Evoluce orofaryngeální a rektální mikrobioty po těžkém traumatickém poranění mozku (BBAX)
Od mozku k broukům: Evoluce orofaryngeální a rektální mikrobioty pacientů s těžkým traumatickým poraněním mozku přijatým na JIP
Modifikace lidské střevní mikroflóry byly spojeny s různými patologickými stavy, jako je obezita, zánětlivá onemocnění střev a neurodegenerativní onemocnění. Nedávno byla popsána „osa mozek-gut“, obousměrná komunikační osa mezi mozkem a střevem. V nedávných studiích na zvířatech bylo akutní poranění mozku spojeno s rychlými změnami střevní mikroflóry.
U lidí je traumatické poranění mozku (TBI) hlavní příčinou smrti a invalidity. Vzorce střevní a orofaryngeální mikroflóry po TBI nejsou známy. Primárním účelem této studie je charakterizovat střevní a orofaryngeální mikrobiotu pacientů s těžkou TBI.
Přehled studie
Postavení
Detailní popis
Protokol studie:
Observační prospektivní kohortová studie.
Pacienti
Budou zahrnuti pacienti přijatí na JIP pro těžké trauma. Budou studovány dvě skupiny pacientů s těžkým traumatem:
- Pacienti s izolovaným těžkým traumatickým poraněním mozku (TBI): TBI s počáteční Glasgow Coma Scale (GCS) ≤ 8 a AISextrahead skóre ≤3
- Pacienti s těžkým traumatem bez TBI (AISextrahead skóre > 3)
Skupina zdravých jedinců bude sloužit jako kontrolní populace.
Očekávaný celkový počet 20 pacientů v každé skupině a 10 zdravých kontrol.
Sběr dat pacientů
Pro každého pacienta budou shromážděny následující údaje:
- Demografické údaje: věk, pohlaví, výška, hmotnost, datum přijetí na JIP, zjednodušené skóre akutní fyziologie II (SAPS II), skóre závažnosti poranění (ISS), zkrácená stupnice poranění (AIS) při příjmu na JIP.
- Údaje související s traumatem: počet a typ poranění orgánů souvisejících s traumatem, počáteční GCS, přítomnost mydriázy při počáteční léčbě.
- Faktory s potenciálním vlivem na mikroflóru: antimikrobiální léčba, typ výživy, medikace (inhibitory protonové pumpy, opioidy, sedace, katecholaminy, steroidy), chirurgický výkon během pobytu na JIP.
- Evoluce: získání multirezistentních bakterií během pobytu na JIP, získané infekce na JIP. Doba trvání mechanické ventilace, extrarenální epurace, délka pobytu na JIP, neurologický výsledek hodnocený stupnicí hodnocení invalidity (DRS-F) při propuštění z JIP a 90 dnů po traumatu, úmrtí při propuštění z JIP a 90 dnů.
Kolekce vzorků
Orofaryngeální a rektální výtěry budou prováděny u každého pacienta během prvních 24 hodin po přijetí na JIP (den 0), poté 48 hodin (den 2) a 7 dnů (den 7) po přijetí na JIP a poté každý týden až do propuštění z JIP. Rektální a orofaryngeální výtěry provede vyškolený nelékařský personál pomocí sterilních výtěrů s transportním médiem ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA). Výtěry budou skladovány při -80 °C až do extrakce DNA.
Extrakce DNA
Extrakce DNA bude provedena pomocí soupravy QIAamp PowerFecal Pro DNA® (Qiagen®, Courtaboeuf, Francie) pro rektální výtěry a soupravy Extracta DNA Prep® (Quanta Biosciences®, Beverly, USA) pro orofaryngeální výtěry. DNA bude kvantifikována pomocí sady Quantit® dsDNA HighSensitivity Assay Kit (Fisher Scientific).
Amplifikace a sekvenování 16S rRNA
Oblasti V3 a V4 sekvencí bakteriálního genu 16S rRNA budou amplifikovány pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR) s univerzálními primery (TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG a GTCTCGTGGGCTCGGAGATG®TATAAGAGACGTA1Systém podle protokolu ICCTAqlumina® podle protokolu ICCGTAqlumina® Amplikony budou purifikovány a poté sekvenovány pomocí sekvenačního systému MiSeq® ((Illumina®).
Zpracování sekvencí
Zpracování sekvencí a shlukování provozních taxonomických jednotek (OTU) bude provedeno pomocí softwaru SHAMAN (SHiny Application for Metagenomic ANalysis) založeného na softwaru R® (balík DESeq2), který poskytuje Pasteur Institute. Taxonomická klasifikace bude provedena pomocí referenční databáze SILVA.
Statistická analýza
Statistická analýza bude provedena pomocí softwaru SHAMAN (SHiny Application for Metagenomic ANalysis). Bude analyzována repartice bakteriálních kmenů, rodin a rodů a bude porovnána relativní četnost bakteriálních rodů mezi různými populacemi. Alfa-diverzita bude analyzována pomocí různých parametrů (Shannonův index, Simpsonův index diverzity), stejně jako beta-diverzita (analýza hlavních složek).
Budou porovnány různé populace pacientů a zdravých dobrovolníků a bude studován vývoj mikrobioty v průběhu času.
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
-
Le Kremlin-Bicetre, Francie, 94270
- APHP Bicêtre Hospital
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Přijetí do traumatického centra nemocnice Bicêtre pro těžké trauma s:
buď izolované těžké traumatické poškození mozku (TBI): TBI s počáteční Glasgow Coma Scale (GCS) ≤ 8 a AISextrahead skóre ≤3; buď těžké trauma bez TBI (AISextrahead skóre > 3)
- Odhadovaná délka pobytu na JIP 48 hodin nebo více
Kritéria vyloučení:
- Antimikrobiální léčba během předchozích 3 měsíců
- Dlouhodobé užívání kortikosteroidů
- Aktivní rakovina
- Institucionalizovaný pacient
- Gastrointestinální perforace nebo urgentní gastrointestinální operace po traumatu
- Odvolání souhlasu
- Pacient v opatrovnictví
- Těhotné nebo kojící ženy
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Case-Control
- Časové perspektivy: Budoucí
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Pacienti s izolovaným těžkým traumatickým poraněním mozku (TBI)
TBI s počáteční Glasgow Coma Scale (GCS) ≤ 8 a AISextrahead skóre ≤3.
Orofaryngeální a rektální výtěry budou prováděny u každého pacienta během prvních 24 hodin po přijetí na JIP (den 0), poté 48 hodin (den 2) a 7 dnů (den 7) po přijetí na JIP a poté každý týden až do propuštění z JIP.
|
Provede vyškolený zdravotnický personál pomocí sterilních tamponů s transportním médiem ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Výtěry budou skladovány při -80 °C až do extrakce DNA.
Provede vyškolený zdravotnický personál pomocí sterilních tamponů s transportním médiem ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Výtěry budou skladovány při -80 °C až do extrakce DNA.
Bude posouzeno v den 90 +/- 7 dní.
|
|
Pacienti s těžkým traumatem bez TBI
Pacienti s těžkým traumatem bez TBI (AISextrahead skóre > 3).
Orofaryngeální a rektální výtěry budou prováděny u každého pacienta během prvních 24 hodin po přijetí na JIP (den 0), poté 48 hodin (den 2) a 7 dnů (den 7) po přijetí na JIP a poté každý týden až do propuštění z JIP.
|
Provede vyškolený zdravotnický personál pomocí sterilních tamponů s transportním médiem ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Výtěry budou skladovány při -80 °C až do extrakce DNA.
Provede vyškolený zdravotnický personál pomocí sterilních tamponů s transportním médiem ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Výtěry budou skladovány při -80 °C až do extrakce DNA.
Bude posouzeno v den 90 +/- 7 dní.
|
|
Zdravé ovládání
Osoby, které neměly studované stavy nebo jinak související stavy či symptomy, jak je uvedeno v požadavcích na způsobilost. Orofaryngeální a rektální výtěry budou odebrány pouze jednou, při zařazení, poté bude účast kontrolního jedince ve studii dokončena. |
Provede vyškolený zdravotnický personál pomocí sterilních tamponů s transportním médiem ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Výtěry budou skladovány při -80 °C až do extrakce DNA.
Provede vyškolený zdravotnický personál pomocí sterilních tamponů s transportním médiem ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Výtěry budou skladovány při -80 °C až do extrakce DNA.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Změna v alfa-diverzitě mikrobioty měřená Shannonovým indexem
Časové okno: Ode dne 0 do dne 90
|
Orofaryngeální a rektální výtěry provedené v den 0, den 2, den 7 po přijetí na JIP a poté každý týden až do propuštění z JIP nebo nejpozději do 90. dne se použijí pro extrakci DNA a amplifikaci a sekvenování bakteriální 16S rRNA za účelem identifikace bakteriální druhy kolonizující střevo.
|
Ode dne 0 do dne 90
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Alfa a beta-diverzita orofaryngeální a rektální mikrobioty v různých časech po traumatu.
Časové okno: Ode dne 0 do dne 90
|
Orofaryngeální a rektální výtěry provedené v den 0, den 2, den 7 po přijetí na JIP a poté každý týden až do propuštění z JIP nebo nejpozději do 90. dne se použijí pro extrakci DNA a amplifikaci a sekvenování bakteriální 16S rRNA za účelem identifikace bakteriální druhy.
|
Ode dne 0 do dne 90
|
|
Infekce získané na JIP
Časové okno: Ode dne 0 do dne 90
|
Míra infekcí získaných na JIP během pobytu na JIP
|
Ode dne 0 do dne 90
|
|
Počet pacientů, kteří získali kolonizaci nebo infekci multirezistentními bakteriemi během pobytu na JIP
Časové okno: Ode dne 0 do dne 90
|
Kolonizace multirezistentních bakterií nebo infekce získaná během pobytu na JIP
|
Ode dne 0 do dne 90
|
|
Smrt při propuštění z JIP a 90 dní po traumatu.
Časové okno: Ode dne 0 do dne 90
|
Míra úmrtí při propuštění z JIP a 90 dnů po traumatu
|
Ode dne 0 do dne 90
|
|
Skóre na stupnici hodnocení postižení (DRS-F) 90 dní po traumatu
Časové okno: Ode dne 0 do dne 90
|
Neurologický výsledek 90 dnů po traumatu hodnocený pomocí hodnotící škály postižení, francouzský překlad (DRS-F) citovaný od 0 (žádné postižení) do 29 (extrémní vegetativní stav)
|
Ode dne 0 do dne 90
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Samy Figueiredo, MD, PhD, Assistance Publique - Hopitaux de Paris
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Aktuální)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- APHP180537
- 2018-A02973-52 (Jiný identifikátor: IDRCB)
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Traumatické zranění mozku
-
The Hong Kong Polytechnic UniversityDokončenoMrtvice | Rozhraní Brain ComputerHongkong
-
Neurolutions, Inc.Zatím nenabírámeMrtvice | Hemiparéza po mrtvici | Rozhraní Brain Computer
-
Uludag UniversityDokončenoPorucha pozornosti s hyperaktivitou (ADHD) | Rozhraní Brain ComputerTurecko (Türkiye)
-
Wright State UniversityAktivní, ne náborBolest hlavy | Bolest hlavy vyvolaná chladem | Brain Freeze | Cephalgie vyvolaná chlademSpojené státy
-
Neurolutions, Inc.Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development...DokončenoMrtvice | Hemiparéza | Spasticita jako pokračování mrtvice | Rozhraní Brain ComputerSpojené státy
Klinické studie na Orofaryngeální výtěr
-
Queen's Medical CenterUniversity of Hawaii FoundationNáborChlamydie | Kapavka | Trichomonasová infekce | Sexuálně přenosná nemoc (STD)Spojené státy
-
University of California, San FranciscoCentral California Faculty Medical GroupDokončenoChlamydia trachomatis | Neisseria GonorrhoeaeSpojené státy
-
Assistance Publique Hopitaux De MarseilleZatím nenabírámeSolidní rakoviny | Solidní nádorová malignitaFrancie
-
H. Lee Moffitt Cancer Center and Research InstituteMerck Sharp & Dohme LLCDokončenoKoronavirová infekceSpojené státy