SynapDx 自闭症基因表达分析研究（故事） (STORY)
SynapDx 自闭症谱系障碍基因表达分析研究
这项研究将前瞻性地招募大约 880 名年龄至少为 18 个月且小于 60 个月的儿童，他们已被转诊至儿科发育评估中心。 登记的儿童将抽血进行 RNA 基因表达分析，并可选择进行代谢物、脂质和 DNA 分析，并进行临床评估以确定是否存在 ASD 诊断。
本研究的主要目标是：
- 开发一种算法来对血液 RNA 基因表达模式进行分类，以最大限度地提高分类与自闭症谱系障碍 (ASD) 是否存在的临床评估之间的一致性。
本研究的次要目标是：
- 开发一种算法来对血浆代谢物和/或脂质谱进行分类，以使分类与 ASD 存在或不存在的临床评估之间的一致性最大化。
- 前瞻性评估血浆代谢物和/或脂质谱分类算法在由儿童组成的单独人群中的临床敏感性和特异性，这些儿童因可能的发育障碍 (DD) 而被转诊至发育评估诊所。
- 评估基因表达特征、代谢物和/或脂质特征的各种组合的临床敏感性和特异性，以及通过染色体微阵列分析 (CMA) 或基因组蛋白质编码区域测序检测到的 ASD 相关遗传变异的存在。
研究概览
地位
条件
详细说明
本研究的主要目的是定义指示 ASD 的基因表达特征并确定其临床敏感性和特异性。 临床医生诊断 ASD 将使用 DSM-5 作为参考标准仪器。 广泛使用的诊断工具自闭症诊断观察表 (ADOS-2) 是对诊断为 ASD 的儿童进行临床评估的典型组成部分，将对所有研究参与者进行此评估。 本研究的次要目的是 (1) 定义指示 ASD 的代谢物和脂质特征并建立它们的临床敏感性和特异性，以及 (2) 确定基因表达特征、代谢物和/或脂质特征的各种组合的临床敏感性和特异性，以及通过 CMA 和基因组蛋白质编码区域测序检测到的 ASD 相关遗传变异的存在
分析：分析的详细信息将在统计分析计划 (SAP) 中指定，其中将包括处理异常值、缺失数据和站点间差异的程序。 在验证集揭盲之前，SAP 将由首席研究员 (PI) 委员会审查和批准。
主要分析：该研究的主要结果将是根据 DSM-5 ASD 诊断对 SDX-002 测试的临床敏感性和特异性进行分类的估计，以及相关的 95% 置信区间。 将根据 DSM-5（2013 年 5 月发布）对是否存在自闭症谱系障碍的临床诊断达成一致，对验证阶段人群评估敏感性和特异性。
基因表达签名将在 500 个受试者开发阶段集上进行训练，对多种机器学习算法（包括偏最小二乘法、支持向量机和增强决策树）的结果使用 5 折交叉验证。 训练过程将为每种方法生成估计的 ROC 曲线，以及曲线下面积 (AUC) 的置信区间。 机器学习算法的最终选择将基于 AUC 以及 ROC 曲线上所选操作点的估计性能。 将选择操作点以在可接受的特异性下提供高灵敏度。
二次分析：在迄今为止登记的大多数患者中，获得了收集可选生物样本库样本的同意。 生物样本库样本的预期分析现已确定（另请参见上面列出的次要目标）。 代谢组学和脂肪组学特征将在开发阶段组中同意生物储存库样本的 500 名受试者的子集上进行类似的评估。 除了基因表达特征之外，代谢物和/或脂质特征和 DNA 分析将与各种配置的基因表达特征相结合，并将评估这些额外措施对临床敏感性和特异性的影响。 如果这些额外的代谢组学/脂肪组学特征和/或 DNA 分析提高了测试性能，则这些元素可能包含在 SDX-002 分析中。
最终 SDX-002 检测的敏感性和特异性也将使用人口统计信息和发育测试的结果在亚群中进行评估。 许多这些亚群中的受试者可能很少，因此在解释结果时会谨慎行事。 计划的亚群分析包括性别、年龄、种族、ASD DSM-IV-TR 诊断亚类、DSM-5 ASD 严重程度（社交沟通和受限兴趣/重复行为）和 ADOS-2 评分。
研究类型
注册 (预期的)
联系人和位置
学习地点
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Alberta
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Edmonton、Alberta、加拿大、T5G 0B7
- Glenrose Rehabilitation Hospital
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Ontario
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Toronto、Ontario、加拿大、M4G 1R8
- Holland Bloorview Kids Rehabilitation Hospital
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Arizona
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Scottsdale、Arizona、美国、85254
- Melmed Center
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California
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Long Beach、California、美国、90806
- Miller Children's Hospital
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Sacramento、California、美国、95817
- UC Davis MIND Institute
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Georgia
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Decatur、Georgia、美国、30033
- Emory University
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Illinois
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Chicago、Illinois、美国、60612
- Rush Medical Center
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Indiana
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Indianapolis、Indiana、美国、46202
- Riley Hospital for Children
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Massachusetts
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Boston、Massachusetts、美国、02115
- Children's Hospital Boston
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Lexington、Massachusetts、美国、02421
- Lurie Center Massachusetts General Hospital
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New York
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New York、New York、美国、10029
- Mount Sinai School of Medicine/Seaver Center
-
Staten Island、New York、美国、10314
- Institute for Behavioral Research on Staten Island
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-
North Carolina
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Chapel Hill、North Carolina、美国、27517
- University of North Carolina at Chapel Hill
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Ohio
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Cincinnati、Ohio、美国、45229
- Cincinnati Children's Hospital Medical Center
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Columbus、Ohio、美国、43205
- Nationwide Children's Hospital
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Pennsylvania
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Philadelphia、Pennsylvania、美国、19104
- Children's Hospital of Philadelphia
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South Carolina
-
Charleston、South Carolina、美国、29425
- Medical University of South Carolina
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Tennessee
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Nashville、Tennessee、美国、37212
- Vanderbilt University
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Texas
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Houston、Texas、美国、77054
- Baylor College of Medicine/Texas Children's Hospital
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Washington
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Seattle、Washington、美国、98121
- Seattle Children's
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
描述
纳入标准：
- 转诊至发育评估中心以评估可能存在的发育障碍，而不是孤立的运动问题。
- 至少 18 个月且少于 60 个月。
- 家长/法定监护人已获悉该研究并签署了知情同意书。
排除标准：
- 自闭症谱系障碍的先前可靠诊断（即 多学科团队的事先评估已经可靠地建立了自闭症谱系障碍诊断）。
- 无法或不愿完成学习程序。
学习计划
研究是如何设计的？
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
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开发组
在开发阶段，将进行分析，直到分类算法最终确定。
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验证组
验证阶段将评估最终分类算法在 300 名受试者中的表现。
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
大体时间 |
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外周血中的RNA基因表达
大体时间：收集后 30 天内
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收集后 30 天内
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次要结果测量
结果测量 |
大体时间 |
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外周血中的代谢物、脂质和DNA变异
大体时间：收集后 30 天内
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收集后 30 天内
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合作者和调查者
赞助
调查人员
- 研究主任：Barbara Rathmell, MD、SynapDx Corp
研究记录日期
研究主要日期
学习开始
初级完成 (实际的)
研究完成 (实际的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (估计)
研究记录更新
最后更新发布 (估计)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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