Ruotsi Cancerome Analysis Network - Rinta: Rintasyövän genominen profilointi (SCAN-B)
maanantai 24. elokuuta 2026 päivittänyt: Åke Borg, Lund University
SCAN-B: Ruotsin syöpäanalyysiverkosto - Breast Initiative
Tässä tutkimuksessa arvioidaan rintasyövän genomiprofiileja prospektiivisella ja väestöpohjaisella tavalla.
Ensimmäisessä vaiheessa rintakasvaimet analysoidaan koko transkription RNA-sekvensoinnilla.
Geenien ilmentymisprofiileja, mutaatioprofiileja ja transkription isoformitason tietoja analysoidaan potilastietojen, kliiniset patologisten muuttujien ja tulosten yhteydessä tavoitteena kehittää uusia rintasyövän molekyylidiagnostisia määrityksiä.
Tulevaisuudessa tehdään lisää genomimittakaavaisia RNA-, DNA- ja proteiinianalyysejä.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Rekrytointi
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Rintasyövän molekulaarinen, patologinen ja kliininen heterogeenisuus on merkittävää. Nykyinen potilas- ja kliinisatologinen arviointi on epätäydellinen lopputuloksen ennustamiseksi, mikä johtaa monien potilaiden ylihoitoon ja toisille johtaa kuolemaan uusiutuvan sairauden vuoksi. Siksi tarvitaan lisäkriteerejä hoidon yksilöimiseksi paremmin ja hoidon tehokkuuden ja eloonjäämisen maksimoimiseksi.
Sweden Cancerome Analysis Network - Breast (SCAN-B) -tutkimus käynnistettiin vuonna 2010 monikeskuksena tulevana populaatiopohjaisena havainnointitutkimuksena, jonka pitkäjänteinen tavoite on analysoida rintasyöpiä seuraavan sukupolven genomitekniikoilla translaatiotutkimukseen ja integroituna terveydenhuoltoon. tulkita peruskasvainbiologia näistä analyyseista; hyödyntää genomitietoja uusien kliinisesti toimivien biomarkkerimääritysten kehittämiseen ja validointiin; ja luoda reaaliaikainen kliininen molekyylidiagnostisten, prognostisten ja ennustavien testien toteutus. Ensimmäisessä vaiheessa keskitymme molekyylien profilointiin seuraavan sukupolven RNA-sekvensoinnilla. Geenien ilmentymisprofiileja, mutaatioprofiileja ja transkription isoformitason tietoja analysoidaan potilastietojen, kliiniset patologisten muuttujien ja tulosten yhteydessä tavoitteena kehittää uusia rintasyövän molekyylidiagnostisia määrityksiä. Tulevaisuudessa tehdään lisää genomimittakaavaisia RNA-, DNA- ja proteiinianalyysejä.
Lokakuuhun 2021 mennessä tutkimukseen on ilmoittautunut yli 17 000 potilasta, mikä edustaa noin 85 % kaikista hoitoalueen kelvollisista potilaista. Kudosten ja veren kerääminen on integroitu terveydenhuollon rutiineihin, ja kliiniset tiedot saadaan kansallisista laaturekistereistä.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
20000
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskeluyhteys
- Nimi: Åke Borg, PhD
- Puhelinnumero: +46-46-2752552
- Sähköposti: ake.borg@med.lu.se
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Lao Saal, MD, PhD
- Sähköposti: lao.saal@med.lu.se
Opiskelupaikat
-
-
-
Borås, Ruotsi
- Rekrytointi
- Södra Älvsborg Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Zakaria Einbeigi, PhD MD
- Puhelinnumero: +4603306161000
- Sähköposti: zakaria.einbeigi@oncology.gu.se
-
Halmstad, Ruotsi, 30233
- Keskeytetty
- Hallands Hospital Halmstad
-
Helsingborg, Ruotsi, 25187
- Rekrytointi
- Helsingborg Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Anna-Karin Falck, MD
- Sähköposti: anna-karin.falck@skane.se
-
Jönköping, Ruotsi, 55185
- Keskeytetty
- Kirurgiska kliniken
-
Karlskrona, Ruotsi, 37185
- Rekrytointi
- Blekinge County Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Monika Sjövall, MD
- Sähköposti: monika.sjovall@ltblekinge.se
-
Kristianstad, Ruotsi, 29185
- Rekrytointi
- Central Hospital Kristianstad
-
Ottaa yhteyttä:
- Tor Svensjö, MD, PhD
- Sähköposti: tor.svensjo@skane.se
-
Lund, Ruotsi, 22185
- Rekrytointi
- Skane University Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Lisa Rydén, MD PhD
- Puhelinnumero: +46-46-176241
- Sähköposti: lisa.ryden@med.lu.se
-
Malmö, Ruotsi, 20502
- Rekrytointi
- Skane University Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Martin Rehn, MD, PhD
- Puhelinnumero: +46-40-331892
- Sähköposti: martin.rehn@skane.se
-
Uppsala, Ruotsi, 75185
- Rekrytointi
- Uppsala University Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Tobias Sjöblom, PhD
- Puhelinnumero: +46-18-4715036
- Sähköposti: tobias.sjoblom@igp.uu.se
-
Vaxjo, Ruotsi, 35234
- Rekrytointi
- Central Hospital Växjö
-
Ottaa yhteyttä:
- Per Weber, MD
- Puhelinnumero: +46-470-588052
- Sähköposti: per.weber@ltkronoberg.se
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Näytteenottomenetelmä
Todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Kaikki potilaat, joilla on epäilty tai vahvistettu primaarisen rintasyövän diagnoosi osallistuvissa sairaalajärjestelmissä Etelä-Ruotsin terveydenhuollon alueella, Uppsalan läänissä ja Jönköpingin maassa, Ruotsissa.
Muut sairaalat Pohjoismaista ovat tervetulleita mukaan.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- primaarisen rintasyövän epäily tai vahvistettu diagnoosi
- allekirjoitettu tietoinen suostumus
Poissulkemiskriteerit:
- allekirjoitetun tietoon perustuvan suostumuksen puuttuminen
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Kohortti
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Biomarkkerit ja kliiniset patologiset tiedot
Aikaikkuna: jopa 20 vuotta
|
Genomitietojen (biomarkkerien) analyysi ja niiden suhde potilas- ja kasvainklinikopatologiseen tietoon; analyyttisen validiteetin arviointi.
|
jopa 20 vuotta
|
|
Invasiivisista taudeista vapaa selviytyminen
Aikaikkuna: jopa 20 vuotta
|
Erilaisia biomarkkereita analysoidaan invasiivisen taudista vapaan eloonjäämisen (IDFS) yhteydessä eri ajankohtina tulevan kohortin eri alaryhmille, esimerkiksi kaikille potilaille, jotka saavat tiettyä hoitoa tai potilaille, joilla on tietyn molekyylialatyypin kasvaimet.
|
jopa 20 vuotta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Patologinen vaste
Aikaikkuna: intraoperatiivinen
|
Erilaisia biomarkkereita analysoidaan patologisen vasteen yhteydessä leikkauksen aikana potilailla, jotka saavat preoperatiivista hoitoa.
|
intraoperatiivinen
|
|
Kokonaisselviytyminen
Aikaikkuna: 3 vuotta, 5 vuotta, 10 vuotta, 15 vuotta, 20 vuotta
|
Erilaisia biomarkkereita analysoidaan kokonaiseloonjäämisen (OS) yhteydessä eri ajankohtina tulevan kohortin eri alaryhmille, esimerkiksi kaikille potilaille, jotka saavat tiettyä hoitoa tai potilaille, joilla on tietyn molekyylin alatyypin kasvaimet.
|
3 vuotta, 5 vuotta, 10 vuotta, 15 vuotta, 20 vuotta
|
|
Rintasyöpäspesifinen eloonjääminen
Aikaikkuna: 3 vuotta, 5 vuotta, 10 vuotta, 15 vuotta, 20 vuotta
|
Erilaisia biomarkkereita analysoidaan rintasyövän eloonjäämisen (BCS) yhteydessä eri ajankohtina tulevan kohortin eri alaryhmille, esimerkiksi kaikille potilaille, jotka saavat tiettyä hoitoa tai potilaille, joilla on tietyn molekyylialatyypin kasvaimet.
|
3 vuotta, 5 vuotta, 10 vuotta, 15 vuotta, 20 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Tutkijat
- Opintojohtaja: Åke Borg, PhD, Lund University
- Päätutkija: Christer Larsson, PhD, Lund University
- Päätutkija: Niklas Loman, MD, PhD, Skane University Hospital
- Päätutkija: Anna Ehinger, MD, PhD, Skane University Hospital
- Päätutkija: Lisa Rydén, MD, PhD, Skane University Hospital
- Päätutkija: Lao H Saal, MD, PhD, Lund University
- Opintojen puheenjohtaja: Cecilia Hegardt, PhD, Lund University
- Päätutkija: Johan Vallon-Christersson, PhD, Lund University
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.
Yleiset julkaisut
- Ryden L, Loman N, Larsson C, Hegardt C, Vallon-Christersson J, Malmberg M, Lindman H, Ehinger A, Saal LH, Borg A. Minimizing inequality in access to precision medicine in breast cancer by real-time population-based molecular analysis in the SCAN-B initiative. Br J Surg. 2018 Jan;105(2):e158-e168. doi: 10.1002/bjs.10741.
- Saal LH, Vallon-Christersson J, Hakkinen J, Hegardt C, Grabau D, Winter C, Brueffer C, Tang MH, Reutersward C, Schulz R, Karlsson A, Ehinger A, Malina J, Manjer J, Malmberg M, Larsson C, Ryden L, Loman N, Borg A. The Sweden Cancerome Analysis Network - Breast (SCAN-B) Initiative: a large-scale multicenter infrastructure towards implementation of breast cancer genomic analyses in the clinical routine. Genome Med. 2015 Feb 2;7(1):20. doi: 10.1186/s13073-015-0131-9. eCollection 2015.
- Staaf J, Glodzik D, Bosch A, Vallon-Christersson J, Reutersward C, Hakkinen J, Degasperi A, Amarante TD, Saal LH, Hegardt C, Stobart H, Ehinger A, Larsson C, Ryden L, Loman N, Malmberg M, Kvist A, Ehrencrona H, Davies HR, Borg A, Nik-Zainal S. Whole-genome sequencing of triple-negative breast cancers in a population-based clinical study. Nat Med. 2019 Oct;25(10):1526-1533. doi: 10.1038/s41591-019-0582-4. Epub 2019 Sep 30.
- Vallon-Christersson J, Hakkinen J, Hegardt C, Saal LH, Larsson C, Ehinger A, Lindman H, Olofsson H, Sjoblom T, Warnberg F, Ryden L, Loman N, Malmberg M, Borg A, Staaf J. Cross comparison and prognostic assessment of breast cancer multigene signatures in a large population-based contemporary clinical series. Sci Rep. 2019 Aug 21;9(1):12184. doi: 10.1038/s41598-019-48570-x.
- Dihge L, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Saal LH, Hakkinen J, Larsson C, Ehinger A, Loman N, Malmberg M, Bendahl PO, Borg A, Staaf J, Ryden L. Prediction of Lymph Node Metastasis in Breast Cancer by Gene Expression and Clinicopathological Models: Development and Validation within a Population-Based Cohort. Clin Cancer Res. 2019 Nov 1;25(21):6368-6381. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-19-0075. Epub 2019 Jul 24.
- Lundgren C, Bendahl PO, Borg A, Ehinger A, Hegardt C, Larsson C, Loman N, Malmberg M, Olofsson H, Saal LH, Sjoblom T, Lindman H, Klintman M, Hakkinen J, Vallon-Christersson J, Ferno M, Ryden L, Ekholm M. Agreement between molecular subtyping and surrogate subtype classification: a contemporary population-based study of ER-positive/HER2-negative primary breast cancer. Breast Cancer Res Treat. 2019 Nov;178(2):459-467. doi: 10.1007/s10549-019-05378-7. Epub 2019 Aug 20.
- Sokilde R, Persson H, Ehinger A, Pirona AC, Ferno M, Hegardt C, Larsson C, Loman N, Malmberg M, Ryden L, Saal L, Borg A, Vallon-Christerson J, Rovira C. Refinement of breast cancer molecular classification by miRNA expression profiles. BMC Genomics. 2019 Jun 17;20(1):503. doi: 10.1186/s12864-019-5887-7.
- Persson H, Sokilde R, Hakkinen J, Pirona AC, Vallon-Christersson J, Kvist A, Mertens F, Borg A, Mitelman F, Hoglund M, Rovira C. Frequent miRNA-convergent fusion gene events in breast cancer. Nat Commun. 2017 Oct 5;8(1):788. doi: 10.1038/s41467-017-01176-1.
- Persson H, Sokilde R, Hakkinen J, Vallon-Christersson J, Mitelman F, Borg A, Hoglund M, Rovira C. Analysis of fusion transcripts indicates widespread deregulation of snoRNAs and their host genes in breast cancer. Int J Cancer. 2020 Jun 15;146(12):3343-3353. doi: 10.1002/ijc.32927. Epub 2020 Feb 28.
- Winter C, Nilsson MP, Olsson E, George AM, Chen Y, Kvist A, Torngren T, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Hakkinen J, Jonsson G, Grabau D, Malmberg M, Kristoffersson U, Rehn M, Gruvberger-Saal SK, Larsson C, Borg A, Loman N, Saal LH. Targeted sequencing of BRCA1 and BRCA2 across a large unselected breast cancer cohort suggests that one-third of mutations are somatic. Ann Oncol. 2016 Aug;27(8):1532-8. doi: 10.1093/annonc/mdw209. Epub 2016 May 18.
- Dahlgren M, George AM, Brueffer C, Gladchuk S, Chen Y, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Hakkinen J, Ryden L, Malmberg M, Larsson C, Gruvberger-Saal SK, Ehinger A, Loman N, Borg A, Saal LH. Preexisting Somatic Mutations of Estrogen Receptor Alpha (ESR1) in Early-Stage Primary Breast Cancer. JNCI Cancer Spectr. 2021 Apr 22;5(2):pkab028. doi: 10.1093/jncics/pkab028. eCollection 2021 Apr.
- Brueffer C, Gladchuk S, Winter C, Vallon-Christersson J, Hegardt C, Hakkinen J, George AM, Chen Y, Ehinger A, Larsson C, Loman N, Malmberg M, Ryden L, Borg A, Saal LH. The mutational landscape of the SCAN-B real-world primary breast cancer transcriptome. EMBO Mol Med. 2020 Oct 7;12(10):e12118. doi: 10.15252/emmm.202012118. Epub 2020 Sep 14.
- Glodzik D, Bosch A, Hartman J, Aine M, Vallon-Christersson J, Reutersward C, Karlsson A, Mitra S, Nimeus E, Holm K, Hakkinen J, Hegardt C, Saal LH, Larsson C, Malmberg M, Ryden L, Ehinger A, Loman N, Kvist A, Ehrencrona H, Nik-Zainal S, Borg A, Staaf J. Comprehensive molecular comparison of BRCA1 hypermethylated and BRCA1 mutated triple negative breast cancers. Nat Commun. 2020 Jul 27;11(1):3747. doi: 10.1038/s41467-020-17537-2.
- Larsson C, Ehinger A, Winslow S, Leandersson K, Klintman M, Dahl L, Vallon-Christersson J, Hakkinen J, Hegardt C, Manjer J, Saal L, Ryden L, Malmberg M, Borg A, Loman N. Prognostic implications of the expression levels of different immunoglobulin heavy chain-encoding RNAs in early breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2020 Jul 6;6:28. doi: 10.1038/s41523-020-0170-2. eCollection 2020.
- Fornvik D, Aaltonen KE, Chen Y, George AM, Brueffer C, Rigo R, Loman N, Saal LH, Ryden L. Detection of circulating tumor cells and circulating tumor DNA before and after mammographic breast compression in a cohort of breast cancer patients scheduled for neoadjuvant treatment. Breast Cancer Res Treat. 2019 Sep;177(2):447-455. doi: 10.1007/s10549-019-05326-5. Epub 2019 Jun 24.
- Brueffer C, Vallon-Christersson J, Grabau D, Ehinger A, Hakkinen J, Hegardt C, Malina J, Chen Y, Bendahl PO, Manjer J, Malmberg M, Larsson C, Loman N, Ryden L, Borg A, Saal LH. Clinical Value of RNA Sequencing-Based Classifiers for Prediction of the Five Conventional Breast Cancer Biomarkers: A Report From the Population-Based Multicenter Sweden Cancerome Analysis Network-Breast Initiative. JCO Precis Oncol. 2018 Mar 9;2:PO.17.00135. doi: 10.1200/PO.17.00135. eCollection 2018.
- Nilsson MP, Emmertz M, Kristoffersson U, Borg A, Larsson C, Rehn M, Winter C, Saal LH, Brandberg Y, Loman N. Germline mutations in BRCA1 and BRCA2 incidentally revealed in a biobank research study: experiences from re-contacting mutation carriers and relatives. J Community Genet. 2018 Jul;9(3):201-208. doi: 10.1007/s12687-017-0341-5. Epub 2017 Oct 30.
- Nilsson MP, Winter C, Kristoffersson U, Rehn M, Larsson C, Saal LH, Loman N. Efficacy versus effectiveness of clinical genetic testing criteria for BRCA1 and BRCA2 hereditary mutations in incident breast cancer. Fam Cancer. 2017 Apr;16(2):187-193. doi: 10.1007/s10689-016-9953-x.
- Axelsson U, Ryden L, Johnsson P, Eden P, Mansson J, Hallberg IR, Borrebaeck CAK. A multicenter study investigating the molecular fingerprint of psychological resilience in breast cancer patients: study protocol of the SCAN-B resilience study. BMC Cancer. 2018 Aug 6;18(1):789. doi: 10.1186/s12885-018-4669-y.
- Demircan K, Bengtsson Y, Sun Q, Brange A, Vallon-Christersson J, Rijntjes E, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Borg A, Manjer J, Schomburg L. Serum selenium, selenoprotein P and glutathione peroxidase 3 as predictors of mortality and recurrence following breast cancer diagnosis: A multicentre cohort study. Redox Biol. 2021 Nov;47:102145. doi: 10.1016/j.redox.2021.102145. Epub 2021 Sep 21.
- Dalal H, Dahlgren M, Gladchuk S, Brueffer C, Gruvberger-Saal SK, Saal LH. Clinical associations of ESR2 (estrogen receptor beta) expression across thousands of primary breast tumors. Sci Rep. 2022 Mar 18;12(1):4696. doi: 10.1038/s41598-022-08210-3.
- Demircan K, Sun Q, Bengtsson Y, Seemann P, Vallon-Christersson J, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Minich WB, Borg A, Manjer J, Schomburg L. Autoimmunity to selenoprotein P predicts breast cancer recurrence. Redox Biol. 2022 Jul;53:102346. doi: 10.1016/j.redox.2022.102346. Epub 2022 May 25.
- Staaf J, Hakkinen J, Hegardt C, Saal LH, Kimbung S, Hedenfalk I, Lien T, Sorlie T, Naume B, Russnes H, Marcone R, Ayyanan A, Brisken C, Malterling RR, Asking B, Olofsson H, Lindman H, Bendahl PO, Ehinger A, Larsson C, Loman N, Ryden L, Malmberg M, Borg A, Vallon-Christersson J. RNA sequencing-based single sample predictors of molecular subtype and risk of recurrence for clinical assessment of early-stage breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2022 Aug 16;8(1):94. doi: 10.1038/s41523-022-00465-3.
- Saghir H, Veerla S, Malmberg M, Ryden L, Ehinger A, Saal LH, Vallon-Christersson J, Borg A, Hegardt C, Larsson C, Haidar A, Hedenfalk I, Loman N, Kimbung S. How Reliable Are Gene Expression-Based and Immunohistochemical Biomarkers Assessed on a Core-Needle Biopsy? A Study of Paired Core-Needle Biopsies and Surgical Specimens in Early Breast Cancer. Cancers (Basel). 2022 Aug 18;14(16):4000. doi: 10.3390/cancers14164000.
- Bengtsson Y, Demircan K, Vallon-Christersson J, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Borg A, Schomburg L, Sandsveden M, Manjer J. Serum copper, zinc and copper/zinc ratio in relation to survival after breast cancer diagnosis: A prospective multicenter cohort study. Redox Biol. 2023 Jul;63:102728. doi: 10.1016/j.redox.2023.102728. Epub 2023 May 16.
- Demircan K, Bengtsson Y, Chillon TS, Vallon-Christersson J, Sun Q, Larsson C, Malmberg M, Saal LH, Ryden L, Borg A, Manjer J, Schomburg L. Matched analysis of circulating selenium with the breast cancer selenotranscriptome: a multicentre prospective study. J Transl Med. 2023 Sep 23;21(1):658. doi: 10.1186/s12967-023-04502-y.
- Sharma A, Weitz P, Wang Y, Liu B, Vallon-Christersson J, Hartman J, Rantalainen M. Development and prognostic validation of a three-level NHG-like deep learning-based model for histological grading of breast cancer. Breast Cancer Res. 2024 Jan 29;26(1):17. doi: 10.1186/s13058-024-01770-4.
- Sigurjonsdottir G, De Marchi T, Ehinger A, Hartman J, Bosch A, Staaf J, Killander F, Nimeus E. Comparison of SP142 and 22C3 PD-L1 assays in a population-based cohort of triple-negative breast cancer patients in the context of their clinically established scoring algorithms. Breast Cancer Res. 2023 Oct 10;25(1):123. doi: 10.1186/s13058-023-01724-2.
- Wang Y, Ali MA, Vallon-Christersson J, Humphreys K, Hartman J, Rantalainen M. Transcriptional intra-tumour heterogeneity predicted by deep learning in routine breast histopathology slides provides independent prognostic information. Eur J Cancer. 2023 Sep;191:112953. doi: 10.1016/j.ejca.2023.112953. Epub 2023 Jun 23.
- Nacer DF, Vallon-Christersson J, Nordborg N, Ehrencrona H, Kvist A, Borg A, Staaf J. Molecular characteristics of breast tumors in patients screened for germline predisposition from a population-based observational study. Genome Med. 2023 Apr 14;15(1):25. doi: 10.1186/s13073-023-01177-4.
- Gulis K, Ellbrant J, Svensjo T, Skarping I, Vallon-Christersson J, Loman N, Bendahl PO, Ryden L. A prospective cohort study identifying radiologic and tumor related factors of importance for breast conserving surgery after neoadjuvant chemotherapy. Eur J Surg Oncol. 2023 Jul;49(7):1189-1195. doi: 10.1016/j.ejso.2023.03.225. Epub 2023 Mar 28.
- Bjorklund SS, Aure MR, Hakkinen J, Vallon-Christersson J, Kumar S, Evensen KB, Fleischer T, Tost J; OSBREAC; Sahlberg KK, Mathelier A, Bhanot G, Ganesan S, Tekpli X, Kristensen VN. Subtype and cell type specific expression of lncRNAs provide insight into breast cancer. Commun Biol. 2022 Aug 18;5(1):834. doi: 10.1038/s42003-022-03559-7.
- Sartor H, Zackrisson S, Hegardt C, Larsson C. "Association of mammographic features with molecular breast tumor profiles". Cancer Treat Res Commun. 2021;28:100387. doi: 10.1016/j.ctarc.2021.100387. Epub 2021 May 9.
- Veerla S, Hohmann L, Nacer DF, Vallon-Christersson J, Staaf J. Perturbation and stability of PAM50 subtyping in population-based primary invasive breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2023 Oct 19;9(1):83. doi: 10.1038/s41523-023-00589-0.
- Rediti M, Venet D, Joaquin Garcia A, Maetens M, Vincent D, Majjaj S, El-Abed S, Di Cosimo S, Ueno T, Izquierdo M, Piccart M, Pusztai L, Loi S, Salgado R, Viale G, Rothe F, Sotiriou C. Identification of HER2-positive breast cancer molecular subtypes with potential clinical implications in the ALTTO clinical trial. Nat Commun. 2024 Nov 29;15(1):10402. doi: 10.1038/s41467-024-54621-3.
- Aine M, Boyaci C, Hartman J, Hakkinen J, Mitra S, Campos AB, Nimeus E, Ehinger A, Vallon-Christersson J, Borg A, Staaf J. Molecular analyses of triple-negative breast cancer in the young and elderly. Breast Cancer Res. 2021 Feb 10;23(1):20. doi: 10.1186/s13058-021-01392-0.
- Mosquim Junior S, Zamore M, Vallon-Christersson J, Ryden L, Levander F. Multiomic profiling of ER-positive HER2-negative breast cancer reveals markers associated with metastatic spread. Breast Cancer Res. 2026 Jan 12;28(1):12. doi: 10.1186/s13058-025-02173-9.
- Sigurjonsdottir G, De Marchi T, Ehinger A, Hartman J, Ullen S, Leandersson K, Bosch A, Staaf J, Killander F, Nimeus E. Evaluation of alternative prognostic thresholds for SP142 and 22C3 immunohistochemical PD-L1 expression in triple-negative breast cancer: results from a population-based cohort. Breast Cancer Res Treat. 2025 Apr;210(2):271-284. doi: 10.1007/s10549-024-07561-x. Epub 2024 Dec 10.
- Fornvik D, Borgquist S, Larsson M, Zackrisson S, Skarping I. Deep learning analysis of serial digital breast tomosynthesis images in a prospective cohort of breast cancer patients who received neoadjuvant chemotherapy. Eur J Radiol. 2024 Sep;178:111624. doi: 10.1016/j.ejrad.2024.111624. Epub 2024 Jul 14.
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus
Sunnuntai 1. elokuuta 2010
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Perjantai 1. elokuuta 2031
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Perjantai 1. elokuuta 2031
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Maanantai 1. joulukuuta 2014
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 2. joulukuuta 2014
Ensimmäinen Lähetetty (Arvioitu)
Keskiviikko 3. joulukuuta 2014
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Torstai 27. elokuuta 2026
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Maanantai 24. elokuuta 2026
Viimeksi vahvistettu
Lauantai 1. elokuuta 2026
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
- genomiikka
- kiertävät kasvainsolut
- minimaalinen jäännössairaus
- nestemäinen biopsia
- metabolomiikka
- translaatiotutkimus
- kiertävä kasvain-DNA
- proteomiikkaa
- BRCA
- patologinen täydellinen vaste
- geeniekspression profilointi
- molekyylien alatyyppi
- transkriptomiikka
- RNA-sekvensointi
- mutaatioseulonta
- prognostiset ja ennustavat biomarkkerit
- RNA-seq
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- SCANB001
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
PÄÄTTÄMÄTÖN
IPD-suunnitelman kuvaus
Julkaisemisen yhteydessä asiaankuuluvat anonymisoidut yksittäisten osallistujien tiedot jaetaan.
Tutkimustiedot/asiakirjat
-
RNA-seq käsitellyt geeniekspressiotiedot ja huomautukset (n = 49 potilasta)
Tiedon tunniste: GSE60789Tietokommentit: SuperSeries: GSE60789 Alasarja: GSE60785, GSE60788
-
RNA-seq käsitellyt geeniekspressiotiedot ja -merkinnät (n = 3678 potilasta)
Tiedon tunniste: GSE81540Tietokommentit: SuperSeries: GSE81540 Alasarja: GSE81538, GSE96058
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .