciali nel sangue totale di tutti i campioni utilizzando la provetta RNA Paxgene.
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2 anni
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Analisi della citometria a flusso per determinare le proporzioni cellulari nella miscela di sangue totale in tutti gli individui.
Lasso di tempo: 24 ore
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9 pannelli ottimizzati di anticorpi verranno utilizzati per determinare le sottopopolazioni cellulari nel sangue periferico (comprese le popolazioni cellulari molto minori).
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24 ore
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Genotipizzazione
Lasso di tempo: 2 anni
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La genotipizzazione verrà eseguita utilizzando un intero array di genomi.
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2 anni
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Determinazione dei metaboliti
Lasso di tempo: 2 anni
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Determinazione dei metaboliti nel plasma e nelle urine mediante Risonanza Magnetica Nucleare
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2 anni
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Isolamento esosomico da plasma e urina
Lasso di tempo: 2 anni
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messa a punto della metodologia per l'isolamento degli esosomi in questi fluidi corporei per l'analisi dell'espressione genica
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2 anni
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Determinazione del profilo delle citochine
Lasso di tempo: 2 anni
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88 diverse citochine saranno valutate con Luminex
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2 anni
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autoanticorpi di routine nel siero
Lasso di tempo: 2 anni
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il set di autoanticorpi sierici sarà determinato in un laboratorio europeo convalidato.
Inoltre, eseguiranno il rilevamento di anticorpi contro piccole frazioni lipidiche (ad es. antifosforilcolina), lupus anticoagulante e proteine del complemento nel plasma.
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2 anni
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Metilazione dell'espressione genica nel sangue totale
Lasso di tempo: 2 anni
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L'analisi della metilazione verrà eseguita utilizzando l'array methylome 450k utilizzando il DNA ottenuto dal sangue totale.
Array di espressione genica di microRNA che utilizzano sangue totale.
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2 anni
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Collaboratori e investigatori
Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.
Collaboratori
Studiare le date dei record
Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
1 dicembre 2014
Completamento primario (Effettivo)
1 ottobre 2017
Completamento dello studio (Effettivo)
1 ottobre 2017
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
22 agosto 2016
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
31 agosto 2016
Primo Inserito (Stima)
7 settembre 2016
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
23 maggio 2018
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
22 maggio 2018
Ultimo verificato
1 aprile 2018
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- PRECISESADS-T
Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)
Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?
Indeciso
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