- ICH GCP
- Registro degli studi clinici negli Stati Uniti
- Sperimentazione clinica NCT02306096
Sweden Cancerome Analysis Network - Breast: Genomic Profiling of Breast Cancer (SCAN-B)
SCAN-B: The Sweden Cancerome Analysis Network - Breast Initiative
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Descrizione dettagliata
Il cancro al seno mostra una significativa eterogeneità molecolare, patologica e clinica. L'attuale valutazione del paziente e clinicopatologico è imperfetta per prevedere l'esito, il che si traduce in un trattamento eccessivo per molti pazienti e, per altri, porta alla morte per malattia ricorrente. Pertanto, sono necessari criteri aggiuntivi per personalizzare meglio l'assistenza e massimizzare l'efficacia del trattamento e la sopravvivenza.
Lo studio Sweden Cancerome Analysis Network - Breast (SCAN-B) è stato avviato nel 2010 come studio osservazionale prospettico multicentrico basato sulla popolazione con obiettivi lungimiranti per analizzare i tumori al seno con tecnologie genomiche di nuova generazione per la ricerca traslazionale e integrata con l'assistenza sanitaria; decifrare la biologia fondamentale del tumore da queste analisi; utilizzare i dati genomici per sviluppare e convalidare nuovi test di biomarcatori utilizzabili clinicamente; e stabilire l'implementazione clinica in tempo reale di test molecolari diagnostici, prognostici e predittivi. Nella prima fase, ci concentriamo sul profilo molecolare mediante il sequenziamento dell'RNA di nuova generazione. I profili di espressione genica, i profili mutazionali e i dati a livello di isoforme di trascrizione saranno analizzati nel contesto delle informazioni del paziente, delle variabili clinicopatologiche e dell'esito, con lo scopo di sviluppare nuovi test diagnostici molecolari per il cancro al seno. In futuro verranno eseguite ulteriori analisi di RNA, DNA e proteine su scala genomica.
A partire da ottobre 2021, oltre 17.000 pazienti si sono arruolati nello studio, rappresentando circa l'85% di tutti i pazienti idonei all'interno del bacino di utenza. La raccolta dei tessuti e del sangue è integrata nelle routine sanitarie e le informazioni cliniche sono fornite dai registri di qualità nazionali.
Tipo di studio
Iscrizione (Stimato)
Contatti e Sedi
Contatto studio
- Nome: Åke Borg, PhD
- Numero di telefono: +46-46-2752552
- Email: ake.borg@med.lu.se
Backup dei contatti dello studio
- Nome: Lao Saal, MD, PhD
- Email: lao.saal@med.lu.se
Luoghi di studio
-
-
-
Borås, Svezia
- Reclutamento
- Södra Älvsborg Hospital
-
Contatto:
- Zakaria Einbeigi, PhD MD
- Numero di telefono: +4603306161000
- Email: zakaria.einbeigi@oncology.gu.se
-
Halmstad, Svezia, 30233
- Sospeso
- Hallands Hospital Halmstad
-
Helsingborg, Svezia, 25187
- Reclutamento
- Helsingborg Hospital
-
Contatto:
- Anna-Karin Falck, MD
- Email: anna-karin.falck@skane.se
-
Jönköping, Svezia, 55185
- Sospeso
- Kirurgiska kliniken
-
Karlskrona, Svezia, 37185
- Reclutamento
- Blekinge County Hospital
-
Contatto:
- Monika Sjövall, MD
- Email: monika.sjovall@ltblekinge.se
-
Kristianstad, Svezia, 29185
- Reclutamento
- Central Hospital Kristianstad
-
Contatto:
- Tor Svensjö, MD, PhD
- Email: tor.svensjo@skane.se
-
Lund, Svezia, 22185
- Reclutamento
- Skane University Hospital
-
Contatto:
- Lisa Rydén, MD PhD
- Numero di telefono: +46-46-176241
- Email: lisa.ryden@med.lu.se
-
Malmö, Svezia, 20502
- Reclutamento
- Skane University Hospital
-
Contatto:
- Martin Rehn, MD, PhD
- Numero di telefono: +46-40-331892
- Email: martin.rehn@skane.se
-
Uppsala, Svezia, 75185
- Reclutamento
- Uppsala University Hospital
-
Contatto:
- Tobias Sjöblom, PhD
- Numero di telefono: +46-18-4715036
- Email: tobias.sjoblom@igp.uu.se
-
Vaxjo, Svezia, 35234
- Reclutamento
- Central Hospital Växjö
-
Contatto:
- Per Weber, MD
- Numero di telefono: +46-470-588052
- Email: per.weber@ltkronoberg.se
-
-
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Bambino
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- sospetto o diagnosi confermata di carcinoma mammario primario
- consenso informato firmato
Criteri di esclusione:
- mancanza di consenso informato firmato
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Coorte
- Prospettive temporali: Prospettiva
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Biomarcatori e informazioni clinicopatologiche
Lasso di tempo: fino a 20 anni
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Analisi dei dati genomici (biomarcatori) e loro relazione con le informazioni clinicopatologiche del paziente e del tumore; valutazione della validità analitica.
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fino a 20 anni
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Sopravvivenza libera da malattia invasiva
Lasso di tempo: fino a 20 anni
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Diversi biomarcatori saranno analizzati nel contesto della sopravvivenza libera da malattia invasiva (IDFS) in diversi punti temporali per diversi sottogruppi della potenziale coorte, ad esempio per tutti i pazienti che ricevono una particolare terapia o pazienti con tumori di uno specifico sottotipo molecolare.
|
fino a 20 anni
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Risposta patologica
Lasso di tempo: intraoperatorio
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Diversi biomarcatori saranno analizzati nel contesto della risposta patologica al momento dell'intervento chirurgico per i pazienti sottoposti a terapia preoperatoria.
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intraoperatorio
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Sopravvivenza globale
Lasso di tempo: 3 anni, 5 anni, 10 anni, 15 anni, 20 anni
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Diversi biomarcatori saranno analizzati nel contesto della sopravvivenza globale (OS) in diversi punti temporali per diversi sottogruppi della potenziale coorte, ad esempio per tutti i pazienti che ricevono una particolare terapia o pazienti con tumori di uno specifico sottotipo molecolare.
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3 anni, 5 anni, 10 anni, 15 anni, 20 anni
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Sopravvivenza specifica per il cancro al seno
Lasso di tempo: 3 anni, 5 anni, 10 anni, 15 anni, 20 anni
|
Diversi biomarcatori saranno analizzati nel contesto della sopravvivenza del cancro al seno (BCS) in diversi punti temporali per diversi sottogruppi della potenziale coorte, ad esempio per tutti i pazienti che ricevono una particolare terapia o pazienti con tumori di uno specifico sottotipo molecolare.
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3 anni, 5 anni, 10 anni, 15 anni, 20 anni
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Investigatori
- Direttore dello studio: Åke Borg, PhD, Lund University
- Investigatore principale: Christer Larsson, PhD, Lund University
- Investigatore principale: Niklas Loman, MD, PhD, Skane University Hospital
- Investigatore principale: Anna Ehinger, MD, PhD, Skane University Hospital
- Investigatore principale: Lisa Rydén, MD, PhD, Skane University Hospital
- Investigatore principale: Lao H Saal, MD, PhD, Lund University
- Cattedra di studio: Cecilia Hegardt, PhD, Lund University
- Investigatore principale: Johan Vallon-Christersson, PhD, Lund University
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Ryden L, Loman N, Larsson C, Hegardt C, Vallon-Christersson J, Malmberg M, Lindman H, Ehinger A, Saal LH, Borg A. Minimizing inequality in access to precision medicine in breast cancer by real-time population-based molecular analysis in the SCAN-B initiative. Br J Surg. 2018 Jan;105(2):e158-e168. doi: 10.1002/bjs.10741.
- Saal LH, Vallon-Christersson J, Hakkinen J, Hegardt C, Grabau D, Winter C, Brueffer C, Tang MH, Reutersward C, Schulz R, Karlsson A, Ehinger A, Malina J, Manjer J, Malmberg M, Larsson C, Ryden L, Loman N, Borg A. The Sweden Cancerome Analysis Network - Breast (SCAN-B) Initiative: a large-scale multicenter infrastructure towards implementation of breast cancer genomic analyses in the clinical routine. Genome Med. 2015 Feb 2;7(1):20. doi: 10.1186/s13073-015-0131-9. eCollection 2015.
- Staaf J, Glodzik D, Bosch A, Vallon-Christersson J, Reutersward C, Hakkinen J, Degasperi A, Amarante TD, Saal LH, Hegardt C, Stobart H, Ehinger A, Larsson C, Ryden L, Loman N, Malmberg M, Kvist A, Ehrencrona H, Davies HR, Borg A, Nik-Zainal S. Whole-genome sequencing of triple-negative breast cancers in a population-based clinical study. Nat Med. 2019 Oct;25(10):1526-1533. doi: 10.1038/s41591-019-0582-4. Epub 2019 Sep 30.
- Vallon-Christersson J, Hakkinen J, Hegardt C, Saal LH, Larsson C, Ehinger A, Lindman H, Olofsson H, Sjoblom T, Warnberg F, Ryden L, Loman N, Malmberg M, Borg A, Staaf J. Cross comparison and prognostic assessment of breast cancer multigene signatures in a large population-based contemporary clinical series. Sci Rep. 2019 Aug 21;9(1):12184. doi: 10.1038/s41598-019-48570-x.
- Dihge L, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Saal LH, Hakkinen J, Larsson C, Ehinger A, Loman N, Malmberg M, Bendahl PO, Borg A, Staaf J, Ryden L. Prediction of Lymph Node Metastasis in Breast Cancer by Gene Expression and Clinicopathological Models: Development and Validation within a Population-Based Cohort. Clin Cancer Res. 2019 Nov 1;25(21):6368-6381. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-19-0075. Epub 2019 Jul 24.
- Lundgren C, Bendahl PO, Borg A, Ehinger A, Hegardt C, Larsson C, Loman N, Malmberg M, Olofsson H, Saal LH, Sjoblom T, Lindman H, Klintman M, Hakkinen J, Vallon-Christersson J, Ferno M, Ryden L, Ekholm M. Agreement between molecular subtyping and surrogate subtype classification: a contemporary population-based study of ER-positive/HER2-negative primary breast cancer. Breast Cancer Res Treat. 2019 Nov;178(2):459-467. doi: 10.1007/s10549-019-05378-7. Epub 2019 Aug 20.
- Sokilde R, Persson H, Ehinger A, Pirona AC, Ferno M, Hegardt C, Larsson C, Loman N, Malmberg M, Ryden L, Saal L, Borg A, Vallon-Christerson J, Rovira C. Refinement of breast cancer molecular classification by miRNA expression profiles. BMC Genomics. 2019 Jun 17;20(1):503. doi: 10.1186/s12864-019-5887-7.
- Persson H, Sokilde R, Hakkinen J, Pirona AC, Vallon-Christersson J, Kvist A, Mertens F, Borg A, Mitelman F, Hoglund M, Rovira C. Frequent miRNA-convergent fusion gene events in breast cancer. Nat Commun. 2017 Oct 5;8(1):788. doi: 10.1038/s41467-017-01176-1.
- Persson H, Sokilde R, Hakkinen J, Vallon-Christersson J, Mitelman F, Borg A, Hoglund M, Rovira C. Analysis of fusion transcripts indicates widespread deregulation of snoRNAs and their host genes in breast cancer. Int J Cancer. 2020 Jun 15;146(12):3343-3353. doi: 10.1002/ijc.32927. Epub 2020 Feb 28.
- Winter C, Nilsson MP, Olsson E, George AM, Chen Y, Kvist A, Torngren T, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Hakkinen J, Jonsson G, Grabau D, Malmberg M, Kristoffersson U, Rehn M, Gruvberger-Saal SK, Larsson C, Borg A, Loman N, Saal LH. Targeted sequencing of BRCA1 and BRCA2 across a large unselected breast cancer cohort suggests that one-third of mutations are somatic. Ann Oncol. 2016 Aug;27(8):1532-8. doi: 10.1093/annonc/mdw209. Epub 2016 May 18.
- Dahlgren M, George AM, Brueffer C, Gladchuk S, Chen Y, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Hakkinen J, Ryden L, Malmberg M, Larsson C, Gruvberger-Saal SK, Ehinger A, Loman N, Borg A, Saal LH. Preexisting Somatic Mutations of Estrogen Receptor Alpha (ESR1) in Early-Stage Primary Breast Cancer. JNCI Cancer Spectr. 2021 Apr 22;5(2):pkab028. doi: 10.1093/jncics/pkab028. eCollection 2021 Apr.
- Brueffer C, Gladchuk S, Winter C, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Hakkinen J, George AM, Chen Y, Ehinger A, Larsson C, Loman N, Malmberg M, Ryden L, Borg A, Saal LH. The mutational landscape of the SCAN-B real-world primary breast cancer transcriptome. EMBO Mol Med. 2020 Oct 7;12(10):e12118. doi: 10.15252/emmm.202012118. Epub 2020 Sep 14.
- Glodzik D, Bosch A, Hartman J, Aine M, Vallon-Christersson J, Reutersward C, Karlsson A, Mitra S, Nimeus E, Holm K, Hakkinen J, Hegardt C, Saal LH, Larsson C, Malmberg M, Ryden L, Ehinger A, Loman N, Kvist A, Ehrencrona H, Nik-Zainal S, Borg A, Staaf J. Comprehensive molecular comparison of BRCA1 hypermethylated and BRCA1 mutated triple negative breast cancers. Nat Commun. 2020 Jul 27;11(1):3747. doi: 10.1038/s41467-020-17537-2.
- Larsson C, Ehinger A, Winslow S, Leandersson K, Klintman M, Dahl L, Vallon-Christersson J, Hakkinen J, Hegardt C, Manjer J, Saal L, Ryden L, Malmberg M, Borg A, Loman N. Prognostic implications of the expression levels of different immunoglobulin heavy chain-encoding RNAs in early breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2020 Jul 6;6:28. doi: 10.1038/s41523-020-0170-2. eCollection 2020.
- Fornvik D, Aaltonen KE, Chen Y, George AM, Brueffer C, Rigo R, Loman N, Saal LH, Ryden L. Detection of circulating tumor cells and circulating tumor DNA before and after mammographic breast compression in a cohort of breast cancer patients scheduled for neoadjuvant treatment. Breast Cancer Res Treat. 2019 Sep;177(2):447-455. doi: 10.1007/s10549-019-05326-5. Epub 2019 Jun 24.
- Brueffer C, Vallon-Christersson J, Grabau D, Ehinger A, Hakkinen J, Hegardt C, Malina J, Chen Y, Bendahl PO, Manjer J, Malmberg M, Larsson C, Loman N, Ryden L, Borg A, Saal LH. Clinical Value of RNA Sequencing-Based Classifiers for Prediction of the Five Conventional Breast Cancer Biomarkers: A Report From the Population-Based Multicenter Sweden Cancerome Analysis Network-Breast Initiative. JCO Precis Oncol. 2018 Mar 9;2:PO.17.00135. doi: 10.1200/PO.17.00135. eCollection 2018.
- Nilsson MP, Emmertz M, Kristoffersson U, Borg A, Larsson C, Rehn M, Winter C, Saal LH, Brandberg Y, Loman N. Germline mutations in BRCA1 and BRCA2 incidentally revealed in a biobank research study: experiences from re-contacting mutation carriers and relatives. J Community Genet. 2018 Jul;9(3):201-208. doi: 10.1007/s12687-017-0341-5. Epub 2017 Oct 30.
- Nilsson MP, Winter C, Kristoffersson U, Rehn M, Larsson C, Saal LH, Loman N. Efficacy versus effectiveness of clinical genetic testing criteria for BRCA1 and BRCA2 hereditary mutations in incident breast cancer. Fam Cancer. 2017 Apr;16(2):187-193. doi: 10.1007/s10689-016-9953-x.
- Axelsson U, Ryden L, Johnsson P, Eden P, Mansson J, Hallberg IR, Borrebaeck CAK. A multicenter study investigating the molecular fingerprint of psychological resilience in breast cancer patients: study protocol of the SCAN-B resilience study. BMC Cancer. 2018 Aug 6;18(1):789. doi: 10.1186/s12885-018-4669-y.
- Demircan K, Bengtsson Y, Sun Q, Brange A, Vallon-Christersson J, Rijntjes E, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Borg A, Manjer J, Schomburg L. Serum selenium, selenoprotein P and glutathione peroxidase 3 as predictors of mortality and recurrence following breast cancer diagnosis: A multicentre cohort study. Redox Biol. 2021 Nov;47:102145. doi: 10.1016/j.redox.2021.102145. Epub 2021 Sep 21.
- Dalal H, Dahlgren M, Gladchuk S, Brueffer C, Gruvberger-Saal SK, Saal LH. Clinical associations of ESR2 (estrogen receptor beta) expression across thousands of primary breast tumors. Sci Rep. 2022 Mar 18;12(1):4696. doi: 10.1038/s41598-022-08210-3.
- Demircan K, Sun Q, Bengtsson Y, Seemann P, Vallon-Christersson J, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Minich WB, Borg A, Manjer J, Schomburg L. Autoimmunity to selenoprotein P predicts breast cancer recurrence. Redox Biol. 2022 Jul;53:102346. doi: 10.1016/j.redox.2022.102346. Epub 2022 May 25.
- Staaf J, Hakkinen J, Hegardt C, Saal LH, Kimbung S, Hedenfalk I, Lien T, Sorlie T, Naume B, Russnes H, Marcone R, Ayyanan A, Brisken C, Malterling RR, Asking B, Olofsson H, Lindman H, Bendahl PO, Ehinger A, Larsson C, Loman N, Ryden L, Malmberg M, Borg A, Vallon-Christersson J. RNA sequencing-based single sample predictors of molecular subtype and risk of recurrence for clinical assessment of early-stage breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2022 Aug 16;8(1):94. doi: 10.1038/s41523-022-00465-3.
- Saghir H, Veerla S, Malmberg M, Ryden L, Ehinger A, Saal LH, Vallon-Christersson J, Borg A, Hegardt C, Larsson C, Haidar A, Hedenfalk I, Loman N, Kimbung S. How Reliable Are Gene Expression-Based and Immunohistochemical Biomarkers Assessed on a Core-Needle Biopsy? A Study of Paired Core-Needle Biopsies and Surgical Specimens in Early Breast Cancer. Cancers (Basel). 2022 Aug 18;14(16):4000. doi: 10.3390/cancers14164000.
- Bengtsson Y, Demircan K, Vallon-Christersson J, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Borg A, Schomburg L, Sandsveden M, Manjer J. Serum copper, zinc and copper/zinc ratio in relation to survival after breast cancer diagnosis: A prospective multicenter cohort study. Redox Biol. 2023 Jul;63:102728. doi: 10.1016/j.redox.2023.102728. Epub 2023 May 16.
- Demircan K, Bengtsson Y, Chillon TS, Vallon-Christersson J, Sun Q, Larsson C, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Borg A, Manjer J, Schomburg L. Matched analysis of circulating selenium with the breast cancer selenotranscriptome: a multicentre prospective study. J Transl Med. 2023 Sep 23;21(1):658. doi: 10.1186/s12967-023-04502-y.
- Sharma A, Weitz P, Wang Y, Liu B, Vallon-Christersson J, Hartman J, Rantalainen M. Development and prognostic validation of a three-level NHG-like deep learning-based model for histological grading of breast cancer. Breast Cancer Res. 2024 Jan 29;26(1):17. doi: 10.1186/s13058-024-01770-4.
- Sigurjonsdottir G, De Marchi T, Ehinger A, Hartman J, Bosch A, Staaf J, Killander F, Nimeus E. Comparison of SP142 and 22C3 PD-L1 assays in a population-based cohort of triple-negative breast cancer patients in the context of their clinically established scoring algorithms. Breast Cancer Res. 2023 Oct 10;25(1):123. doi: 10.1186/s13058-023-01724-2.
- Wang Y, Ali MA, Vallon-Christersson J, Humphreys K, Hartman J, Rantalainen M. Transcriptional intra-tumour heterogeneity predicted by deep learning in routine breast histopathology slides provides independent prognostic information. Eur J Cancer. 2023 Sep;191:112953. doi: 10.1016/j.ejca.2023.112953. Epub 2023 Jun 23.
- Nacer DF, Vallon-Christersson J, Nordborg N, Ehrencrona H, Kvist A, Borg A, Staaf J. Molecular characteristics of breast tumors in patients screened for germline predisposition from a population-based observational study. Genome Med. 2023 Apr 14;15(1):25. doi: 10.1186/s13073-023-01177-4.
- Gulis K, Ellbrant J, Svensjo T, Skarping I, Vallon-Christersson J, Loman N, Bendahl PO, Ryden L. A prospective cohort study identifying radiologic and tumor related factors of importance for breast conserving surgery after neoadjuvant chemotherapy. Eur J Surg Oncol. 2023 Jul;49(7):1189-1195. doi: 10.1016/j.ejso.2023.03.225. Epub 2023 Mar 28.
- Bjorklund SS, Aure MR, Hakkinen J, Vallon-Christersson J, Kumar S, Evensen KB, Fleischer T, Tost J; OSBREAC; Sahlberg KK, Mathelier A, Bhanot G, Ganesan S, Tekpli X, Kristensen VN. Subtype and cell type specific expression of lncRNAs provide insight into breast cancer. Commun Biol. 2022 Aug 18;5(1):834. doi: 10.1038/s42003-022-03559-7.
- Sartor H, Zackrisson S, Hegardt C, Larsson C. "Association of mammographic features with molecular breast tumor profiles". Cancer Treat Res Commun. 2021;28:100387. doi: 10.1016/j.ctarc.2021.100387. Epub 2021 May 9.
- Veerla S, Hohmann L, Nacer DF, Vallon-Christersson J, Staaf J. Perturbation and stability of PAM50 subtyping in population-based primary invasive breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2023 Oct 19;9(1):83. doi: 10.1038/s41523-023-00589-0.
- Rediti M, Venet D, Joaquin Garcia A, Maetens M, Vincent D, Majjaj S, El-Abed S, Di Cosimo S, Ueno T, Izquierdo M, Piccart M, Pusztai L, Loi S, Salgado R, Viale G, Rothe F, Sotiriou C. Identification of HER2-positive breast cancer molecular subtypes with potential clinical implications in the ALTTO clinical trial. Nat Commun. 2024 Nov 29;15(1):10402. doi: 10.1038/s41467-024-54621-3.
- Aine M, Boyaci C, Hartman J, Hakkinen J, Mitra S, Campos AB, Nimeus E, Ehinger A, Vallon-Christersson J, Borg A, Staaf J. Molecular analyses of triple-negative breast cancer in the young and elderly. Breast Cancer Res. 2021 Feb 10;23(1):20. doi: 10.1186/s13058-021-01392-0.
- Mosquim Junior S, Zamore M, Vallon-Christersson J, Ryden L, Levander F. Multiomic profiling of ER-positive HER2-negative breast cancer reveals markers associated with metastatic spread. Breast Cancer Res. 2026 Jan 12;28(1):12. doi: 10.1186/s13058-025-02173-9.
- Sigurjonsdottir G, De Marchi T, Ehinger A, Hartman J, Ullen S, Leandersson K, Bosch A, Staaf J, Killander F, Nimeus E. Evaluation of alternative prognostic thresholds for SP142 and 22C3 immunohistochemical PD-L1 expression in triple-negative breast cancer: results from a population-based cohort. Breast Cancer Res Treat. 2025 Apr;210(2):271-284. doi: 10.1007/s10549-024-07561-x. Epub 2024 Dec 10.
- Fornvik D, Borgquist S, Larsson M, Zackrisson S, Skarping I. Deep learning analysis of serial digital breast tomosynthesis images in a prospective cohort of breast cancer patients who received neoadjuvant chemotherapy. Eur J Radiol. 2024 Sep;178:111624. doi: 10.1016/j.ejrad.2024.111624. Epub 2024 Jul 14.
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Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
- genomica
- cellule tumorali circolanti
- minima malattia residua
- biopsia liquida
- metabolomica
- ricerca traslazionale
- DNA tumorale circolante
- proteomica
- BRCA
- risposta patologica completa
- profili di espressione genica
- sottotipo molecolare
- trascrittomica
- Sequenziamento dell'RNA
- screening delle mutazioni
- biomarcatori prognostici e predittivi
- RNA-seq
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- SCANB001
Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)
Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?
Descrizione del piano IPD
Dati/documenti di studio
-
Dati e annotazioni sull'espressione genica elaborata con RNA-seq (n=49 pazienti)
Identificatore informazioni: GSE60789Commenti informativi: Superserie: GSE60789 Sottoserie: GSE60785, GSE60788
-
Dati e annotazioni sull'espressione genica elaborata con RNA-seq (n=3678 pazienti)
Identificatore informazioni: GSE81540Commenti informativi: Superserie: GSE81540 Sottoserie: GSE81538, GSE96058
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