Studio sull'analisi dell'espressione genica dell'autismo SynapDx (STORY) (STORY)
Studio sull'analisi dell'espressione genica del disturbo dello spettro autistico SynapDx
Questo studio arruolerà prospetticamente circa 880 bambini, di età compresa tra almeno 18 mesi e meno di 60 mesi, che sono stati indirizzati a un centro di valutazione dello sviluppo pediatrico. I bambini arruolati riceveranno un prelievo di sangue per l'analisi dell'espressione genica dell'RNA e facoltativamente per l'analisi di metaboliti, lipidi e DNA e saranno sottoposti a una valutazione clinica per determinare la presenza o l'assenza di una diagnosi di ASD.
L'obiettivo primario di questo studio è:
- Sviluppare un algoritmo per classificare i modelli di espressione genica dell'RNA nel sangue per massimizzare l'accordo tra la classificazione e una valutazione clinica della presenza o dell'assenza di disturbi dello spettro autistico (ASD).
Gli obiettivi secondari di questo studio sono:
- Sviluppare un algoritmo per classificare i metaboliti plasmatici e/o i profili lipidici in modo tale da massimizzare l'accordo tra la classificazione e una valutazione clinica della presenza o assenza di ASD.
- Valutare in modo prospettico la sensibilità clinica e la specificità dell'algoritmo di classificazione del metabolita plasmatico e/o del profilo lipidico in una popolazione separata composta da bambini indirizzati a una clinica di valutazione dello sviluppo per un possibile disturbo dello sviluppo (DD).
- Valutare la sensibilità clinica e la specificità di varie combinazioni di firme di espressione genica, firme di metaboliti e/o lipidi e presenza di variazioni genetiche associate all'ASD rilevate mediante analisi di microarray cromosomico (CMA) o sequenziamento di regioni codificanti proteine del genoma.
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Descrizione dettagliata
Lo scopo principale di questo studio è definire una firma di espressione genica indicativa di ASD e stabilire la sua sensibilità e specificità clinica. La diagnosi clinica di ASD verrà effettuata utilizzando il DSM-5 come strumento standard di riferimento. Lo strumento diagnostico ampiamente utilizzato Autism Diagnostic Observation Schedule (ADOS-2) è un componente tipico della valutazione clinica per un bambino con diagnosi di ASD e questa valutazione verrà eseguita su tutti i partecipanti allo studio. Gli obiettivi secondari di questo studio sono (1) definire le firme metabolita e lipidica indicative di ASD e stabilire la loro sensibilità e specificità clinica e (2) determinare la sensibilità clinica e la specificità di varie combinazioni di firma di espressione genica, metabolita e / o firme lipidiche, e presenza di variazione genetica associata all'ASD rilevata dalla CMA e dal sequenziamento delle regioni codificanti proteine del genoma
Analisi: i dettagli dell'analisi saranno specificati in un piano di analisi statistica (SAP), che includerà procedure per la gestione di valori anomali, dati mancanti e differenze tra i siti. Il SAP sarà esaminato e approvato da un comitato di Principal Investigators (PI) prima di sbloccare il set di convalida.
Analisi primarie: i risultati primari dello studio saranno le stime della sensibilità clinica e della specificità del test SDX-002 per classificare i soggetti in base alla diagnosi DSM-5 ASD, con intervalli di confidenza del 95% associati. La sensibilità e la specificità saranno valutate sulla popolazione della fase di convalida in base all'accordo con la diagnosi clinica di presenza o assenza di disturbo dello spettro autistico del DSM-5 (pubblicato a maggio 2013).
La firma dell'espressione genica verrà addestrata sul set della fase di sviluppo di 500 soggetti, utilizzando la convalida incrociata di 5 volte sui risultati di diversi algoritmi di apprendimento automatico, inclusi minimi quadrati parziali, macchine vettoriali di supporto e alberi decisionali potenziati. La procedura di addestramento genererà curve ROC stimate per ciascun metodo, nonché intervalli di confidenza per l'area sotto la curva (AUC). La scelta finale di un algoritmo di apprendimento automatico sarà basata sull'AUC, nonché sulla prestazione stimata nel punto operativo scelto sulla curva ROC. Il punto operativo sarà scelto per fornire alta sensibilità ad una specificità accettabile.
Analisi secondarie: nella maggior parte dei pazienti arruolati fino ad oggi, è stato ottenuto il consenso per la raccolta di un campione biologico facoltativo. L'analisi prevista dei campioni di biorepository è stata ora stabilita (vedere anche gli obiettivi secondari sopra elencati). Le firme metabolomiche e lipomiche saranno valutate in modo simile sul sottoinsieme dei 500 soggetti nel set della fase di sviluppo che acconsentono a un campione di bio-repository. Oltre alla firma dell'espressione genica, le firme dei metaboliti e/o dei lipidi e l'analisi del DNA saranno combinate con la firma dell'espressione genica in varie configurazioni e sarà valutato l'impatto di queste misure aggiuntive sulla sensibilità e specificità clinica. Se queste ulteriori firme metabolomiche/lipomiche e/o analisi del DNA migliorano le prestazioni del test, questi elementi possono essere inclusi nel test SDX-002.
La sensibilità e la specificità del test SDX-002 finale saranno inoltre valutate tra le sottopopolazioni utilizzando informazioni demografiche e i risultati dei test di sviluppo. È probabile che ci siano pochi soggetti in molte di queste sottopopolazioni e sarà usata cautela nell'interpretazione dei risultati. Le analisi pianificate della sottopopolazione includono sesso, età, etnia, sottocategoria diagnostica ASD DSM-IV-TR, livello di gravità ASD DSM-5 (comunicazione sociale e interessi ristretti/comportamenti ripetitivi) e punteggi ADOS-2.
Tipo di studio
Iscrizione (Anticipato)
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
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Alberta
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Edmonton, Alberta, Canada, T5G 0B7
- Glenrose Rehabilitation Hospital
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Ontario
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Toronto, Ontario, Canada, M4G 1R8
- Holland Bloorview Kids Rehabilitation Hospital
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Arizona
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Scottsdale, Arizona, Stati Uniti, 85254
- Melmed Center
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California
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Long Beach, California, Stati Uniti, 90806
- Miller Children's Hospital
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Sacramento, California, Stati Uniti, 95817
- Uc Davis Mind Institute
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Georgia
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Decatur, Georgia, Stati Uniti, 30033
- Emory University
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Illinois
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Chicago, Illinois, Stati Uniti, 60612
- Rush Medical Center
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Indiana
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Indianapolis, Indiana, Stati Uniti, 46202
- Riley Hospital for Children
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Massachusetts
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Boston, Massachusetts, Stati Uniti, 02115
- Children's Hospital Boston
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Lexington, Massachusetts, Stati Uniti, 02421
- Lurie Center Massachusetts General Hospital
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New York
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New York, New York, Stati Uniti, 10029
- Mount Sinai School of Medicine/Seaver Center
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Staten Island, New York, Stati Uniti, 10314
- Institute for Behavioral Research on Staten Island
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North Carolina
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Chapel Hill, North Carolina, Stati Uniti, 27517
- University of North Carolina at Chapel Hill
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Ohio
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Cincinnati, Ohio, Stati Uniti, 45229
- Cincinnati Children's Hospital Medical Center
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Columbus, Ohio, Stati Uniti, 43205
- Nationwide Children's Hospital
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Pennsylvania
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Philadelphia, Pennsylvania, Stati Uniti, 19104
- Children's Hospital of Philadelphia
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South Carolina
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Charleston, South Carolina, Stati Uniti, 29425
- Medical University of South Carolina
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Tennessee
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Nashville, Tennessee, Stati Uniti, 37212
- Vanderbilt University
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Texas
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Houston, Texas, Stati Uniti, 77054
- Baylor College of Medicine/Texas Children's Hospital
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Washington
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Seattle, Washington, Stati Uniti, 98121
- Seattle Children's
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Inviato a un centro di valutazione dello sviluppo per la valutazione di un possibile disturbo dello sviluppo, diverso da problemi motori isolati.
- Almeno 18 mesi e meno di 60 mesi.
- Il genitore/tutore legale è stato informato dello studio e ha firmato un modulo di consenso informato.
Criteri di esclusione:
- Pregressa diagnosi affidabile di Disturbo dello Spettro Autistico (es. la valutazione preventiva da parte di un team multidisciplinare ha già stabilito in modo affidabile la diagnosi di disturbo dello spettro autistico).
- Incapace o riluttante a completare le procedure di studio.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
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Gruppo di sviluppo
Nella fase di sviluppo, verranno eseguite analisi fino alla finalizzazione dell'algoritmo di classificazione.
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Gruppo di convalida
La fase di convalida valuterà le prestazioni dell'algoritmo di classificazione finalizzato in 300 soggetti.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Lasso di tempo |
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Espressione genica dell'RNA nel sangue periferico
Lasso di tempo: Entro 30 giorni dalla raccolta
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Entro 30 giorni dalla raccolta
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Lasso di tempo |
|---|---|
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Metaboliti, lipidi e variazione del DNA nel sangue periferico
Lasso di tempo: Entro 30 giorni dalla raccolta
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Entro 30 giorni dalla raccolta
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Investigatori
- Direttore dello studio: Barbara Rathmell, MD, SynapDx Corp
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio
Completamento primario (Effettivo)
Completamento dello studio (Effettivo)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Stima)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Stima)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- 12002 (Identificatore di registro: DAIDS-ES)
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