Ein Pilotprojekt zur Untersuchung der Auswirkungen der Sequenzierung des gesamten Genoms im Gesundheitswesen

Dienstleistungen zur Sequenzierung des gesamten Genoms (WGS) und zur Sequenzierung des gesamten Exoms (WES) stehen Ärzten und ihren Patienten derzeit sowohl in der Forschung als auch im klinischen Umfeld zur Verfügung und werden von ihnen genutzt. Die weitverbreitete Verfügbarkeit und Nutzung von WGS und WES in der Praxis der klinischen Medizin steht unmittelbar bevor. In naher Zukunft wird die Sequenzierung einzelner Genome kostengünstig und allgegenwärtig sein, und Patienten werden sich an die medizinische Einrichtung wenden, um Interpretationen, Erkenntnisse und Ratschläge zur Verbesserung ihrer Gesundheit zu erhalten. Die Entwicklung von Standards und Verfahren für die Verwendung von WGS-Informationen in der klinischen Medizin ist dringend erforderlich, es gibt jedoch zahlreiche Hindernisse im Zusammenhang mit der Integrität und Speicherung von WGS-Daten, der Interpretation und der verantwortungsvollen klinischen Integration. Ziel von MedSeq™ ist es, einen Prozess zur Integration von WGS in die klinische Medizin zu entwickeln und die Auswirkungen dieses Vorgehens zu untersuchen.

Wir glauben, dass WGS auf vielfältige Weise eingesetzt werden wird, auch in zwei unterschiedlichen und sich ergänzenden Situationen. Bei allgemein gesunden Patienten werden Ärzte die Ergebnisse der WGS nutzen, um Erkenntnisse über zukünftige Gesundheitsrisiken abzuleiten und Präventions- und Überwachungsbemühungen zu unterstützen, eine Kategorie, die wir als Allgemeine Genomische Medizin bezeichnen. Bei Patienten mit einer Familienanamnese oder Symptomen einer Krankheit nutzen Ärzte die Ergebnisse der WGS, um bestimmte Gensätze abzufragen, von denen bekannt ist, dass sie mit der betreffenden Krankheit assoziiert sind. Diese Kategorie bezeichnen wir als krankheitsspezifische genomische Medizin.

Ab Herbst 2012 werden wir 10 Hausärzte und 100 ihrer gesunden Patienten mittleren Alters einschreiben, um den Einsatz der Allgemeinen Genommedizin zu bewerten, sowie 10 Kardiologen und 100 ihrer Patienten, die an hypertropher Kardiomyopathie (HCM) oder dilatativer Kardiomyopathie (DCM) leiden ), um den Einsatz der krankheitsspezifischen genomischen Medizin zu bewerten. Wir werden Ärzte und ihre Patienten innerhalb jedes der oben genannten Modelle randomisieren, um klinisch bedeutsame Informationen zu erhalten, die aus WGS im Vergleich zum aktuellen Pflegestandard ohne Verwendung von WGS abgeleitet wurden.

MedSeq™ besteht aus drei unterschiedlichen, aber stark kollaborativen Projekten. Projekt 1 wird Ärzte und Patienten in das Protokoll aufnehmen, die Ärzte über grundlegende genomische Prinzipien aufklären und die Verwendung genomischer Informationen in der klinischen Praxis sicher überwachen. Projekt 2 wird eine WGS-Analyse-/Interpretationspipeline verwenden, um einen Genombericht für jeden Patienten zu erstellen, der nach dem Zufallsprinzip WGS in diesem Protokoll erhalten soll. Projekt 3 wird die Präferenzen und Motivationen der eingeschriebenen Ärzte und Patienten untersuchen, den Fluss und die Nutzung genomischer Informationen innerhalb der klinischen Interaktionen bewerten und das Verständnis, das Verhalten, die medizinischen Konsequenzen und die Gesundheitskosten bewerten, die mit der Verwendung von WGS in diesen Modellen der medizinischen Praxis verbunden sind.

In einer Erweiterungsphase der Studie werden wir 1) etwa 10–15 Patienten rekrutieren, die sich selbst als Afroamerikaner oder Afroamerikaner identifizieren und deren Ärzte sie für gesund halten. Alle werden in den gesamten Genomsequenzierungsarm der Studie eingeordnet. Bis auf die Randomisierung durchlaufen sie dieselben Aktivitäten wie herkömmliche MedSeq-Teilnehmer. 2) Wir werden eine gezielte Phänotypbewertung bei Patienten des MedSeq-Projekts durchführen, bei denen ein monogener Befund festgestellt wurde. Wir planen, zusätzliche Analysen durchzuführen, indem wir ihre Krankenakten überprüfen und speziell im Hinblick auf ihre Variante untersuchen, um zu sehen, ob mit den Varianten verbundene Merkmale vor der Studie bekannt waren oder durch weitere Tests oder durch ihre körperliche Untersuchung im Verlauf der Studie identifiziert wurden.

Diese Initiative wird den Einsatz der Genomik in der klinischen Medizin erheblich beschleunigen, indem neuartige Methoden zur Integration von WGS-Informationen in die ärztliche Patientenversorgung entwickelt und sicher getestet werden.