Estudo de análise de expressão genética de autismo SynapDx (STORY) (STORY)
Estudo de Análise de Expressão Gênica do Transtorno do Espectro do Autismo SynapDx
Este estudo incluirá prospectivamente aproximadamente 880 crianças, com pelo menos 18 meses e menos de 60 meses de idade, que foram encaminhadas para um centro de avaliação do desenvolvimento pediátrico. As crianças inscritas terão coleta de sangue para análise de expressão gênica de RNA e, opcionalmente, para análise de metabólitos, lipídios e DNA e serão submetidas a uma avaliação clínica para determinar a presença ou ausência de diagnóstico de TEA.
O objetivo primário deste estudo é:
- Desenvolver um algoritmo para classificar padrões de expressão gênica de RNA sanguíneo para maximizar a concordância entre a classificação e uma avaliação clínica da presença ou ausência de Transtornos do Espectro do Autismo (TEA).
Os objetivos secundários deste estudo são:
- Desenvolver um algoritmo para classificar metabólitos plasmáticos e/ou perfis lipídicos de forma a maximizar a concordância entre a classificação e uma avaliação clínica da presença ou ausência de TEA.
- Avaliar prospectivamente a sensibilidade clínica e a especificidade do metabólito plasmático e/ou algoritmo de classificação do perfil lipídico em uma população separada composta por crianças encaminhadas a uma clínica de avaliação do desenvolvimento para um possível distúrbio do desenvolvimento (DD).
- Avaliar a sensibilidade e especificidade clínica de várias combinações de assinatura de expressão gênica, assinaturas de metabólitos e/ou lipídios e presença de variação genética associada a ASD detectada por análise de microarranjo cromossômico (CMA) ou sequenciamento de regiões codificadoras de proteínas do genoma.
Visão geral do estudo
Status
Condições
Descrição detalhada
O objetivo principal deste estudo é definir uma assinatura de expressão gênica indicativa de TEA e estabelecer sua sensibilidade e especificidade clínica. O diagnóstico clínico de TEA será feito usando o DSM-5 como instrumento padrão de referência. O amplamente utilizado instrumento de diagnóstico Autism Diagnostic Observation Schedule (ADOS-2) é um componente típico da avaliação clínica para uma criança diagnosticada com TEA e esta avaliação será realizada em todos os participantes do estudo. Os objetivos secundários deste estudo são (1) definir metabólitos e assinaturas lipídicas indicativas de TEA e estabelecer sua sensibilidade e especificidade clínicas e (2) determinar a sensibilidade e especificidade clínicas de várias combinações de assinatura de expressão gênica, metabólitos e/ou assinaturas lipídicas, e presença de variação genética associada ao TEA detectada por CMA e sequenciamento de regiões codificadoras de proteínas do genoma
Análises: Os detalhes da análise serão especificados em um Plano de Análise Estatística (SAP), que incluirá procedimentos para lidar com valores discrepantes, dados ausentes e diferenças entre sites. O SAP será revisado e aprovado por um comitê de Pesquisadores Principais (PIs) antes de revelar o conjunto de validação.
Análises primárias: Os resultados primários do estudo serão as estimativas da sensibilidade clínica e especificidade do teste SDX-002 para classificar indivíduos de acordo com o diagnóstico de TEA do DSM-5, com intervalos de confiança associados de 95%. A sensibilidade e a especificidade serão avaliadas na população da Fase de Validação com base na concordância com o diagnóstico clínico de presença ou ausência de Transtorno do Espectro Autista pelo DSM-5 (publicado em maio de 2013).
A assinatura da expressão gênica será treinada no conjunto de Fase de Desenvolvimento de 500 indivíduos, usando validação cruzada de 5 vezes sobre os resultados de vários algoritmos de aprendizado de máquina, incluindo mínimos quadrados parciais, máquinas de vetor de suporte e árvores de decisão aprimoradas. O procedimento de treinamento gerará curvas ROC estimadas para cada método, bem como intervalos de confiança para a área sob a curva (AUC). A escolha final de um algoritmo de aprendizado de máquina será baseada na AUC, bem como no desempenho estimado no ponto de operação escolhido na curva ROC. O ponto de operação será escolhido para fornecer alta sensibilidade em uma especificidade aceitável.
Análises secundárias: Na maioria dos pacientes inscritos até o momento, foi obtido consentimento para a coleta de uma amostra de biorrepositório opcional. A análise pretendida das amostras do bio-repositório já foi estabelecida (ver também os objetivos secundários listados acima). As assinaturas metabolômicas e lipômicas serão avaliadas de forma semelhante no subconjunto dos 500 indivíduos no conjunto da Fase de Desenvolvimento que consentem em uma amostra de bio-repositório. Além da assinatura de expressão gênica, assinaturas de metabólitos e/ou lipídios e análise de DNA serão combinadas com a assinatura de expressão gênica em várias configurações e o impacto dessas medidas adicionais na sensibilidade e especificidade clínica será avaliado. Se essas assinaturas metabolômicas/lipômicas adicionais e/ou análises de DNA melhorarem o desempenho do teste, esses elementos podem ser incluídos no ensaio SDX-002.
A sensibilidade e a especificidade do ensaio SDX-002 final também serão avaliadas entre as subpopulações usando informações demográficas e os resultados dos testes de desenvolvimento. É provável que haja poucos indivíduos em muitas dessas subpopulações e cautela será usada na interpretação dos resultados. Análises de subpopulações planejadas incluem sexo, idade, etnia, subcategoria de diagnóstico de TEA DSM-IV-TR, nível de gravidade de DSM-5 ASD (comunicação social e interesses restritos/comportamentos repetitivos) e pontuações ADOS-2.
Tipo de estudo
Inscrição (Antecipado)
Contactos e Locais
Locais de estudo
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Alberta
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Edmonton, Alberta, Canadá, T5G 0B7
- Glenrose Rehabilitation Hospital
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Ontario
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Toronto, Ontario, Canadá, M4G 1R8
- Holland Bloorview Kids Rehabilitation Hospital
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Arizona
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Scottsdale, Arizona, Estados Unidos, 85254
- Melmed Center
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California
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Long Beach, California, Estados Unidos, 90806
- Miller Children's Hospital
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Sacramento, California, Estados Unidos, 95817
- UC Davis MIND Institute
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Georgia
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Decatur, Georgia, Estados Unidos, 30033
- Emory University
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Illinois
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Chicago, Illinois, Estados Unidos, 60612
- Rush Medical Center
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Indiana
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Indianapolis, Indiana, Estados Unidos, 46202
- Riley Hospital for Children
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Massachusetts
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Boston, Massachusetts, Estados Unidos, 02115
- Children's Hospital Boston
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Lexington, Massachusetts, Estados Unidos, 02421
- Lurie Center Massachusetts General Hospital
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New York
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New York, New York, Estados Unidos, 10029
- Mount Sinai School of Medicine/Seaver Center
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Staten Island, New York, Estados Unidos, 10314
- Institute for Behavioral Research on Staten Island
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North Carolina
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Chapel Hill, North Carolina, Estados Unidos, 27517
- University of North Carolina at Chapel Hill
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Ohio
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Cincinnati, Ohio, Estados Unidos, 45229
- Cincinnati Children's Hospital Medical Center
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Columbus, Ohio, Estados Unidos, 43205
- Nationwide Children's Hospital
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Pennsylvania
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Philadelphia, Pennsylvania, Estados Unidos, 19104
- Children's Hospital of Philadelphia
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South Carolina
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Charleston, South Carolina, Estados Unidos, 29425
- Medical University of South Carolina
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Tennessee
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Nashville, Tennessee, Estados Unidos, 37212
- Vanderbilt University
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Texas
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Houston, Texas, Estados Unidos, 77054
- Baylor College of Medicine/Texas Children's Hospital
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Washington
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Seattle, Washington, Estados Unidos, 98121
- Seattle Children's
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
Aceita Voluntários Saudáveis
Gêneros Elegíveis para o Estudo
Método de amostragem
População do estudo
Descrição
Critério de inclusão:
- Encaminhado a um centro de avaliação do desenvolvimento para avaliação de um possível distúrbio do desenvolvimento, além de problemas motores isolados.
- Mínimo de 18 meses e inferior a 60 meses.
- Os pais/responsáveis legais foram informados sobre o estudo e assinaram um termo de consentimento informado.
Critério de exclusão:
- Diagnóstico prévio confiável de Transtorno do Espectro do Autismo (ou seja, avaliação prévia por uma equipe multidisciplinar já estabeleceu o diagnóstico de Transtorno do Espectro Autista de forma confiável).
- Incapaz ou sem vontade de concluir os procedimentos do estudo.
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
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Grupo de Desenvolvimento
Na Fase de Desenvolvimento, as análises serão realizadas até que o algoritmo de classificação seja finalizado.
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Grupo de Validação
A Fase de Validação avaliará o desempenho do algoritmo de classificação finalizado em 300 indivíduos.
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Prazo |
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Expressão gênica de RNA no sangue periférico
Prazo: Até 30 dias após a coleta
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Até 30 dias após a coleta
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Prazo |
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Metabólitos, lipídios e variação do DNA no sangue periférico
Prazo: Até 30 dias após a coleta
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Até 30 dias após a coleta
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Investigadores
- Diretor de estudo: Barbara Rathmell, MD, SynapDx Corp
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo
Conclusão Primária (Real)
Conclusão do estudo (Real)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Estimativa)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Estimativa)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- 12002 (Identificador de registro: DAIDS-ES)
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