早産におけるマイクロバイオームとマルチオミクス: 細菌と出産の研究 (BaBs)
早産におけるマイクロバイオームとマルチオミクス: 細菌と出産の研究 (BaBs)
ヒト科とヒト科は微生物にとって優れた宿主として機能し、私たちは過去 450 万年にわたって非常に多量のコミュニティとして共進化してきました。 ヒト関連微生物（「マイクロバイオーム」）は、新生児期からヒト細胞の量を少なくとも 10 倍上回る数で存在します。 集合ゲノム (「メタゲノム」) は、遺伝子含有量の点でヒトゲノムを 150 倍以上上回っています。 微生物叢と早産に関しては、子宮内感染の大部分は下部生殖管で発生し、微生物叢が無菌である子宮内環境に上昇して胎盤（早産）、胎児膜（絨毛膜羊膜炎）、臍帯に感染すると一般に考えられてきました。へその緒（結腸炎）、および胎児（敗血症）。 しかし、私たちと他の研究者らは、妊娠中には膣と腸のマイクロバイオーム群集が明確に構造化されており、胎盤は実際には無菌ではなく、むしろ口腔マイクロバイオームの血行感染によって獲得される可能性が高い低濃度のマイクロバイオームを保持していることを最近実証しました。
私たちの以前の研究と予備データに基づいて、私たちの中心的な仮説は、妊娠中の明確で大部分が共生する常在マイクロバイオームが早産のリスクをもたらすというものです。 早産被験者の縦断的な症例コホートで最先端の科学技術と分析ツールを活用することで、「発見に基づいた」メタゲノミクスとマルチオミクス科学を、これまでに例のないレベルで容易に翻訳可能なメカニズム研究に変換できるようになります。レベル。
調査の概要
状態
条件
詳細な説明
具体的な目的 1. 縦断的な母体 (膣、口腔、皮膚、腸)、胎児 (口腔、皮膚、腸)、および胎盤 (基底板および実質) の 16S ベースのメタゲノム プロファイリングと推定メタゲノミクスにより、早産に関連する異なる微生物群集が明らかになります。 。 方法: 526 人のリスクのある妊婦を登録して、401 人のリスクのある正期産対照を含むおよそ 135 人の早産児を生成します。 妊娠初期/妊娠中期初期から始めて、複数の時点（出生前から出産まで）で複数の体の部位（膣、口腔、便、胎盤）をサンプリングし、微生物DNAを単離し、ニッチ特異的な微生物群集の16Sベースの決定を実行します。早産に関連して発見されました。 私たちの症例コホート縦断的デザインにより、よく開発された教師あり学習アプローチを適用して、どの分類群が早産のリスクに寄与しているのか、また、どの分類群が早産を予測する体の部位と在胎週数を明らかにすることができるようになります。
具体的な目的 2. 選択された被験者および身体部位からの全ゲノムショットガン (WGS) メタゲノミクスにより、早産マイクロバイオームの構造、機能、多様性を決定するための種の同定、微生物遺伝子カタログの作成、および代謝の再構築が可能になります。 方法: 代謝機能を調査し、病原体関連メカニズムを説明するために、サンプルのサブセットに対してショットガン メタゲノミクスを使用して総遺伝子量の変化を分析します。 私たちは、機能的な計算パイプラインを構築して、対象となる被験者のメタゲノム特徴を完全に特徴づけます。
具体的な目的 3. 統合された宿主ゲノミクス、メタトランスクリプトミクス、メタボノミクスデータは、サンプルの限られたサブセットにおける早産の根底にある分子機構とネットワークを明らかにします。 方法: 同時に取得した臨床メタデータ、微生物および宿主の遺伝子発現データ (RNA-Seq メタトランスクリプトミクス)、メタボノミクス プロファイリングを高度な計算および生物統計学的アプローチで調べて統合します。 科目の選択は、目標 1 と 2 のデータに基づいて行われます。
研究の種類
入学 (予想される)
連絡先と場所
研究場所
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Texas
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Houston、Texas、アメリカ、77030
- Baylor College of Medicine
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 早産の危険性がある妊婦。以下のように定義されます。 妊娠 16 週 0 日から 36 週 6 週までの自然早産の既往歴が医療記録の検討によって確認されている。 医療記録の回収が失敗した場合、資格は前回の出生時の出来事と出生体重が 2 kg 未満であるかによって異なります。在胎週数 24 週未満の経験豊富な超音波検査技師による経膣超音波検査により、子宮頸管が 2.5 cm 未満に短縮していることが記録されている。文書化され培養証明された複雑な下部または上部尿路感染症。入院を必要とする尿路感染症（腎盂腎炎など）として定義されます。治療済みまたは未治療の歯周病が記録されている。再発性下部生殖器感染症が記録されている。早産のリスクを高める喫煙またはその他の化学物質への依存。早産の高リスクに関するその他の臨床的懸念（BCM の主任研究者である Aagaard 博士または UTMB の Saade 博士によって解消された）
- 最良の産科推定による妊娠 20 週以下での登録
- 英語を話すことができる、または通訳が必要な方
- 研究に参加できるだけの十分な認知的認識を持っている
- 在胎週数10週を超える妊娠可能な妊婦
- プロトコールのすべての必須側面に同意する意思 - 追加の必須ではない側面があり、参加する被験者の 20% を募集します。 これらは任意のオプトイン要素となります
- 16歳以上
除外基準:
- 妊娠中のいつでも多胎妊娠
- 既知のHIVまたはC型肝炎感染
- 既知の免疫抑制疾患
- 過去6か月以内に以下の薬物のいずれかを使用した。サイトカイン;メトトレキサートまたは免疫抑制性細胞傷害性薬剤
- -管理され完全に治療されている皮膚の扁平上皮癌または基底細胞癌または甲状腺癌を除く癌の病歴。
- 過去 5 年間に胆嚢摘出術と虫垂切除術を除く、消化管の大手術 (胃バイパスを含む)。 いつでも大規模な腸切除。 研究への参加中にそのような手術が必要な症状が生じた場合でも、被験者は登録後に除外されません。 登録後に患者がそのような手術の必要性を示した場合でも、患者は除外されません。
- 記録された慢性消化器疾患（クローン病など）
- 消化器症状を伴う慢性疾患（例： 嚢胞性線維症）
- 自閉症スペクトラム障害または重大な発達遅延、精神病、大うつ病性障害、または同意能力に懸念がある場合の双極性障害の病歴
- トキシックショック症候群の治療を受けている、またはトキシックショック症候群を患った疑いがある。
- 致命的な胎児異常。 事前に特定されていない場合は登録後に除外されます
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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母体と胎児のマイクロバイオームの特性評価
時間枠：妊娠から産後4～6週間まで
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早産のリスクがあるコホートにおける母体、胎盤、乳児のマイクロバイオームを縦断的に特徴づけます。
すべての女性が最終的に早産になるわけではありません。早産に関連するマイクロバイオームの変化があるかどうかを確認できるようになります。
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妊娠から産後4～6週間まで
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母体のマイクロバイオーム（腸、口腔、膣、胎盤）と早産の関連性
時間枠：妊娠から産後4～6週間まで
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早産のリスクがあるコホートにおける母体、胎盤、乳児のマイクロバイオームを縦断的に特徴づけます。
すべての女性が最終的に早産になるわけではありません。早産に関連するマイクロバイオームの変化があるかどうかを確認できるようになります。
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妊娠から産後4～6週間まで
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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早産率
時間枠：妊娠から出産日まで、37 週未満
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妊娠 37 週未満および 34 週未満の早産率を測定します。これは、24 週未満の超音波検査、または最終月経期間が不明の 24 週未満の超音波検査、または熟練した検査および 24 週未満の超音波検査と一致する最終月経期間の最良の産科推定によって定義されます。
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妊娠から出産日まで、37 週未満
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正期産率
時間枠：構想から納品日まで
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24 週未満の超音波検査、または最終月経期間が不明の 24 週未満の超音波検査、または熟練した検査および 24 週未満の超音波検査と一致する最終月経期間の最良の産科推定によって定義される正期産率を測定します。
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構想から納品日まで
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者：Kjersti Aagaard, MD/PhD、Associate Professor / Vice Chair for Research
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (予想される)
研究の完了 (予想される)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (見積もり)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (見積もり)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。