Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Pilotní projekt zkoumající dopad sekvenování celého genomu ve zdravotnictví

1. dubna 2024 aktualizováno: Robert C. Green, MD, MPH, Brigham and Women's Hospital

Pilotní studie projektu MedSeq: Integrace sekvenování celého genomu do praxe klinické medicíny

Projekt MedSeq™ se snaží prozkoumat dopad začlenění informací z celé genomové sekvence pacienta do praxe klinické medicíny. V rozšiřující fázi MedSeq se snažíme zvýšit naši rozmanitost účastníků zvýšením cíleného zápisu pacientů z Afriky/Afriky.

Přehled studie

Detailní popis

Služby sekvenování celého genomu (WGS) a sekvenování celého exomu (WES) jsou v současné době dostupné lékařům a jejich pacientům a jsou využívány jak ve výzkumu, tak v klinickém prostředí. Široká dostupnost a využití WGS a WES v praxi klinické medicíny se blíží. Ve velmi blízké budoucnosti bude sekvenování jednotlivých genomů levné a všudypřítomné a pacienti budou v lékařském zařízení hledat interpretace, náhled a rady ke zlepšení svého zdraví. Vývoj standardů a postupů pro použití informací WGS v klinické medicíně je naléhavou potřebou, ale existuje řada překážek souvisejících s integritou a ukládáním dat WGS, interpretací a odpovědnou klinickou integrací. MedSeq™ se snaží vyvinout proces pro integraci WGS do klinické medicíny a prozkoumat dopady toho.

Věříme, že WGS bude využíván mnoha způsoby, včetně dvou odlišných a vzájemně se doplňujících situací. U obecně zdravých pacientů budou lékaři používat výsledky WGS k odvození náhledu na budoucí zdravotní rizika a informují o úsilí o prevenci a sledování, což je kategorie, kterou nazýváme všeobecná genomická medicína. U pacientů s rodinnou anamnézou nebo symptomy nemoci budou lékaři používat výsledky WGS k dotazování konkrétních souborů genů, o nichž je známo, že jsou spojeny s danou nemocí, kategorii, kterou nazýváme jako Genomická medicína specifická pro onemocnění.

Počínaje podzimem 2012 zaregistrujeme 10 lékařů primární péče a 100 jejich zdravých pacientů středního věku, aby zhodnotili používání Všeobecné genomické medicíny, a 10 kardiologů a 100 jejich pacientů s hypertrofickou kardiomyopatií (HCM) nebo dilatační kardiomyopatií (DCM). ) vyhodnotit použití Genomické medicíny specifické pro onemocnění. Budeme randomizovat lékaře a jejich pacienty v každém z výše uvedených modelů, aby obdrželi klinicky smysluplné informace odvozené z WGS oproti současnému standardu péče bez použití WGS.

MedSeq™ se skládá ze tří odlišných, ale vysoce spolupracujících projektů. Projekt 1 zařadí lékaře a pacienty do protokolu, vzdělá lékaře o základních genomických principech a bezpečně monitoruje využití genomických informací v klinické praxi. Projekt 2 použije analytický/interpretační kanál WGS ke generování zprávy o genomu každého pacienta randomizovaného k přijetí WGS v tomto protokolu. Projekt 3 prozkoumá preference a motivace lékařů a zapsaných pacientů, vyhodnotí tok a využití genomických informací v rámci klinických interakcí a zhodnotí porozumění, chování, lékařské důsledky a náklady na zdravotní péči spojené s používáním WGS v těchto modelech lékařské praxe.

V prodloužené fázi studie 1) přijmeme přibližně 10-15 pacientů-účastníků, kteří se sami identifikují jako Afroameričané nebo Afroameričané, jejichž lékaři považují za zdravé. Všechny budou umístěny do celého genomového sekvenačního ramene studie. Podstoupí stejné aktivity jako tradiční účastníci MedSeq s výjimkou randomizace. 2) Provedeme cílené posouzení fenotypu u pacientů-účastníků projektu MedSeq, u kterých bude identifikován monogenní nález. Plánujeme provést další analýzu přezkoumáním jejich lékařských záznamů a konkrétním pohledem na jejich variantu, abychom zjistili, zda rysy spojené s variantami byly známy před studií nebo byly identifikovány dalším testováním nebo jejich fyzickými vlastnostmi v průběhu studie.

Tato iniciativa výrazně urychlí využití genomiky v klinické medicíně vytvořením a bezpečným testováním nových metod pro integraci informací z WGS do lékařské péče o pacienty.

Typ studie

Intervenční

Zápis (Aktuální)

213

Fáze

  • Nelze použít

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní místa

    • Massachusetts
      • Boston, Massachusetts, Spojené státy, 02115
        • Brigham and Women's Hospital

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let až 90 let (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ano

Popis

Poznámka k věku:

  • Kardiologičtí pacienti 18 let až 90 let NEBO
  • Pacienti primární péče ve věku 40 až 65 let (dospělí, senioři)

Kritéria pro zařazení:

Primární péče

  • Obecně zdraví (podle definice poskytovatele primární péče) dospělí pacienti v Brigham and Women's Hospital ve věku 40–65 let. Všichni pacienti musí mluvit plynně anglicky.

Kardiologie

  • Pacienti ve zdravotnickém systému Partners, kteří jsou starší 18 let s diagnózou hypertrofické kardiomyopatie (HCM) nebo dilatační kardiomyopatie (DCM) a rodinnou anamnézou HCM nebo DCM, kteří dříve měli nebo jsou kandidáty na cílené genetické testování HCM nebo DCM prostřednictvím rutinní klinická praxe v rámci Partners. Všichni pacienti musí mluvit plynně anglicky.

Kritéria vyloučení:

Primární péče

  • Pacienti, kteří nesplňují výše uvedená kritéria. Pacienti se srdečním onemocněním nebo progresivním vysilujícím onemocněním. Těhotné pacientky nebo pacientky, jejichž manželé/manželky/významné další osoby jsou těhotné. Pacienti s neléčenou klinickou úzkostí nebo depresí (měřeno pomocí skóre Hospital Anxiety and Depression Scale (HADS) > 11 podaných při návštěvě základní studie.)

Kardiologie

  • Pacienti, kteří nesplňují výše uvedená kritéria. Pacienti s progresivním vysilujícím onemocněním. Těhotné pacientky nebo pacientky, jejichž manželé/manželky/významné další osoby jsou těhotné. Pacienti s neléčenou klinickou úzkostí nebo depresí (měřeno pomocí skóre Hospital Anxiety and Depression Scale (HADS) > 11 podaných při návštěvě základní studie.)

Fáze rozšíření – další kritéria zahrnutí

Část 1:

  • Nad kritérii pro zařazení a vyloučení PLUS:
  • Zahrnutí: Identifikujte se jako Afričan nebo Afroameričan.

Část 2:

Kritéria pro zařazení

  • Účastníci MedSeq určili monogenní nález

Kritéria vyloučení

  • Účastníci, kteří se dříve nezapsali do projektu MedSeq
  • U účastníků nebyl identifikován monogenní nález

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Primární účel: Výzkum zdravotnických služeb
  • Přidělení: Randomizované
  • Intervenční model: Paralelní přiřazení
  • Maskování: Žádné (otevřený štítek)

Zbraně a zásahy

Skupina účastníků / Arm
Intervence / Léčba
Experimentální: Rodinná anamnéza + sekvenování celého genomu
Lékaři a jejich pacienti dostávají zprávu o genomu a komentovanou zprávu o rodinné anamnéze.

Lékaři a jejich pacienti obdrží zprávu o genomu a zprávu o rodinné anamnéze.

Zpráva o genomu má dvě části:

  1. Zpráva o obecném genomu, která zahrnuje vysoce penetrantní mutace onemocnění, stav přenašeče pro recesivní onemocnění a farmakogenetické asociace.
  2. Cardiac Risk Supplement, které obsahují genetické informace nalezené v genomu týkající se srdečních onemocnění nebo rizika kardiovaskulárních onemocnění, které mohou pomoci s péčí o pacienta.

Fáze rozšíření: Experimentální: Rodinná anamnéza + sekvenování celého genomu

*V hlavní studii jsou účastníci randomizováni do experimentální nebo jiné větve, ve fázi prodloužení studie jsou všichni účastníci v experimentální větvi.

Aktivní komparátor: Pouze rodinná historie
Lékaři a jejich pacienti obdrží pouze komentovanou zprávu o rodinné anamnéze.
Lékaři a jejich pacienti obdrží zprávu o rodinné anamnéze.

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Změna v postojích a důvěře
Časové okno: Změna 6 týdnů po zveřejnění výsledků ve srovnání s výchozí hodnotou, podávaná přibližně 12,5 měsíce po výchozí hodnotě
Upravená opatření (Hall, MA, et al. 2006) hodnotila postoje účastníků ke genetickým informacím, důvěru jejich lékařů a lékařského systému, pokud jde o interpretaci a použití genetické informace. Vyšší skóre na škále 12-60 představuje pozitivnější postoje a větší důvěru.
Změna 6 týdnů po zveřejnění výsledků ve srovnání s výchozí hodnotou, podávaná přibližně 12,5 měsíce po výchozí hodnotě
Změna vlastní účinnosti
Časové okno: Výchozí stav a 6 měsíců po zveřejnění výsledků (6měsíční sledování prováděné přibližně 17 měsíců po výchozím stavu)
Posouzeno pomocí škály vyvinuté pro Multiplex Initiative (Kaphingst, K.A., et al. 2012). Vyšší skóre na škále 0-24 značí větší důvěru ve schopnosti účastníků porozumět genetické informaci.
Výchozí stav a 6 měsíců po zveřejnění výsledků (6měsíční sledování prováděné přibližně 17 měsíců po výchozím stavu)
Změna v předvolbách pro informace WGS
Časové okno: Výchozí stav a 6 týdnů po zveřejnění informací (6 týdnů sledování podávané přibližně 12,5 měsíce po výchozím stavu)
Prostřednictvím devíti nových položek průzkumu byli účastníci dotázáni na jejich preference ohledně typů výsledků genetického testování, které by chtěli získat z celé své genomové sekvence. Skóre na stupnici 0–9 představuje změnu v počtu kategorií typů výsledků genetického testování z 9, o kterých se účastníci chtěli dozvědět od základního stavu po 6týdenní sledování.
Výchozí stav a 6 týdnů po zveřejnění informací (6 týdnů sledování podávané přibližně 12,5 měsíce po výchozím stavu)
Změna ve vnímání zdraví
Časové okno: Výchozí stav, při prohlídce (asi 1 hodinu po zveřejnění výsledků, v průměru 11 měsíců po výchozí hodnotě) a 6 měsíců po zveřejnění (6měsíční následné sledování prováděné přibližně 17 měsíců po výchozí hodnotě)
Jednopoložkové měření hodnotilo, jak účastníci vnímají své vlastní zdraví na stupnici 1-5. Převzato z SF-12 (DeSalvo KB, Qual Life Res, 2006). Vyšší skóre ukazuje na pozitivnější vnímání zdraví při sledování
Výchozí stav, při prohlídce (asi 1 hodinu po zveřejnění výsledků, v průměru 11 měsíců po výchozí hodnotě) a 6 měsíců po zveřejnění (6měsíční následné sledování prováděné přibližně 17 měsíců po výchozí hodnotě)
Změna ve sdíleném rozhodování
Časové okno: Výchozí stav a 6 týdnů po zveřejnění informací (6 týdnů sledování podávané přibližně 12,5 měsíce po výchozím stavu)
Změny ve sdíleném rozhodování byly hodnoceny pomocí jediné položky upravené ze škály preferencí kontroly, což je opatření určené ke zjištění míry kontroly, kterou chce jednotlivec převzít, když se rozhoduje o lékařském ošetření. Vyšší skóre na škále 1-3 indikují preference směrem k rovnoměrnějšímu sdílenému rozhodování (Heisler et al 2003). Vyšší průměrné změny v průběhu času naznačují změnu preference směrem k rovnoměrnějšímu sdílení rozhodování při sledování.
Výchozí stav a 6 týdnů po zveřejnění informací (6 týdnů sledování podávané přibližně 12,5 měsíce po výchozím stavu)
Změna v nesnášenlivosti nejistoty
Časové okno: Výchozí stav a 6 měsíců po zveřejnění (6měsíční sledování prováděné přibližně 17 měsíců po výchozím stavu)
Změny v toleranci účastníků k nejistotě byly hodnoceny prostřednictvím krátké 12položkové verze škály intolerance nejistoty (Carleton, 2007). Celkový rozsah součtu škály je 12–60, přičemž vyšší skóre ukazuje na zvýšené negativní pocity ohledně nejistoty od výchozího stavu až po sledování.
Výchozí stav a 6 měsíců po zveřejnění (6měsíční sledování prováděné přibližně 17 měsíců po výchozím stavu)
Změna celkové úzkosti a deprese
Časové okno: Výchozí stav, při prohlídce (přibližně 1 hodinu po zveřejnění výsledků, v průměru 11 měsíců po výchozí hodnotě), 6 týdnů po zveřejnění a 6 měsíců po zveřejnění (6 týdnů. sledování prováděné přibližně 12,5 měsíců a 6 měs. sledování cca 17 měs. po základní linii)
Škála nemocniční úzkosti a deprese (HADS) byla administrována prostřednictvím průzkumu. Toto je ověřená škála navržená k posouzení úrovně deprese a úzkosti účastníků prostřednictvím otázek typu Likert. Celkové rozmezí pro každou sčítanou subškálu, úzkost a depresi, je 0-21. Každý účastník, který dosáhl skóre >14 na subškále úzkosti nebo >16 na subškále deprese, byl kontaktován pracovníky studie za účelem vyhodnocení. Vyšší skóre indikují zvýšenou úzkost nebo depresi od výchozího stavu po sledování.
Výchozí stav, při prohlídce (přibližně 1 hodinu po zveřejnění výsledků, v průměru 11 měsíců po výchozí hodnotě), 6 týdnů po zveřejnění a 6 měsíců po zveřejnění (6 týdnů. sledování prováděné přibližně 12,5 měsíců a 6 měs. sledování cca 17 měs. po základní linii)
Změna zdravotního chování
Časové okno: 6 týdnů po odhalení a 6 měsíců po odhalení (6 týdnů sledování prováděné přibližně 12,5 měs. a 6 měsíců sledování přibližně 17 měs. po výchozím stavu)
Nové položky, které se zeptaly, zda účastníci změnili užívání vitamínů, užívání doplňků, užívání léků, dietu, cvičení nebo „jiné“ zdravotní chování. Počty a procenta představují účastníky, kteří nahlásili jakékoli změny zdravotního chování.
6 týdnů po odhalení a 6 měsíců po odhalení (6 týdnů sledování prováděné přibližně 12,5 měs. a 6 měsíců sledování přibližně 17 měs. po výchozím stavu)
Sdílení informací
Časové okno: Při prohlídce (asi 1 hodinu po zveřejnění výsledků, v průměru 11 měsíců po výchozí hodnotě) a 6 měsíců po zveřejnění (přibližně 17 měsíců po výchozí hodnotě)
Sdílení informací bylo hodnoceno dotazem pacientů, zda mají v úmyslu podělit se o výsledky s ostatními (na konci informační návštěvy) a zda své výsledky sdíleli s ostatními (6 měsíců po zveřejnění) upraveného z průzkumu zdravotnických informací National Trends Survey (HINTS). ).
Při prohlídce (asi 1 hodinu po zveřejnění výsledků, v průměru 11 měsíců po výchozí hodnotě) a 6 měsíců po zveřejnění (přibližně 17 měsíců po výchozí hodnotě)
Změny v genomické gramotnosti
Časové okno: Posouzení genomické gramotnosti na začátku a 6 měsíců po zveřejnění (přibližně 17 měsíců po výchozím stavu)
Změny v genomické gramotnosti účastníků byly měřeny pomocí 11-položkového měření upraveného ze studie ClinSeq (Kaphingst K.A. et al. 2012) podávané na začátku a 6 měsíců po zveřejnění. Položky jsou označeny jako správné (1) nebo nesprávné (0) a sečteny pro celkový rozsah stupnice od 0 do 11, přičemž vyšší skóre značí vyšší genomickou gramotnost.
Posouzení genomické gramotnosti na začátku a 6 měsíců po zveřejnění (přibližně 17 měsíců po výchozím stavu)
Změny ve využívání zdravotní péče
Časové okno: 6 měsíců před zveřejněním a 6 měsíců po zveřejnění (přibližně 17 měsíců po výchozím stavu) a 5 let po zveřejnění
Využití zdravotní péče účastníky bylo hodnoceno prostřednictvím kombinace přezkoumání lékařských záznamů a nových a přizpůsobených opatření ze systému sledování rizikových faktorů chování (BRFSS). Změny se posuzují porovnáním počtu služeb a postupů přijatých během 6 měsíců po zveřejnění s počtem služeb a postupů přijatých během 6 měsíců před zveřejněním.
6 měsíců před zveřejněním a 6 měsíců po zveřejnění (přibližně 17 měsíců po výchozím stavu) a 5 let po zveřejnění
Změna ve vnímané utilitě
Časové okno: Na začátku a 6 měsíců po zveřejnění (přibližně 17 měsíců po výchozím stavu)
Nová položka průzkumu požádala účastníky, aby ohodnotili užitečnost výsledků sekvenování celého genomu pro řízení zdraví na stupnici 1-10. Skóre po 6 měsících bylo porovnáno se skóre na začátku.
Na začátku a 6 měsíců po zveřejnění (přibližně 17 měsíců po výchozím stavu)

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Psychologický dopad
Časové okno: 6 týdnů po odhalení a 6 měsíců po odhalení (6 týdnů sledování prováděné přibližně 12,5 měs. a 6 měsíců sledování přibližně 17 měs. po výchozím stavu)
Psychologický dopad byl hodnocen pomocí upravené verze dotazníku Multidimenzionálního hodnocení dopadu rakoviny (MICRA). Vyšší skóre naznačovalo větší úzkost související s výsledky studie.
6 týdnů po odhalení a 6 měsíců po odhalení (6 týdnů sledování prováděné přibližně 12,5 měs. a 6 měsíců sledování přibližně 17 měs. po výchozím stavu)
Rozhodovací lítost
Časové okno: Při návštěvě po zveřejnění (asi 1 hodinu po zveřejnění výsledků, v průměru 11 měsíců po výchozí hodnotě), 6 týdnů po zveřejnění a 6 měsíců po zveřejnění (6 týdnů sledování přibližně 12,5 měs. a 6 měsíců sledování cca 17 měsíců po základní linii)
Spokojenost účastníků s jejich rozhodnutím zúčastnit se projektu MedSeq prostřednictvím 5-položkové validované škály (Brehaut 2003). Průměrné skóre vypočtené po obrácení skóre 2 negativně formulovaných položek a převedení skóre na rozsah od 0 do 100 odečtením 1 a vynásobením 25. Vyšší skóre znamená větší lítost.
Při návštěvě po zveřejnění (asi 1 hodinu po zveřejnění výsledků, v průměru 11 měsíců po výchozí hodnotě), 6 týdnů po zveřejnění a 6 měsíců po zveřejnění (6 týdnů sledování přibližně 12,5 měs. a 6 měsíců sledování cca 17 měsíců po základní linii)
Porozumění
Časové okno: Při návštěvě po zveřejnění (asi 1 hodinu po zveřejnění výsledků, v průměru 11 měsíců po výchozí hodnotě), 6 týdnů po zveřejnění a 6 měsíců po zveřejnění (6 týdnů sledování přibližně 12,5 měs. a 6 měsíců sledování cca 17 měsíců po základní linii)
Nová položka hodnotila subjektivní porozumění účastníků výsledkům jejich studie na stupnici 1-5, kde vyšší skóre značí větší subjektivní porozumění.
Při návštěvě po zveřejnění (asi 1 hodinu po zveřejnění výsledků, v průměru 11 měsíců po výchozí hodnotě), 6 týdnů po zveřejnění a 6 měsíců po zveřejnění (6 týdnů sledování přibližně 12,5 měs. a 6 měsíců sledování cca 17 měsíců po základní linii)
Očekávání
Časové okno: Základní linie
Nové položky průzkumu se účastníků dotazovaly na to, zda by výsledky jejich genetických testů byly užitečné ze specifických důvodů. Možnosti odpovědi byly „ne“, „pravděpodobně ne“, „pravděpodobně ano“ a „ano“. Odpovědi „pravděpodobně ano“ a „ano“ byly zkombinovány, aby se zjednodušila prezentace dat.
Základní linie

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Robert C Green, MD, MPH, Brigham and Women's Hospital

Publikace a užitečné odkazy

Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.

Obecné publikace

Užitečné odkazy

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

1. prosince 2011

Primární dokončení (Aktuální)

4. listopadu 2016

Dokončení studie (Aktuální)

2. ledna 2021

Termíny zápisu do studia

První předloženo

17. srpna 2012

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

28. listopadu 2012

První zveřejněno (Odhadovaný)

29. listopadu 2012

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

23. dubna 2024

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

1. dubna 2024

Naposledy ověřeno

1. dubna 2024

Více informací

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

3
Předplatit