Sweden Cancerome Analysis Network - Breast : 乳がんのゲノムプロファイリング (SCAN-B)
2026年8月24日 更新者：Åke Borg、Lund University
SCAN-B: スウェーデンがん解析ネットワーク - 乳房イニシアチブ
この研究では、乳癌のゲノム プロファイルを前向きかつ集団ベースの方法で評価します。
第 1 段階では、乳房腫瘍は全トランスクリプトーム RNA シーケンスによって分析されます。
乳がんの新しい分子診断アッセイを開発する目的で、患者情報、臨床病理学的変数、転帰との関連で、遺伝子発現プロファイル、変異プロファイル、および転写物アイソフォームレベルのデータが分析されます。
今後、追加のゲノム規模の RNA、DNA、およびタンパク質分析が実施される予定です。
調査の概要
状態
募集
条件
詳細な説明
乳癌は、分子的、病理学的、臨床的にかなりの不均一性を示します。 現在の患者および臨床病理学的評価は転帰を予測するのに不完全であり、その結果、多くの患者が過剰治療され、他の患者は再発性疾患による死亡につながります。 したがって、ケアをより個別化し、治療の有効性と生存率を最大化するには、追加の基準が必要です。
Sweden Cancerome Analysis Network - Breast (SCAN-B) 研究は、トランスレーショナル リサーチ用の次世代ゲノム技術を使用して乳がんを分析し、ヘルスケアと統合するという長期的な目的を持つ、多施設共同前向き集団ベースの観察研究として 2010 年に開始されました。これらの分析から基本的な腫瘍生物学を解読します。ゲノムデータを利用して、臨床的に実用的な新しいバイオマーカーアッセイを開発および検証します。分子診断、予後、および予測テストのリアルタイムの臨床実装を確立します。 最初のフェーズでは、次世代 RNA シーケンスによる分子プロファイリングに焦点を当てます。 乳がんの新しい分子診断アッセイを開発する目的で、患者情報、臨床病理学的変数、転帰との関連で、遺伝子発現プロファイル、変異プロファイル、および転写物アイソフォームレベルのデータが分析されます。 今後、追加のゲノム規模の RNA、DNA、およびタンパク質分析が実施される予定です。
2021 年 10 月の時点で、17,000 人を超える患者がこの研究に登録しており、対象地域内のすべての適格患者の約 85% に相当します。 組織と採血はヘルスケアルーチンに統合され、臨床情報は国家品質登録から提供されます。
研究の種類
観察的
入学 (推定)
20000
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究連絡先
- 名前：Åke Borg, PhD
- 電話番号：+46-46-2752552
- メール：ake.borg@med.lu.se
研究連絡先のバックアップ
- 名前：Lao Saal, MD, PhD
- メール：lao.saal@med.lu.se
研究場所
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Borås、スウェーデン
- 募集
- Södra Älvsborg Hospital
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コンタクト：
- Zakaria Einbeigi, PhD MD
- 電話番号：+4603306161000
- メール：zakaria.einbeigi@oncology.gu.se
-
Halmstad、スウェーデン、30233
- 一時停止
- Hallands Hospital Halmstad
-
Helsingborg、スウェーデン、25187
- 募集
- Helsingborg Hospital
-
コンタクト：
- Anna-Karin Falck, MD
- メール：anna-karin.falck@skane.se
-
Jönköping、スウェーデン、55185
- 一時停止
- Kirurgiska kliniken
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Karlskrona、スウェーデン、37185
- 募集
- Blekinge County Hospital
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コンタクト：
- Monika Sjövall, MD
- メール：monika.sjovall@ltblekinge.se
-
Kristianstad、スウェーデン、29185
- 募集
- Central Hospital Kristianstad
-
コンタクト：
- Tor Svensjö, MD, PhD
- メール：tor.svensjo@skane.se
-
Lund、スウェーデン、22185
- 募集
- Skane University Hospital
-
コンタクト：
- Lisa Rydén, MD PhD
- 電話番号：+46-46-176241
- メール：lisa.ryden@med.lu.se
-
Malmö、スウェーデン、20502
- 募集
- Skane University Hospital
-
コンタクト：
- Martin Rehn, MD, PhD
- 電話番号：+46-40-331892
- メール：martin.rehn@skane.se
-
Uppsala、スウェーデン、75185
- 募集
- Uppsala University Hospital
-
コンタクト：
- Tobias Sjöblom, PhD
- 電話番号：+46-18-4715036
- メール：tobias.sjoblom@igp.uu.se
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Vaxjo、スウェーデン、35234
- 募集
- Central Hospital Växjö
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コンタクト：
- Per Weber, MD
- 電話番号：+46-470-588052
- メール：per.weber@ltkronoberg.se
-
-
参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
いいえ
サンプリング方法
確率サンプル
調査対象母集団
スウェーデン南部のヘルスケア地域、ウプサラ郡、およびヨンショーピング郡の参加病院システム内で原発性乳がんの診断が疑われる、または確定診断されたすべての患者。
北欧諸国内からの追加の病院サイトの参加を歓迎します。
説明
包含基準:
- 原発性乳癌の疑いまたは確定診断
- 署名済みのインフォームド コンセント
除外基準:
- 署名されたインフォームドコンセントの欠如
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 観測モデル：コホート
- 時間の展望：見込みのある
この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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バイオマーカーと臨床病理情報
時間枠：最長20年
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ゲノムデータ（バイオマーカー）の分析と、患者および腫瘍の臨床病理学的情報との関係;分析的妥当性の評価。
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最長20年
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侵襲性疾患のない生存率
時間枠：20年まで
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異なるバイオマーカーは、例えば、特定の治療を受けているすべての患者または特定の分子サブタイプの腫瘍を有する患者など、予測コホートの異なるサブグループの異なる時点で、浸潤性疾患のない生存期間（IDFS）に関連して分析されます。
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20年まで
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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病理学的反応
時間枠：術中
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術前治療を受けている患者の手術時の病理学的反応に関連して、さまざまなバイオマーカーが分析されます。
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術中
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全生存
時間枠：3年、5年、10年、15年、20年
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さまざまなバイオマーカーは、将来コホートのさまざまなサブグループ、たとえば、特定の治療を受けているすべての患者または特定の分子サブタイプの腫瘍を有する患者について、さまざまな時点での全生存期間（OS）に関連して分析されます。
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3年、5年、10年、15年、20年
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乳がん特異的生存率
時間枠：3年、5年、10年、15年、20年
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乳がん生存率 (BCS) に関連して、将来コホートのさまざまなサブグループ、たとえば特定の治療を受けているすべての患者や特定の分子サブタイプの腫瘍を有する患者について、さまざまな時点でさまざまなバイオマーカーが分析されます。
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3年、5年、10年、15年、20年
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協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
スポンサー
捜査官
- スタディディレクター：Åke Borg, PhD、Lund University
- 主任研究者：Christer Larsson, PhD、Lund University
- 主任研究者：Niklas Loman, MD, PhD、Skane University Hospital
- 主任研究者：Anna Ehinger, MD, PhD、Skane University Hospital
- 主任研究者：Lisa Rydén, MD, PhD、Skane University Hospital
- 主任研究者：Lao H Saal, MD, PhD、Lund University
- スタディチェア：Cecilia Hegardt, PhD、Lund University
- 主任研究者：Johan Vallon-Christersson, PhD、Lund University
出版物と役立つリンク
研究に関する情報を入力する責任者は、自発的にこれらの出版物を提供します。これらは、研究に関連するあらゆるものに関するものである可能性があります。
一般刊行物
- Ryden L, Loman N, Larsson C, Hegardt C, Vallon-Christersson J, Malmberg M, Lindman H, Ehinger A, Saal LH, Borg A. Minimizing inequality in access to precision medicine in breast cancer by real-time population-based molecular analysis in the SCAN-B initiative. Br J Surg. 2018 Jan;105(2):e158-e168. doi: 10.1002/bjs.10741.
- Saal LH, Vallon-Christersson J, Hakkinen J, Hegardt C, Grabau D, Winter C, Brueffer C, Tang MH, Reutersward C, Schulz R, Karlsson A, Ehinger A, Malina J, Manjer J, Malmberg M, Larsson C, Ryden L, Loman N, Borg A. The Sweden Cancerome Analysis Network - Breast (SCAN-B) Initiative: a large-scale multicenter infrastructure towards implementation of breast cancer genomic analyses in the clinical routine. Genome Med. 2015 Feb 2;7(1):20. doi: 10.1186/s13073-015-0131-9. eCollection 2015.
- Staaf J, Glodzik D, Bosch A, Vallon-Christersson J, Reutersward C, Hakkinen J, Degasperi A, Amarante TD, Saal LH, Hegardt C, Stobart H, Ehinger A, Larsson C, Ryden L, Loman N, Malmberg M, Kvist A, Ehrencrona H, Davies HR, Borg A, Nik-Zainal S. Whole-genome sequencing of triple-negative breast cancers in a population-based clinical study. Nat Med. 2019 Oct;25(10):1526-1533. doi: 10.1038/s41591-019-0582-4. Epub 2019 Sep 30.
- Vallon-Christersson J, Hakkinen J, Hegardt C, Saal LH, Larsson C, Ehinger A, Lindman H, Olofsson H, Sjoblom T, Warnberg F, Ryden L, Loman N, Malmberg M, Borg A, Staaf J. Cross comparison and prognostic assessment of breast cancer multigene signatures in a large population-based contemporary clinical series. Sci Rep. 2019 Aug 21;9(1):12184. doi: 10.1038/s41598-019-48570-x.
- Dihge L, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Saal LH, Hakkinen J, Larsson C, Ehinger A, Loman N, Malmberg M, Bendahl PO, Borg A, Staaf J, Ryden L. Prediction of Lymph Node Metastasis in Breast Cancer by Gene Expression and Clinicopathological Models: Development and Validation within a Population-Based Cohort. Clin Cancer Res. 2019 Nov 1;25(21):6368-6381. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-19-0075. Epub 2019 Jul 24.
- Lundgren C, Bendahl PO, Borg A, Ehinger A, Hegardt C, Larsson C, Loman N, Malmberg M, Olofsson H, Saal LH, Sjoblom T, Lindman H, Klintman M, Hakkinen J, Vallon-Christersson J, Ferno M, Ryden L, Ekholm M. Agreement between molecular subtyping and surrogate subtype classification: a contemporary population-based study of ER-positive/HER2-negative primary breast cancer. Breast Cancer Res Treat. 2019 Nov;178(2):459-467. doi: 10.1007/s10549-019-05378-7. Epub 2019 Aug 20.
- Sokilde R, Persson H, Ehinger A, Pirona AC, Ferno M, Hegardt C, Larsson C, Loman N, Malmberg M, Ryden L, Saal L, Borg A, Vallon-Christerson J, Rovira C. Refinement of breast cancer molecular classification by miRNA expression profiles. BMC Genomics. 2019 Jun 17;20(1):503. doi: 10.1186/s12864-019-5887-7.
- Persson H, Sokilde R, Hakkinen J, Pirona AC, Vallon-Christersson J, Kvist A, Mertens F, Borg A, Mitelman F, Hoglund M, Rovira C. Frequent miRNA-convergent fusion gene events in breast cancer. Nat Commun. 2017 Oct 5;8(1):788. doi: 10.1038/s41467-017-01176-1.
- Persson H, Sokilde R, Hakkinen J, Vallon-Christersson J, Mitelman F, Borg A, Hoglund M, Rovira C. Analysis of fusion transcripts indicates widespread deregulation of snoRNAs and their host genes in breast cancer. Int J Cancer. 2020 Jun 15;146(12):3343-3353. doi: 10.1002/ijc.32927. Epub 2020 Feb 28.
- Winter C, Nilsson MP, Olsson E, George AM, Chen Y, Kvist A, Torngren T, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Hakkinen J, Jonsson G, Grabau D, Malmberg M, Kristoffersson U, Rehn M, Gruvberger-Saal SK, Larsson C, Borg A, Loman N, Saal LH. Targeted sequencing of BRCA1 and BRCA2 across a large unselected breast cancer cohort suggests that one-third of mutations are somatic. Ann Oncol. 2016 Aug;27(8):1532-8. doi: 10.1093/annonc/mdw209. Epub 2016 May 18.
- Dahlgren M, George AM, Brueffer C, Gladchuk S, Chen Y, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Hakkinen J, Ryden L, Malmberg M, Larsson C, Gruvberger-Saal SK, Ehinger A, Loman N, Borg A, Saal LH. Preexisting Somatic Mutations of Estrogen Receptor Alpha (ESR1) in Early-Stage Primary Breast Cancer. JNCI Cancer Spectr. 2021 Apr 22;5(2):pkab028. doi: 10.1093/jncics/pkab028. eCollection 2021 Apr.
- Brueffer C, Gladchuk S, Winter C, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Hakkinen J, George AM, Chen Y, Ehinger A, Larsson C, Loman N, Malmberg M, Ryden L, Borg A, Saal LH. The mutational landscape of the SCAN-B real-world primary breast cancer transcriptome. EMBO Mol Med. 2020 Oct 7;12(10):e12118. doi: 10.15252/emmm.202012118. Epub 2020 Sep 14.
- Glodzik D, Bosch A, Hartman J, Aine M, Vallon-Christersson J, Reutersward C, Karlsson A, Mitra S, Nimeus E, Holm K, Hakkinen J, Hegardt C, Saal LH, Larsson C, Malmberg M, Ryden L, Ehinger A, Loman N, Kvist A, Ehrencrona H, Nik-Zainal S, Borg A, Staaf J. Comprehensive molecular comparison of BRCA1 hypermethylated and BRCA1 mutated triple negative breast cancers. Nat Commun. 2020 Jul 27;11(1):3747. doi: 10.1038/s41467-020-17537-2.
- Larsson C, Ehinger A, Winslow S, Leandersson K, Klintman M, Dahl L, Vallon-Christersson J, Hakkinen J, Hegardt C, Manjer J, Saal L, Ryden L, Malmberg M, Borg A, Loman N. Prognostic implications of the expression levels of different immunoglobulin heavy chain-encoding RNAs in early breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2020 Jul 6;6:28. doi: 10.1038/s41523-020-0170-2. eCollection 2020.
- Fornvik D, Aaltonen KE, Chen Y, George AM, Brueffer C, Rigo R, Loman N, Saal LH, Ryden L. Detection of circulating tumor cells and circulating tumor DNA before and after mammographic breast compression in a cohort of breast cancer patients scheduled for neoadjuvant treatment. Breast Cancer Res Treat. 2019 Sep;177(2):447-455. doi: 10.1007/s10549-019-05326-5. Epub 2019 Jun 24.
- Brueffer C, Vallon-Christersson J, Grabau D, Ehinger A, Hakkinen J, Hegardt C, Malina J, Chen Y, Bendahl PO, Manjer J, Malmberg M, Larsson C, Loman N, Ryden L, Borg A, Saal LH. Clinical Value of RNA Sequencing-Based Classifiers for Prediction of the Five Conventional Breast Cancer Biomarkers: A Report From the Population-Based Multicenter Sweden Cancerome Analysis Network-Breast Initiative. JCO Precis Oncol. 2018 Mar 9;2:PO.17.00135. doi: 10.1200/PO.17.00135. eCollection 2018.
- Nilsson MP, Emmertz M, Kristoffersson U, Borg A, Larsson C, Rehn M, Winter C, Saal LH, Brandberg Y, Loman N. Germline mutations in BRCA1 and BRCA2 incidentally revealed in a biobank research study: experiences from re-contacting mutation carriers and relatives. J Community Genet. 2018 Jul;9(3):201-208. doi: 10.1007/s12687-017-0341-5. Epub 2017 Oct 30.
- Nilsson MP, Winter C, Kristoffersson U, Rehn M, Larsson C, Saal LH, Loman N. Efficacy versus effectiveness of clinical genetic testing criteria for BRCA1 and BRCA2 hereditary mutations in incident breast cancer. Fam Cancer. 2017 Apr;16(2):187-193. doi: 10.1007/s10689-016-9953-x.
- Axelsson U, Ryden L, Johnsson P, Eden P, Mansson J, Hallberg IR, Borrebaeck CAK. A multicenter study investigating the molecular fingerprint of psychological resilience in breast cancer patients: study protocol of the SCAN-B resilience study. BMC Cancer. 2018 Aug 6;18(1):789. doi: 10.1186/s12885-018-4669-y.
- Demircan K, Bengtsson Y, Sun Q, Brange A, Vallon-Christersson J, Rijntjes E, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Borg A, Manjer J, Schomburg L. Serum selenium, selenoprotein P and glutathione peroxidase 3 as predictors of mortality and recurrence following breast cancer diagnosis: A multicentre cohort study. Redox Biol. 2021 Nov;47:102145. doi: 10.1016/j.redox.2021.102145. Epub 2021 Sep 21.
- Dalal H, Dahlgren M, Gladchuk S, Brueffer C, Gruvberger-Saal SK, Saal LH. Clinical associations of ESR2 (estrogen receptor beta) expression across thousands of primary breast tumors. Sci Rep. 2022 Mar 18;12(1):4696. doi: 10.1038/s41598-022-08210-3.
- Demircan K, Sun Q, Bengtsson Y, Seemann P, Vallon-Christersson J, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Minich WB, Borg A, Manjer J, Schomburg L. Autoimmunity to selenoprotein P predicts breast cancer recurrence. Redox Biol. 2022 Jul;53:102346. doi: 10.1016/j.redox.2022.102346. Epub 2022 May 25.
- Staaf J, Hakkinen J, Hegardt C, Saal LH, Kimbung S, Hedenfalk I, Lien T, Sorlie T, Naume B, Russnes H, Marcone R, Ayyanan A, Brisken C, Malterling RR, Asking B, Olofsson H, Lindman H, Bendahl PO, Ehinger A, Larsson C, Loman N, Ryden L, Malmberg M, Borg A, Vallon-Christersson J. RNA sequencing-based single sample predictors of molecular subtype and risk of recurrence for clinical assessment of early-stage breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2022 Aug 16;8(1):94. doi: 10.1038/s41523-022-00465-3.
- Saghir H, Veerla S, Malmberg M, Ryden L, Ehinger A, Saal LH, Vallon-Christersson J, Borg A, Hegardt C, Larsson C, Haidar A, Hedenfalk I, Loman N, Kimbung S. How Reliable Are Gene Expression-Based and Immunohistochemical Biomarkers Assessed on a Core-Needle Biopsy? A Study of Paired Core-Needle Biopsies and Surgical Specimens in Early Breast Cancer. Cancers (Basel). 2022 Aug 18;14(16):4000. doi: 10.3390/cancers14164000.
- Bengtsson Y, Demircan K, Vallon-Christersson J, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Borg A, Schomburg L, Sandsveden M, Manjer J. Serum copper, zinc and copper/zinc ratio in relation to survival after breast cancer diagnosis: A prospective multicenter cohort study. Redox Biol. 2023 Jul;63:102728. doi: 10.1016/j.redox.2023.102728. Epub 2023 May 16.
- Demircan K, Bengtsson Y, Chillon TS, Vallon-Christersson J, Sun Q, Larsson C, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Borg A, Manjer J, Schomburg L. Matched analysis of circulating selenium with the breast cancer selenotranscriptome: a multicentre prospective study. J Transl Med. 2023 Sep 23;21(1):658. doi: 10.1186/s12967-023-04502-y.
- Sharma A, Weitz P, Wang Y, Liu B, Vallon-Christersson J, Hartman J, Rantalainen M. Development and prognostic validation of a three-level NHG-like deep learning-based model for histological grading of breast cancer. Breast Cancer Res. 2024 Jan 29;26(1):17. doi: 10.1186/s13058-024-01770-4.
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- Gulis K, Ellbrant J, Svensjo T, Skarping I, Vallon-Christersson J, Loman N, Bendahl PO, Ryden L. A prospective cohort study identifying radiologic and tumor related factors of importance for breast conserving surgery after neoadjuvant chemotherapy. Eur J Surg Oncol. 2023 Jul;49(7):1189-1195. doi: 10.1016/j.ejso.2023.03.225. Epub 2023 Mar 28.
- Bjorklund SS, Aure MR, Hakkinen J, Vallon-Christersson J, Kumar S, Evensen KB, Fleischer T, Tost J; OSBREAC; Sahlberg KK, Mathelier A, Bhanot G, Ganesan S, Tekpli X, Kristensen VN. Subtype and cell type specific expression of lncRNAs provide insight into breast cancer. Commun Biol. 2022 Aug 18;5(1):834. doi: 10.1038/s42003-022-03559-7.
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- Rediti M, Venet D, Joaquin Garcia A, Maetens M, Vincent D, Majjaj S, El-Abed S, Di Cosimo S, Ueno T, Izquierdo M, Piccart M, Pusztai L, Loi S, Salgado R, Viale G, Rothe F, Sotiriou C. Identification of HER2-positive breast cancer molecular subtypes with potential clinical implications in the ALTTO clinical trial. Nat Commun. 2024 Nov 29;15(1):10402. doi: 10.1038/s41467-024-54621-3.
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- Fornvik D, Borgquist S, Larsson M, Zackrisson S, Skarping I. Deep learning analysis of serial digital breast tomosynthesis images in a prospective cohort of breast cancer patients who received neoadjuvant chemotherapy. Eur J Radiol. 2024 Sep;178:111624. doi: 10.1016/j.ejrad.2024.111624. Epub 2024 Jul 14.
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始
2010年8月1日
一次修了 (推定)
2031年8月1日
研究の完了 (推定)
2031年8月1日
試験登録日
最初に提出
2014年12月1日
QC基準を満たした最初の提出物
2014年12月2日
最初の投稿 (推定)
2014年12月3日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
2026年8月27日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2026年8月24日
最終確認日
2026年8月1日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- SCANB001
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
未定
IPD プランの説明
公開時に、関連する匿名化された個々の参加者データが共有されます。
試験データ・資料
-
RNA-seq 処理された遺伝子発現データと注釈 (n=49 患者)
情報識別子：GSE60789情報コメント：スーパーシリーズ: GSE60789 サブシリーズ: GSE60785、GSE60788
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RNA-seq 処理された遺伝子発現データと注釈 (n=3678 患者)
情報識別子：GSE81540情報コメント：スーパーシリーズ: GSE81540 サブシリーズ: GSE81538、GSE96058
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