PCOSの病因における腸内細菌叢の異常症の役割。
多嚢胞性卵巣症候群の病因における腸内微生物叢の異常症の役割。
調査の概要
詳細な説明
- データの品質保証: ① 患者が自己収集する唾液と便のサンプルを除き、すべての検査と測定は、標準操作手順 (SOP) に従って、病院または配列決定会社の担当者によって実行されます。 サンプル収集については、SOP のテキストによる説明とビデオによる説明を提供します。 サポートのために指定されたスタッフが割り当てられ、参加者がサンプル収集に関して質問がある場合は連絡を取ることができます。 ② 症例報告書(CRF)は現在の SOP に従って作成され、データ収集の一貫性を確保するための詳細な指示が提供されます。 同時に、各 CRF は検証とバックトラッキングのために少なくとも 5 年間適切に保管されます。 ③ すべての実験データはデータベースに記録され、既存のデータに基づく情報の正確性が保証されます。 ④各参加者の連絡先を控え、参加時の注意事項を周知し、定期的なフォローアップを行います。
- サンプル サイズの決定: 参加者の数は、文献の比較可能なサンプル サイズに基づいています。 この試験では、50 人の健康な個人 (対照群) と 150 人の PCOS (多嚢胞性卵巣症候群) 患者が参加します。 150 人の PCOS 患者は、3 つの介入グループにランダムに割り当てられます。 このサンプルサイズは、研究が完了する前の患者のドロップアウトと撤退によって引き起こされるデータの妥当な不足を説明しています. 参加サイクルは約 4 か月で、その後 2 年間のフォローアップが続きます。
メタゲノム配列決定技術 メタゲノム配列決定は、この研究で使用される主な技術です。 経済学としても知られるメタゲノミクスは、Handelman によって最初に提案され、微生物集団の分子構成、それらの相互作用、および遺伝子機能を研究します。
医学では、メタゲノミクスは、正常な状態と病気の状態でのヒト微生物群集の構造的および機能的変化を比較します。 健康な個人と病気の患者の微生物群集の多様性と機能の違いを分析できるため、微生物群集とそれぞれの代謝ネットワークの変化に病気がどのように関係しているかを判断できます。 したがって、メタゲノミクスは、疾患の予防、検出、および治療の理論的証拠を提供します。 現在、国際的に有名な Human Microbiome Project (HMP、http://www.hmpdacc.org/) およびヒト腸管のメタゲノミクス (MetaHIT) は、医療におけるメタゲノミクスの典型的なアプリケーションです。
【メタゲノム種、遺伝子、機能注釈】
① データの品質管理: シーケンスされた生データには、品質の低いデータが一定量含まれるため、品質管理を実行する必要があります。 サンプル中の微生物の実際の発生を正確に反映できるのは、高品質のデータのみです。
② メタゲノム組立:Clean Dataをもとに、まず個々のサンプルを別々に組立て、次に上記組立に関与しないリードを組み合わせて混合して組立てます。 これにより、各サンプル内の存在量の少ない種の配列決定の深さが増し、種ごとにより多くの配列決定情報が提供されます。
③ 遺伝子予測:MetaGeneMark は、単一サンプルおよび混合集合スカフティグに基づく遺伝子予測に使用されます。 すべての予測遺伝子の冗長性を減らして、Uniq 遺伝子セットを取得します。 次に、各サンプルのクリーン データが遺伝子セットと比較され、各サンプルの遺伝子セットの存在量が決定されます。
④種の注釈:Clean Dataは品質管理に使用されます。 これは、NCBI の細菌、古細菌、ウイルス、および真菌のリファレンス ゲノム データベースに従って注釈付きで比較されます。 異なる分類レベルのサンプルごとに、種存在量テーブルが取得されます。
⑤ 機能アノテーション:Uniq遺伝子セットとKEGGデータベースを基に、機能アノテーションと存在量統計を作成します。
研究の種類
入学 (予想される)
段階
- フェーズ 3
連絡先と場所
研究場所
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Beijing、中国
- 募集
- Peking Union Medical College Hospital
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コンタクト:
- Xu Zhang, Master
- メール:zhangxu_5050@163.com
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コンタクト:
- Rong Chen, Ph. D
- 電話番号:(86-10)-69155012
- メール:chenrongpumch@163.com
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
説明
包含基準:
2003 年ロッテルダムの古典的な PCOS 診断基準に準拠しています。
- まばらな排卵または無排卵;
- 高アンドロゲンおよび/または高アンドロゲン症の臨床症状;
卵巣の多嚢胞性変化: 超音波検査では、卵巣の片側または両側に直径 2 ~ 9 mm の卵胞が 12 個以上、および/または卵巣の体積が 10 ml 以上あることが示唆されます。
3 項目中 2 項目で、先天性副腎過形成、クッシング症候群、アンドロゲン分泌腫瘍など、他の高アンドロゲンの原因を除外します。
- 年齢:18~45歳。
除外基準:
- 妊娠;
- 閉経;
- 副腎の異常;
- 甲状腺機能障害;
- 過去3か月間抗生物質を服用している;
- 経口避妊薬を服用している;
- 消化管の基本的な疾患(潰瘍性大腸炎、クローン病、炎症性腸疾患など);
- 喫煙歴;
- BMI
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 主な目的:処理
- 割り当て:ランダム化
- 介入モデル:並列代入
- マスキング:独身
武器と介入
参加者グループ / アーム |
介入・治療 |
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介入なし:健康管理グループ
参加者は健康な女性であり、介入はありません。
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実験的:ライフスタイル介入グループ
参加者は PCOS 患者であり、ライフスタイルの介入のみが行われます。
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患者はプロバイオティクスパウダー(製品名:Tangwen Tai、Lactobacillus plantarum LP45 + Lactobacillus acidophilus La28 + Bifidobacterium lactobacillus BAL531)を 1 日 2 回、3 か月間服用する必要があります。
他の名前:
患者は、ドロスピレノン エチニル エストラジオール錠 (商品名: Yousi Yue) を 1 日 1 錠、3 か月間服用する必要があります。
他の名前:
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実験的:プロバイオティクス エージェント グループ
参加者は PCOS 患者であり、ライフスタイルの介入 + プロバイオティクス エージェントの介入が行われます。
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患者は、ドロスピレノン エチニル エストラジオール錠 (商品名: Yousi Yue) を 1 日 1 錠、3 か月間服用する必要があります。
他の名前:
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実験的:経口避妊薬グループ
参加者は PCOS 患者であり、生活習慣の介入 + 経口避妊薬の介入が行われます。
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患者はプロバイオティクスパウダー(製品名:Tangwen Tai、Lactobacillus plantarum LP45 + Lactobacillus acidophilus La28 + Bifidobacterium lactobacillus BAL531)を 1 日 2 回、3 か月間服用する必要があります。
他の名前:
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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遺伝子と種の多様性解析
時間枠:研究完了まで、平均12週間
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各サンプルの遺伝子と種の組成に基づいて、各グループの遺伝子と種の多様性の違いを識別するために、Chao1 とシャノンのインデックス、および観測された OTU (操作上の分類単位) が計算されます。
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研究完了まで、平均12週間
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PCOS患者と対照群の腸内細菌叢の違いの分析
時間枠:研究完了まで、平均12週間
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遺伝子間のSpearman相関係数を計算し、相関の強い遺伝子をCAGとして1つのクラスターにまとめます。
各サンプルのCAGの量が決定されます。さらに、コントロールおよびPCOSグループで大幅に濃縮された種がネットワーク表示のために列挙されます。
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研究完了まで、平均12週間
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対照群と比較したPCOS患者の腸内細菌叢の機能的差異の分析
時間枠:研究完了まで、平均12週間
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LEfSe 判別分析を使用して、グループ間の有意差をスクリーニングします。
次元削減は LDA によって実装され、関数の違いの影響を評価して LDA スコアを取得し、グループ間で有意に異なる関数を特定します。
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研究完了まで、平均12週間
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バイオマーカーと臨床指標の相関分析
時間枠:研究完了まで、平均12週間
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得られた有意差のある種、遺伝子、または機能について、それらと臨床指標との相関を計算し、有意かつ強い相関を持つ重要なバイオマーカーを特定します。
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研究完了まで、平均12週間
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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インスリン抵抗性
時間枠:研究完了まで、平均12週間
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耐糖能およびインスリン検査 (75gOGTT+インスリン) を使用して、患者にインスリン抵抗性があるかどうか、およびインスリン抵抗性のレベルを評価します。
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研究完了まで、平均12週間
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アンドロゲンレベル
時間枠:研究完了まで、平均12週間
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臨床検査項目の1つである6つの性ホルモン検査が行われ、被験者のアンドロゲンレベルが測定されます。
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研究完了まで、平均12週間
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協力者と研究者
捜査官
- スタディディレクター:Rong Chen, Ph. D.、Beijing Union Medical College Hospital
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Alvarez-Blasco F, Luque-Ramirez M, Escobar-Morreale HF. Diet composition and physical activity in overweight and obese premenopausal women with or without polycystic ovary syndrome. Gynecol Endocrinol. 2011 Dec;27(12):978-81. doi: 10.3109/09513590.2011.579658. Epub 2011 May 24.
- Tremellen K, Pearce K. Dysbiosis of Gut Microbiota (DOGMA)--a novel theory for the development of Polycystic Ovarian Syndrome. Med Hypotheses. 2012 Jul;79(1):104-12. doi: 10.1016/j.mehy.2012.04.016. Epub 2012 Apr 27.
- Liu R, Zhang C, Shi Y, Zhang F, Li L, Wang X, Ling Y, Fu H, Dong W, Shen J, Reeves A, Greenberg AS, Zhao L, Peng Y, Ding X. Dysbiosis of Gut Microbiota Associated with Clinical Parameters in Polycystic Ovary Syndrome. Front Microbiol. 2017 Feb 28;8:324. doi: 10.3389/fmicb.2017.00324. eCollection 2017.
- Guo Y, Qi Y, Yang X, Zhao L, Wen S, Liu Y, Tang L. Association between Polycystic Ovary Syndrome and Gut Microbiota. PLoS One. 2016 Apr 19;11(4):e0153196. doi: 10.1371/journal.pone.0153196. eCollection 2016.
- Torres PJ, Siakowska M, Banaszewska B, Pawelczyk L, Duleba AJ, Kelley ST, Thackray VG. Gut Microbial Diversity in Women With Polycystic Ovary Syndrome Correlates With Hyperandrogenism. J Clin Endocrinol Metab. 2018 Apr 1;103(4):1502-1511. doi: 10.1210/jc.2017-02153.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (予想される)
研究の完了 (予想される)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- JS-1691
- 81871141 (その他の助成金/資金番号:National Natural Science Foundation of China)
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
IPD プランの説明
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
米国で製造され、米国から輸出された製品。
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