SynapDx 自閉症遺伝子発現解析研究 (STORY) (STORY)
SynapDx 自閉症スペクトラム障害の遺伝子発現解析研究
この研究では、小児発達評価センターに紹介された生後18か月以上60か月未満の約880人の子供を前向きに登録する予定です。 登録した児童は、RNA遺伝子発現分析のため、また必要に応じて代謝物、脂質、DNA分析のために採血され、ASDの診断の有無を決定するための臨床評価を受けることになる。
この研究の主な目的は次のとおりです。
- 分類と自閉症スペクトラム障害（ASD）の有無の臨床評価との一致を最大化するために、血液RNA遺伝子発現パターンを分類するアルゴリズムを開発する。
この研究の二次的な目的は次のとおりです。
- 分類とASDの有無の臨床評価との間の一致を最大化するような方法で、血漿代謝物および/または脂質プロファイルを分類するアルゴリズムを開発すること。
- 小児からなる別の集団における血漿代謝物および/または脂質プロファイル分類アルゴリズムの臨床感度と臨床的感度と特異性を前向きに評価するために、発達障害 (DD) の可能性について発達評価クリニックを受診しました。
- 遺伝子発現シグネチャー、代謝物および/または脂質シグネチャー、および染色体マイクロアレイ解析 (CMA) またはゲノムのタンパク質コード領域の配列決定によって検出される ASD 関連の遺伝的変異の存在のさまざまな組み合わせの臨床感度と特異性を評価します。
調査の概要
状態
条件
詳細な説明
この研究の主な目的は、ASD を示す遺伝子発現サインを定義し、その臨床感度と特異性を確立することです。 ASD の臨床医の診断は、参照標準機器として DSM-5 を使用して行われます。 広く使用されている診断手段である自閉症診断観察スケジュール (ADOS-2) は、ASD と診断された子供の臨床評価の典型的な構成要素であり、この評価は研究参加者全員に対して実施されます。 この研究の第 2 の目的は、(1) ASD を示す代謝産物および脂質サインを定義し、それらの臨床感度と特異性を確立すること、および (2) 遺伝子発現サイン、代謝産物および/または脂質サインのさまざまな組み合わせの臨床感度と特異性を決定することです。 CMAおよびゲノムのタンパク質コード領域の配列決定によって検出されるASD関連の遺伝的変異の存在
分析: 分析の詳細は統計分析計画 (SAP) で指定されます。これには、外れ値、欠損データ、サイト間の差異を処理する手順が含まれます。 SAP は、検証セットの盲検化を解除する前に、主任研究者 (PI) の委員会によって審査および承認されます。
一次分析: 研究の主な結果は、DSM-5 ASD 診断に従って対象を分類するための SDX-002 検査の臨床感度と特異度の推定値であり、関連する 95% 信頼区間となります。 感度と特異度は、DSM-5 (2013 年 5 月発行) による自閉症スペクトラム障害の有無の臨床診断との一致に基づいて、検証段階の集団で評価されます。
遺伝子発現シグネチャは、部分最小二乗法、サポート ベクター マシン、ブースト決定ツリーなどのいくつかの機械学習アルゴリズムの結果に対する 5 重交差検証を使用して、500 件の被験者の開発フェーズ セットでトレーニングされます。 トレーニング手順では、各手法の推定 ROC 曲線と、曲線下面積 (AUC) の信頼区間が生成されます。 機械学習アルゴリズムの最終的な選択は、AUC と、ROC 曲線上の選択された動作点での推定パフォーマンスに基づいて行われます。 動作点は、許容可能な特異性で高い感度を提供するように選択されます。
二次分析: 現在までに登録された患者の大多数において、オプションのバイオリポジトリサンプルの収集について同意が得られました。 バイオリポジトリサンプルの目的の分析は現在確立されています（上記の二次目的も参照）。 メタボロミクスおよびリポミクスのサインは、バイオリポジトリサンプルに同意した開発フェーズセットの 500 人の被験者のサブセットに対して同様に評価されます。 遺伝子発現シグネチャーに加えて、代謝物および/または脂質シグネチャーと DNA 分析がさまざまな構成で遺伝子発現シグネチャーと組み合わされ、臨床感度と特異性に対するこれらの追加の測定の影響が評価されます。 これらの追加のメタボロミクス/リポミクス シグネチャおよび/または DNA 分析によって検査パフォーマンスが向上する場合、これらの要素が SDX-002 アッセイに含まれる可能性があります。
最終的な SDX-002 アッセイの感度と特異性も、人口統計情報と発達検査の結果を使用して部分集団間で評価されます。 これらの部分母集団の多くには被験者の数がほとんどないと思われるため、結果の解釈には注意が必要です。 計画された部分母集団分析には、性別、年齢、民族性、ASD DSM-IV-TR 診断サブカテゴリ、DSM-5 ASD 重症度レベル (社会的コミュニケーションおよび制限された興味/反復的行動)、および ADOS-2 スコアが含まれます。
研究の種類
入学 (予想される)
連絡先と場所
研究場所
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Arizona
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Scottsdale、Arizona、アメリカ、85254
- Melmed Center
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California
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Long Beach、California、アメリカ、90806
- Miller Children's Hospital
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Sacramento、California、アメリカ、95817
- UC Davis MIND Institute
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Georgia
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Decatur、Georgia、アメリカ、30033
- Emory University
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Illinois
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Chicago、Illinois、アメリカ、60612
- Rush Medical Center
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Indiana
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Indianapolis、Indiana、アメリカ、46202
- Riley Hospital for Children
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Massachusetts
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Boston、Massachusetts、アメリカ、02115
- Children's Hospital Boston
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Lexington、Massachusetts、アメリカ、02421
- Lurie Center Massachusetts General Hospital
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New York
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New York、New York、アメリカ、10029
- Mount Sinai School of Medicine/Seaver Center
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Staten Island、New York、アメリカ、10314
- Institute for Behavioral Research on Staten Island
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North Carolina
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Chapel Hill、North Carolina、アメリカ、27517
- University of North Carolina at Chapel Hill
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Ohio
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Cincinnati、Ohio、アメリカ、45229
- Cincinnati Children's Hospital Medical Center
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Columbus、Ohio、アメリカ、43205
- Nationwide Children's Hospital
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Pennsylvania
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Philadelphia、Pennsylvania、アメリカ、19104
- Children's Hospital of Philadelphia
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South Carolina
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Charleston、South Carolina、アメリカ、29425
- Medical University of South Carolina
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Tennessee
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Nashville、Tennessee、アメリカ、37212
- Vanderbilt University
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Texas
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Houston、Texas、アメリカ、77054
- Baylor College of Medicine/Texas Children's Hospital
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Washington
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Seattle、Washington、アメリカ、98121
- Seattle Children's
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Alberta
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Edmonton、Alberta、カナダ、T5G 0B7
- Glenrose Rehabilitation Hospital
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Ontario
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Toronto、Ontario、カナダ、M4G 1R8
- Holland Bloorview Kids Rehabilitation Hospital
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 孤立した運動障害以外の発達障害の可能性を評価するために、発達評価センターに紹介されました。
- 18か月以上60か月未満。
- 親/法的保護者は研究について知らされており、インフォームドコンセントフォームに署名しています。
除外基準:
- 自閉症スペクトラム障害に関する事前の信頼できる診断（すなわち、 多分野のチームによる事前の評価により、自閉症スペクトラム障害の診断はすでに確実に確立されています）。
- 学習手順を完了できない、または完了する気がない。
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
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開発グループ
開発フェーズでは、分類アルゴリズムが完成するまで分析が実行されます。
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検証グループ
検証フェーズでは、300 人の被験者における最終的な分類アルゴリズムのパフォーマンスを評価します。
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
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末梢血におけるRNA遺伝子発現
時間枠：回収後30日以内
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回収後30日以内
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二次結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
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末梢血中の代謝物、脂質、および DNA 変異
時間枠：回収後30日以内
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回収後30日以内
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協力者と研究者
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捜査官
- スタディディレクター：Barbara Rathmell, MD、SynapDx Corp
研究記録日
主要日程の研究
研究開始
一次修了 (実際)
研究の完了 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (見積もり)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (見積もり)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- 12002 (レジストリ識別子：DAIDS-ES)
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。