심한 외상성 뇌손상 후 구인두 및 직장 미생물총의 진화 (BBAX)
뇌에서 벌레까지: 중환자실에 입원한 중증 외상성 뇌손상 환자의 구강인두 및 직장 미생물군의 진화
인간 장내 미생물총의 변형은 비만, 염증성 장 질환 및 신경퇴행성 질환과 같은 다양한 병리학적 상태와 관련이 있습니다. 최근 뇌와 장 사이의 양방향 통신 축인 "Brain-Gut Axis"가 설명되었습니다. 최근 동물 연구에서 급성 뇌 손상은 장내 미생물의 급격한 변화와 관련이 있었습니다.
인간의 경우 외상성 뇌 손상(TBI)은 사망 및 장애의 주요 원인입니다. TBI 후 장 및 구인두 미생물의 패턴은 알려져 있지 않습니다. 이 연구의 주요 목적은 중증 TBI 환자의 장 및 구강인두 미생물군을 특성화하는 것입니다.
연구 개요
상세 설명
연구 프로토콜:
관찰 전향적 코호트 연구.
환자
심각한 외상으로 ICU에 입원한 환자가 포함됩니다. 심각한 외상을 입은 두 그룹의 환자를 연구할 것입니다.
- 단독 중증 외상성 뇌 손상(TBI) 환자: 초기 글래스고 혼수 척도(GCS) ≤ 8 및 AISextrahead 점수 ≤3인 TBI
- TBI가 없는 중증 외상 환자(AISextrahead 점수 > 3)
건강한 개인 그룹이 대조군으로 사용됩니다.
예상되는 총 등록은 각 그룹에 20명의 환자와 10명의 건강한 대조군입니다.
환자 데이터 수집
각 환자에 대해 다음 데이터가 수집됩니다.
- 인구통계학적 데이터: 나이, 성별, 신장, 체중, ICU 입원일, SAPS II(Simplified
- 외상 관련 데이터: 외상 관련 장기 손상의 수와 유형, 초기 GCS, 초기 관리 시 산동의 존재.
- 미생물군에 잠재적인 영향을 미치는 요인: 항균 요법, 영양 유형, 약물(양성자 펌프 억제제, 오피오이드, 진정제, 카테콜아민, 스테로이드), ICU 체류 중 수술 절차.
- 진화: ICU 체류 중 다제내성 박테리아 획득, ICU 획득 감염. 기계 환기 기간, 신장외 발진, ICU 재원 기간, ICU 퇴원 시 장애 등급 척도(DRS-F)로 평가한 신경학적 결과 및 외상 후 90일, ICU 퇴원 시 사망 및 90일.
샘플 수집
구인두 및 직장 면봉 채취는 ICU 입원 후 처음 24시간(0일), ICU 입원 후 48시간(2일) 및 7일(7일) 및 이후 ICU 퇴원까지 매주 수행됩니다. 직장 및 구강인두 면봉 채취는 운송 매체 ESwab®(Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA)이 포함된 멸균 면봉을 사용하여 훈련된 준의료 직원이 수행합니다. 면봉은 DNA 추출 전까지 -80°C에서 보관됩니다.
DNA 추출
DNA 추출은 직장 면봉용 QIAamp PowerFecal Pro DNA® 키트(Qiagen®, Courtaboeuf, 프랑스) 및 구인두 면봉용 Extracta DNA Prep® 키트(Quanta Biosciences®, Beverly, USA)를 사용하여 수행됩니다. DNA는 Quantit® dsDNA HighSensitivity Assay Kit(Fisher Scientific)로 정량화됩니다.
16S rRNA 증폭 및 시퀀싱
박테리아 16S rRNA 유전자 서열의 V3 및 V4 영역은 Illumina MiSeq® 시스템 프로토콜(Illumina®)에 따라 범용 프라이머(TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG 및 GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC)를 사용한 중합효소 연쇄 반응(PCR)에 의해 증폭됩니다. 앰플리콘은 정제된 후 MiSeq® 시퀀싱 시스템((Illumina®)을 사용하여 시퀀싱됩니다.
시퀀스 처리
파스퇴르 연구소에서 제공하는 R® 소프트웨어(패키지 DESeq2)를 기반으로 하는 SHAMAN 소프트웨어(Metagenomic ANalysis용 SHiny 애플리케이션)를 사용하여 서열 처리 및 작동 분류 단위(OTU) 클러스터링을 수행합니다. 분류학적 분류는 SILVA 데이터베이스 참조를 사용하여 수행됩니다.
통계 분석
SHAMAN 소프트웨어(Metagenomic ANalysis용 SHiny 애플리케이션)를 사용하여 통계 분석을 수행합니다. 세균 문(phyla), 과(科), 속(屬) 재분할을 분석하고 세균 속의 상대적 풍부도를 서로 다른 개체군 간에 비교합니다. 알파-다양성은 다양한 매개변수(Shannon 지수, Simpson의 다양성 지수)와 베타-다양성(주성분 분석)을 사용하여 분석됩니다.
다양한 환자 집단과 건강한 지원자를 비교하고 시간에 따른 미생물군의 진화를 연구할 것입니다.
연구 유형
등록 (실제)
연락처 및 위치
연구 장소
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Le Kremlin-Bicetre, 프랑스, 94270
- APHP Bicêtre Hospital
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 다음과 같은 심각한 외상으로 Bicêtre 병원 외상 센터에 입원:
분리된 중증 외상성 뇌 손상(TBI): 초기 글래스고 혼수 척도(GCS) ≤ 8 및 AISextrahead 점수 ≤3인 TBI; TBI가 없는 심각한 외상(AISextrahead 점수 > 3)
- 예상 ICU 체류 기간 48시간 이상
제외 기준:
- 지난 3개월 이내의 항균 요법
- 장기간 코르티코스테로이드 사용
- 활성 암
- 입원 환자
- 외상 후 위장 천공 또는 응급 위장 수술
- 동의 철회
- 후견인
- 임산부 또는 모유 수유 중인 여성
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
- 관찰 모델: 케이스 컨트롤
- 시간 관점: 유망한
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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격리된 중증 외상성 뇌손상(TBI) 환자
초기 Glasgow Coma Scale(GCS) ≤ 8 및 AISextrahead 점수 ≤3인 TBI.
구인두 및 직장 면봉 채취는 ICU 입원 후 처음 24시간(0일), ICU 입원 후 48시간(2일) 및 7일(7일) 및 이후 ICU 퇴원까지 매주 수행됩니다.
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운송 매체 ESwab®(Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA)이 포함된 멸균 면봉을 사용하여 훈련된 준의료진이 수행합니다.
면봉은 DNA 추출 전까지 -80°C에서 보관됩니다.
운송 매체 ESwab®(Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA)이 포함된 멸균 면봉을 사용하여 훈련된 준의료진이 수행합니다.
면봉은 DNA 추출 전까지 -80°C에서 보관됩니다.
90일 +/- 7일에 평가됩니다.
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TBI가 없는 중증 외상 환자
TBI가 없는 심각한 외상 환자(AISextrahead 점수 > 3).
구인두 및 직장 면봉 채취는 ICU 입원 후 처음 24시간(0일), ICU 입원 후 48시간(2일) 및 7일(7일) 및 이후 ICU 퇴원까지 매주 수행됩니다.
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운송 매체 ESwab®(Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA)이 포함된 멸균 면봉을 사용하여 훈련된 준의료진이 수행합니다.
면봉은 DNA 추출 전까지 -80°C에서 보관됩니다.
운송 매체 ESwab®(Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA)이 포함된 멸균 면봉을 사용하여 훈련된 준의료진이 수행합니다.
면봉은 DNA 추출 전까지 -80°C에서 보관됩니다.
90일 +/- 7일에 평가됩니다.
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건강한 통제
자격 요건에 명시된 바와 같이 연구 중인 조건 또는 기타 관련 조건 또는 증상이 없는 사람. 구인두 및 직장 면봉은 시험에 대조군 개인의 참여가 완료된 후 포함 시 한 번만 채취됩니다. |
운송 매체 ESwab®(Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA)이 포함된 멸균 면봉을 사용하여 훈련된 준의료진이 수행합니다.
면봉은 DNA 추출 전까지 -80°C에서 보관됩니다.
운송 매체 ESwab®(Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA)이 포함된 멸균 면봉을 사용하여 훈련된 준의료진이 수행합니다.
면봉은 DNA 추출 전까지 -80°C에서 보관됩니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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Shannon 지수로 측정한 미생물군 알파 다양성의 변화
기간: 0일부터 90일까지
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ICU 입원 후 0일, 2일, 7일에 그리고 그 후 ICU 퇴원까지 매주 또는 늦어도 90일까지 수행되는 구인두 및 직장 면봉 검사는 DNA 추출 및 박테리아 16S rRNA 증폭 및 시퀀싱에 사용됩니다. 내장을 식민지화하는 박테리아 종.
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0일부터 90일까지
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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외상 후 서로 다른 시기에 구인두 및 직장 미생물군의 알파 및 베타 다양성.
기간: 0일부터 90일까지
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ICU 입원 후 0일, 2일, 7일에 그리고 그 후 ICU 퇴원까지 매주 또는 늦어도 90일까지 수행되는 구인두 및 직장 면봉 검사는 DNA 추출 및 박테리아 16S rRNA 증폭 및 시퀀싱에 사용됩니다. 박테리아 종.
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0일부터 90일까지
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ICU 획득 감염
기간: 0일부터 90일까지
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중환자실 입원 중 중환자실 감염률
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0일부터 90일까지
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중환자실 입원 중 다제내성균 집락화 또는 감염 환자 수
기간: 0일부터 90일까지
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중환자실 입원 중 다제내성 세균 집락 형성 또는 감염
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0일부터 90일까지
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ICU 퇴원 및 외상 후 90일 사망.
기간: 0일부터 90일까지
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ICU 퇴원 및 외상 후 90일 사망률
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0일부터 90일까지
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장애 평가 척도(DRS-F) 외상 후 90일 점수
기간: 0일부터 90일까지
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0(장애 없음)에서 29(극단적인 식물인간 상태)까지 인용된 프랑스어 번역(DRS-F)인 장애 등급 척도(Disability Rating Scale)로 평가한 외상 후 90일의 신경학적 결과
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0일부터 90일까지
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공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Samy Figueiredo, MD, PhD, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (실제)
연구 완료 (추정된)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
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