Evolutie van orofaryngeale en rectale microbiota na ernstig traumatisch hersenletsel (BBAX)
Van de hersenen tot de bugs: evolutie van orofaryngeale en rectale microbiota van patiënten met ernstig traumatisch hersenletsel opgenomen op de ICU
Modificaties van de menselijke darmmicrobiota zijn in verband gebracht met verschillende pathologische aandoeningen zoals obesitas, inflammatoire darmziekten en neurodegeneratieve ziekten. Onlangs is de "Brain-Gut Axis" beschreven, een bidirectionele communicatie-as tussen hersenen en darmen. In recente dierstudies werd een acuut hersenletsel in verband gebracht met snelle veranderingen van de darmmicrobiota.
Bij mensen is traumatisch hersenletsel (TBI) een belangrijke doodsoorzaak en invaliditeit. De patronen van darm- en orofaryngeale microbiota na TBI zijn onbekend. Het primaire doel van deze studie is het karakteriseren van de darm- en orofaryngeale microbiota van patiënten met ernstig TBI.
Studie Overzicht
Toestand
Gedetailleerde beschrijving
Leerprotocool :
Observationele prospectieve cohortstudie.
Patiënten
Patiënten die vanwege een ernstig trauma op de IC zijn opgenomen, worden opgenomen. Er zullen twee groepen patiënten met ernstig trauma worden bestudeerd:
- Patiënten met geïsoleerd ernstig traumatisch hersenletsel (TBI): TBI met initiële Glasgow Coma Scale (GCS) ≤ 8 en AISextrahead-score ≤3
- Patiënten met ernstig trauma zonder TBI (AISextraheadscore > 3)
Een groep gezonde individuen zal dienen als controlepopulatie.
Verwachte totale inschrijving 20 patiënten in elke groep en 10 gezonde controles.
Patiëntgegevens verzamelen
Van elke patiënt worden de volgende gegevens verzameld:
- Demografische gegevens: leeftijd, geslacht, lengte, gewicht, opnamedatum op de IC, vereenvoudigde acute fysiologiescore II (SAPS II), letselernstscore (ISS), verkorte letselschaal (AIS) bij opname op de IC.
- Traumagerelateerde gegevens: aantal en type traumagerelateerde orgaanletsels, initiële GCS, aanwezigheid van mydriasis bij initiële behandeling.
- Factoren met mogelijke impact op de microbiota: antimicrobiële therapie, type voeding, medicijnen (protonpompremmers, opioïden, sedaties, catecholamines, steroïden), chirurgische ingreep tijdens verblijf op de IC.
- Evolutie: verwerving van multiresistente bacteriën tijdens IC-verblijf, ICU-infecties. Duur van de mechanische beademing, extrarenale epureatie, verblijfsduur op de IC, neurologische uitkomst beoordeeld door invaliditeitsbeoordelingsschaal (DRS-F) bij ontslag uit de IC en 90 dagen na trauma, overlijden bij ontslag uit de IC en 90 dagen.
Voorbeeld verzameling
Orofaryngeale en rectale uitstrijkjes worden bij elke patiënt uitgevoerd binnen de eerste 24 uur na IC-opname (dag 0), vervolgens 48 uur (dag 2) en 7 dagen (dag 7) na IC-opname en daarna wekelijks tot IC-ontslag. Rectale en orofaryngeale uitstrijkjes zullen worden uitgevoerd door getraind paramedisch personeel met behulp van steriele uitstrijkjes met transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, VS). Swabs worden bewaard bij -80°C tot DNA-extractie.
DNA-extractie
DNA-extractie zal worden uitgevoerd met behulp van de QIAamp PowerFecal Pro DNA®-kit (Qiagen®, Courtaboeuf, Frankrijk) voor rectale uitstrijkjes en de Extracta DNA Prep®-kit (Quanta Biosciences®, Beverly, VS) voor orofaryngeale uitstrijkjes. DNA wordt gekwantificeerd door Quantit® dsDNA HighSensitivity Assay Kit (Fisher Scientific).
16S rRNA-amplificatie en sequentiebepaling
V3- en V4-regio's van bacteriële 16S rRNA-gensequenties zullen worden geamplificeerd door polymerasekettingreactie (PCR) met universele primers (TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG en GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC), volgens het Illumina MiSeq®-systeemprotocol (Illumina®). Amplicons worden gezuiverd en vervolgens gesequenced met behulp van het MiSeq®-sequencingsysteem ((Illumina®).
Sequenties verwerking
Sequentiesverwerking en operationele taxonomische eenheid (OTU) clustering zullen worden uitgevoerd met behulp van SHAMAN-software (SHiny Application for Metagenomic ANAlysis) gebaseerd op R®-software (pakket DESeq2), geleverd door Pasteur Institute. Taxonomische classificatie zal worden uitgevoerd met behulp van de SILVA-databasereferentie.
statistische analyse
Statistische analyse zal worden uitgevoerd met behulp van SHAMAN-software (SHiny Application for Metagenomic ANAlysis). Bacteriële phyla, families en geslachtsverdeling zullen worden geanalyseerd, en de relatieve dichtheid van bacteriële geslachten tussen de verschillende populaties zal worden vergeleken. Alfa-diversiteit zal worden geanalyseerd aan de hand van verschillende parameters (Shannon-index, Simpson's diversiteitsindex), evenals bèta-diversiteit (principal component analysis).
De verschillende populaties van patiënten en gezonde vrijwilligers zullen vergeleken worden, en de evolutie van de microbiota doorheen de tijd zal bestudeerd worden.
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
-
Le Kremlin-Bicetre, Frankrijk, 94270
- APHP Bicêtre Hospital
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Opname in het traumacentrum van het ziekenhuis van Bicêtre voor ernstig trauma met:
ofwel geïsoleerd ernstig traumatisch hersenletsel (TBI): TBI met initiële Glasgow Coma Scale (GCS) ≤ 8 en AISextrahead-score ≤3; ofwel ernstig trauma zonder TBI (AISextraheadscore > 3)
- Geschatte IC-verblijfsduur 48 uur of meer
Uitsluitingscriteria:
- Antimicrobiële therapie in de afgelopen 3 maanden
- Langdurig gebruik van corticosteroïden
- Actieve kanker
- Geïnstitutionaliseerde patiënt
- Gastro-intestinale perforatie of gastro-intestinale spoedoperatie na een trauma
- Intrekking van toestemming
- Patiënt onder curatele
- Zwangere vrouwen of vrouwen die borstvoeding geven
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Case-control
- Tijdsperspectieven: Prospectief
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Patiënten met geïsoleerd ernstig traumatisch hersenletsel (TBI)
TBI met initiële Glasgow Coma Scale (GCS) ≤ 8 en AISextrahead-score ≤3.
Orofaryngeale en rectale uitstrijkjes worden bij elke patiënt uitgevoerd binnen de eerste 24 uur na IC-opname (dag 0), vervolgens 48 uur (dag 2) en 7 dagen (dag 7) na IC-opname en daarna wekelijks tot IC-ontslag.
|
Zal worden uitgevoerd door getraind paramedisch personeel met behulp van steriele wattenstaafjes met transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, VS).
Swabs worden bewaard bij -80°C tot DNA-extractie.
Zal worden uitgevoerd door getraind paramedisch personeel met behulp van steriele wattenstaafjes met transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, VS).
Swabs worden bewaard bij -80°C tot DNA-extractie.
Wordt beoordeeld op dag 90 +/- 7 dagen.
|
|
Patiënten met ernstig trauma zonder TBI
Patiënten met ernstig trauma zonder TBI (AISextraheadscore > 3).
Orofaryngeale en rectale uitstrijkjes worden bij elke patiënt uitgevoerd binnen de eerste 24 uur na IC-opname (dag 0), vervolgens 48 uur (dag 2) en 7 dagen (dag 7) na IC-opname en daarna wekelijks tot IC-ontslag.
|
Zal worden uitgevoerd door getraind paramedisch personeel met behulp van steriele wattenstaafjes met transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, VS).
Swabs worden bewaard bij -80°C tot DNA-extractie.
Zal worden uitgevoerd door getraind paramedisch personeel met behulp van steriele wattenstaafjes met transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, VS).
Swabs worden bewaard bij -80°C tot DNA-extractie.
Wordt beoordeeld op dag 90 +/- 7 dagen.
|
|
Gezonde controles
Personen die niet de aandoeningen hebben gehad die worden bestudeerd of anderszins gerelateerde aandoeningen of symptomen, zoals gespecificeerd in de geschiktheidsvereisten. Orofaryngeale en rectale uitstrijkjes worden slechts eenmaal genomen, bij inclusie, waarna de deelname van de controlepersoon aan het onderzoek voltooid is. |
Zal worden uitgevoerd door getraind paramedisch personeel met behulp van steriele wattenstaafjes met transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, VS).
Swabs worden bewaard bij -80°C tot DNA-extractie.
Zal worden uitgevoerd door getraind paramedisch personeel met behulp van steriele wattenstaafjes met transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, VS).
Swabs worden bewaard bij -80°C tot DNA-extractie.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Verandering in de alfa-diversiteit van de microbiota zoals gemeten met de Shannon-index
Tijdsspanne: Van dag 0 tot dag 90
|
De orofaryngeale en rectale uitstrijkjes, uitgevoerd op dag 0, dag 2, dag 7 na IC-opname en daarna wekelijks tot IC-ontslag of uiterlijk op dag 90, zullen worden gebruikt voor DNA-extractie en de bacteriële 16S rRNA-amplificatie en -sequencing om de bacteriesoort die de darm koloniseert.
|
Van dag 0 tot dag 90
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Alfa- en bètadiversiteiten van orofaryngeale en rectale microbiota op verschillende tijdstippen na trauma.
Tijdsspanne: Van dag 0 tot dag 90
|
De orofaryngeale en rectale uitstrijkjes, uitgevoerd op dag 0, dag 2, dag 7 na IC-opname en daarna wekelijks tot IC-ontslag of uiterlijk op dag 90, zullen worden gebruikt voor DNA-extractie en de bacteriële 16S rRNA-amplificatie en -sequencing om de bacteriesoort.
|
Van dag 0 tot dag 90
|
|
ICU-verworven infecties
Tijdsspanne: Van dag 0 tot dag 90
|
De ICU-infectiecijfers tijdens het ICU-verblijf
|
Van dag 0 tot dag 90
|
|
Aantal patiënten dat kolonisatie of infectie oploopt met multiresistente bacteriën tijdens verblijf op de IC
Tijdsspanne: Van dag 0 tot dag 90
|
Kolonisatie of infectie van multiresistente bacteriën tijdens het verblijf op de IC
|
Van dag 0 tot dag 90
|
|
Overlijden bij ontslag uit de IC en 90 dagen na trauma.
Tijdsspanne: Van dag 0 tot dag 90
|
Het aantal sterfgevallen bij ontslag op de IC en 90 dagen na het trauma
|
Van dag 0 tot dag 90
|
|
Disability Rating Scale (DRS-F) score 90 dagen na trauma
Tijdsspanne: Van dag 0 tot dag 90
|
Neurologisch resultaat op 90 dagen na trauma geëvalueerd door de Disability Rating Scale, de Franse vertaling (DRS-F) geciteerd van 0 (geen handicap) tot 29 (extreem vegetatieve toestand)
|
Van dag 0 tot dag 90
|
Medewerkers en onderzoekers
Medewerkers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Samy Figueiredo, MD, PhD, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing (Geschat)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- APHP180537
- 2018-A02973-52 (Andere identificatie: IDRCB)
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .