Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

SynapDx Autism Gene Expression Analysis Study (STORY) (STORY)

15 december 2014 uppdaterad av: SynapDx

SynapDx Autism Spectrum Disorder Analys av genuttryck

Denna studie kommer prospektivt att registrera cirka 880 barn, minst 18 månader och yngre än 60 månader, som har remitterats till ett pediatriskt utvecklingsutvärderingscenter. Inskrivna barn kommer att ta blod för RNA-genexpressionsanalys och eventuellt för metabolit-, lipid- och DNA-analys och genomgå en klinisk utvärdering för att fastställa närvaron eller frånvaron av en diagnos av ASD.

Det primära syftet med denna studie är:

- Att utveckla en algoritm för att klassificera blod-RNA-genexpressionsmönster för att maximera överensstämmelsen mellan klassificeringen och en klinisk bedömning av närvaro eller frånvaro av Autism Spectrum Disorders (ASD).

De sekundära målen för denna studie är:

  • Att utveckla en algoritm för att klassificera plasmametabolit- och/eller lipidprofiler på ett sådant sätt att man maximerar överensstämmelsen mellan klassificeringen och en klinisk bedömning av närvaro eller frånvaro av ASD.
  • Att prospektivt bedöma den kliniska känsligheten och specificiteten hos plasmametaboliten och/eller lipidprofilklassificeringsalgoritmen i en separat population bestående av barn som remitteras till en utvecklingsutvärderingsklinik för en möjlig utvecklingsstörning (DD).
  • För att utvärdera klinisk känslighet och specificitet för olika kombinationer av genuttryckssignatur, metabolit- och/eller lipidsignaturer och närvaro av ASD-associerad genetisk variation detekterad genom kromosomal mikroarrayanalys (CMA) eller sekvensering av proteinkodande regioner i genomet.

Studieöversikt

Status

Avslutad

Betingelser

Detaljerad beskrivning

Det primära syftet med denna studie är att definiera en genuttryckssignatur som indikerar ASD och att fastställa dess kliniska känslighet och specificitet. Klinikerdiagnostik av ASD kommer att göras med DSM-5 som referensstandardinstrument. Det ofta använda diagnostiska instrumentet Autism Diagnostic Observation Schedule (ADOS-2) är en typisk komponent i den kliniska bedömningen för ett barn som diagnostiserats med ASD och denna utvärdering kommer att utföras på alla studiedeltagare. Sekundära syften med denna studie är (1) att definiera metabolit- och lipidsignaturer som indikerar ASD och fastställa deras kliniska känslighet och specificitet och (2) att bestämma klinisk sensitivitet och specificitet för olika kombinationer av genuttryckssignatur, metabolit och/eller lipidsignaturer, och närvaro av ASD-associerad genetisk variation detekterad av CMA och sekvenserande proteinkodande regioner i genomet

Analyser: Detaljer om analysen kommer att specificeras i en statistisk analysplan (SAP), som kommer att inkludera procedurer för hantering av extremvärden, saknade data och skillnader mellan olika platser. SAP kommer att granskas och godkännas av en kommitté av huvudutredare (PI) innan valideringssetet avblindas.

Primära analyser: De primära resultaten av studien kommer att vara uppskattningarna av den kliniska sensitiviteten och specificiteten för SDX-002-testet för att klassificera försökspersoner enligt DSM-5 ASD-diagnos, med tillhörande 95 % konfidensintervall. Sensitivitet och specificitet kommer att bedömas på valideringsfaspopulationen baserat på överensstämmelse med den kliniska diagnosen närvaro eller frånvaro av autismspektrumstörning av DSM-5 (publicerad maj 2013).

Genuttryckssignaturen kommer att tränas på uppsättningen av 500 personer i utvecklingsfas, med hjälp av 5-faldig korsvalidering över resultaten av flera maskininlärningsalgoritmer, inklusive partiella minsta kvadrater, stödvektormaskiner och förstärkta beslutsträd. Utbildningsproceduren kommer att generera uppskattade ROC-kurvor för varje metod, såväl som konfidensintervall för området under kurvan (AUC). Det slutliga valet av en maskininlärningsalgoritm kommer att baseras på AUC, såväl som på den uppskattade prestandan vid den valda arbetspunkten på ROC-kurvan. Arbetspunkten kommer att väljas för att ge hög känslighet vid en acceptabel specificitet.

Sekundära analyser: Hos majoriteten av patienter som hittills inkluderats erhölls samtycke för insamling av ett valfritt bioförvarsprov. Den avsedda analysen av bioförvarsproverna har nu fastställts (se även sekundära mål listade ovan). De metabolomiska och lipomiska signaturerna kommer att bedömas på liknande sätt på undergruppen av de 500 försökspersonerna i uppsättningen utvecklingsfas som samtycker till ett bioförvarsprov. Utöver genuttryckssignaturen kommer metabolit- och/eller lipidsignaturer och DNA-analys att kombineras med genuttryckssignaturen i olika konfigurationer och effekten av dessa ytterligare åtgärder på klinisk sensitivitet och specificitet kommer att utvärderas. Om dessa ytterligare metabolomiska/lipomiska signaturer och/eller DNA-analyser förbättrar testprestanda, kan dessa element inkluderas i SDX-002-analysen.

Sensitivitet och specificitet den slutliga SDX-002-analysen kommer också att bedömas bland subpopulationer med hjälp av demografisk information och resultaten av utvecklingstester. Det kommer sannolikt att finnas få försökspersoner i många av dessa delpopulationer och försiktighet kommer att användas vid tolkningen av resultaten. Planerade subpopulationsanalyser inkluderar kön, ålder, etnicitet, ASD DSM-IV-TR diagnostisk underkategori, DSM-5 ASD svårighetsgrad (social kommunikation och begränsade intressen/repetitiva beteenden) och ADOS-2 poäng.

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Förväntat)

880

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studieorter

  • Förenta staterna
    • Arizona
      • Scottsdale, Arizona, Förenta staterna, 85254
        • Melmed Center
    • California
      • Long Beach, California, Förenta staterna, 90806
        • Miller Children's Hospital
      • Sacramento, California, Förenta staterna, 95817
        • UC Davis MIND Institute
    • Georgia
      • Decatur, Georgia, Förenta staterna, 30033
        • Emory University
    • Illinois
      • Chicago, Illinois, Förenta staterna, 60612
        • Rush Medical Center
    • Indiana
      • Indianapolis, Indiana, Förenta staterna, 46202
        • Riley Hospital for Children
    • Massachusetts
      • Boston, Massachusetts, Förenta staterna, 02115
        • Children's Hospital Boston
      • Lexington, Massachusetts, Förenta staterna, 02421
        • Lurie Center Massachusetts General Hospital
    • New York
      • New York, New York, Förenta staterna, 10029
        • Mount Sinai School of Medicine/Seaver Center
      • Staten Island, New York, Förenta staterna, 10314
        • Institute for Behavioral Research on Staten Island
    • North Carolina
      • Chapel Hill, North Carolina, Förenta staterna, 27517
        • University of North Carolina at Chapel Hill
    • Ohio
      • Cincinnati, Ohio, Förenta staterna, 45229
        • Cincinnati Children's Hospital Medical Center
      • Columbus, Ohio, Förenta staterna, 43205
        • Nationwide Children's Hospital
    • Pennsylvania
      • Philadelphia, Pennsylvania, Förenta staterna, 19104
        • Children's Hospital of Philadelphia
    • South Carolina
      • Charleston, South Carolina, Förenta staterna, 29425
        • Medical University of South Carolina
    • Tennessee
      • Nashville, Tennessee, Förenta staterna, 37212
        • Vanderbilt University
    • Texas
      • Houston, Texas, Förenta staterna, 77054
        • Baylor College of Medicine/Texas Children's Hospital
    • Washington
      • Seattle, Washington, Förenta staterna, 98121
        • Seattle Children's
  • Kanada
    • Alberta
      • Edmonton, Alberta, Kanada, T5G 0B7
        • Glenrose Rehabilitation Hospital
    • Ontario
      • Toronto, Ontario, Kanada, M4G 1R8
        • Holland Bloorview Kids Rehabilitation Hospital

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

1 år till 5 år (Barn)

Tar emot friska volontärer

Nej

Kön som är behöriga för studier

Allt

Testmetod

Sannolikhetsprov

Studera befolkning

Barn 18 månader till mindre än 60 månader remitterade till ett utvecklingsutvärderingscentrum för utvärdering av en eventuell utvecklingsstörning.

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • Remitteras till ett utvecklingsutvärderingscentrum för utvärdering av eventuell utvecklingsstörning, annat än enstaka motoriska problem.
  • Minst 18 månader och mindre än 60 månader.
  • Förälder/vårdnadshavare har informerats om studien och har undertecknat ett informerat samtyckesformulär.

Exklusions kriterier:

  • Tidigare tillförlitlig diagnos av autismspektrumstörning (dvs. tidigare utvärdering av ett tvärvetenskapligt team har redan på ett tillförlitligt sätt fastställt diagnosen Autism Spectrum Disorder).
  • Kan eller vill inte slutföra studieprocedurer.

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Utvecklingsgrupp
I utvecklingsfasen kommer analyser att utföras tills klassificeringsalgoritmen är klar.
Valideringsgrupp
Valideringsfasen kommer att bedöma prestandan för den slutgiltiga klassificeringsalgoritmen i 300 ämnen.

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Tidsram
RNA-genuttryck i perifert blod
Tidsram: Inom 30 dagar efter insamling
Inom 30 dagar efter insamling

Sekundära resultatmått

Resultatmått
Tidsram
Metaboliter, lipider och DNA-variation i perifert blod
Tidsram: Inom 30 dagar efter insamling
Inom 30 dagar efter insamling

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Sponsor

SynapDx

Utredare

  • Studierektor: Barbara Rathmell, MD, SynapDx Corp

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart

1 mars 2013

Primärt slutförande (Faktisk)

1 juli 2014

Avslutad studie (Faktisk)

1 december 2014

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

11 mars 2013

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

12 mars 2013

Första postat (Uppskatta)

13 mars 2013

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Uppskatta)

17 december 2014

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

15 december 2014

Senast verifierad

1 december 2014

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Nyckelord

Ytterligare relevanta MeSH-villkor

Andra studie-ID-nummer

  • 12002 (Registeridentifierare: DAIDS-ES)

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera