미숙아의 마이크로바이옴 및 멀티오믹스: 박테리아 및 출산 연구 (BaBs)
조산의 마이크로바이옴 및 멀티오믹스: 박테리아 및 출생 연구(BaBs)
호미니드와 호미닌은 미생물의 현저한 숙주 역할을 하며, 우리는 지난 450만 년 동안 고도로 과다한 군집으로 함께 진화해 왔습니다. 인간 관련 미생물("마이크로바이옴")은 신생아기에 시작하여 인간 세포의 양을 최소 10배 이상 초과하는 숫자로 존재합니다. 집단 게놈("메타게놈")은 유전자 함량 면에서 인간 게놈을 150배 이상 능가합니다. 미생물군과 조산과 관련하여 일반적으로 자궁내 감염의 대부분은 하부 생식기에서 시작되며 미생물군은 무균 상태인 자궁내 환경으로 올라와 태반(조산), 태아막(융모양막염), 제대 코드 (funisitis) 및 태아 (패혈증). 그러나 우리와 다른 사람들은 최근 질 및 소화관 미생물 군집이 임신 중에 뚜렷하게 구조화되고 태반은 실제로 무균 상태가 아니라 오히려 구강 미생물 군집의 혈행성 전달을 통해 획득될 가능성이 있는 소량의 미생물 군집을 품고 있음을 입증했습니다.
우리의 이전 연구와 예비 데이터를 기반으로, 우리의 중심 가설은 임신 중 뚜렷하고 크게 상주하는 미생물 군집이 조산의 위험을 초래한다는 것입니다. 조산 피험자의 종적 사례 코호트에서 최신 과학 기술 및 분석 도구를 활용함으로써 "발견 기반" metagenomics 및 multi'omics 과학을 이전에 비교할 수 없는 수준에서 쉽게 번역할 수 있는 역학 연구로 변환할 수 있습니다. 수준.
연구 개요
상태
정황
상세 설명
구체적인 목표 1. 종방향 산모(질, 구강, 피부, 장), 태아(구강, 피부, 장) 및 태반(기저판 및 실질) 16S 기반 메타게놈 프로파일링과 유추된 메타게노믹스는 조산과 관련하여 뚜렷한 미생물 군집을 밝힐 것입니다. . 방법: 우리는 526개의 위험 임신부를 등록하여 401개의 위험 만삭 대조군과 함께 대략 135명의 조산을 산출할 것입니다. 임신 1/2분기 초반부터 여러 시점(산전부터 분만까지)에서 여러 신체 부위(질, 구강, 대변, 태반)를 샘플링하고, 미생물 DNA를 분리하고, 틈새 특정 미생물 군집의 16S 기반 결정을 수행합니다. 조산과 관련하여 발견됩니다. 케이스-코호트 종적 설계를 통해 조산의 위험에 기여하는 분류군과 조산을 예측하는 신체 부위 및 재태 연령을 밝히기 위해 잘 개발된 지도 학습 접근 방식을 적용할 수 있습니다.
특정 목표 2. 선택된 피험자 및 신체 부위의 전체 게놈 샷건(WGS) 메타게놈학은 조산 미생물의 구조, 기능 및 다양성을 결정하기 위해 종 식별, 미생물 유전자 카탈로그 생성 및 대사 재구성을 가능하게 합니다. 방법: 대사 기능을 조사하고 병원체 관련 메커니즘을 설명하기 위해 샘플의 하위 집합에서 샷건 메타게노믹스를 사용하여 총 유전자 함량의 변화를 분석합니다. 우리는 기능적 계산 파이프라인을 구축하여 대상 대상의 메타게노믹 서명을 완전히 특성화할 것입니다.
특정 목표 3. 통합된 숙주 유전체학, 메타전사체학 및 대사체학 데이터는 제한된 샘플 하위 집합에서 조산의 기본이 되는 분자 메커니즘과 네트워크를 밝힐 것입니다. 방법: 우리는 동시에 획득한 임상 메타데이터, 미생물 및 숙주 유전자 발현 데이터(RNA-Seq metatranscriptomics), 메타보노믹스 프로파일링을 고급 계산 및 생물 통계학적 접근 방식으로 조사하고 통합할 것입니다. 우리는 목표 1과 2의 데이터에 따라 과목 선택을 안내받을 것입니다.
연구 유형
등록 (예상)
연락처 및 위치
연구 장소
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Texas
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Houston, Texas, 미국, 77030
- Baylor College of Medicine
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 조산 위험이 있는 Gravidae는 다음과 같이 정의됩니다. 의료 기록 검토를 통해 확인된 임신 16주~36주 사이의 이전 자연 조산 이력. 의료 기록을 검색하려는 노력이 성공적이지 않은 경우 자격은 이전 출생 및 2kg 미만의 출생 체중을 둘러싼 사건에 따라 달라집니다. 재태 연령 24주 미만의 숙련된 초음파 기사가 수행한 경질 초음파에 의해 2.5cm 미만으로 단축된 자궁경부가 문서화되었습니다. 입원이 필요한 요로 감염으로 정의되는 문서화되고 배양으로 입증된 복합 하부 또는 상부 요로 감염(예: 신우신염); 기록된 치주 질환, 치료 또는 미치료; 문서화된 재발성 하부 생식기 감염; 조산의 위험이 증가하는 흡연 또는 기타 화학적 의존성 조산의 고위험에 대한 기타 임상적 우려(BCM의 PI Dr. Aagaard 또는 UTMB의 Saade 박사가 승인함)
- 최선의 산과적 추정에 의한 임신 20주 이하의 등록
- 영어를 구사하거나 통역사와 함께 일할 수 있는 분
- 연구에 참여할 수 있을 만큼 충분히 인지하고 있음
- 임신 가능한 임신 >10주 재태 연령을 가진 Gravidae
- 프로토콜의 모든 필수 측면에 대한 동의 의지 - 참여할 피험자의 20%를 모집할 추가 비필수 측면이 있을 것입니다. 이는 자발적인 옵트인 측면입니다.
- 16세 이상
제외 기준:
- 임신 중 언제든지 다태아 임신
- 알려진 HIV 또는 C형 간염 감염
- 알려진 면역 억제 질환
- 지난 6개월 이내에 다음 약물 중 하나를 사용했습니다. 사이토카인; 메토트렉세이트 또는 면역억제성 세포독성제
- 관리되고 완전히 치료된 피부 또는 갑상선암의 편평 또는 기저 세포 암종을 제외한 암의 병력.
- 지난 5년 동안 담낭 절제술 및 충수 절제술을 제외한 위장관 대수술(위 우회술 포함). 언제든지 주요 창자 절제. 연구에 참여하는 동안 그러한 수술이 필요한 조건이 발생하는 경우 등록 후 피험자가 제외되지 않습니다. 환자가 등록 후 그러한 수술이 필요한 경우 제외되지 않습니다.
- 기록된 만성 GI 장애(예: 크론병)
- GI 증상이 있는 만성 질환(예: 낭포성 섬유증)
- 동의 능력에 대한 우려가 있는 경우 자폐 스펙트럼 장애 또는 상당한 발달 지연, 정신병, 주요 우울 장애 또는 양극성 장애 병력
- 독성 쇼크 증후군에 대한 치료 또는 의심.
- 치명적인 태아 기형. 이전에 확인되지 않은 경우 등록 후 제외됩니다.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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모체-태아 마이크로바이옴의 특성
기간: 수태 ~ 산후 4-6주
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조산 위험이 있는 코호트에서 산모, 태반 및 영아 마이크로바이옴을 세로로 특성화합니다.
모든 여성이 궁극적으로 조산하는 것은 아닙니다. 조산과 관련된 미생물 변화가 있는지 확인할 수 있습니다.
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수태 ~ 산후 4-6주
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산모의 마이크로바이옴(장, 구강, 질, 태반)과 조산의 연관성
기간: 수태 ~ 산후 4-6주
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조산 위험이 있는 코호트에서 산모, 태반 및 영아 마이크로바이옴을 세로로 특성화합니다.
모든 여성이 궁극적으로 조산하는 것은 아닙니다. 조산과 관련된 미생물 변화가 있는지 확인할 수 있습니다.
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수태 ~ 산후 4-6주
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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조산율
기간: 착상일부터 배송일까지, 37주 미만
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24주 미만의 초음파 사진, 또는 마지막 월경 기간을 알 수 없는 24주 미만의 초음파 사진, 또는 숙련된 검사 및 24주 미만의 초음파 사진과 일치하는 마지막 월경 기간의 최선의 산과적 추정치에 의해 정의된 조산 37주 미만 및 34주 미만 임신율 측정
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착상일부터 배송일까지, 37주 미만
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출산율
기간: 납품일까지의 착상
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24주 미만의 초음파 사진, 또는 마지막 월경 기간을 알 수 없는 24주 미만의 초음파 사진, 또는 숙련된 검사 및 24주 미만의 초음파 사진과 일치하는 마지막 월경 기간의 최선의 산과적 추정치에 의해 정의된 만기 출생률을 측정합니다.
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납품일까지의 착상
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공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Kjersti Aagaard, MD/PhD, Associate Professor / Vice Chair for Research
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (예상)
연구 완료 (예상)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (추정)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (추정)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
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조산에 대한 임상 시험
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University Hospitals Cleveland Medical CenterThe Cleveland Clinic; MetroHealth Medical Center종료됨조산 | 임신 조산 | 무도회(임신) | 임신 프롬 | PROM, 조산아(임신) | 파열/분만 사이의 기간에 대한 Premat Rupture Membranes Preterm Unspec미국