SynapDx-Studie zur Genexpressionsanalyse bei Autismus (GESCHICHTE) (STORY)
SynapDx-Studie zur Genexpressionsanalyse der Autismus-Spektrum-Störung
An dieser Studie werden voraussichtlich etwa 880 Kinder im Alter von mindestens 18 Monaten und unter 60 Monaten teilnehmen, die an ein pädiatrisches Entwicklungsbewertungszentrum überwiesen wurden. Eingeschriebenen Kindern wird Blut zur RNA-Genexpressionsanalyse und optional zur Metaboliten-, Lipid- und DNA-Analyse entnommen und einer klinischen Untersuchung unterzogen, um festzustellen, ob eine ASD-Diagnose vorliegt oder nicht.
Das Hauptziel dieser Studie ist:
- Entwicklung eines Algorithmus zur Klassifizierung von RNA-Genexpressionsmustern im Blut, um die Übereinstimmung zwischen der Klassifizierung und einer klinischen Beurteilung des Vorhandenseins oder Nichtvorhandenseins von Autismus-Spektrum-Störungen (ASD) zu maximieren.
Die sekundären Ziele dieser Studie sind:
- Entwicklung eines Algorithmus zur Klassifizierung von Plasmametaboliten- und/oder Lipidprofilen auf eine Weise, die eine maximale Übereinstimmung zwischen der Klassifizierung und einer klinischen Beurteilung des Vorhandenseins oder Nichtvorhandenseins von ASD gewährleistet.
- Zur prospektiven Beurteilung der klinischen Sensitivität und Spezifität des Plasmametaboliten- und/oder Lipidprofil-Klassifizierungsalgorithmus in einer separaten Population bestehend aus Kindern, die wegen einer möglichen Entwicklungsstörung (DD) an eine Klinik zur Entwicklungsbewertung überwiesen wurden.
- Bewertung der klinischen Sensitivität und Spezifität verschiedener Kombinationen von Genexpressionssignaturen, Metaboliten- und/oder Lipidsignaturen sowie des Vorhandenseins von ASD-assoziierten genetischen Variationen, die durch chromosomale Microarray-Analyse (CMA) oder Sequenzierung proteinkodierender Regionen des Genoms nachgewiesen wurden.
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Detaillierte Beschreibung
Das Hauptziel dieser Studie besteht darin, eine Genexpressionssignatur zu definieren, die auf ASD hinweist, und deren klinische Sensitivität und Spezifität festzustellen. Die klinische Diagnose von ASD wird unter Verwendung von DSM-5 als Referenzstandardinstrument gestellt. Das weit verbreitete Diagnoseinstrument Autism Diagnostic Observation Schedule (ADOS-2) ist ein typischer Bestandteil der klinischen Beurteilung eines mit ASD diagnostizierten Kindes und diese Beurteilung wird bei allen Studienteilnehmern durchgeführt. Sekundäre Ziele dieser Studie sind (1) die Definition von Metaboliten- und Lipidsignaturen, die auf ASD hinweisen, und die Feststellung ihrer klinischen Sensitivität und Spezifität und (2) die Bestimmung der klinischen Sensitivität und Spezifität verschiedener Kombinationen von Genexpressionssignaturen, Metaboliten- und/oder Lipidsignaturen. und Vorhandensein einer ASD-assoziierten genetischen Variation, die durch CMA und Sequenzierung proteinkodierender Regionen des Genoms nachgewiesen wurde
Analysen: Einzelheiten der Analyse werden in einem statistischen Analyseplan (SAP) festgelegt, der Verfahren zum Umgang mit Ausreißern, fehlenden Daten und Unterschieden zwischen Standorten umfasst. Der SAP wird von einem Ausschuss aus Principal Investigators (PIs) überprüft und genehmigt, bevor der Validierungssatz freigegeben wird.
Primäre Analysen: Die primären Ergebnisse der Studie werden Schätzungen der klinischen Sensitivität und Spezifität des SDX-002-Tests zur Klassifizierung von Probanden gemäß der DSM-5-ASD-Diagnose mit zugehörigen 95 %-Konfidenzintervallen sein. Sensitivität und Spezifität werden anhand der Population der Validierungsphase auf der Grundlage der Übereinstimmung mit der klinischen Diagnose des Vorhandenseins oder Nichtvorhandenseins einer Autismus-Spektrum-Störung durch DSM-5 (veröffentlicht im Mai 2013) bewertet.
Die Genexpressionssignatur wird auf dem 500 Probanden umfassenden Entwicklungsphasensatz trainiert, wobei eine fünffache Kreuzvalidierung über die Ergebnisse mehrerer maschineller Lernalgorithmen erfolgt, darunter partielle kleinste Quadrate, Support-Vektor-Maschinen und verstärkte Entscheidungsbäume. Das Trainingsverfahren generiert geschätzte ROC-Kurven für jede Methode sowie Konfidenzintervalle für die Fläche unter der Kurve (AUC). Die endgültige Auswahl eines Algorithmus für maschinelles Lernen basiert auf der AUC sowie auf der geschätzten Leistung am gewählten Betriebspunkt auf der ROC-Kurve. Der Arbeitspunkt wird so gewählt, dass er eine hohe Empfindlichkeit bei akzeptabler Spezifität bietet.
Sekundäranalysen: Bei der Mehrzahl der bisher eingeschlossenen Patienten wurde die Einwilligung zur Entnahme einer optionalen Bio-Repositorium-Probe eingeholt. Die beabsichtigte Analyse der Biolagerproben steht nun fest (siehe auch oben aufgeführte Nebenziele). Die metabolomischen und lipomischen Signaturen werden in ähnlicher Weise an der Untergruppe der 500 Probanden im Entwicklungsphasensatz bewertet, die einer Bio-Repository-Probe zustimmen. Zusätzlich zur Genexpressionssignatur werden Metaboliten- und/oder Lipidsignaturen sowie DNA-Analysen in verschiedenen Konfigurationen mit der Genexpressionssignatur kombiniert und der Einfluss dieser zusätzlichen Maßnahmen auf die klinische Sensitivität und Spezifität evaluiert. Wenn diese zusätzlichen metabolomischen/lipomischen Signaturen und/oder DNA-Analysen die Testleistung verbessern, können diese Elemente in den SDX-002-Assay einbezogen werden.
Die Sensitivität und Spezifität des endgültigen SDX-002-Tests wird auch bei Subpopulationen anhand demografischer Informationen und den Ergebnissen von Entwicklungstests bewertet. In vielen dieser Teilpopulationen dürfte es nur wenige Probanden geben, und bei der Interpretation der Ergebnisse ist Vorsicht geboten. Geplante Subpopulationsanalysen umfassen Geschlecht, Alter, ethnische Zugehörigkeit, ASD-DSM-IV-TR-Diagnoseunterkategorie, DSM-5-ASD-Schweregrad (soziale Kommunikation und eingeschränkte Interessen/repetitive Verhaltensweisen) und ADOS-2-Scores.
Studientyp
Einschreibung (Voraussichtlich)
Kontakte und Standorte
Studienorte
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Alberta
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Edmonton, Alberta, Kanada, T5G 0B7
- Glenrose Rehabilitation Hospital
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Ontario
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Toronto, Ontario, Kanada, M4G 1R8
- Holland Bloorview Kids Rehabilitation Hospital
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Arizona
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Scottsdale, Arizona, Vereinigte Staaten, 85254
- Melmed Center
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California
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Long Beach, California, Vereinigte Staaten, 90806
- Miller Children's Hospital
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Sacramento, California, Vereinigte Staaten, 95817
- Uc Davis Mind Institute
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Georgia
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Decatur, Georgia, Vereinigte Staaten, 30033
- Emory University
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Illinois
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Chicago, Illinois, Vereinigte Staaten, 60612
- Rush Medical Center
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Indiana
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Indianapolis, Indiana, Vereinigte Staaten, 46202
- Riley Hospital for Children
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Massachusetts
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Boston, Massachusetts, Vereinigte Staaten, 02115
- Children's Hospital Boston
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Lexington, Massachusetts, Vereinigte Staaten, 02421
- Lurie Center Massachusetts General Hospital
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New York
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New York, New York, Vereinigte Staaten, 10029
- Mount Sinai School of Medicine/Seaver Center
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Staten Island, New York, Vereinigte Staaten, 10314
- Institute for Behavioral Research on Staten Island
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North Carolina
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Chapel Hill, North Carolina, Vereinigte Staaten, 27517
- University of North Carolina At Chapel Hill
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Ohio
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Cincinnati, Ohio, Vereinigte Staaten, 45229
- Cincinnati Children's Hospital Medical Center
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Columbus, Ohio, Vereinigte Staaten, 43205
- Nationwide Children's Hospital
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Pennsylvania
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Philadelphia, Pennsylvania, Vereinigte Staaten, 19104
- Children's Hospital of Philadelphia
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South Carolina
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Charleston, South Carolina, Vereinigte Staaten, 29425
- Medical University of South Carolina
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Tennessee
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Nashville, Tennessee, Vereinigte Staaten, 37212
- Vanderbilt University
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Texas
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Houston, Texas, Vereinigte Staaten, 77054
- Baylor College of Medicine/Texas Children's Hospital
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Washington
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Seattle, Washington, Vereinigte Staaten, 98121
- Seattle Children's
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Überweisung an ein Entwicklungsbewertungszentrum zur Beurteilung einer möglichen Entwicklungsstörung, bei der es sich nicht um isolierte motorische Probleme handelt.
- Mindestens 18 Monate und weniger als 60 Monate.
- Die Eltern/Erziehungsberechtigten wurden über die Studie informiert und haben eine Einverständniserklärung unterzeichnet.
Ausschlusskriterien:
- Vorherige zuverlässige Diagnose einer Autismus-Spektrum-Störung (d. h. Eine vorherige Beurteilung durch ein multidisziplinäres Team hat die Diagnose einer Autismus-Spektrum-Störung bereits zuverlässig bestätigt.
- Nicht in der Lage oder nicht bereit, die Studienprozeduren abzuschließen.
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
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Entwicklungsgruppe
In der Entwicklungsphase werden Analysen durchgeführt, bis der Klassifizierungsalgorithmus finalisiert ist.
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Validierungsgruppe
In der Validierungsphase wird die Leistung des endgültigen Klassifizierungsalgorithmus bei 300 Probanden bewertet.
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Zeitfenster |
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RNA-Genexpression im peripheren Blut
Zeitfenster: Innerhalb von 30 Tagen nach Abholung
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Innerhalb von 30 Tagen nach Abholung
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Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Zeitfenster |
|---|---|
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Metaboliten, Lipide und DNA-Variation im peripheren Blut
Zeitfenster: Innerhalb von 30 Tagen nach Abholung
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Innerhalb von 30 Tagen nach Abholung
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Ermittler
- Studienleiter: Barbara Rathmell, MD, SynapDx Corp
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Studienabschluss (Tatsächlich)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Schätzen)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Schätzen)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Schlüsselwörter
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
- 12002 (Registrierungskennung: DAIDS-ES)
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