염증성 장 질환의 장내 마이크로바이옴

본 전향적 코호트 연구는 한국인 IBD 환자를 위한 장내 미생물군집 라이브러리를 구축하는 것을 목표로 하며, 또한 연구자의 다중오믹스 분석 플랫폼을 사용하여 뚜렷한 임상/유전적 특징 및 잠재적 상호 작용과 함께 장내 미생물 시그니처를 탐색하는 것을 목표로 합니다.

정보에 입각한 동의서에 서명한 후 다양한 생물학적 샘플(대변, 점막 및 혈액 샘플)과 포괄적인 임상 데이터(환자 설문 조사를 사용한 정신 측정 평가 포함)를 정기적으로 환자로부터 얻을 것입니다.

다중 오믹스 조사는 metagenomics(16s RNA 시퀀싱 및 전체 metagenomic 시퀀싱), 대사체학, 인간 유전체학(게놈 전체 SNP 데이터, 전체 엑솜 및 게놈 시퀀싱), transcriptomics, proteomics, epigenetics 및 단일 세포 다중 오믹스 분석으로 구성됩니다. . 분변 샘플을 사용하여 시험관 내 및 생체 내 연구를 수행할 것입니다.

간단히 말해, 혈액 샘플에서 DNA를 추출한 후 전체 게놈 시퀀싱을 수행하고 데이터를 이전에 보고된 분산과 비교합니다. 새로운 분산 또는 특정 분산의 발생률이 측정됩니다. 대변 ​​샘플을 수집하고 각 연구 대상의 미생물군집 구성을 분석합니다. 분변미생물의 다양성은 미생물 중 유전정보가 잘 보존된 영역인 16S 리보솜 RNA의 시퀀싱 데이터로부터 측정될 것이다. 결장 점막 샘플은 일상적인 내시경 감시가 계획될 때 수집됩니다. 샘플은 분석을 위해 질병 및 정상 점막 모두에서 수집됩니다. 미생물 다양성은 샘플의 16S RNA 시퀀싱 데이터에서 측정됩니다.

다중 오믹스 데이터는 통합 생물정보학 분석 플랫폼을 사용하여 포괄적인 임상 메타데이터로 분석됩니다. 임상 데이터에는 인구 통계, 질병 특성 및 환자가 보고한 다양한 결과 데이터(건강 관련 삶의 질, 불안, 우울증 등 포함)가 포함됩니다. 환자가 보고한 결과 데이터는 검증된 설문지를 사용하여 주기적으로 수집됩니다.

기본 분석의 데이터는 개인 간 차이, 질병 특성(예: 질병 표현형, 치료 유형 및 혈청학적 표지자) 간의 차이, 심리사회적 특성(예: 불안 또는 우울증의 존재 및 삶의 질) 등 또한 기본 분석 데이터는 한국인 IBD 환자에 대한 참고 자료로 사용되며 "다른 민족" 또는 "건강한" 한국인 인구에서 얻은 다른 데이터와 비교됩니다.

결론적으로, 이 장기간의 대규모 전향적 연구는 IBD의 기저에 있는 장내 미생물군집의 숨겨진 서명을 밝히고 IBD에서 잠재적인 생물학적 마커를 식별하기 위해 번역 의학 분야를 연구하기 위한 플랫폼을 제공할 것입니다.