炎症性腸疾患における腸内微生物叢

この前向きコホート研究は、韓国の IBD 患者のための腸内微生物叢ライブラリーを構築することを目的としており、研究者のマルチオミクス分析プラットフォームを使用して、明確な臨床的/遺伝的特徴とそれらの潜在的な相互作用とともに腸内微生物の特徴を調査することも目的としています。

インフォームド コンセントに署名した後、さまざまな生物学的サンプル (糞便、粘膜、および血液サンプル) と包括的な臨床データ (患者調査を使用した心理測定評価を含む) が定期的に患者から取得されます。

マルチオミクス調査には、メタゲノミクス (16s RNA シーケンスおよび全メタゲノム シーケンス)、メタボロミクス、ヒト ゲノミクス (ゲノムワイド SNP データ、全エクソームおよびゲノム シーケンス)、トランスクリプトミクス、プロテオミクス、エピジェネティクス、および単一細胞マルチオミクス解析が含まれます。 . 糞便サンプルを用いた in vitro および in vivo 試験を実施します。

簡単に言えば、血液サンプルから DNA を抽出した後、全ゲノム配列決定が実行され、データが以前に報告された差異と比較されます。 新規の分散または特定の分散の発生率が測定されます。 糞便サンプルが収集され、各研究対象のマイクロバイオーム組成が分析されます。 糞便中の微生物の多様性は、微生物の中で遺伝情報の高度に保存された領域である 16S リボソーム RNA のシーケンス データから測定されます。 定期的な内視鏡検査が計画されている場合、結腸粘膜サンプルが収集されます。 サンプルは、分析のために病気の粘膜と正常な粘膜から収集されます。 微生物の多様性は、サンプルの 16S RNA シーケンス データから測定されます。

マルチオミクス データは、統合されたバイオインフォマティクス分析プラットフォームを使用して、包括的な臨床メタデータで分析されます。 臨床データには、人口統計、疾患の特徴、およびさまざまな患者報告アウトーム データ (健康関連の生活の質、不安、うつ病などを含む) が含まれます。 患者が報告した転帰データは、検証済みのアンケートを使用して定期的に収集されます。

基本的な分析から得られたデータは、個人差、疾患特性の違い (疾患の表現型、治療の種類、血清学的マーカーなど)、心理社会的特性の違い (不安やうつ病の有無など) の観点から再調査されます。生活の質）など さらに、基本的な分析からのデータは、韓国の IBD 患者の参照として使用され、「異なる民族性」または「健康な」韓国人集団から得られた他のデータと比較されます。

結論として、この長期的で大規模な前向き研究は、トランスレーショナル メディシンの分野を研究するためのプラットフォームを提供し、IBD の根底にある腸内微生物叢の隠れた特徴を明らかにし、IBD の潜在的な生物学的マーカーを特定します。