Darmmikrobiom bei entzündlichen Darmerkrankungen

Diese prospektive Kohortenstudie zielt darauf ab, eine Darmmikrobiom-Bibliothek für koreanische IBD-Patienten aufzubauen, und zielt auch darauf ab, Darmmikrobensignaturen zusammen mit unterschiedlichen klinischen/genetischen Merkmalen und ihrem möglichen Zusammenspiel unter Verwendung der Multi-Omics-Analyseplattform des Prüfarztes zu untersuchen.

Nach Unterzeichnung der Einwilligungserklärung werden regelmäßig verschiedene biologische Proben (Stuhl-, Schleimhaut- und Blutproben) sowie umfassende klinische Daten (einschließlich psychometrischer Auswertungen mittels Patientenbefragung) von Patienten erhoben.

Die Multi-Omics-Untersuchungen umfassen: Metagenomik (16s-RNA-Sequenzierung und vollständige metagenomische Sequenzierung), Metabolomik, Humangenomik (genomweite SNP-Daten, vollständige Exom- und Genomsequenzierung), Transkriptomik, Proteomik, Epigenetik und Einzelzell-Multi-Omics-Analyse . Es werden In-vitro- und In-vivo-Studien mit Stuhlproben durchgeführt.

Kurz gesagt, nach der Extraktion der DNA aus Blutproben wird eine Gesamtgenomsequenzierung durchgeführt und die Daten werden mit den zuvor gemeldeten Abweichungen verglichen. Neuartige Varianzen oder das Auftreten spezifischer Varianzen werden gemessen. Es wird eine Kotprobe entnommen und die Mikrobiomzusammensetzung jeder Studienperson wird analysiert. Die fäkale mikrobielle Diversität wird anhand von Sequenzierungsdaten von 16S-ribosomaler RNA gemessen, die ein hochkonservierter Bereich der genetischen Information unter Mikroorganismen ist. Eine Darmschleimhautprobe wird entnommen, wenn eine routinemäßige endoskopische Überwachung geplant ist. Zur Analyse wird eine Probe von erkrankter und normaler Schleimhaut insgesamt entnommen. Die mikrobielle Diversität wird anhand der 16S-RNA-Sequenzierungsdaten der Proben gemessen.

Die Multi-Omics-Daten werden mit umfassenden klinischen Metadaten unter Verwendung einer integrierten bioinformatischen Analyseplattform analysiert. Zu den klinischen Daten gehören demografische Daten, Krankheitsmerkmale und verschiedene von Patienten gemeldete Outome-Daten (einschließlich gesundheitsbezogener Lebensqualität, Angstzustände, Depressionen und andere). Von Patienten gemeldete Ergebnisdaten werden regelmäßig mit validierten Fragebögen erhoben.

Daten aus der Basisanalyse werden im Hinblick auf interindividuelle Unterschiede, Unterschiede zwischen Krankheitsmerkmalen (wie Krankheitsphänotyp, Art der medizinischen Behandlung und serologischen Marker), Unterschiede zwischen psychosozialen Merkmalen (wie das Vorhandensein von Angstzuständen oder Depressionen und Lebensqualität) usw. Darüber hinaus werden Daten aus der Basisanalyse als Referenz für den koreanischen IBD-Patienten verwendet und mit anderen Daten verglichen, die von der „anderen ethnischen Zugehörigkeit“ oder der „gesunden“ koreanischen Bevölkerung stammen.

Zusammenfassend lässt sich sagen, dass diese langfristige, groß angelegte prospektive Studie eine Plattform für die Untersuchung eines Bereichs der translationalen Medizin bieten wird, um verborgene Signaturen des Darmmikrobioms aufzudecken, die CED zugrunde liegen, und potenzielle biologische Marker bei CED zu identifizieren.