Szwedzka Sieć Analiz Raka - Pierś: Profilowanie genomowe raka piersi (SCAN-B)
7 lutego 2024 zaktualizowane przez: Åke Borg, Lund University
SCAN-B: Szwedzka Sieć Analizy Raka – Inicjatywa na rzecz piersi
To badanie ocenia profile genomowe raka piersi w sposób prospektywny i populacyjny.
W pierwszej fazie guzy piersi są analizowane za pomocą sekwencjonowania całego transkryptomu RNA.
Profile ekspresji genów, profile mutacji i dane na poziomie izoform transkryptu zostaną przeanalizowane w kontekście informacji o pacjencie, zmiennych kliniczno-patologicznych i wyniku, w celu opracowania nowych molekularnych testów diagnostycznych dla raka piersi.
W przyszłości zostaną przeprowadzone dodatkowe analizy RNA, DNA i białek w skali genomu.
Przegląd badań
Status
Rekrutacyjny
Warunki
Szczegółowy opis
Rak piersi wykazuje znaczną heterogeniczność molekularną, patologiczną i kliniczną. Obecna ocena pacjenta i kliniczno-patologiczna jest niedoskonała do przewidywania wyniku, co u wielu pacjentów skutkuje nadmiernym leczeniem, a u innych prowadzi do śmierci z powodu nawrotu choroby. Dlatego potrzebne są dodatkowe kryteria, aby lepiej spersonalizować opiekę i zmaksymalizować skuteczność leczenia i przeżycie.
Badanie Szwedzkiej Sieci Analiz Raka - Piersi (SCAN-B) rozpoczęto w 2010 r. jako wieloośrodkowe, prospektywne, populacyjne badanie obserwacyjne z dalekowzrocznymi celami analizy raka piersi za pomocą technologii genomowych nowej generacji do badań translacyjnych i zintegrowanych z opieką zdrowotną; rozszyfrować podstawową biologię nowotworów na podstawie tych analiz; wykorzystywać dane genomowe do opracowywania i walidacji nowych, możliwych do zastosowania klinicznego testów biomarkerów; i ustanowić kliniczne wdrożenie molekularnych testów diagnostycznych, prognostycznych i predykcyjnych w czasie rzeczywistym. W pierwszej fazie skupiamy się na profilowaniu molekularnym poprzez sekwencjonowanie RNA nowej generacji. Profile ekspresji genów, profile mutacji i dane na poziomie izoform transkryptu zostaną przeanalizowane w kontekście informacji o pacjencie, zmiennych kliniczno-patologicznych i wyniku, w celu opracowania nowych molekularnych testów diagnostycznych dla raka piersi. W przyszłości zostaną przeprowadzone dodatkowe analizy RNA, DNA i białek w skali genomu.
Od października 2021 r. do badania zapisało się ponad 17 000 pacjentów, co stanowi około 85% wszystkich kwalifikujących się pacjentów w regionie zlewni. Pobieranie tkanek i krwi jest zintegrowane z procedurami opieki zdrowotnej, a informacje kliniczne są dostarczane z krajowych rejestrów jakości.
Typ studiów
Obserwacyjny
Zapisy (Szacowany)
20000
Kontakty i lokalizacje
Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Åke Borg, PhD
- Numer telefonu: +46-46-2752552
- E-mail: ake.borg@med.lu.se
Kopia zapasowa kontaktu do badania
- Nazwa: Lao Saal, MD, PhD
- E-mail: lao.saal@med.lu.se
Lokalizacje studiów
-
-
-
Halmstad, Szwecja, 30233
- Zawieszony
- Hallands Hospital Halmstad
-
Helsingborg, Szwecja, 25187
- Rekrutacyjny
- Helsingborg Hospital
-
Kontakt:
- Anna-Karin Falck, MD
- E-mail: anna-karin.falck@skane.se
-
Jönköping, Szwecja, 55185
- Rekrutacyjny
- Kirurgiska kliniken
-
Kontakt:
- Bengt Asking, MD
- Numer telefonu: +46-36-321353
- E-mail: bengt.asking@rjl.se
-
Karlskrona, Szwecja, 37185
- Rekrutacyjny
- Blekinge County Hospital
-
Kontakt:
- Monika Sjövall, MD
- E-mail: monika.sjovall@ltblekinge.se
-
Kristianstad, Szwecja, 29185
- Rekrutacyjny
- Central Hospital Kristianstad
-
Kontakt:
- Tor Svensjö, MD, PhD
- E-mail: tor.svensjo@skane.se
-
Lund, Szwecja, 22185
- Rekrutacyjny
- Skåne University Hospital
-
Kontakt:
- Lisa Rydén, MD PhD
- Numer telefonu: +46-46-176241
- E-mail: lisa.ryden@med.lu.se
-
Malmö, Szwecja, 20502
- Rekrutacyjny
- Skåne University Hospital
-
Kontakt:
- Martin Rehn, MD, PhD
- Numer telefonu: +46-40-331892
- E-mail: martin.rehn@skane.se
-
Uppsala, Szwecja, 75185
- Rekrutacyjny
- Uppsala University Hospital
-
Kontakt:
- Tobias Sjöblom, PhD
- Numer telefonu: +46-18-4715036
- E-mail: tobias.sjoblom@igp.uu.se
-
Växjö, Szwecja, 35234
- Rekrutacyjny
- Central Hospital Växjö
-
Kontakt:
- Per Weber, MD
- Numer telefonu: +46-470-588052
- E-mail: per.weber@ltkronoberg.se
-
-
Kryteria uczestnictwa
Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dziecko
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Nie
Metoda próbkowania
Próbka prawdopodobieństwa
Badana populacja
Wszyscy pacjenci z podejrzeniem lub potwierdzonym rozpoznaniem pierwotnego raka piersi w uczestniczących systemach szpitalnych w Regionie Opieki Zdrowotnej Południowej Szwecji, okręgu Uppsala i kraju Jönköping w Szwecji.
Zapraszamy do przyłączenia się dodatkowe szpitale z krajów skandynawskich.
Opis
Kryteria przyjęcia:
- podejrzenie lub potwierdzone rozpoznanie pierwotnego raka piersi
- podpisana świadoma zgoda
Kryteria wyłączenia:
- brak podpisanej świadomej zgody
Plan studiów
Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Modele obserwacyjne: Kohorta
- Perspektywy czasowe: Spodziewany
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Biomarkery i informacje kliniczno-patologiczne
Ramy czasowe: do 20 lat
|
Analiza danych genomowych (biomarkerów) i ich związek z informacjami kliniczno-patologicznymi pacjenta i nowotworu; ocena trafności analitycznej.
|
do 20 lat
|
|
Inwazyjne przeżycie wolne od choroby
Ramy czasowe: do 20-lat
|
Różne biomarkery będą analizowane w kontekście przeżycia wolnego od choroby inwazyjnej (IDFS) w różnych punktach czasowych dla różnych podgrup prospektywnej kohorty, na przykład dla wszystkich pacjentów otrzymujących określoną terapię lub pacjentów z nowotworami o określonym podtypie molekularnym.
|
do 20-lat
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Odpowiedź patologiczna
Ramy czasowe: śródoperacyjny
|
Różne biomarkery zostaną przeanalizowane w kontekście odpowiedzi patologicznej w czasie operacji u pacjentów otrzymujących terapię przedoperacyjną.
|
śródoperacyjny
|
|
Ogólne przetrwanie
Ramy czasowe: 3 lata, 5 lat, 10 lat, 15 lat, 20 lat
|
Różne biomarkery będą analizowane w kontekście całkowitego przeżycia (OS) w różnych punktach czasowych dla różnych podgrup prospektywnej kohorty, na przykład dla wszystkich pacjentów otrzymujących określoną terapię lub pacjentów z nowotworami o określonym podtypie molekularnym.
|
3 lata, 5 lat, 10 lat, 15 lat, 20 lat
|
|
Przeżycie specyficzne dla raka piersi
Ramy czasowe: 3 lata, 5 lat, 10 lat, 15 lat, 20 lat
|
Różne biomarkery będą analizowane w kontekście przeżycia raka piersi (BCS) w różnych punktach czasowych dla różnych podgrup potencjalnej kohorty, na przykład dla wszystkich pacjentów otrzymujących określoną terapię lub pacjentów z nowotworami o określonym podtypie molekularnym.
|
3 lata, 5 lat, 10 lat, 15 lat, 20 lat
|
Współpracownicy i badacze
Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.
Sponsor
Śledczy
- Dyrektor Studium: Åke Borg, PhD, Lund University
- Główny śledczy: Christer Larsson, PhD, Lund University
- Główny śledczy: Niklas Loman, MD, PhD, Skåne University Hospital
- Główny śledczy: Anna Ehinger, MD, PhD, Skåne University Hospital
- Główny śledczy: Lisa Rydén, MD, PhD, Skåne University Hospital
- Główny śledczy: Lao H Saal, MD, PhD, Lund University
- Krzesło do nauki: Cecilia Hegardt, PhD, Lund University
- Główny śledczy: Johan Vallon-Christersson, PhD, Lund University
Publikacje i pomocne linki
Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.
Publikacje ogólne
- Ryden L, Loman N, Larsson C, Hegardt C, Vallon-Christersson J, Malmberg M, Lindman H, Ehinger A, Saal LH, Borg A. Minimizing inequality in access to precision medicine in breast cancer by real-time population-based molecular analysis in the SCAN-B initiative. Br J Surg. 2018 Jan;105(2):e158-e168. doi: 10.1002/bjs.10741.
- Saal LH, Vallon-Christersson J, Hakkinen J, Hegardt C, Grabau D, Winter C, Brueffer C, Tang MH, Reutersward C, Schulz R, Karlsson A, Ehinger A, Malina J, Manjer J, Malmberg M, Larsson C, Ryden L, Loman N, Borg A. The Sweden Cancerome Analysis Network - Breast (SCAN-B) Initiative: a large-scale multicenter infrastructure towards implementation of breast cancer genomic analyses in the clinical routine. Genome Med. 2015 Feb 2;7(1):20. doi: 10.1186/s13073-015-0131-9. eCollection 2015.
- Staaf J, Glodzik D, Bosch A, Vallon-Christersson J, Reutersward C, Hakkinen J, Degasperi A, Amarante TD, Saal LH, Hegardt C, Stobart H, Ehinger A, Larsson C, Ryden L, Loman N, Malmberg M, Kvist A, Ehrencrona H, Davies HR, Borg A, Nik-Zainal S. Whole-genome sequencing of triple-negative breast cancers in a population-based clinical study. Nat Med. 2019 Oct;25(10):1526-1533. doi: 10.1038/s41591-019-0582-4. Epub 2019 Sep 30.
- Vallon-Christersson J, Hakkinen J, Hegardt C, Saal LH, Larsson C, Ehinger A, Lindman H, Olofsson H, Sjoblom T, Warnberg F, Ryden L, Loman N, Malmberg M, Borg A, Staaf J. Cross comparison and prognostic assessment of breast cancer multigene signatures in a large population-based contemporary clinical series. Sci Rep. 2019 Aug 21;9(1):12184. doi: 10.1038/s41598-019-48570-x.
- Dihge L, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Saal LH, Hakkinen J, Larsson C, Ehinger A, Loman N, Malmberg M, Bendahl PO, Borg A, Staaf J, Ryden L. Prediction of Lymph Node Metastasis in Breast Cancer by Gene Expression and Clinicopathological Models: Development and Validation within a Population-Based Cohort. Clin Cancer Res. 2019 Nov 1;25(21):6368-6381. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-19-0075. Epub 2019 Jul 24.
- Lundgren C, Bendahl PO, Borg A, Ehinger A, Hegardt C, Larsson C, Loman N, Malmberg M, Olofsson H, Saal LH, Sjoblom T, Lindman H, Klintman M, Hakkinen J, Vallon-Christersson J, Ferno M, Ryden L, Ekholm M. Agreement between molecular subtyping and surrogate subtype classification: a contemporary population-based study of ER-positive/HER2-negative primary breast cancer. Breast Cancer Res Treat. 2019 Nov;178(2):459-467. doi: 10.1007/s10549-019-05378-7. Epub 2019 Aug 20.
- Sokilde R, Persson H, Ehinger A, Pirona AC, Ferno M, Hegardt C, Larsson C, Loman N, Malmberg M, Ryden L, Saal L, Borg A, Vallon-Christerson J, Rovira C. Refinement of breast cancer molecular classification by miRNA expression profiles. BMC Genomics. 2019 Jun 17;20(1):503. doi: 10.1186/s12864-019-5887-7.
- Persson H, Sokilde R, Hakkinen J, Pirona AC, Vallon-Christersson J, Kvist A, Mertens F, Borg A, Mitelman F, Hoglund M, Rovira C. Frequent miRNA-convergent fusion gene events in breast cancer. Nat Commun. 2017 Oct 5;8(1):788. doi: 10.1038/s41467-017-01176-1.
- Persson H, Sokilde R, Hakkinen J, Vallon-Christersson J, Mitelman F, Borg A, Hoglund M, Rovira C. Analysis of fusion transcripts indicates widespread deregulation of snoRNAs and their host genes in breast cancer. Int J Cancer. 2020 Jun 15;146(12):3343-3353. doi: 10.1002/ijc.32927. Epub 2020 Feb 28.
- Winter C, Nilsson MP, Olsson E, George AM, Chen Y, Kvist A, Torngren T, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Hakkinen J, Jonsson G, Grabau D, Malmberg M, Kristoffersson U, Rehn M, Gruvberger-Saal SK, Larsson C, Borg A, Loman N, Saal LH. Targeted sequencing of BRCA1 and BRCA2 across a large unselected breast cancer cohort suggests that one-third of mutations are somatic. Ann Oncol. 2016 Aug;27(8):1532-8. doi: 10.1093/annonc/mdw209. Epub 2016 May 18.
- Dahlgren M, George AM, Brueffer C, Gladchuk S, Chen Y, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Hakkinen J, Ryden L, Malmberg M, Larsson C, Gruvberger-Saal SK, Ehinger A, Loman N, Borg A, Saal LH. Preexisting Somatic Mutations of Estrogen Receptor Alpha (ESR1) in Early-Stage Primary Breast Cancer. JNCI Cancer Spectr. 2021 Apr 22;5(2):pkab028. doi: 10.1093/jncics/pkab028. eCollection 2021 Apr.
- Brueffer C, Gladchuk S, Winter C, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Hakkinen J, George AM, Chen Y, Ehinger A, Larsson C, Loman N, Malmberg M, Ryden L, Borg A, Saal LH. The mutational landscape of the SCAN-B real-world primary breast cancer transcriptome. EMBO Mol Med. 2020 Oct 7;12(10):e12118. doi: 10.15252/emmm.202012118. Epub 2020 Sep 14.
- Glodzik D, Bosch A, Hartman J, Aine M, Vallon-Christersson J, Reutersward C, Karlsson A, Mitra S, Nimeus E, Holm K, Hakkinen J, Hegardt C, Saal LH, Larsson C, Malmberg M, Ryden L, Ehinger A, Loman N, Kvist A, Ehrencrona H, Nik-Zainal S, Borg A, Staaf J. Comprehensive molecular comparison of BRCA1 hypermethylated and BRCA1 mutated triple negative breast cancers. Nat Commun. 2020 Jul 27;11(1):3747. doi: 10.1038/s41467-020-17537-2.
- Larsson C, Ehinger A, Winslow S, Leandersson K, Klintman M, Dahl L, Vallon-Christersson J, Hakkinen J, Hegardt C, Manjer J, Saal L, Ryden L, Malmberg M, Borg A, Loman N. Prognostic implications of the expression levels of different immunoglobulin heavy chain-encoding RNAs in early breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2020 Jul 6;6:28. doi: 10.1038/s41523-020-0170-2. eCollection 2020.
- Fornvik D, Aaltonen KE, Chen Y, George AM, Brueffer C, Rigo R, Loman N, Saal LH, Ryden L. Detection of circulating tumor cells and circulating tumor DNA before and after mammographic breast compression in a cohort of breast cancer patients scheduled for neoadjuvant treatment. Breast Cancer Res Treat. 2019 Sep;177(2):447-455. doi: 10.1007/s10549-019-05326-5. Epub 2019 Jun 24.
- Brueffer C, Vallon-Christersson J, Grabau D, Ehinger A, Hakkinen J, Hegardt C, Malina J, Chen Y, Bendahl PO, Manjer J, Malmberg M, Larsson C, Loman N, Ryden L, Borg A, Saal LH. Clinical Value of RNA Sequencing-Based Classifiers for Prediction of the Five Conventional Breast Cancer Biomarkers: A Report From the Population-Based Multicenter Sweden Cancerome Analysis Network-Breast Initiative. JCO Precis Oncol. 2018 Mar 9;2:PO.17.00135. doi: 10.1200/PO.17.00135. eCollection 2018.
- Nilsson MP, Emmertz M, Kristoffersson U, Borg A, Larsson C, Rehn M, Winter C, Saal LH, Brandberg Y, Loman N. Germline mutations in BRCA1 and BRCA2 incidentally revealed in a biobank research study: experiences from re-contacting mutation carriers and relatives. J Community Genet. 2018 Jul;9(3):201-208. doi: 10.1007/s12687-017-0341-5. Epub 2017 Oct 30.
- Nilsson MP, Winter C, Kristoffersson U, Rehn M, Larsson C, Saal LH, Loman N. Efficacy versus effectiveness of clinical genetic testing criteria for BRCA1 and BRCA2 hereditary mutations in incident breast cancer. Fam Cancer. 2017 Apr;16(2):187-193. doi: 10.1007/s10689-016-9953-x.
- Axelsson U, Ryden L, Johnsson P, Eden P, Mansson J, Hallberg IR, Borrebaeck CAK. A multicenter study investigating the molecular fingerprint of psychological resilience in breast cancer patients: study protocol of the SCAN-B resilience study. BMC Cancer. 2018 Aug 6;18(1):789. doi: 10.1186/s12885-018-4669-y.
- Demircan K, Bengtsson Y, Sun Q, Brange A, Vallon-Christersson J, Rijntjes E, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Borg A, Manjer J, Schomburg L. Serum selenium, selenoprotein P and glutathione peroxidase 3 as predictors of mortality and recurrence following breast cancer diagnosis: A multicentre cohort study. Redox Biol. 2021 Nov;47:102145. doi: 10.1016/j.redox.2021.102145. Epub 2021 Sep 21.
- Dalal H, Dahlgren M, Gladchuk S, Brueffer C, Gruvberger-Saal SK, Saal LH. Clinical associations of ESR2 (estrogen receptor beta) expression across thousands of primary breast tumors. Sci Rep. 2022 Mar 18;12(1):4696. doi: 10.1038/s41598-022-08210-3.
- Demircan K, Sun Q, Bengtsson Y, Seemann P, Vallon-Christersson J, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Minich WB, Borg A, Manjer J, Schomburg L. Autoimmunity to selenoprotein P predicts breast cancer recurrence. Redox Biol. 2022 Jul;53:102346. doi: 10.1016/j.redox.2022.102346. Epub 2022 May 25.
- Staaf J, Hakkinen J, Hegardt C, Saal LH, Kimbung S, Hedenfalk I, Lien T, Sorlie T, Naume B, Russnes H, Marcone R, Ayyanan A, Brisken C, Malterling RR, Asking B, Olofsson H, Lindman H, Bendahl PO, Ehinger A, Larsson C, Loman N, Ryden L, Malmberg M, Borg A, Vallon-Christersson J. RNA sequencing-based single sample predictors of molecular subtype and risk of recurrence for clinical assessment of early-stage breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2022 Aug 16;8(1):94. doi: 10.1038/s41523-022-00465-3.
- Saghir H, Veerla S, Malmberg M, Ryden L, Ehinger A, Saal LH, Vallon-Christersson J, Borg A, Hegardt C, Larsson C, Haidar A, Hedenfalk I, Loman N, Kimbung S. How Reliable Are Gene Expression-Based and Immunohistochemical Biomarkers Assessed on a Core-Needle Biopsy? A Study of Paired Core-Needle Biopsies and Surgical Specimens in Early Breast Cancer. Cancers (Basel). 2022 Aug 18;14(16):4000. doi: 10.3390/cancers14164000.
- Bengtsson Y, Demircan K, Vallon-Christersson J, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Borg A, Schomburg L, Sandsveden M, Manjer J. Serum copper, zinc and copper/zinc ratio in relation to survival after breast cancer diagnosis: A prospective multicenter cohort study. Redox Biol. 2023 Jul;63:102728. doi: 10.1016/j.redox.2023.102728. Epub 2023 May 16.
- Demircan K, Bengtsson Y, Chillon TS, Vallon-Christersson J, Sun Q, Larsson C, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Borg A, Manjer J, Schomburg L. Matched analysis of circulating selenium with the breast cancer selenotranscriptome: a multicentre prospective study. J Transl Med. 2023 Sep 23;21(1):658. doi: 10.1186/s12967-023-04502-y.
- Sharma A, Weitz P, Wang Y, Liu B, Vallon-Christersson J, Hartman J, Rantalainen M. Development and prognostic validation of a three-level NHG-like deep learning-based model for histological grading of breast cancer. Breast Cancer Res. 2024 Jan 29;26(1):17. doi: 10.1186/s13058-024-01770-4.
- Sigurjonsdottir G, De Marchi T, Ehinger A, Hartman J, Bosch A, Staaf J, Killander F, Nimeus E. Comparison of SP142 and 22C3 PD-L1 assays in a population-based cohort of triple-negative breast cancer patients in the context of their clinically established scoring algorithms. Breast Cancer Res. 2023 Oct 10;25(1):123. doi: 10.1186/s13058-023-01724-2.
- Wang Y, Ali MA, Vallon-Christersson J, Humphreys K, Hartman J, Rantalainen M. Transcriptional intra-tumour heterogeneity predicted by deep learning in routine breast histopathology slides provides independent prognostic information. Eur J Cancer. 2023 Sep;191:112953. doi: 10.1016/j.ejca.2023.112953. Epub 2023 Jun 23.
- Nacer DF, Vallon-Christersson J, Nordborg N, Ehrencrona H, Kvist A, Borg A, Staaf J. Molecular characteristics of breast tumors in patients screened for germline predisposition from a population-based observational study. Genome Med. 2023 Apr 14;15(1):25. doi: 10.1186/s13073-023-01177-4.
- Gulis K, Ellbrant J, Svensjo T, Skarping I, Vallon-Christersson J, Loman N, Bendahl PO, Ryden L. A prospective cohort study identifying radiologic and tumor related factors of importance for breast conserving surgery after neoadjuvant chemotherapy. Eur J Surg Oncol. 2023 Jul;49(7):1189-1195. doi: 10.1016/j.ejso.2023.03.225. Epub 2023 Mar 28.
- Bjorklund SS, Aure MR, Hakkinen J, Vallon-Christersson J, Kumar S, Evensen KB, Fleischer T, Tost J; OSBREAC; Sahlberg KK, Mathelier A, Bhanot G, Ganesan S, Tekpli X, Kristensen VN. Subtype and cell type specific expression of lncRNAs provide insight into breast cancer. Commun Biol. 2022 Aug 18;5(1):834. doi: 10.1038/s42003-022-03559-7.
- Sartor H, Zackrisson S, Hegardt C, Larsson C. "Association of mammographic features with molecular breast tumor profiles". Cancer Treat Res Commun. 2021;28:100387. doi: 10.1016/j.ctarc.2021.100387. Epub 2021 May 9.
- Veerla S, Hohmann L, Nacer DF, Vallon-Christersson J, Staaf J. Perturbation and stability of PAM50 subtyping in population-based primary invasive breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2023 Oct 19;9(1):83. doi: 10.1038/s41523-023-00589-0.
- Aine M, Boyaci C, Hartman J, Hakkinen J, Mitra S, Campos AB, Nimeus E, Ehinger A, Vallon-Christersson J, Borg A, Staaf J. Molecular analyses of triple-negative breast cancer in the young and elderly. Breast Cancer Res. 2021 Feb 10;23(1):20. doi: 10.1186/s13058-021-01392-0. Erratum In: Breast Cancer Res. 2021 Feb 24;23(1):28.
Daty zapisu na studia
Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów
1 sierpnia 2010
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
1 sierpnia 2031
Ukończenie studiów (Szacowany)
1 sierpnia 2031
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
1 grudnia 2014
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
2 grudnia 2014
Pierwszy wysłany (Szacowany)
3 grudnia 2014
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Szacowany)
9 lutego 2024
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
7 lutego 2024
Ostatnia weryfikacja
1 lutego 2024
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
- genomika
- krążących komórek nowotworowych
- minimalna choroba resztkowa
- płynna biopsja
- metabolomika
- Wyszukiwanie tłumaczenia
- krążące DNA guza
- proteomika
- BRCA
- patologiczna odpowiedź całkowita
- profilowanie ekspresji genów
- podtyp molekularny
- transkryptomika
- Sekwencjonowanie RNA
- skrining mutacji
- biomarkery prognostyczne i predykcyjne
- Sekwencja RNA
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- SCANB001
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
NIEZDECYDOWANY
Opis planu IPD
Po opublikowaniu odpowiednie zanonimizowane dane poszczególnych uczestników zostaną udostępnione.
Badanie danych/dokumentów
-
Dane i adnotacje dotyczące ekspresji genów przetworzonych RNA-seq (n=49 pacjentów)
Identyfikator informacji: GSE60789Komentarze do informacji: Superseria: GSE60789 Podseria: GSE60785, GSE60788
-
Dane i adnotacje dotyczące ekspresji genów przetworzonych w seq RNA (n=3678 pacjentów)
Identyfikator informacji: GSE81540Komentarze do informacji: Nadseria: GSE81540 Podseria: GSE81538, GSE96058
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .