重度の外傷性脳損傷後の口腔咽頭および直腸微生物叢の進化 (BBAX)
脳から虫へ：ICUに入院した重度の外傷性脳損傷患者の口腔咽頭および直腸微生物叢の進化
人間の腸内微生物叢の変化は、肥満、炎症性腸疾患、神経変性疾患などのさまざまな病的状態に関連しています。 最近、脳と腸の間の双方向通信軸である「脳腸軸」が記述されています。 最近の動物研究では、急性脳損傷は腸内微生物叢の急速な変化と関連していました。
人間では、外傷性脳損傷 (TBI) は、死亡および身体障害の主な原因です。 TBI 後の腸および口腔咽頭微生物叢のパターンは不明です。 この研究の主な目的は、重度のTBI患者の腸および口腔咽頭の微生物叢を特徴付けることです。
調査の概要
詳細な説明
研究プロトコル:
観察的前向きコホート研究。
忍耐
重度の外傷のためにICUに入院した患者が含まれます。 重度の外傷患者の 2 つのグループが研究されます。
- -孤立した重度の外傷性脳損傷（TBI）の患者：最初のグラスゴー昏睡スケール（GCS）≤8およびAISextraheadスコア≤3のTBI
- TBI のない重度の外傷患者 (AISextrahead スコア > 3)
健康な個人のグループは、対照集団として機能します。
各グループに合計 20 人の患者が登録され、10 人の健康なコントロールが予想されます。
患者データ収集
各患者について、次のデータが収集されます。
- 人口統計データ: 年齢、性別、身長、体重、ICU 入院日、簡易急性生理学スコア II (SAPS II)、傷害重症度スコア (ISS)、ICU 入院時の簡易傷害尺度 (AIS)。
- 外傷関連データ: 外傷関連臓器損傷の数と種類、初期 GCS、初期管理時の散瞳の存在。
- 微生物叢に影響を与える可能性のある要因: 抗菌療法、栄養の種類、投薬 (プロトンポンプ阻害剤、オピオイド、鎮静剤、カテコールアミン、ステロイド)、ICU 滞在中の外科手術。
- 進化：ICU滞在中の多剤耐性菌獲得、ICU獲得感染。 人工呼吸期間、腎外液出液、ICU 滞在期間、ICU 退院時および外傷後 90 日での障害評価尺度 (DRS-F) によって評価された神経学的転帰、ICU 退院時および 90 日での死亡。
サンプルコレクション
口咽頭および直腸スワブは、ICU 入院後最初の 24 時間以内 (0 日目)、ICU 入院後 48 時間 (2 日目) および 7 日目 (7 日目) に各患者に対して実施され、その後は ICU 退院まで毎週行われます。 直腸および口腔咽頭スワブは、輸送培地ESwab（Becton、Dickinson and Company、ニュージャージー、米国）を含む滅菌スワブを使用して、訓練を受けた医療補助スタッフによって実行されます。 スワブは DNA 抽出まで -80 ° C で保存されます。
DNA抽出
DNA抽出は、直腸スワブにはQIAamp PowerFecal Pro DNA®キット（Qiagen®、コートタブフ、フランス）を使用し、口咽頭スワブにはExtracta DNA Prep®キット（Quanta Biosciences®、ビバリー、米国）を使用して実行されます。 DNAは、Quantit® dsDNA HighSensitivity Assay Kit (Fisher Scientific)によって定量化されます。
16S rRNA の増幅と配列決定
細菌の 16S rRNA 遺伝子配列の V3 および V4 領域は、イルミナ MiSeq® システム プロトコル (イルミナ®) に従って、ユニバーサル プライマー (TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG および GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC) を用いたポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) によって増幅されます。 アンプリコンは精製され、MiSeq® シーケンス システム ((Illumina®)) を使用してシーケンスされます。
シーケンス処理
パスツール研究所が提供する R® ソフトウェア (パッケージ DESeq2) に基づく SHAMAN ソフトウェア (メタゲノム解析のための SHiny アプリケーション) を使用して、配列処理と運用分類単位 (OTU) クラスタリングを実行します。 分類学的分類は、SILVA データベース参照を使用して実行されます。
統計分析
統計分析は、SHAMAN ソフトウェア (メタゲノム解析のための SHiny アプリケーション) を使用して実行されます。 細菌の門、科、および属の再分配が分析され、異なる集団間で細菌の属の相対的存在量が比較されます。 アルファ多様性は、さまざまなパラメーター (シャノン指数、シンプソン多様性指数) およびベータ多様性 (主成分分析) を使用して分析されます。
患者と健康なボランティアのさまざまな集団が比較され、経時的な微生物叢の進化が研究されます。
研究の種類
入学 (実際)
連絡先と場所
研究場所
-
-
-
Le Kremlin-Bicetre、フランス、94270
- APHP Bicêtre Hospital
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 重度の外傷のためのビセートル病院外傷センターへの入院:
孤立した重度の外傷性脳損傷（TBI）：最初のグラスゴー昏睡スケール（GCS）≤8およびAISextraheadスコア≤3のTBI。 TBI を伴わない重度の外傷 (AISextrahead スコア > 3)
- 推定 ICU 滞在時間 48 時間以上
除外基準:
- -過去3か月以内の抗菌療法
- コルチコステロイドの長期使用
- 活動中のがん
- 施設に収容された患者
- 外傷後の消化管穿孔または緊急消化管手術
- 同意の撤回
- 後見人
- 妊娠中または授乳中の女性
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 観測モデル：ケースコントロール
- 時間の展望：見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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-孤立した重度の外傷性脳損傷（TBI）の患者
-最初のグラスゴー昏睡スケール（GCS）≤8およびAISextraheadスコア≤3のTBI。
口咽頭および直腸スワブは、ICU 入院後最初の 24 時間以内 (0 日目)、ICU 入院後 48 時間 (2 日目) および 7 日目 (7 日目) に各患者に対して実施され、その後は ICU 退院まで毎週行われます。
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輸送培地ESwab®（Becton、Dickinson and Company、ニュージャージー州、米国）を含む滅菌スワブを使用して、訓練を受けた救急医療スタッフによって実行されます。
スワブは DNA 抽出まで -80 ° C で保存されます。
輸送培地ESwab®（Becton、Dickinson and Company、ニュージャージー州、米国）を含む滅菌スワブを使用して、訓練を受けた救急医療スタッフによって実行されます。
スワブは DNA 抽出まで -80 ° C で保存されます。
90 日目 +/- 7 日で評価されます。
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TBIのない重度の外傷患者
TBIのない重度の外傷のある患者（AISextraheadスコア> 3）。
口咽頭および直腸スワブは、ICU 入院後最初の 24 時間以内 (0 日目)、ICU 入院後 48 時間 (2 日目) および 7 日目 (7 日目) に各患者に対して実施され、その後は ICU 退院まで毎週行われます。
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輸送培地ESwab®（Becton、Dickinson and Company、ニュージャージー州、米国）を含む滅菌スワブを使用して、訓練を受けた救急医療スタッフによって実行されます。
スワブは DNA 抽出まで -80 ° C で保存されます。
輸送培地ESwab®（Becton、Dickinson and Company、ニュージャージー州、米国）を含む滅菌スワブを使用して、訓練を受けた救急医療スタッフによって実行されます。
スワブは DNA 抽出まで -80 ° C で保存されます。
90 日目 +/- 7 日で評価されます。
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健康管理
資格要件で指定されているように、調査中の状態、またはその他の関連する状態または症状を持っていない人。 口腔咽頭および直腸スワブは、組み入れ時に一度だけ採取され、その後、試験への対照個人の参加が完了する。 |
輸送培地ESwab®（Becton、Dickinson and Company、ニュージャージー州、米国）を含む滅菌スワブを使用して、訓練を受けた救急医療スタッフによって実行されます。
スワブは DNA 抽出まで -80 ° C で保存されます。
輸送培地ESwab®（Becton、Dickinson and Company、ニュージャージー州、米国）を含む滅菌スワブを使用して、訓練を受けた救急医療スタッフによって実行されます。
スワブは DNA 抽出まで -80 ° C で保存されます。
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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シャノン指数で測定した微生物叢のアルファ多様性の変化
時間枠：0 日目から 90 日目まで
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ICU 入院後 0 日目、2 日目、7 日目、その後 ICU 退院時まで、または 90 日目までに毎週実施される口腔咽頭および直腸スワブは、DNA 抽出および細菌 16S rRNA の増幅と同定のために使用されます。腸内に定着している細菌種。
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0 日目から 90 日目まで
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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外傷後のさまざまな時期における口腔咽頭および直腸微生物叢のアルファおよびベータ多様性。
時間枠：0 日目から 90 日目まで
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ICU 入院後 0 日目、2 日目、7 日目、その後 ICU 退院時まで、または 90 日目までに毎週実施される口腔咽頭および直腸スワブは、DNA 抽出および細菌の 16S rRNA 増幅および同定のために使用されます。細菌種。
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0 日目から 90 日目まで
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ICU 感染症
時間枠：0 日目から 90 日目まで
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ICU滞在中のICU取得感染率
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0 日目から 90 日目まで
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ICU滞在中に多剤耐性菌の定着・感染を獲得した患者数
時間枠：0 日目から 90 日目まで
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ICU滞在中に獲得した多剤耐性菌の定着または感染
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0 日目から 90 日目まで
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ICU 退院時に死亡し、外傷後 90 日。
時間枠：0 日目から 90 日目まで
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ICU 退院時および外傷後 90 日での死亡率
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0 日目から 90 日目まで
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外傷後 90 日目の障害評価尺度 (DRS-F) スコア
時間枠：0 日目から 90 日目まで
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Disability Rating Scale、0 (障害なし) から 29 (極度の植物状態) までのフランス語訳 (DRS-F) によって評価された外傷後 90 日の神経学的転帰
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0 日目から 90 日目まで
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者：Samy Figueiredo, MD, PhD、Assistance Publique - Hôpitaux de Paris
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (実際)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。