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Le rôle de la dysbiose du microbiote intestinal dans la pathogenèse du SOPK.

9 octobre 2019 mis à jour par: Peking Union Medical College Hospital

Le rôle de la dysbiose du microbiote intestinal dans la pathogenèse du syndrome des ovaires polykystiques.

Le syndrome des ovaires polykystiques (SOPK) a un impact significatif sur la santé des femmes, mais sa pathogenèse n'est pas encore claire. La dysbiose du microbiote intestinal peut jouer un rôle dans l'évolution pathologique du SOPK. La plupart des recherches actuelles se limitent encore à l'utilisation du séquençage des amplicons pour comparer les différences taxonomiques fondamentales du microbiote intestinal entre les patients atteints du SOPK et les témoins normaux. L'analyse globale des espèces, des gènes, de la fonction, du métabolisme et de l'immunité du microbiome dans le SOPK fait toujours défaut. Dans cette recherche, nous effectuerions un séquençage métagénomique pour trouver les caractéristiques du microbiote intestinal du SOPK et pour explorer leurs corrélations avec les symptômes métaboliques, immunitaires et cliniques. Enfin, différentes interventions (interventions sur le mode de vie, interventions sur le mode de vie + probiotique oral, interventions sur le mode de vie + contraceptifs oraux composés) seraient utilisées pour explorer le changement du microbiome intestinal chez les patients atteints du SOPK. Cette recherche aidera non seulement à comprendre la physiopathologie du SOPK, mais fournira également une référence pour la sélection des options de traitement clinique.

Aperçu de l'étude

Statut

Inconnue

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

  1. Assurance de la qualité des données : ① toutes les inspections et mesures seront effectuées par le personnel de l'hôpital ou de la société de séquençage conformément aux procédures opératoires standard (SOP), à l'exception des échantillons de salive et de selles, qui seront auto-prélevés par les patients. Pour la collecte d'échantillons, nous fournirons des descriptions textuelles des SOP ainsi que des instructions vidéo. Un personnel désigné sera affecté au soutien et pourra être contacté si les participants ont des questions concernant la collecte d'échantillons ; ② un formulaire de rapport de cas (CRF) sera préparé conformément aux POS en vigueur, et des instructions détaillées seront fournies pour assurer la cohérence de la collecte des données. Dans le même temps, chaque CRF sera correctement stocké au moins 5 ans pour vérification et retour en arrière ; ③ toutes les données expérimentales seront enregistrées dans la base de données pour garantir l'exactitude des informations basées sur les données existantes ; ④ nous conserverons les coordonnées de chaque participant, leur rappellerons les précautions lors de la participation et effectuerons des suivis réguliers.
  2. Détermination de la taille de l'échantillon : Le nombre de participants est basé sur des tailles d'échantillons comparables dans la littérature. Dans cet essai, il y aura 50 personnes en bonne santé (groupe témoin) et 150 patientes atteintes du SOPK (syndrome des ovaires polykystiques). Les 150 patients atteints du SOPK seront assignés au hasard à trois groupes d'intervention. Cette taille d'échantillon représente une insuffisance plausible de données causée par les abandons et les retraits de patients avant la fin de l'étude. Le cycle de participation est d'environ quatre mois, suivi d'un suivi de 2 ans.

  3. Technologie de séquençage métagénomique Le séquençage métagénomique est la principale technique utilisée dans cette étude. La métagénomique, également connue sous le nom d'économie, a été proposée pour la première fois par Handelman et étudie la composition moléculaire des populations microbiennes, leurs interactions et les fonctions des gènes.

    En médecine, la métagénomique compare les changements structurels et fonctionnels des communautés microbiennes humaines dans des états normaux et pathologiques. Il peut analyser la diversité et les différences fonctionnelles des communautés microbiennes d'individus sains et de patients atteints de maladies, déterminant ainsi comment les maladies sont liées aux changements dans les communautés microbiennes et dans leurs réseaux métaboliques respectifs. Par conséquent, la métagénomique fournit des preuves théoriques pour la prévention, la détection et le traitement des maladies. À l'heure actuelle, le Human Microbiome Project de renommée internationale (HMP, http://www.hmpdacc.org/) et la métagénomique du tractus intestinal humain (MetaHIT) sont des applications typiques de la métagénomique en médecine.

    [Espèce métagénomique, gènes et annotation fonctionnelle]

    ① Contrôle de la qualité des données : les données brutes séquencées contiendront une certaine quantité de données de faible qualité, un contrôle de la qualité doit donc être effectué. Seules des données de haute qualité peuvent refléter correctement la présence réelle de micro-organismes dans l'échantillon.

    ② Assemblage du métagénome : sur la base des données propres, les échantillons individuels seront d'abord assemblés séparément, puis les lectures qui ne participent pas à l'assemblage ci-dessus seront combinées et mélangées pour l'assemblage. Cela augmentera la profondeur de séquençage des espèces à faible abondance dans chaque échantillon et fournira plus d'informations de séquençage pour chaque espèce.

    ③ Prédiction des gènes : MetaGeneMark sera utilisé pour la prédiction des gènes sur la base d'échantillons uniques et de scaftigs assemblés de manière mixte. La redondance de tous les gènes prédits sera réduite pour obtenir un ensemble de gènes Uniq. Ensuite, les données propres de chaque échantillon seront comparées à l'ensemble de gènes et l'abondance de l'ensemble de gènes sera déterminée pour chaque échantillon.

    ④ Annotation des espèces : les données propres seront utilisées pour le contrôle de la qualité. Elle sera comparée à une base de données génomique annotée selon les références génomiques de bactéries, archées, virus et champignons du NCBI. Un tableau d'abondance des espèces sera obtenu pour chaque échantillon à différents niveaux de classification.

    ⑤ Annotation fonctionnelle : l'annotation fonctionnelle et les statistiques d'abondance seront basées sur l'ensemble de gènes Uniq et la base de données KEGG.

Type d'étude

Interventionnel

Inscription (Anticipé)

200

Phase

  • Phase 3

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans à 45 ans (Adulte)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Femelle

La description

Critère d'intégration:

  1. Conforme aux critères de diagnostic du SOPK classique de Rotterdam 2003.

    1. ovulation clairsemée ou anovulation;
    2. manifestations cliniques d'androgènes élevés et/ou d'hyperandrogénie ;

    3. modifications polykystiques ovariennes: l'échographie suggère un ou les deux côtés de l'ovaire avec un diamètre de follicules de 2 à 9 mm ≥ 12 et / ou un volume ovarien ≥ 10 ml;

      2 éléments sur 3, et exclure d'autres causes à fort taux d'androgènes, telles que l'hyperplasie congénitale des surrénales, le syndrome de Cushing et les tumeurs sécrétant des androgènes ;

  2. Âge : 18-45 ans.

Critère d'exclusion:

  1. grossesse;
  2. ménopause;
  3. anomalies surrénaliennes;
  4. dysfonctionnement thyroïdien;
  5. prendre des antibiotiques au cours des 3 derniers mois;
  6. prend un traitement contraceptif oral;
  7. maladies de base du tractus gastro-intestinal (colite ulcéreuse, maladie de Crohn, maladie inflammatoire de l'intestin, etc.);
  8. antécédents de tabagisme;
  9. IMC

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Objectif principal: Traitement
  • Répartition: Randomisé
  • Modèle interventionnel: Affectation parallèle
  • Masquage: Seul

Armes et Interventions

Groupe de participants / Bras
Intervention / Traitement
Aucune intervention: Groupe de contrôle sanitaire
Les participants sont des femmes en bonne santé et il n'y a pas d'interventions.
Expérimental: Groupe d'interventions sur le mode de vie
Les participants sont des patients atteints du SOPK et ne recevront que des interventions sur le mode de vie.
Médicament: Agent probiotique
Les patients doivent prendre une poudre probiotique (nom du produit : Tangwen Tai, lactobacillus plantarum LP45 + Lactobacillus acidophilus La28 + Bifidobacterium lactobacillus BAL531) deux fois par jour pendant trois mois.
Autres noms:
  • Tangwen Taï
Médicament: Contraceptif oral
Le patient doit prendre des comprimés de drospirénone éthinylestradiol (nom commercial : Yousi Yue) 1 comprimé par jour pendant 3 mois.
Autres noms:
  • Comprimés de drospirénone et d'éthinylestradiol
  • Yousi Yue
Expérimental: Groupe d'agents probiotiques
Les participants sont des patients atteints du SOPK et recevront des interventions sur le mode de vie + des interventions sur les agents probiotiques.
Médicament: Contraceptif oral
Le patient doit prendre des comprimés de drospirénone éthinylestradiol (nom commercial : Yousi Yue) 1 comprimé par jour pendant 3 mois.
Autres noms:
  • Comprimés de drospirénone et d'éthinylestradiol
  • Yousi Yue
Comportemental: Intervention sur le mode de vie
  1. Équilibrez le régime alimentaire;
  2. Limitez la consommation d'aliments riches en calories et en matières grasses, réduisez les sorties au restaurant et établissez des habitudes alimentaires régulières ;
  3. Surveillez votre poids corporel, évitez la sédentarité, obtenez plus de soleil et des activités régulières ;
  4. Réglementation de la santé mentale.
Expérimental: Groupe contraceptif oral
Les participants sont des patients atteints du SOPK et recevront une intervention sur le mode de vie + des interventions sur la contraception orale.
Médicament: Agent probiotique
Les patients doivent prendre une poudre probiotique (nom du produit : Tangwen Tai, lactobacillus plantarum LP45 + Lactobacillus acidophilus La28 + Bifidobacterium lactobacillus BAL531) deux fois par jour pendant trois mois.
Autres noms:
  • Tangwen Taï
Comportemental: Intervention sur le mode de vie
  1. Équilibrez le régime alimentaire;
  2. Limitez la consommation d'aliments riches en calories et en matières grasses, réduisez les sorties au restaurant et établissez des habitudes alimentaires régulières ;
  3. Surveillez votre poids corporel, évitez la sédentarité, obtenez plus de soleil et des activités régulières ;
  4. Réglementation de la santé mentale.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Analyse de la diversité des gènes et des espèces
Délai: Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 semaines
Sur la base de la composition génétique et spécifique de chaque échantillon, les indices Chao1 et Shannon, ainsi que les OTU (unités taxonomiques opérationnelles) observées, seront calculés afin d'identifier les différences de diversité génétique et spécifique pour chaque groupe.
Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 semaines
Analyse des différences de microbiote intestinal entre les patients SOPK et le groupe contrôle
Délai: Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 semaines
Le coefficient de corrélation de Spearman entre les gènes sera calculé et les gènes présentant une forte corrélation seront regroupés en un seul groupe, en tant que CAG. L'abondance des CAG dans chaque échantillon sera déterminée. De plus, les espèces considérablement enrichies dans les groupes de contrôle et de SOPK seront énumérées pour l'affichage du réseau.
Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 semaines
Analyse des différences fonctionnelles du microbiote intestinal des patients SOPK par rapport au groupe témoin
Délai: Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 semaines
L'analyse discriminante LEfSe sera utilisée pour dépister les différences significatives entre les groupes. La réduction de la dimensionnalité sera mise en œuvre par LDA, et l'impact de la différence de fonction sera évalué pour obtenir le score LDA et identifier des fonctions significativement différentes entre les groupes.
Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 semaines
Analyse de corrélation entre biomarqueurs et indicateurs cliniques
Délai: Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 semaines
Pour les espèces, les gènes ou les fonctions obtenus avec une différence significative, la corrélation entre eux et les indicateurs cliniques sera calculée, et des biomarqueurs clés avec une corrélation significative et forte seront identifiés.
Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 semaines

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Résistance à l'insuline
Délai: Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 semaines
Utilisez la tolérance au glucose et le test d'insuline (75gOGTT + insuline) pour évaluer si le patient a une résistance à l'insuline, ainsi que le niveau de résistance à l'insuline.
Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 semaines
Niveau d'androgènes
Délai: Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 semaines
Des tests à six hormones sexuelles, l'un des éléments de l'examen clinique, seront effectués pour mesurer les niveaux d'androgènes chez les sujets.
Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 semaines

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Peking Union Medical College Hospital

Collaborateurs

Peking Union Medical College

Les enquêteurs

  • Directeur d'études: Rong Chen, Ph. D., Beijing Union Medical College Hospital

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

21 février 2019

Achèvement primaire (Anticipé)

30 juin 2020

Achèvement de l'étude (Anticipé)

31 décembre 2020

Dates d'inscription aux études

Première soumission

11 février 2019

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

13 février 2019

Première publication (Réel)

18 février 2019

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

10 octobre 2019

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

9 octobre 2019

Dernière vérification

1 octobre 2019

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • JS-1691
  • 81871141 (Autre subvention/numéro de financement: National Natural Science Foundation of China)

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

Non

Description du régime IPD

Selon les lois et réglementations nationales, les ressources génétiques humaines ne peuvent pas être fournies à l'étranger.

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

produit fabriqué et exporté des États-Unis.

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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