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Étude d'analyse de l'expression génique de l'autisme SynapDx (STORY) (STORY)

15 décembre 2014 mis à jour par: SynapDx

Étude d'analyse de l'expression génique des troubles du spectre autistique SynapDx

Cette étude recrutera de manière prospective environ 880 enfants, âgés d'au moins 18 mois et de moins de 60 mois, qui ont été référés à un centre d'évaluation du développement pédiatrique. Les enfants inscrits subiront une prise de sang pour l'analyse de l'expression génique de l'ARN et éventuellement pour l'analyse des métabolites, des lipides et de l'ADN et subiront une évaluation clinique pour déterminer la présence ou l'absence d'un diagnostic de TSA.

L'objectif premier de cette étude est :

- Développer un algorithme pour classer les modèles d'expression des gènes de l'ARN sanguin afin de maximiser la concordance entre la classification et une évaluation clinique de la présence ou de l'absence de troubles du spectre autistique (TSA).

Les objectifs secondaires de cette étude sont :

Développer un algorithme pour classer les métabolites plasmatiques et/ou les profils lipidiques de manière à maximiser la concordance entre la classification et une évaluation clinique de la présence ou de l'absence de TSA.
Évaluer de manière prospective la sensibilité et la spécificité cliniques de l'algorithme de classification des métabolites plasmatiques et/ou du profil lipidique dans une population distincte composée d'enfants référés à une clinique d'évaluation du développement pour un éventuel trouble du développement (DD).
Évaluer la sensibilité et la spécificité cliniques de diverses combinaisons de signatures d'expression génique, de métabolites et/ou de signatures lipidiques, et la présence d'une variation génétique associée à l'ASD détectée par l'analyse des microréseaux chromosomiques (CMA) ou le séquençage des régions codant pour les protéines du génome.

Aperçu de l'étude

Statut

Complété

Les conditions

Autisme

Description détaillée

L'objectif principal de cette étude est de définir une signature d'expression génique indicative de TSA et d'établir sa sensibilité et sa spécificité cliniques. Le diagnostic clinicien de TSA sera effectué en utilisant le DSM-5 comme instrument standard de référence. L'instrument de diagnostic largement utilisé Autism Diagnostic Observation Schedule (ADOS-2) est un élément typique de l'évaluation clinique d'un enfant diagnostiqué avec un TSA et cette évaluation sera effectuée sur tous les participants à l'étude. Les objectifs secondaires de cette étude sont (1) de définir les signatures métabolites et lipidiques indicatives des TSA et d'établir leur sensibilité et spécificité cliniques et (2) de déterminer la sensibilité et la spécificité cliniques de diverses combinaisons de signatures d'expression génique, de métabolites et/ou de signatures lipidiques, et présence d'une variation génétique associée au TSA détectée par CMA et séquençage des régions codant pour les protéines du génome

Analyses : les détails de l'analyse seront spécifiés dans un plan d'analyse statistique (PAS), qui comprendra des procédures de traitement des valeurs aberrantes, des données manquantes et des différences entre les sites. Le SAP sera examiné et approuvé par un comité de chercheurs principaux (PI) avant la levée de l'aveugle de l'ensemble de validation.

Analyses principales : les principaux résultats de l'étude seront les estimations de la sensibilité et de la spécificité cliniques du test SDX-002 pour classer les sujets selon le diagnostic de TSA du DSM-5, avec des intervalles de confiance associés à 95 %. La sensibilité et la spécificité seront évaluées sur la population de la phase de validation en fonction de la concordance avec le diagnostic clinique de présence ou d'absence de trouble du spectre autistique par le DSM-5 (publié en mai 2013).

La signature d'expression génique sera formée sur l'ensemble de la phase de développement de 500 sujets, en utilisant une validation croisée quintuple sur les résultats de plusieurs algorithmes d'apprentissage automatique, y compris les moindres carrés partiels, les machines à vecteurs de support et les arbres de décision boostés. La procédure de formation générera des courbes ROC estimées pour chaque méthode, ainsi que des intervalles de confiance pour l'aire sous la courbe (AUC). Le choix final d'un algorithme d'apprentissage automatique sera basé sur l'AUC, ainsi que sur les performances estimées au point de fonctionnement choisi sur la courbe ROC. Le point de fonctionnement sera choisi pour fournir une sensibilité élevée à une spécificité acceptable.

Analyses secondaires : Chez la majorité des patients inscrits à ce jour, le consentement a été obtenu pour le prélèvement d'un échantillon de bio-dépôt facultatif. L'analyse prévue des échantillons du bio-dépôt est maintenant établie (voir également les objectifs secondaires énumérés ci-dessus). Les signatures métabolomique et lipomique seront évaluées de la même manière sur le sous-ensemble des 500 sujets de l'ensemble de la phase de développement qui consentent à un échantillon de bio-dépôt. En plus de la signature d'expression génique, les signatures métabolites et/ou lipidiques et l'analyse de l'ADN seront combinées avec la signature d'expression génique dans diverses configurations et l'impact de ces mesures supplémentaires sur la sensibilité et la spécificité cliniques sera évalué. Si ces signatures métabolomiques/lipomiques et/ou analyses d'ADN supplémentaires améliorent les performances du test, ces éléments peuvent être inclus dans le test SDX-002.

La sensibilité et la spécificité du test SDX-002 final seront également évaluées parmi les sous-populations à l'aide d'informations démographiques et des résultats des tests de développement. Il est probable qu'il y ait peu de sujets dans bon nombre de ces sous-populations et la prudence sera de mise dans l'interprétation des résultats. Les analyses de sous-population prévues incluent le sexe, l'âge, l'origine ethnique, la sous-catégorie de diagnostic de TSA DSM-IV-TR, le niveau de gravité du TSA DSM-5 (communication sociale et intérêts restreints/comportements répétitifs) et les scores ADOS-2.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Anticipé)

880

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

Canada
- Alberta
  - Edmonton, Alberta, Canada, T5G 0B7
    - Glenrose Rehabilitation Hospital
- Ontario
  - Toronto, Ontario, Canada, M4G 1R8
    - Holland Bloorview Kids Rehabilitation Hospital
États-Unis
- Arizona
  - Scottsdale, Arizona, États-Unis, 85254
    - Melmed Center
- California
  - Long Beach, California, États-Unis, 90806
    - Miller Children's Hospital
  - Sacramento, California, États-Unis, 95817
    - UC Davis MIND Institute
- Georgia
  - Decatur, Georgia, États-Unis, 30033
    - Emory University
- Illinois
  - Chicago, Illinois, États-Unis, 60612
    - Rush Medical Center
- Indiana
  - Indianapolis, Indiana, États-Unis, 46202
    - Riley Hospital for Children
- Massachusetts
  - Boston, Massachusetts, États-Unis, 02115
    - Children's Hospital Boston
  - Lexington, Massachusetts, États-Unis, 02421
    - Lurie Center Massachusetts General Hospital
- New York
  - New York, New York, États-Unis, 10029
    - Mount Sinai School of Medicine/Seaver Center
  - Staten Island, New York, États-Unis, 10314
    - Institute for Behavioral Research on Staten Island
- North Carolina
  - Chapel Hill, North Carolina, États-Unis, 27517
    - University of North Carolina at Chapel Hill
- Ohio
  - Cincinnati, Ohio, États-Unis, 45229
    - Cincinnati Children's Hospital Medical Center
  - Columbus, Ohio, États-Unis, 43205
    - Nationwide Children's Hospital
- Pennsylvania
  - Philadelphia, Pennsylvania, États-Unis, 19104
    - Children's Hospital of Philadelphia
- South Carolina
  - Charleston, South Carolina, États-Unis, 29425
    - Medical University of South Carolina
- Tennessee
  - Nashville, Tennessee, États-Unis, 37212
    - Vanderbilt University
- Texas
  - Houston, Texas, États-Unis, 77054
    - Baylor College of Medicine/Texas Children's Hospital
- Washington
  - Seattle, Washington, États-Unis, 98121
    - Seattle Children's

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

1 an à 5 ans (Enfant)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon de probabilité

Population étudiée

Les enfants de 18 mois à moins de 60 mois sont dirigés vers un centre d'évaluation du développement pour l'évaluation d'un éventuel trouble du développement.

La description

Critère d'intégration:

Aiguillé vers un centre d'évaluation du développement pour l'évaluation d'un possible trouble du développement, autre que des problèmes moteurs isolés.
Au moins 18 mois et moins de 60 mois.
Le parent/tuteur légal a été informé de l'étude et a signé un formulaire de consentement éclairé.

Critère d'exclusion:

Diagnostic antérieur fiable de trouble du spectre autistique (c.-à-d. une évaluation préalable par une équipe multidisciplinaire a déjà établi de manière fiable un diagnostic de trouble du spectre autistique).
Incapable ou refusant de terminer les procédures d'étude.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Nombre de groupes / cohortes

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Groupe de développement Dans la phase de développement, des analyses seront effectuées jusqu'à ce que l'algorithme de classification soit finalisé.
Groupe de validation La phase de validation évaluera les performances de l'algorithme de classification finalisé chez 300 sujets.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats	Délai
Expression du gène de l'ARN dans le sang périphérique Délai: Dans les 30 jours suivant la collecte	Dans les 30 jours suivant la collecte

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats	Délai
Métabolites, lipides et variation de l'ADN dans le sang périphérique Délai: Dans les 30 jours suivant la collecte	Dans les 30 jours suivant la collecte

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

SynapDx

Les enquêteurs

Directeur d'études: Barbara Rathmell, MD, SynapDx Corp

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude

1 mars 2013

Achèvement primaire (Réel)

1 juillet 2014

Achèvement de l'étude (Réel)

1 décembre 2014

Dates d'inscription aux études

Première soumission

11 mars 2013

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

12 mars 2013

Première publication (Estimation)

13 mars 2013

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Estimation)

17 décembre 2014

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

15 décembre 2014

Dernière vérification