肠道菌群失调在 PCOS 发病机制中的作用。

宏基因组测序技术 宏基因组测序是本研究采用的主要技术。 宏基因组学又称经济学，最早由汉德尔曼提出，研究微生物种群的分子组成、相互作用和基因功能。

在医学中，宏基因组学比较人类微生物群落在正常和疾病状态下的结构和功能变化。 它可以分析健康个体和疾病患者微生物群落的多样性和功能差异，从而确定疾病如何与微生物群落及其各自代谢网络的变化相关。 因此，宏基因组学为疾病的预防、检测和治疗提供了理论依据。 目前，国际知名的人类微生物组计划（HMP，http://www.hmpdacc.org/） 和人类肠道宏基因组学（MetaHIT）是宏基因组学在医学上的典型应用。

【宏基因组物种、基因及功能注释】

① 数据质量控制：测序后的原始数据会包含一定数量的低质量数据，因此必须进行质量控制。 只有高质量的数据才能正确反映样品中微生物的实际存在情况。

② 宏基因组组装：基于Clean Data，首先将单个样本单独组装，然后将未参与上述组装的reads合并混合组装。 这将增加每个样本中低丰度物种的测序深度，并为每个物种提供更多的测序信息。

③ 基因预测：MetaGeneMark将用于基于单一样本和混合组装scaftigs的基因预测。 将所有预测基因的冗余度降低，得到一个Uniq基因集。 然后，将每个样本的 Clean Data 与基因集进行比较，并确定每个样本的基因集丰度。

④ 物种注释：Clean Data 将用于质量控制。 它将与根据来自 NCBI 的细菌、古细菌、病毒和真菌的参考基因组数据库注释的结果进行比较。 将为每个样本在不同分类级别获得物种丰度表。

⑤功能注释：功能注释和丰度统计将基于Uniq基因集和KEGG数据库。