Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Mikrobiom og multi'omics i præterm fødsel: bakterie- og fødselsundersøgelsen (BaBs)

9. maj 2023 opdateret af: Kjersti Aagaard, Baylor College of Medicine

Mikrobiom og multiomics i præterm fødsel: bakterie- og fødselsundersøgelsen (BaBs)

Hominider og homininer tjener som bemærkelsesværdige værter for mikrober, og vi har udviklet os sammen i løbet af de sidste 4,5 millioner år som meget overflodssamfund. Menneske-associerede mikroorganismer ("mikrobiomet") er til stede i et antal, der overstiger mængden af ​​humane celler med mindst 10 gange begyndende i den neonatale periode. Det kollektive genom ("metagenomet") overstiger vores menneskelige genom med hensyn til genindhold med mere end 150 gange. Med hensyn til mikrobiota og for tidlig fødsel har man generelt antaget, at størstedelen af ​​intrauterine infektioner stammer fra den nedre genitalkanal, hvor mikrobiota stiger op i det ellers sterile intrauterine miljø for at inficere moderkagen (for tidlig fødsel), fosterets membraner (chorioamnionitis), navlestrengen. ledning (funisitis) og fosteret (sepsis). Men vi og andre har for nylig påvist, at vaginal- og tarmmikrobiomsamfundene er tydeligt strukturerede under graviditet, og moderkagen er faktisk ikke steril, men rummer snarere et mikrobiom med lav overflod, som sandsynligvis erhverves gennem hæmatogen overførsel af det orale mikrobiom.

Baseret på vores tidligere undersøgelser og foreløbige data er vores centrale hypotese, at et distinkt og stort set kommensalt hjemmehørende mikrobiom i graviditeten udgør en risiko for for tidlig fødsel. Ved at bruge vores state-of-the-science teknologi og analyseværktøjer i en longitudinel case-kohorte af præmature fødsler, vil vi være i stand til at transformere "opdagelsesbaseret" metagenomics og multi'omics videnskab til let oversættelige mekanistiske undersøgelser på et tidligere uden sidestykke niveau.

Studieoversigt

Status

Aktiv, ikke rekrutterende

Betingelser

Detaljeret beskrivelse

Specifikt mål 1. Longitudinel maternal (vaginal, oral, hud, tarm), føtal (oral, hud, tarm) og placental (basalplade og parenkym) 16S-baseret metagenomisk profilering med udledt metagenomik vil afsløre distinkte mikrobielle samfund i forbindelse med for tidlig fødsel . Metoder: Vi vil indskrive 526 gravide i risikozonen for at give ca. 135 præmature fødsler med 401 risikokontroller. Fra det første/begyndelige andet trimester vil vi prøve flere kropssteder (vagina, oral, afføring, placenta) på flere tidspunkter (antenatal gennem levering), isolere mikrobielt DNA og udføre 16S-baseret bestemmelse af nichespecifikke mikrobielle samfund fundet i forbindelse med for tidlig fødsel. Med vores case-kohorte longitudinelle design vil vi være i stand til at anvende vores veludviklede superviserede læringstilgange til at afsløre, hvilke taxa der bidrager til risikoen for for tidlig fødsel, og på hvilke kropssteder og svangerskabsalder de er forudsigelige for for tidlig fødsel.

Specifikt mål 2. Helgenomhaglgevær (WGS) metagenomik fra udvalgte forsøgspersoner og kropssteder vil muliggøre artsidentifikation, generering af mikrobielle genkataloger og metaboliske rekonstruktioner for at bestemme strukturen, funktionen og mangfoldigheden af ​​mikrobiomet for tidlig fødsel. Metoder: For at undersøge metabolisk funktionalitet og beskrive patogen-relaterede mekanismer, vil vi analysere ændringer i det samlede genindhold ved hjælp af haglgeværmetagenomik på en undergruppe af prøver. Vi vil bygge videre på vores funktionelle beregningsmæssige pipelines for fuldt ud at karakterisere målrettede emners metagenomiske signaturer.

Specifikt mål 3. Integreret værtsgenomik, metatranscriptomics og metabonomics data vil afsløre molekylære mekanismer og netværk, der ligger til grund for for tidlig fødsel i en begrænset delmængde af prøver. Metoder: Vi vil undersøge og integrere vores samtidig erhvervede kliniske metadata, mikrobielle og værtsgenekspressionsdata (RNA-Seq metatranscriptomics) og metabonomics profilering med avancerede beregningsmæssige og biostatistiske tilgange. Vi vil blive vejledt i vores valg af emner af vores data fra mål 1 og 2.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Forventet)

526

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

  • Forenede Stater
    • Texas
      • Houston, Texas, Forenede Stater, 77030
        • Baylor College of Medicine

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

16 år til 64 år (Barn, Voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ja

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Kvinder, der i øjeblikket er gravide, som har høj risiko for for tidlig fødsel; Gravid med en baby (ikke tvillinger eller trillinger), og som deltager i regelmæssige prænatale besøg. De vil bruge yderligere 20 minutter på 5-6 prioriterede planlagte besøg for at få undersøgelsesprøver og udfylde spørgeskemaer, hvor det sidste besøg finder sted omkring 6 uger efter levering.

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Gravidae i risiko for for tidlig fødsel, defineret som: Anamnese med tidligere spontan præmatur fødsel ved 16w0d-36w6d gestationsalder bekræftet ved gennemgang af lægejournaler. Hvis bestræbelserne på at hente lægejournaler ikke lykkes, vil berettigelsen afhænge af begivenhederne omkring den forudgående fødsel og fødselsvægt under 2 kg; Dokumenteret forkortet cervix <2,5 cm ved transvaginal ultralyd udført af erfaren sonograf ved <24 ugers svangerskabsalder; Dokumenteret og kulturbevist kompliceret nedre eller øvre urinvejsinfektion defineret som en urinvejsinfektion, der kræver indlæggelse (f.eks. pyelonefritis); Dokumenteret paradentose, behandlet eller ubehandlet; Dokumenteret tilbagevendende nedre genital infektion; Rygning eller anden kemisk afhængighed, der ville medføre en øget risiko for for tidlig fødsel; Anden klinisk bekymring for høj risiko for for tidlig fødsel (og godkendt af PI Dr. Aagaard ved BCM eller Dr. Saade ved UTMB)
  • Tilmelding ved mindre end eller lig med 20 ugers svangerskab efter bedste obstetriske skøn
  • Kunne tale engelsk eller arbejde med tolk
  • Kognitivt bevidst nok til at kunne deltage i undersøgelsen
  • Gravidae med levedygtig graviditet >10 ugers svangerskabsalder
  • Vilje til at give samtykke til alle krævede aspekter af protokollen - Der vil være yderligere ikke-påkrævede aspekter, som vi vil rekruttere 20 % af emnerne til at deltage i. Disse vil være frivillige opt-in aspekter
  • 16 år eller ældre

Ekskluderingskriterier:

  • Multifetal graviditet på ethvert tidspunkt under graviditeten
  • Kendt HIV eller Hepatitis C infektion
  • Kendt immunsuppressiv sygdom
  • Brug af et af følgende lægemidler inden for de sidste 6 måneder; Cytokiner; Methotrexat eller immunsuppressive cytotoksiske midler
  • Anamnese med kræft med undtagelse af plade- eller basalcellekarcinomer i huden eller kræft i skjoldbruskkirtlen, som er blevet behandlet og fuldt behandlet.
  • Større kirurgi i mave-tarmkanalen (inklusive gastrisk bypass), med undtagelse af kolecystektomi og blindtarmsoperation inden for de seneste fem år. Enhver større tarmresektion til enhver tid. Hvis der opstår forhold, der kræver sådanne operationer under deltagelse i undersøgelsen, vil forsøgspersoner ikke blive udelukket efter tilmelding. Hvis patienten udvikler behov for en sådan operation efter tilmelding, vil de ikke blive udelukket.
  • Dokumenterede kroniske GI lidelser (fx Crohns sygdom)
  • Kroniske tilstande med GI-symptomer, (f. cystisk fibrose)
  • Autismespektrumforstyrrelse eller betydelig udviklingsforsinkelse, psykose, svær depressiv lidelse eller en historie med bipolar lidelse, hvis der er bekymring for evnen til at give samtykke
  • Behandling for eller mistanke om nogensinde at have haft toksisk shock-syndrom.
  • Fatal føtal anomali. Vil udelukke efter tilmelding, hvis ikke tidligere identificeret

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Karakterisering af moder-føtalt mikrobiom
Tidsramme: Undfangelse til 4-6 uger efter fødslen
Karakteriser i længderetningen moder-, placenta- og spædbarnsmikrobiomet i en kohorte med risiko for for tidlig fødsel. Ikke alle kvinder vil i sidste ende føde for tidligt; vi vil vi være i stand til at se, om der er mikrobiomændringer forbundet med for tidlig fødsel.
Undfangelse til 4-6 uger efter fødslen
Sammenslutning af maternel mikrobiom (tarm, oral, vaginal, placenta) med for tidlig fødsel
Tidsramme: Undfangelse til 4-6 uger efter fødslen
Karakteriser i længderetningen moder-, placenta- og spædbarnsmikrobiomet i en kohorte med risiko for for tidlig fødsel. Ikke alle kvinder vil i sidste ende føde for tidligt; vi vil vi være i stand til at se, om der er mikrobiomændringer forbundet med for tidlig fødsel.
Undfangelse til 4-6 uger efter fødslen

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Rate af for tidlig fødsel
Tidsramme: Undfangelse til dato for leveringsdato, <37 uger
Mål frekvensen af ​​for tidlig fødsel <37 og <34 ugers svangerskab, som defineret ved bedste obstetriske estimat af sidste menstruation i overensstemmelse med <24 ugers sonogram, ELLER <24 ugers sonogram med ukendt sidste menstruation, ELLER faglært undersøgelse og <24 ugers sonogram
Undfangelse til dato for leveringsdato, <37 uger
Fødselsrate
Tidsramme: Konception til dato for leveringsdato
Mål terminsfødselsraten, som defineret ved bedste obstetriske estimat af sidste menstruation i overensstemmelse med <24 ugers sonogram, ELLER <24 ugers sonogram med ukendt sidste menstruation, ELLER faglært undersøgelse og <24 ugers sonogram
Konception til dato for leveringsdato

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

Baylor College of Medicine

Samarbejdspartnere

The University of Texas Medical Branch, Galveston

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Kjersti Aagaard, MD/PhD, Associate Professor / Vice Chair for Research

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

1. juni 2014

Primær færdiggørelse (Forventet)

1. december 2024

Studieafslutning (Forventet)

1. juni 2025

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

13. marts 2015

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

17. marts 2015

Først opslået (Skøn)

19. marts 2015

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Skøn)

11. maj 2023

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

9. maj 2023

Sidst verificeret

1. maj 2023

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • H-34056

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med For tidlig fødsel

Søg i lignende forsøg

Sponsorer og samarbejdspartnere

Medicinske tilstande

Narkotikainterventioner

CROs by country

CROs in Equatorial Guinea

Betingelser

Sjældne sygdomme

Narkotikainterventioner

Kosttilskud

Sponsor / samarbejdspartnere

Placeringer

Abonner