Questa pagina è stata tradotta automaticamente e l'accuratezza della traduzione non è garantita. Si prega di fare riferimento al Versione inglese per un testo di partenza.

Evoluzione del microbiota orofaringeo e rettale dopo grave lesione cerebrale traumatica (BBAX)

29 maggio 2024 aggiornato da: Assistance Publique - Hôpitaux de Paris

Dal cervello agli insetti: evoluzione del microbiota orofaringeo e rettale dei pazienti con trauma cranico grave ricoverati in terapia intensiva

Le modifiche del microbiota intestinale umano sono state associate a diverse condizioni patologiche come obesità, malattie infiammatorie intestinali e malattie neurodegenerative. Recentemente è stato descritto il "Brain-Gut Axis", un asse di comunicazione bidirezionale tra cervello e intestino. In recenti studi sugli animali, una lesione cerebrale acuta è stata associata a rapide modificazioni del microbiota intestinale.

Negli esseri umani, la lesione cerebrale traumatica (TBI) è una delle principali cause di morte e disabilità. I modelli del microbiota intestinale e orofaringeo dopo il trauma cranico sono sconosciuti. Lo scopo principale di questo studio è caratterizzare il microbiota intestinale e orofaringeo di pazienti con trauma cranico grave.

Panoramica dello studio

Stato

Attivo, non reclutante

Condizioni

Intervento / Trattamento

Descrizione dettagliata

Protocollo di studio:

Studio osservazionale prospettico di coorte.

Pazienti

Saranno inclusi i pazienti ricoverati in terapia intensiva per trauma grave. Saranno studiati due gruppi di pazienti con trauma grave:

  1. Pazienti con trauma cranico grave isolato (TBI): TBI con Glasgow Coma Scale (GCS) iniziale ≤ 8 e punteggio AISextrahead ≤3
  2. Pazienti con trauma grave senza trauma cranico (punteggio AISextrahead > 3)

Un gruppo di individui sani fungerà da popolazione di controllo.

Iscrizione totale prevista 20 pazienti in ciascun gruppo e 10 controlli sani.

Raccolta dati paziente

Per ogni paziente verranno raccolti i seguenti dati:

  • Dati demografici: età, sesso, altezza, peso, data di ricovero in terapia intensiva, punteggio di fisiologia acuta semplificato II (SAPS II), punteggio di gravità della lesione (ISS), scala di lesione abbreviata (AIS) al momento del ricovero in terapia intensiva.
  • Dati relativi al trauma: numero e tipo di lesioni d'organo correlate al trauma, GCS iniziale, presenza di midriasi alla gestione iniziale.
  • Fattori con potenziale impatto sul microbiota: terapia antimicrobica, tipo di nutrizione, farmaci (inibitori della pompa protonica, oppioidi, sedativi, catecolamine, steroidi), procedura chirurgica durante la degenza in terapia intensiva.
  • Evoluzione: acquisizione di batteri multiresistenti durante la degenza in terapia intensiva, infezioni acquisite in terapia intensiva. Durata della ventilazione meccanica, epurazione extrarenale, durata della degenza in terapia intensiva, esito neurologico valutato mediante scala di valutazione della disabilità (DRS-F) alla dimissione dall'ICU ea 90 giorni dal trauma, decesso alla dimissione dall'ICU ea 90 giorni.

Raccolta campioni

I tamponi orofaringei e rettali verranno eseguiti per ciascun paziente entro le prime 24 ore dopo il ricovero in terapia intensiva (giorno 0), quindi 48 ore (giorno 2) e 7 giorni (giorno 7) dopo il ricovero in terapia intensiva e successivamente settimanalmente fino alla dimissione dall'ICU. I tamponi rettali e orofaringei saranno eseguiti da personale paramedico addestrato utilizzando tamponi sterili con mezzo di trasporto ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA). I tamponi saranno conservati a -80°C fino all'estrazione del DNA.

Estrazione del DNA

L'estrazione del DNA verrà eseguita utilizzando il kit QIAamp PowerFecal Pro DNA® (Qiagen®, Courtaboeuf, Francia) per i tamponi rettali e il kit Extracta DNA Prep® (Quanta Biosciences®, Beverly, USA) per i tamponi orofaringei. Il DNA sarà quantificato mediante Quantit® dsDNA HighSensitivity Assay Kit (Fisher Scientific).

Amplificazione e sequenziamento dell'rRNA 16S

Le regioni V3 e V4 delle sequenze del gene 16S rRNA batterico saranno amplificate mediante reazione a catena della polimerasi (PCR) con primer universali (TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG e GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC), seguendo il protocollo Illumina MiSeq® System (Illumina®). Gli ampliconi saranno purificati e quindi sequenziati utilizzando il sistema di sequenziamento MiSeq® ((Illumina®).

Elaborazione di sequenze

L'elaborazione delle sequenze e il clustering delle unità tassonomiche operative (OTU) saranno eseguiti utilizzando il software SHAMAN (SHiny Application for Metagenomic ANalysis) basato sul software R® (pacchetto DESeq2), fornito dall'Istituto Pasteur. La classificazione tassonomica sarà eseguita utilizzando il riferimento del database SILVA.

analisi statistica

L'analisi statistica sarà eseguita utilizzando il software SHAMAN (SHiny Application for Metagenomic ANalysis). Verranno analizzati i phyla batterici, le famiglie e la ripartizione dei generi e verrà confrontata l'abbondanza relativa dei generi batterici tra le diverse popolazioni. La diversità alfa sarà analizzata utilizzando diversi parametri (indice di Shannon, indice di diversità di Simpson) e la diversità beta (analisi delle componenti principali).

Verranno confrontate le diverse popolazioni di pazienti e volontari sani e verrà studiata l'evoluzione del microbiota nel tempo.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Effettivo)

58

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

  • Francia
      • Le Kremlin-Bicetre, Francia, 94270
        • APHP Bicêtre Hospital

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

14 anni e precedenti (Adulto, Adulto più anziano)

Accetta volontari sani

Sì

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Pazienti di età pari o superiore a 18 anni, ricoverati in unità di terapia intensiva per traumi gravi.

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • Ricovero al centro traumatologico dell'ospedale Bicêtre per trauma grave con:

lesione cerebrale traumatica grave isolata (TBI): TBI con Glasgow Coma Scale (GCS) iniziale ≤ 8 e punteggio AISextrahead ≤3; trauma grave senza trauma cranico (punteggio AISextrahead > 3)

  • Durata stimata della degenza in terapia intensiva 48 ore o più

Criteri di esclusione:

  • Terapia antimicrobica nei 3 mesi precedenti
  • Uso di corticosteroidi a lungo termine
  • Cancro attivo
  • Paziente istituzionalizzato
  • Perforazione gastrointestinale o chirurgia gastrointestinale d'urgenza a seguito di trauma
  • Revoca del consenso
  • Paziente sotto tutela
  • Donne incinte o che allattano

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Modelli osservazionali: Caso di controllo
  • Prospettive temporali: Prospettiva

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Pazienti con trauma cranico grave isolato (TBI)
TBI con Glasgow Coma Scale (GCS) iniziale ≤ 8 e punteggio AISextrahead ≤3. I tamponi orofaringei e rettali verranno eseguiti per ciascun paziente entro le prime 24 ore dopo il ricovero in terapia intensiva (giorno 0), quindi 48 ore (giorno 2) e 7 giorni (giorno 7) dopo il ricovero in terapia intensiva e successivamente settimanalmente fino alla dimissione dall'ICU.
Procedura: Tampone orofaringeo
Verrà eseguito da personale paramedico addestrato utilizzando tamponi sterili con mezzo di trasporto ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA). I tamponi saranno conservati a -80°C fino all'estrazione del DNA.
Procedura: Tampone rettale
Verrà eseguito da personale paramedico addestrato utilizzando tamponi sterili con mezzo di trasporto ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA). I tamponi saranno conservati a -80°C fino all'estrazione del DNA.
Procedura: Scala di valutazione della disabilità (DRS-F)
Verrà valutato al giorno 90 +/- 7 giorni.
Pazienti con trauma grave senza trauma cranico
Pazienti con trauma grave senza trauma cranico (punteggio AISextrahead > 3). I tamponi orofaringei e rettali verranno eseguiti per ciascun paziente entro le prime 24 ore dopo il ricovero in terapia intensiva (giorno 0), quindi 48 ore (giorno 2) e 7 giorni (giorno 7) dopo il ricovero in terapia intensiva e successivamente settimanalmente fino alla dimissione dall'ICU.
Procedura: Tampone orofaringeo
Verrà eseguito da personale paramedico addestrato utilizzando tamponi sterili con mezzo di trasporto ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA). I tamponi saranno conservati a -80°C fino all'estrazione del DNA.
Procedura: Tampone rettale
Verrà eseguito da personale paramedico addestrato utilizzando tamponi sterili con mezzo di trasporto ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA). I tamponi saranno conservati a -80°C fino all'estrazione del DNA.
Procedura: Scala di valutazione della disabilità (DRS-F)
Verrà valutato al giorno 90 +/- 7 giorni.
Controlli sani

Persone che non hanno avuto le condizioni oggetto di studio o condizioni o sintomi altrimenti correlati, come specificato nei requisiti di ammissibilità.

I tamponi orofaringei e rettali verranno prelevati una sola volta, al momento dell'inclusione, dopodiché sarà completata la partecipazione del soggetto di controllo alla sperimentazione.
Procedura: Tampone orofaringeo
Verrà eseguito da personale paramedico addestrato utilizzando tamponi sterili con mezzo di trasporto ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA). I tamponi saranno conservati a -80°C fino all'estrazione del DNA.
Procedura: Tampone rettale
Verrà eseguito da personale paramedico addestrato utilizzando tamponi sterili con mezzo di trasporto ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA). I tamponi saranno conservati a -80°C fino all'estrazione del DNA.

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Variazione della diversità alfa del microbiota misurata dall'indice di Shannon
Lasso di tempo: Dal giorno 0 al giorno 90
I tamponi orofaringei e rettali, eseguiti al giorno 0, giorno 2, giorno 7 dopo il ricovero in terapia intensiva e successivamente settimanalmente fino alla dimissione dalla terapia intensiva o non oltre il giorno 90, saranno utilizzati per l'estrazione del DNA e l'amplificazione e il sequenziamento del 16S rRNA batterico al fine di identificare le specie batteriche che colonizzano l'intestino.
Dal giorno 0 al giorno 90

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Diversità alfa e beta del microbiota orofaringeo e rettale in tempi diversi dopo il trauma.
Lasso di tempo: Dal giorno 0 al giorno 90
I tamponi orofaringei e rettali, eseguiti al giorno 0, giorno 2, giorno 7 dopo il ricovero in terapia intensiva e successivamente settimanalmente fino alla dimissione dalla terapia intensiva o non oltre il giorno 90, saranno utilizzati per l'estrazione del DNA e l'amplificazione e il sequenziamento del 16S rRNA batterico al fine di identificare le specie batteriche.
Dal giorno 0 al giorno 90
Infezioni acquisite in terapia intensiva
Lasso di tempo: Dal giorno 0 al giorno 90
I tassi di infezione acquisita in terapia intensiva durante la degenza in terapia intensiva
Dal giorno 0 al giorno 90
Numero di pazienti che hanno acquisito colonizzazione o infezione da batteri multiresistenti durante la degenza in terapia intensiva
Lasso di tempo: Dal giorno 0 al giorno 90
Colonizzazione o infezione batterica multiresistente acquisita durante la degenza in terapia intensiva
Dal giorno 0 al giorno 90
Morte alla dimissione dall'ICU e 90 giorni dopo il trauma.
Lasso di tempo: Dal giorno 0 al giorno 90
I tassi di decessi alla dimissione dall'ICU e 90 giorni dopo il trauma
Dal giorno 0 al giorno 90
Punteggio Disability Rating Scale (DRS-F) a 90 giorni dopo il trauma
Lasso di tempo: Dal giorno 0 al giorno 90
Esito neurologico a 90 giorni post trauma valutato dalla Disability Rating Scale, la traduzione francese (DRS-F) citata da 0 (nessuna disabilità) a 29 (stato vegetativo estremo)
Dal giorno 0 al giorno 90

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

Assistance Publique - Hôpitaux de Paris

Collaboratori

Université Paris-Saclay

Investigatori

  • Investigatore principale: Samy Figueiredo, MD, PhD, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

21 aprile 2019

Completamento primario (Effettivo)

2 gennaio 2023

Completamento dello studio (Stimato)

1 dicembre 2024

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

24 maggio 2019

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

24 maggio 2019

Primo Inserito (Effettivo)

29 maggio 2019

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

30 maggio 2024

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

29 maggio 2024

Ultimo verificato

1 maggio 2024

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Parole chiave

Termini MeSH pertinenti aggiuntivi

Altri numeri di identificazione dello studio

  • APHP180537
  • 2018-A02973-52 (Altro identificatore: IDRCB)

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

INDECISO

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

Prove cliniche su Trauma cranico

Prove cliniche su Tampone orofaringeo

Cerca prove simili

Sponsor e collaboratori

Condizioni mediche

Interventi farmacologici

CROs by country

CROs in Taiwan

Condizioni

Malattie rare

Interventi farmacologici

Supplementi dietetici

Sponsor / Collaboratori

Sedi

Sottoscrivi