医療における全ゲノム解読の影響を調査するパイロットプロジェクト

全ゲノム配列決定 (WGS) および全エクソーム配列決定 (WES) サービスは現在、研究現場と臨床現場の両方で医師と患者に利用可能であり、利用されています。 臨床医学の実践において WGS と WES が広く利用可能になり、使用される日が差し迫っています。 ごく近い将来、個々のゲノムの解読が安価で遍在するようになり、患者は健康を改善するための解釈、洞察、アドバイスを医療機関に求めるようになるでしょう。 臨床医学における WGS 情報の使用のための基準と手順の開発は緊急の必要性がありますが、WGS データの完全性と保存、解釈、責任ある臨床統合に関しては数多くの障害があります。 MedSeq™ は、WGS を臨床医学に統合し、その影響を調査するプロセスの開発を目指しています。

私たちは、WGS が 2 つの異なる補完的な状況を含め、さまざまな方法で使用されると考えています。 一般的に健康な患者の場合、医師は WGS の結果を使用して将来の健康リスクについての洞察を導き出し、予防と監視の取り組みに情報を提供します。これは一般ゲノム医療と呼ばれます。 家族歴や疾患の症状を呈する患者の場合、医師はWGSの結果を利用して、問題の疾患に関連することが知られている特定の遺伝子セットを調査します。これを疾患特異的ゲノム医療と呼んでいます。

2012 年の秋から、一般ゲノム医療の使用を評価するために、かかりつけ医 10 名とその健康な中年患者 100 名を登録し、肥大型心筋症 (HCM) または拡張型心筋症 (DCM) を呈する心臓専門医 10 名とその患者 100 名を登録します。 ) 疾患特異的ゲノム医療の使用を評価する。 上記の各モデル内で医師とその患者をランダム化して、WGS を使用しない現在の標準治療と比較して、WGS から得られる臨床的に意味のある情報を受け取ります。

MedSeq™ は、3 つの異なる、しかし高度に連携したプロジェクトで構成されています。 プロジェクト 1 では、医師と患者をプロトコルに登録し、ゲノムの基本原則について医師を教育し、臨床現場でのゲノム情報の使用を安全に監視します。 プロジェクト 2 では、WGS 分析/解釈パイプラインを使用して、このプロトコルで WGS を受けるようにランダム化された各患者に関するゲノム レポートを生成します。 プロジェクト 3 では、登録された医師と患者の好みと動機を調査し、臨床相互作用におけるゲノム情報の流れと利用を評価し、これらの医療行為モデルにおける WGS の使用に関連する理解、行動、医療上の影響および医療費を評価します。

研究の延長段階では、1) アフリカ人またはアフリカ系アメリカ人を自認し、医師が健康であると判断する約 10 ～ 15 人の患者参加者を募集します。 すべてが研究の全ゲノム配列解析部門に配置されます。 彼らは、ランダム化を除いて、従来の MedSeq 参加者と同じアクティビティを受けます。 2) 単一遺伝子所見があると特定された MedSeq プロジェクトの患者参加者に対して、標的を絞った表現型評価を実施します。 私たちは、彼らの医療記録をレビューし、特にそのバリアントを念頭に置いて、バリアントに関連する特徴が研究前に知られていたのか、あるいはさらなる検査や研究の過程での身体検査によって特定されたのかを確認することで、追加の分析を実行する予定です。

この取り組みは、WGS からの情報を医師の患者ケアに統合するための新しい方法を作成し、安全にテストすることにより、臨床医学におけるゲノミクスの利用を大幅に加速します。