瑞典癌症组分析网络 - 乳腺：乳腺癌的基因组分析 (SCAN-B)
2026年8月24日 更新者：Åke Borg、Lund University
SCAN-B：瑞典癌症组分析网络 - Breast Initiative
本研究以前瞻性和基于人群的方式评估乳腺癌的基因组图谱。
在第一阶段，通过全转录组 RNA 测序分析乳腺肿瘤。
将在患者信息、临床病理变量和结果的背景下分析基因表达谱、突变谱和转录亚型水平数据，目的是开发新的乳腺癌分子诊断分析。
未来将进行其他基因组规模的 RNA、DNA 和蛋白质分析。
研究概览
地位
招聘中
条件
详细说明
乳腺癌表现出显着的分子、病理和临床异质性。 当前的患者和临床病理学评估对于预测结果而言并不完善，这导致许多患者过度治疗，而对于其他患者，则导致疾病复发导致死亡。 因此，需要额外的标准来更好地个性化护理并最大限度地提高治疗效果和生存率。
瑞典癌症组分析网络 - 乳腺癌 (SCAN-B) 研究于 2010 年启动，作为一项多中心前瞻性基于人群的观察性研究，其远见卓识旨在使用用于转化研究并与医疗保健相结合的下一代基因组技术分析乳腺癌；从这些分析中破译基础肿瘤生物学；利用基因组数据开发和验证新的临床可操作生物标志物检测；并建立分子诊断、预后和预测测试的实时临床实施。 在第一阶段，我们专注于通过下一代 RNA 测序进行分子谱分析。 将在患者信息、临床病理变量和结果的背景下分析基因表达谱、突变谱和转录亚型水平数据，目的是开发新的乳腺癌分子诊断分析。 未来将进行其他基因组规模的 RNA、DNA 和蛋白质分析。
截至 2021 年 10 月，已有超过 17,000 名患者参加了该研究，约占服务区域内所有符合条件患者的 85%。 组织和血液采集整合在医疗保健程序中，临床信息由国家质量登记处提供。
研究类型
观察性的
注册 (估计的)
20000
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习联系方式
- 姓名：Åke Borg, PhD
- 电话号码：+46-46-2752552
- 邮箱：ake.borg@med.lu.se
研究联系人备份
- 姓名：Lao Saal, MD, PhD
- 邮箱：lao.saal@med.lu.se
学习地点
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-
-
Borås、瑞典
- 招聘中
- Södra Älvsborg Hospital
-
接触：
- Zakaria Einbeigi, PhD MD
- 电话号码：+4603306161000
- 邮箱：zakaria.einbeigi@oncology.gu.se
-
Halmstad、瑞典、30233
- 暂停
- Hallands Hospital Halmstad
-
Helsingborg、瑞典、25187
- 招聘中
- Helsingborg Hospital
-
接触：
- Anna-Karin Falck, MD
- 邮箱：anna-karin.falck@skane.se
-
Jönköping、瑞典、55185
- 暂停
- Kirurgiska kliniken
-
Karlskrona、瑞典、37185
- 招聘中
- Blekinge County Hospital
-
接触：
- Monika Sjövall, MD
- 邮箱：monika.sjovall@ltblekinge.se
-
Kristianstad、瑞典、29185
- 招聘中
- Central Hospital Kristianstad
-
接触：
- Tor Svensjö, MD, PhD
- 邮箱：tor.svensjo@skane.se
-
Lund、瑞典、22185
- 招聘中
- Skane University Hospital
-
接触：
- Lisa Rydén, MD PhD
- 电话号码：+46-46-176241
- 邮箱：lisa.ryden@med.lu.se
-
Malmö、瑞典、20502
- 招聘中
- Skane University Hospital
-
接触：
- Martin Rehn, MD, PhD
- 电话号码：+46-40-331892
- 邮箱：martin.rehn@skane.se
-
Uppsala、瑞典、75185
- 招聘中
- Uppsala University Hospital
-
接触：
- Tobias Sjöblom, PhD
- 电话号码：+46-18-4715036
- 邮箱：tobias.sjoblom@igp.uu.se
-
Vaxjo、瑞典、35234
- 招聘中
- Central Hospital Växjö
-
接触：
- Per Weber, MD
- 电话号码：+46-470-588052
- 邮箱：per.weber@ltkronoberg.se
-
-
参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
- 孩子
- 成人
- 年长者
接受健康志愿者
不
取样方法
概率样本
研究人群
在瑞典南部医疗保健区、乌普萨拉县和瑞典延雪平县参与的医院系统内所有疑似或确诊原发性乳腺癌的患者。
欢迎来自北欧国家的其他医院站点加入。
描述
纳入标准：
- 怀疑或确诊原发性乳腺癌
- 签署知情同意书
排除标准：
- 未签署知情同意书
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
- 观测模型：队列
- 时间观点：预期
研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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生物标志物和临床病理信息
大体时间：长达 20 年
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分析基因组数据（生物标志物）及其与患者和肿瘤临床病理信息的关系；分析有效性的评估。
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长达 20 年
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无侵袭性疾病生存
大体时间：长达20年
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将在不同时间点针对前瞻性队列的不同亚组（例如所有接受特定治疗的患者或患有特定分子亚型肿瘤的患者），在无侵袭性疾病生存（IDFS）的背景下分析不同的生物标志物。
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长达20年
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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病理反应
大体时间：术中
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对于接受术前治疗的患者，将在手术时的病理反应背景下分析不同的生物标志物。
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术中
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总体生存率
大体时间：3年、5年、10年、15年、20年
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将在不同时间点的总生存期 (OS) 的背景下对前瞻性队列中不同亚组的不同生物标志物进行分析，例如所有接受特定治疗的患者或患有特定分子亚型肿瘤的患者。
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3年、5年、10年、15年、20年
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乳腺癌特异性生存率
大体时间：3年、5年、10年、15年、20年
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将在不同时间点针对前瞻性队列的不同亚组（例如所有接受特定治疗的患者或患有特定分子亚型肿瘤的患者）在乳腺癌生存（BCS）的背景下分析不同的生物标志物。
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3年、5年、10年、15年、20年
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
调查人员
- 研究主任：Åke Borg, PhD、Lund University
- 首席研究员：Christer Larsson, PhD、Lund University
- 首席研究员：Niklas Loman, MD, PhD、Skane University Hospital
- 首席研究员：Anna Ehinger, MD, PhD、Skane University Hospital
- 首席研究员：Lisa Rydén, MD, PhD、Skane University Hospital
- 首席研究员：Lao H Saal, MD, PhD、Lund University
- 学习椅：Cecilia Hegardt, PhD、Lund University
- 首席研究员：Johan Vallon-Christersson, PhD、Lund University
出版物和有用的链接
负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。
一般刊物
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- Saal LH, Vallon-Christersson J, Hakkinen J, Hegardt C, Grabau D, Winter C, Brueffer C, Tang MH, Reutersward C, Schulz R, Karlsson A, Ehinger A, Malina J, Manjer J, Malmberg M, Larsson C, Ryden L, Loman N, Borg A. The Sweden Cancerome Analysis Network - Breast (SCAN-B) Initiative: a large-scale multicenter infrastructure towards implementation of breast cancer genomic analyses in the clinical routine. Genome Med. 2015 Feb 2;7(1):20. doi: 10.1186/s13073-015-0131-9. eCollection 2015.
- Staaf J, Glodzik D, Bosch A, Vallon-Christersson J, Reutersward C, Hakkinen J, Degasperi A, Amarante TD, Saal LH, Hegardt C, Stobart H, Ehinger A, Larsson C, Ryden L, Loman N, Malmberg M, Kvist A, Ehrencrona H, Davies HR, Borg A, Nik-Zainal S. Whole-genome sequencing of triple-negative breast cancers in a population-based clinical study. Nat Med. 2019 Oct;25(10):1526-1533. doi: 10.1038/s41591-019-0582-4. Epub 2019 Sep 30.
- Vallon-Christersson J, Hakkinen J, Hegardt C, Saal LH, Larsson C, Ehinger A, Lindman H, Olofsson H, Sjoblom T, Warnberg F, Ryden L, Loman N, Malmberg M, Borg A, Staaf J. Cross comparison and prognostic assessment of breast cancer multigene signatures in a large population-based contemporary clinical series. Sci Rep. 2019 Aug 21;9(1):12184. doi: 10.1038/s41598-019-48570-x.
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- Winter C, Nilsson MP, Olsson E, George AM, Chen Y, Kvist A, Torngren T, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Hakkinen J, Jonsson G, Grabau D, Malmberg M, Kristoffersson U, Rehn M, Gruvberger-Saal SK, Larsson C, Borg A, Loman N, Saal LH. Targeted sequencing of BRCA1 and BRCA2 across a large unselected breast cancer cohort suggests that one-third of mutations are somatic. Ann Oncol. 2016 Aug;27(8):1532-8. doi: 10.1093/annonc/mdw209. Epub 2016 May 18.
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- Glodzik D, Bosch A, Hartman J, Aine M, Vallon-Christersson J, Reutersward C, Karlsson A, Mitra S, Nimeus E, Holm K, Hakkinen J, Hegardt C, Saal LH, Larsson C, Malmberg M, Ryden L, Ehinger A, Loman N, Kvist A, Ehrencrona H, Nik-Zainal S, Borg A, Staaf J. Comprehensive molecular comparison of BRCA1 hypermethylated and BRCA1 mutated triple negative breast cancers. Nat Commun. 2020 Jul 27;11(1):3747. doi: 10.1038/s41467-020-17537-2.
- Larsson C, Ehinger A, Winslow S, Leandersson K, Klintman M, Dahl L, Vallon-Christersson J, Hakkinen J, Hegardt C, Manjer J, Saal L, Ryden L, Malmberg M, Borg A, Loman N. Prognostic implications of the expression levels of different immunoglobulin heavy chain-encoding RNAs in early breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2020 Jul 6;6:28. doi: 10.1038/s41523-020-0170-2. eCollection 2020.
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- Brueffer C, Vallon-Christersson J, Grabau D, Ehinger A, Hakkinen J, Hegardt C, Malina J, Chen Y, Bendahl PO, Manjer J, Malmberg M, Larsson C, Loman N, Ryden L, Borg A, Saal LH. Clinical Value of RNA Sequencing-Based Classifiers for Prediction of the Five Conventional Breast Cancer Biomarkers: A Report From the Population-Based Multicenter Sweden Cancerome Analysis Network-Breast Initiative. JCO Precis Oncol. 2018 Mar 9;2:PO.17.00135. doi: 10.1200/PO.17.00135. eCollection 2018.
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- Nilsson MP, Winter C, Kristoffersson U, Rehn M, Larsson C, Saal LH, Loman N. Efficacy versus effectiveness of clinical genetic testing criteria for BRCA1 and BRCA2 hereditary mutations in incident breast cancer. Fam Cancer. 2017 Apr;16(2):187-193. doi: 10.1007/s10689-016-9953-x.
- Axelsson U, Ryden L, Johnsson P, Eden P, Mansson J, Hallberg IR, Borrebaeck CAK. A multicenter study investigating the molecular fingerprint of psychological resilience in breast cancer patients: study protocol of the SCAN-B resilience study. BMC Cancer. 2018 Aug 6;18(1):789. doi: 10.1186/s12885-018-4669-y.
- Demircan K, Bengtsson Y, Sun Q, Brange A, Vallon-Christersson J, Rijntjes E, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Borg A, Manjer J, Schomburg L. Serum selenium, selenoprotein P and glutathione peroxidase 3 as predictors of mortality and recurrence following breast cancer diagnosis: A multicentre cohort study. Redox Biol. 2021 Nov;47:102145. doi: 10.1016/j.redox.2021.102145. Epub 2021 Sep 21.
- Dalal H, Dahlgren M, Gladchuk S, Brueffer C, Gruvberger-Saal SK, Saal LH. Clinical associations of ESR2 (estrogen receptor beta) expression across thousands of primary breast tumors. Sci Rep. 2022 Mar 18;12(1):4696. doi: 10.1038/s41598-022-08210-3.
- Demircan K, Sun Q, Bengtsson Y, Seemann P, Vallon-Christersson J, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Minich WB, Borg A, Manjer J, Schomburg L. Autoimmunity to selenoprotein P predicts breast cancer recurrence. Redox Biol. 2022 Jul;53:102346. doi: 10.1016/j.redox.2022.102346. Epub 2022 May 25.
- Staaf J, Hakkinen J, Hegardt C, Saal LH, Kimbung S, Hedenfalk I, Lien T, Sorlie T, Naume B, Russnes H, Marcone R, Ayyanan A, Brisken C, Malterling RR, Asking B, Olofsson H, Lindman H, Bendahl PO, Ehinger A, Larsson C, Loman N, Ryden L, Malmberg M, Borg A, Vallon-Christersson J. RNA sequencing-based single sample predictors of molecular subtype and risk of recurrence for clinical assessment of early-stage breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2022 Aug 16;8(1):94. doi: 10.1038/s41523-022-00465-3.
- Saghir H, Veerla S, Malmberg M, Ryden L, Ehinger A, Saal LH, Vallon-Christersson J, Borg A, Hegardt C, Larsson C, Haidar A, Hedenfalk I, Loman N, Kimbung S. How Reliable Are Gene Expression-Based and Immunohistochemical Biomarkers Assessed on a Core-Needle Biopsy? A Study of Paired Core-Needle Biopsies and Surgical Specimens in Early Breast Cancer. Cancers (Basel). 2022 Aug 18;14(16):4000. doi: 10.3390/cancers14164000.
- Bengtsson Y, Demircan K, Vallon-Christersson J, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Borg A, Schomburg L, Sandsveden M, Manjer J. Serum copper, zinc and copper/zinc ratio in relation to survival after breast cancer diagnosis: A prospective multicenter cohort study. Redox Biol. 2023 Jul;63:102728. doi: 10.1016/j.redox.2023.102728. Epub 2023 May 16.
- Demircan K, Bengtsson Y, Chillon TS, Vallon-Christersson J, Sun Q, Larsson C, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Borg A, Manjer J, Schomburg L. Matched analysis of circulating selenium with the breast cancer selenotranscriptome: a multicentre prospective study. J Transl Med. 2023 Sep 23;21(1):658. doi: 10.1186/s12967-023-04502-y.
- Sharma A, Weitz P, Wang Y, Liu B, Vallon-Christersson J, Hartman J, Rantalainen M. Development and prognostic validation of a three-level NHG-like deep learning-based model for histological grading of breast cancer. Breast Cancer Res. 2024 Jan 29;26(1):17. doi: 10.1186/s13058-024-01770-4.
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- Fornvik D, Borgquist S, Larsson M, Zackrisson S, Skarping I. Deep learning analysis of serial digital breast tomosynthesis images in a prospective cohort of breast cancer patients who received neoadjuvant chemotherapy. Eur J Radiol. 2024 Sep;178:111624. doi: 10.1016/j.ejrad.2024.111624. Epub 2024 Jul 14.
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始
2010年8月1日
初级完成 (估计的)
2031年8月1日
研究完成 (估计的)
2031年8月1日
研究注册日期
首次提交
2014年12月1日
首先提交符合 QC 标准的
2014年12月2日
首次发布 (估计的)
2014年12月3日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2026年8月27日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2026年8月24日
最后验证
2026年8月1日
更多信息
与本研究相关的术语
关键字
其他研究编号
- SCANB001
计划个人参与者数据 (IPD)
计划共享个人参与者数据 (IPD)？
未定
IPD 计划说明
发布后，将共享相关的匿名个人参与者数据。
研究数据/文件
-
RNA-seq 处理的基因表达数据和注释（n=49 名患者）
信息标识符：GSE60789信息评论：超级系列：GSE60789 子系列：GSE60785、GSE60788
-
RNA-seq 处理的基因表达数据和注释（n=3678 名患者）
信息标识符：GSE81540信息评论：超级系列：GSE81540 子系列：GSE81538、GSE96058
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