SynapDx Autisme Genekspressionsanalyse (STORY) (STORY)
SynapDx autismespektrumforstyrrelse genekspressionsanalyseundersøgelse
Denne undersøgelse vil prospektivt optage cirka 880 børn, mindst 18 måneder og under 60 måneder gamle, som er blevet henvist til et pædiatrisk udviklingsvurderingscenter. Tilmeldte børn vil få udtaget blod til RNA-genekspressionsanalyse og eventuelt til metabolit-, lipid- og DNA-analyse og gennemgå en klinisk evaluering for at bestemme tilstedeværelsen eller fraværet af en diagnose af ASD.
Det primære formål med denne undersøgelse er:
- At udvikle en algoritme til at klassificere blod-RNA-genekspressionsmønstre for at maksimere overensstemmelse mellem klassificeringen og en klinisk vurdering af tilstedeværelse eller fravær af autismespektrumforstyrrelser (ASD).
De sekundære mål for denne undersøgelse er:
- At udvikle en algoritme til at klassificere plasmametabolit- og/eller lipidprofiler på en sådan måde, at der maksimeres overensstemmelse mellem klassificeringen og en klinisk vurdering af tilstedeværelse eller fravær af ASD.
- At prospektivt vurdere den kliniske sensitivitet og specificitet af plasmametabolitten og/eller lipidprofilklassificeringsalgoritmen i en separat population bestående af børn henvist til en udviklingsmæssig evalueringsklinik for en mulig udviklingsforstyrrelse (DD).
- At evaluere klinisk sensitivitet og specificitet af forskellige kombinationer af genekspressionssignatur, metabolit og/eller lipidsignaturer og tilstedeværelse af ASD-associeret genetisk variation påvist ved kromosomal mikroarray-analyse (CMA) eller sekventering af proteinkodende regioner af genomet.
Studieoversigt
Status
Betingelser
Detaljeret beskrivelse
Det primære formål med denne undersøgelse er at definere en genekspressionssignatur, der indikerer ASD, og at etablere dens kliniske sensitivitet og specificitet. Klinikerens diagnose af ASD vil blive stillet ved hjælp af DSM-5 som referencestandardinstrument. Det udbredte diagnostiske instrument Autism Diagnostic Observation Schedule (ADOS-2) er en typisk komponent i den kliniske vurdering for et barn diagnosticeret med ASD, og denne evaluering vil blive udført på alle undersøgelsesdeltagere. Sekundære formål med denne undersøgelse er (1) at definere metabolit- og lipidsignaturer, der indikerer ASD, og etablere deres kliniske sensitivitet og specificitet og (2) at bestemme klinisk sensitivitet og specificitet af forskellige kombinationer af genekspressionssignatur, metabolit og/eller lipidsignaturer, og tilstedeværelse af ASD-associeret genetisk variation detekteret af CMA og sekventering af proteinkodende regioner i genomet
Analyser: Detaljer om analysen vil blive specificeret i en statistisk analyseplan (SAP), som vil omfatte procedurer for håndtering af outliers, manglende data og forskelle på tværs af websteder. SAP vil blive gennemgået og godkendt af en komité af Principal Investigators (PI'er) før afblænding af valideringssættet.
Primære analyser: De primære resultater af undersøgelsen vil være estimaterne af den kliniske sensitivitet og specificitet af SDX-002-testen for at klassificere forsøgspersoner i henhold til DSM-5 ASD-diagnose med tilhørende 95 % konfidensintervaller. Sensitivitet og specificitet vil blive vurderet på valideringsfasepopulationen baseret på overensstemmelse med den kliniske diagnose af tilstedeværelse eller fravær af autismespektrumforstyrrelse af DSM-5 (offentliggjort maj 2013).
Genekspressionssignaturen vil blive trænet på 500 emners udviklingsfasesæt, ved hjælp af 5-fold krydsvalidering over resultaterne af adskillige maskinlæringsalgoritmer, herunder delvise mindste kvadrater, støttevektormaskiner og boostede beslutningstræer. Træningsproceduren vil generere estimerede ROC-kurver for hver metode, såvel som konfidensintervaller for området under kurven (AUC). Det endelige valg af en maskinlæringsalgoritme vil være baseret på AUC, samt på den estimerede ydeevne ved det valgte driftspunkt på ROC-kurven. Driftspunktet vil blive valgt til at give høj sensitivitet ved en acceptabel specificitet.
Sekundære analyser: I størstedelen af de patienter, der er indskrevet til dato, blev der opnået samtykke til indsamling af en valgfri prøve fra biodepot. Den påtænkte analyse af biodepotprøverne er nu etableret (se også sekundære mål anført ovenfor). De metabolomiske og lipomiske signaturer vil på samme måde blive vurderet på undergruppen af de 500 forsøgspersoner i udviklingsfasesættet, som giver samtykke til en biodepotprøve. Ud over genekspressionssignaturen vil metabolit- og/eller lipidsignaturer og DNA-analyse blive kombineret med genekspressionssignaturen i forskellige konfigurationer, og virkningen af disse yderligere mål på klinisk sensitivitet og specificitet vil blive evalueret. Hvis disse yderligere metabolomiske/lipomiske signaturer og/eller DNA-analyser forbedrer testydelsen, kan disse elementer inkluderes i SDX-002-analysen.
Sensitivitet og specificitet det endelige SDX-002-assay vil også blive vurderet blandt subpopulationer ved hjælp af demografisk information og resultaterne af udviklingstest. Der vil sandsynligvis være få forsøgspersoner i mange af disse underpopulationer, og der vil blive brugt forsigtighed ved fortolkning af resultaterne. Planlagte subpopulationsanalyser inkluderer køn, alder, etnicitet, ASD DSM-IV-TR diagnostisk underkategori, DSM-5 ASD sværhedsgrad (social kommunikation og begrænsede interesser/repetitiv adfærd) og ADOS-2-score.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Forventet)
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
Alberta
-
Edmonton, Alberta, Canada, T5G 0B7
- Glenrose Rehabilitation Hospital
-
-
Ontario
-
Toronto, Ontario, Canada, M4G 1R8
- Holland Bloorview Kids Rehabilitation Hospital
-
-
-
-
Arizona
-
Scottsdale, Arizona, Forenede Stater, 85254
- Melmed Center
-
-
California
-
Long Beach, California, Forenede Stater, 90806
- Miller Children's Hospital
-
Sacramento, California, Forenede Stater, 95817
- Uc Davis Mind Institute
-
-
Georgia
-
Decatur, Georgia, Forenede Stater, 30033
- Emory University
-
-
Illinois
-
Chicago, Illinois, Forenede Stater, 60612
- Rush Medical Center
-
-
Indiana
-
Indianapolis, Indiana, Forenede Stater, 46202
- Riley Hospital for Children
-
-
Massachusetts
-
Boston, Massachusetts, Forenede Stater, 02115
- Children's Hospital Boston
-
Lexington, Massachusetts, Forenede Stater, 02421
- Lurie Center Massachusetts General Hospital
-
-
New York
-
New York, New York, Forenede Stater, 10029
- Mount Sinai School of Medicine/Seaver Center
-
Staten Island, New York, Forenede Stater, 10314
- Institute for Behavioral Research on Staten Island
-
-
North Carolina
-
Chapel Hill, North Carolina, Forenede Stater, 27517
- University of North Carolina at Chapel Hill
-
-
Ohio
-
Cincinnati, Ohio, Forenede Stater, 45229
- Cincinnati Children's Hospital Medical Center
-
Columbus, Ohio, Forenede Stater, 43205
- Nationwide Children's Hospital
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, Forenede Stater, 19104
- Children's Hospital of Philadelphia
-
-
South Carolina
-
Charleston, South Carolina, Forenede Stater, 29425
- Medical University of South Carolina
-
-
Tennessee
-
Nashville, Tennessee, Forenede Stater, 37212
- Vanderbilt University
-
-
Texas
-
Houston, Texas, Forenede Stater, 77054
- Baylor College of Medicine/Texas Children's Hospital
-
-
Washington
-
Seattle, Washington, Forenede Stater, 98121
- Seattle Children's
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Henvist til et udviklingsmæssigt evalueringscenter for evaluering af en mulig udviklingsforstyrrelse, bortset fra isolerede motoriske problemer.
- Mindst 18 måneder og mindre end 60 måneder.
- Forælder/værge er blevet informeret om undersøgelsen og har underskrevet en informeret samtykkeerklæring.
Ekskluderingskriterier:
- Forudgående pålidelig diagnose af autismespektrumforstyrrelse (dvs. forudgående evaluering af et tværfagligt team har allerede pålideligt etableret diagnosen autismespektrumforstyrrelser).
- Ude af stand eller vilje til at gennemføre undersøgelsesprocedurer.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
|---|
|
Udviklingsgruppe
I udviklingsfasen vil der blive udført analyser, indtil klassifikationsalgoritmen er færdiggjort.
|
|
Valideringsgruppe
Valideringsfasen vil vurdere ydeevnen af den færdige klassifikationsalgoritme i 300 forsøgspersoner.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tidsramme |
|---|---|
|
RNA-genekspression i perifert blod
Tidsramme: Inden for 30 dage efter afhentning
|
Inden for 30 dage efter afhentning
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tidsramme |
|---|---|
|
Metabolitter, lipider og DNA-variation i perifert blod
Tidsramme: Inden for 30 dage efter afhentning
|
Inden for 30 dage efter afhentning
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Efterforskere
- Studieleder: Barbara Rathmell, MD, SynapDx Corp
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Studieafslutning (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Skøn)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Skøn)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 12002 (Registry Identifier: DAIDS-ES)
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .