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Un projet pilote explorant l'impact du séquençage du génome entier dans les soins de santé

5 août 2024 mis à jour par: Robert C. Green, MD, MPH, Brigham and Women's Hospital

L'étude pilote du projet MedSeq : Intégration du séquençage du génome entier dans la pratique de la médecine clinique

Le projet MedSeq™ cherche à explorer l'impact de l'intégration d'informations provenant de la séquence complète du génome d'un patient dans la pratique de la médecine clinique. Dans la phase d'extension de MedSeq, nous tentons d'augmenter la diversité de nos participants en augmentant le recrutement ciblé de patients africains/afro-américains.

Aperçu de l'étude

Statut

Complété

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

Les services de séquençage du génome entier (WGS) et de séquençage de l'exome entier (WES) sont actuellement disponibles et utilisés par les médecins et leurs patients dans les milieux de recherche et cliniques. La disponibilité et l'utilisation généralisées du WGS et du WES dans la pratique de la médecine clinique sont imminentes. Dans un avenir très proche, le séquençage de génomes individuels sera peu coûteux et omniprésent, et les patients se tourneront vers l'établissement médical pour obtenir des interprétations, des idées et des conseils afin d'améliorer leur santé. L'élaboration de normes et de procédures pour l'utilisation des informations WGS en médecine clinique est un besoin urgent, mais il existe de nombreux obstacles liés à l'intégrité et au stockage des données WGS, à l'interprétation et à l'intégration clinique responsable. MedSeq™ cherche à développer un processus pour intégrer le WGS dans la médecine clinique et à explorer l'impact de cette démarche.

Nous pensons que WGS sera utilisé de plusieurs façons, y compris dans deux situations distinctes et complémentaires. Chez les patients généralement en bonne santé, les médecins utiliseront les résultats du WGS pour mieux comprendre les risques futurs pour la santé et éclairer les efforts de prévention et de surveillance, une catégorie que nous appelons la médecine génomique générale. Chez les patients présentant des antécédents familiaux ou des symptômes d'une maladie, les médecins utiliseront les résultats du WGS pour interroger des ensembles particuliers de gènes connus pour être associés à la maladie en question, une catégorie que nous appelons la médecine génomique spécifique à la maladie.

À compter de l'automne 2012, nous recruterons 10 médecins de soins primaires et 100 de leurs patients d'âge moyen en bonne santé pour évaluer l'utilisation de la médecine génomique générale, et 10 cardiologues et 100 de leurs patients présentant une cardiomyopathie hypertrophique (HCM) ou une cardiomyopathie dilatée (DCM ) pour évaluer l'utilisation de la médecine génomique spécifique à une maladie. Nous randomiserons les médecins et leurs patients dans chacun des modèles ci-dessus pour recevoir des informations cliniquement significatives dérivées du WGS par rapport à la norme de soins actuelle sans l'utilisation du WGS.

MedSeq™ est composé de trois projets distincts mais hautement collaboratifs. Le projet 1 inscrira des médecins et des patients au protocole, éduquera les médecins sur les principes de base de la génomique et surveillera en toute sécurité l'utilisation des informations génomiques dans la pratique clinique. Le projet 2 utilisera un pipeline d'analyse/interprétation WGS pour générer un rapport génomique sur chaque patient randomisé pour recevoir le WGS dans ce protocole. Le projet 3 examinera les préférences et les motivations des médecins et des patients inscrits, évaluera le flux et l'utilisation des informations génomiques dans les interactions cliniques et évaluera la compréhension, le comportement, les conséquences médicales et les coûts de santé associés à l'utilisation du WGS dans ces modèles de pratique médicale.

Dans une phase d'extension de l'étude, nous 1) recruterons environ 10 à 15 patients-participants qui s'identifient comme Africains ou Afro-Américains, dont les médecins jugent qu'ils sont en bonne santé. Tous seront placés dans le bras de séquençage du génome entier de l'étude. Ils subiront les mêmes activités que les participants MedSeq traditionnels, à l'exception de la randomisation. 2) Nous effectuerons une évaluation phénotypique ciblée sur les patients-participants au projet MedSeq qui sont identifiés comme présentant une découverte monogénique. Nous prévoyons d'effectuer une analyse supplémentaire en examinant leurs dossiers médicaux et en examinant spécifiquement leur variante à l'esprit pour voir si les caractéristiques associées aux variantes étaient connues avant l'étude ou ont été identifiées par des tests supplémentaires ou par leur physique au cours de l'étude.

Cette initiative accélérera considérablement l'utilisation de la génomique en médecine clinique en créant et en testant en toute sécurité de nouvelles méthodes d'intégration des informations du WGS dans les soins prodigués aux patients par les médecins.

Type d'étude

Interventionnel

Inscription (Réel)

213

Phase

  • N'est pas applicable

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

  • États-Unis
    • Massachusetts
      • Boston, Massachusetts, États-Unis, 02115
        • Brigham and Women's Hospital

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans à 90 ans (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Oui

La description

Remarque concernant l'âge d'admissibilité :

  • Patients en cardiologie âgés de 18 ans à 90 ans OU
  • Patients de soins primaires âgés de 40 à 65 ans (adultes, personnes âgées)

Critère d'intégration:

Premiers soins

  • Patients adultes généralement en bonne santé (tels que définis par le fournisseur de soins primaires) au Brigham and Women's Hospital âgés de 40 à 65 ans. Tous les patients doivent parler couramment l'anglais.

Cardiologie

  • Les patients du système de santé Partners âgés de 18 ans ou plus avec un diagnostic de cardiomyopathie hypertrophique (HCM) ou de cardiomyopathie dilatée (DCM) et des antécédents familiaux de HCM ou de DCM qui ont déjà eu ou qui sont candidats à un test génétique ciblé de HCM ou de DCM par pratique clinique de routine au sein des Partenaires. Tous les patients doivent parler couramment l'anglais.

Critère d'exclusion:

Premiers soins

  • Les patients qui ne répondent pas aux critères ci-dessus. Patients atteints d'une maladie cardiaque ou d'une maladie débilitante progressive. Les patientes enceintes ou les patientes dont les conjointes/personnes importantes sont enceintes. Patients souffrant d'anxiété ou de dépression clinique non traitée (telle que mesurée par un score HADS (Hospital Anxiety and Depression Scale)> 11 administré lors de la visite d'étude initiale.)

Cardiologie

  • Les patients qui ne répondent pas aux critères ci-dessus. Patients atteints d'une maladie débilitante progressive. Les patientes enceintes ou les patientes dont les conjointes/personnes importantes sont enceintes. Patients souffrant d'anxiété ou de dépression clinique non traitée (telle que mesurée par un score HADS (Hospital Anxiety and Depression Scale)> 11 administré lors de la visite d'étude initiale.)

Phase d'extension - Critères d'inclusion supplémentaires

Partie 1:

  • Critères d'inclusion et d'exclusion ci-dessus PLUS :
  • Inclusion : S'identifier comme Africain ou Afro-Américain.

Partie 2:

Critère d'intégration

  • Les participants MedSeq ont déterminé qu'ils avaient un résultat monogénique

Critère d'exclusion

  • Participants non inscrits au projet MedSeq
  • Participants non identifiés pour avoir une découverte monogénique

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Objectif principal: Recherche sur les services de santé
  • Répartition: Randomisé
  • Modèle interventionnel: Affectation parallèle
  • Masquage: Aucun (étiquette ouverte)

Armes et Interventions

Groupe de participants / Bras
Intervention / Traitement
Expérimental: Antécédents familiaux + séquençage du génome entier
Les médecins et leurs patients reçoivent un rapport génomique et un rapport annoté sur les antécédents familiaux.
Autre: Antécédents familiaux + séquençage du génome entier

Les médecins et leurs patients reçoivent un rapport génomique et un rapport d'antécédents familiaux.

Il y a deux sections dans le rapport génomique :

  1. Le rapport général sur le génome, qui comprend les mutations de la maladie hautement pénétrante, le statut de porteur de la maladie récessive et les associations pharmacogénétiques.
  2. Le supplément de risque cardiaque, qui contient des informations génétiques trouvées dans le génome concernant les maladies cardiaques ou un risque de maladies cardiovasculaires qui peuvent aider à la prise en charge du patient.

Phase d'extension : Expérimental : Antécédents familiaux + Séquençage du génome entier

* Dans l'étude principale, les participants sont randomisés dans le bras expérimental ou autre, dans la phase d'extension de l'étude, tous les participants sont dans le bras expérimental.
Comparateur actif: Antécédents familiaux uniquement
Les médecins et leurs patients reçoivent uniquement un rapport d'antécédents familiaux annoté.
Autre: Antécédents familiaux uniquement
Les médecins et leurs patients reçoivent un rapport d'antécédents familiaux.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Changement d'attitude et de confiance
Délai: Changement à 6 semaines après la divulgation des résultats par rapport à la ligne de base, administré environ 12,5 mois après la ligne de base
Des mesures adaptées (Hall, MA, et al. 2006) ont évalué les attitudes des participants envers l'information génétique, la confiance de leurs médecins et du système médical concernant l'interprétation et l'utilisation de l'information génétique. Des scores plus élevés sur une échelle de 12 à 60 représentent des attitudes plus positives et une plus grande confiance.
Changement à 6 semaines après la divulgation des résultats par rapport à la ligne de base, administré environ 12,5 mois après la ligne de base
Changement dans l'auto-efficacité
Délai: Divulgation des résultats au départ et 6 mois après les résultats (suivi de 6 mois administré environ 17 mois après le départ)
Évalué à l'aide d'une échelle développée pour l'Initiative Multiplex (Kaphingst, K.A., et al. 2012). Des scores plus élevés sur une échelle de 0 à 24 indiquent une plus grande confiance dans les capacités des participants à comprendre l'information génétique.
Divulgation des résultats au départ et 6 mois après les résultats (suivi de 6 mois administré environ 17 mois après le départ)
Modification des préférences pour les informations WGS
Délai: Au départ et 6 semaines après la divulgation (suivi de 6 semaines administré environ 12,5 mois après le départ)
À travers neuf nouveaux éléments d'enquête, les participants ont été interrogés sur leurs préférences pour les types de résultats de tests génétiques qu'ils aimeraient recevoir de leur séquence génomique complète. Les scores sur une échelle de 0 à 9 représentent le changement du nombre de catégories de types de résultats de tests génétiques sur 9 que les participants souhaitaient connaître, du niveau de référence au suivi de 6 semaines.
Au départ et 6 semaines après la divulgation (suivi de 6 semaines administré environ 12,5 mois après le départ)
Changement dans la santé perçue
Délai: Au départ, lors de la visite de divulgation (environ 1 heure après la divulgation des résultats, en moyenne 11 mois après le départ) et 6 mois après la divulgation (suivi de suivi de 6 mois administré environ 17 mois après le départ)
Une mesure à un seul élément a évalué la façon dont les participants percevaient leur propre santé sur une échelle de 1 à 5. Adapté du SF-12 (DeSalvo KB, Qual Life Res, 2006). Des scores plus élevés indiquent des perceptions plus positives de la santé lors du suivi
Au départ, lors de la visite de divulgation (environ 1 heure après la divulgation des résultats, en moyenne 11 mois après le départ) et 6 mois après la divulgation (suivi de suivi de 6 mois administré environ 17 mois après le départ)
Changement dans la prise de décision partagée
Délai: Au départ et 6 semaines après la divulgation (suivi de 6 semaines administré environ 12,5 mois après le départ)
Les changements dans la prise de décision partagée ont été évalués à l'aide d'un seul élément adapté de l'échelle des préférences de contrôle, une mesure conçue pour déterminer le degré de contrôle qu'un individu souhaite assumer lorsque des décisions sont prises concernant un traitement médical. Des scores plus élevés sur une échelle de 1 à 3 indiquent des préférences pour une prise de décision plus équitablement partagée (Heisler et al 2003). Des changements moyens plus élevés au fil du temps indiquent un changement de préférence vers une prise de décision plus équitablement partagée lors du suivi.
Au départ et 6 semaines après la divulgation (suivi de 6 semaines administré environ 12,5 mois après le départ)
Modification de l'intolérance à l'incertitude
Délai: Au départ et 6 mois après la divulgation (suivi de 6 mois administré environ 17 mois après le départ)
Les changements dans la tolérance des participants à l'incertitude ont été évalués à l'aide d'une courte version en 12 points de l'échelle d'intolérance à l'incertitude (Carleton, 2007). La plage totale de l'échelle sommée est de 12 à 60, avec des scores plus élevés indiquant une augmentation des sentiments négatifs à propos de l'incertitude de la ligne de base au suivi.
Au départ et 6 mois après la divulgation (suivi de 6 mois administré environ 17 mois après le départ)
Changement dans l'anxiété générale et la dépression
Délai: Au départ, lors de la visite de divulgation (environ 1 heure après la divulgation des résultats, en moyenne 11 mois après la consultation initiale), 6 semaines après la divulgation et 6 mois après la divulgation (6 semaines de suivi administré environ 12,5 mois et 6 mois de suivi environ 17 mois après la ligne de base)
L'échelle HADS (Hospital Anxiety and Depression Scale) a été administrée au moyen d'un sondage. Il s'agit d'une échelle validée conçue pour évaluer le niveau de dépression et d'anxiété des participants grâce à des questions de type Likert. Les plages totales pour chaque sous-échelle additionnée, anxiété et dépression, sont de 0 à 21. Tout participant obtenant un score > 14 sur la sous-échelle d'anxiété ou > 16 sur la sous-échelle de dépression a été contacté par le personnel de l'étude pour évaluation. Des scores plus élevés indiquent une augmentation de l'anxiété ou de la dépression entre le début et le suivi.
Au départ, lors de la visite de divulgation (environ 1 heure après la divulgation des résultats, en moyenne 11 mois après la consultation initiale), 6 semaines après la divulgation et 6 mois après la divulgation (6 semaines de suivi administré environ 12,5 mois et 6 mois de suivi environ 17 mois après la ligne de base)
Changement dans les comportements de santé
Délai: 6 semaines après la divulgation et 6 mois après la divulgation (suivi de 6 semaines administré environ 12,5 mois et suivi de 6 mois environ 17 mois après la ligne de base)
Nouveaux éléments qui demandaient si les participants avaient modifié leur consommation de vitamines, de suppléments, de médicaments, de régime alimentaire, d'exercice ou d'"autres" comportements de santé. Les chiffres et les pourcentages représentent les participants qui ont signalé des changements de comportement liés à la santé.
6 semaines après la divulgation et 6 mois après la divulgation (suivi de 6 semaines administré environ 12,5 mois et suivi de 6 mois environ 17 mois après la ligne de base)
Partage d'information
Délai: Lors de la visite de divulgation (environ 1 heure après la divulgation des résultats, en moyenne 11 mois après la consultation de référence) et 6 mois après la divulgation (environ 17 mois après la consultation de référence)
Le partage de l'information a été évalué en demandant aux patients s'ils avaient l'intention de partager les résultats avec d'autres (à la fin de la visite de divulgation) et s'ils avaient partagé leurs résultats avec d'autres (6 mois après la divulgation) adapté de l'enquête sur les tendances nationales de l'information sur la santé (HINTS ).
Lors de la visite de divulgation (environ 1 heure après la divulgation des résultats, en moyenne 11 mois après la consultation de référence) et 6 mois après la divulgation (environ 17 mois après la consultation de référence)
Changements dans la littératie génomique
Délai: Évaluation de la littératie génomique au départ et 6 mois après la divulgation (environ 17 mois après le départ)
Les changements dans la littératie génomique des participants ont été mesurés à l'aide d'une mesure en 11 items adaptée de l'étude ClinSeq (Kaphingst K.A. et al. 2012) administrée au départ et 6 mois après la divulgation. Les éléments sont marqués comme corrects (1) ou incorrects (0) et additionnés pour une plage d'échelle totale de 0 à 11, les scores les plus élevés indiquant une littératie génomique plus élevée.
Évaluation de la littératie génomique au départ et 6 mois après la divulgation (environ 17 mois après le départ)
Changements dans l'utilisation des soins de santé
Délai: 6 mois avant la divulgation et 6 mois après la divulgation (environ 17 mois après la ligne de base) et 5 ans après la divulgation
L'utilisation des soins de santé par les participants a été évaluée grâce à une combinaison d'examens de dossiers médicaux et de mesures nouvelles et adaptées du système de surveillance des facteurs de risque comportementaux (BRFSS). Les changements sont évalués en comparant le nombre de services et de procédures reçus dans les 6 mois suivant la divulgation au nombre de services et de procédures reçus dans les 6 mois précédant la divulgation.
6 mois avant la divulgation et 6 mois après la divulgation (environ 17 mois après la ligne de base) et 5 ans après la divulgation
Modification de l'utilité perçue
Délai: Au départ et 6 mois après la divulgation (environ 17 mois après le départ)
Un nouvel élément d'enquête demandait aux participants d'évaluer l'utilité des résultats du séquençage du génome entier pour la gestion de la santé sur une échelle de 1 à 10. Les scores à 6 mois ont été comparés aux scores au départ.
Au départ et 6 mois après la divulgation (environ 17 mois après le départ)

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Impact psychologique
Délai: 6 semaines après la divulgation et 6 mois après la divulgation (suivi de 6 semaines administré environ 12,5 mois et suivi de 6 mois environ 17 mois après la ligne de base)
L'impact psychologique a été évalué par une version modifiée du questionnaire MICRA (Multidimensional Impact of Cancer Risk Assessment). Des scores plus élevés indiquaient plus de détresse liée aux résultats de l'étude.
6 semaines après la divulgation et 6 mois après la divulgation (suivi de 6 semaines administré environ 12,5 mois et suivi de 6 mois environ 17 mois après la ligne de base)
Regret décisionnel
Délai: Lors de la visite post-divulgation (environ 1 heure après la divulgation des résultats, en moyenne 11 mois après la consultation de référence), 6 semaines après la divulgation et 6 mois après la divulgation (suivi de 6 semaines environ 12,5 mois et 6 mois de suivi environ 17 mois après la ligne de base)
Satisfaction des participants quant à leur décision de participer au projet MedSeq à travers une échelle validée en 5 items (Brehaut 2003). Score moyen calculé après avoir inversé les scores de 2 éléments formulés négativement et converti le score dans une plage de 0 à 100 en soustrayant 1 et en multipliant par 25. Des scores plus élevés indiquent un plus grand regret.
Lors de la visite post-divulgation (environ 1 heure après la divulgation des résultats, en moyenne 11 mois après la consultation de référence), 6 semaines après la divulgation et 6 mois après la divulgation (suivi de 6 semaines environ 12,5 mois et 6 mois de suivi environ 17 mois après la ligne de base)
Compréhension
Délai: Lors de la visite post-divulgation (environ 1 heure après la divulgation des résultats, en moyenne 11 mois après la consultation de référence), 6 semaines après la divulgation et 6 mois après la divulgation (suivi de 6 semaines environ 12,5 mois et 6 mois de suivi environ 17 mois après la ligne de base)
Un nouvel élément a évalué la compréhension subjective des participants des résultats de leur étude sur une échelle de 1 à 5, où des scores plus élevés indiquent une meilleure compréhension subjective.
Lors de la visite post-divulgation (environ 1 heure après la divulgation des résultats, en moyenne 11 mois après la consultation de référence), 6 semaines après la divulgation et 6 mois après la divulgation (suivi de 6 semaines environ 12,5 mois et 6 mois de suivi environ 17 mois après la ligne de base)
Attentes
Délai: Ligne de base
De nouveaux éléments d'enquête demandaient aux participants si les résultats de leurs tests génétiques seraient utiles ou non pour des raisons spécifiques. Les options de réponse étaient « non », « probablement pas », « probablement oui » et « oui ». Les réponses « probablement oui » et « oui » ont été combinées pour simplifier la présentation des données.
Ligne de base

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Brigham and Women's Hospital

Collaborateurs

Baylor College of Medicine
Duke University
National Human Genome Research Institute (NHGRI)

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Robert C Green, MD, MPH, Brigham and Women's Hospital

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Liens utiles

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

1 décembre 2011

Achèvement primaire (Réel)

4 novembre 2016

Achèvement de l'étude (Réel)

2 janvier 2021

Dates d'inscription aux études

Première soumission

17 août 2012

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

28 novembre 2012

Première publication (Estimé)

29 novembre 2012

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

27 août 2024

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

5 août 2024

Dernière vérification

1 août 2024

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • MedSeq™
  • U01HG006500 (Subvention/contrat des NIH des États-Unis)

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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