Evolusjon av orofaryngeal og rektal mikrobiota etter alvorlig traumatisk hjerneskade (BBAX)
Fra hjernen til feilene: Evolusjon av orofaryngeal og rektal mikrobiota hos pasienter med alvorlig traumatisk hjerneskade innlagt på intensivavdelingen
Modifikasjoner av menneskets tarmmikrobiota har vært assosiert med forskjellige patologiske tilstander som fedme, inflammatoriske tarmsykdommer og nevrodegenerative sykdommer. Nylig har "Brain-Gut Axis", en toveis kommunikasjonsakse mellom hjerne og tarm, blitt beskrevet. I nyere dyrestudier ble en akutt hjerneskade assosiert med raske modifikasjoner av tarmmikrobiotaen.
Hos mennesker er traumatisk hjerneskade (TBI) en ledende årsak til død og funksjonshemming. Mønstrene for tarm- og orofaryngeal mikrobiota etter TBI er ukjent. Hovedformålet med denne studien er å karakterisere tarm- og orofaryngeal mikrobiota hos pasienter med alvorlig TBI.
Studieoversikt
Status
Forhold
Detaljert beskrivelse
Studieprotokoll:
Observasjonell prospektiv kohortstudie.
Pasienter
Pasienter innlagt på intensivavdelingen for alvorlige traumer vil bli inkludert. To grupper av pasienter med alvorlige traumer vil bli studert:
- Pasienter med isolert alvorlig traumatisk hjerneskade (TBI): TBI med initial Glasgow Coma Scale (GCS) ≤ 8 og AISextrahead-score ≤3
- Pasienter med alvorlig traume uten TBI (AISextrahead score > 3)
En gruppe friske individer vil fungere som en kontrollpopulasjon.
Forventet total påmelding 20 pasienter i hver gruppe, og 10 friske kontroller.
Innsamling av pasientdata
For hver pasient vil følgende data bli samlet inn:
- Demografiske data: alder, kjønn, høyde, vekt, innleggelsesdato for intensivavdelingen, forenklet akuttfysiologisk skåre II (SAPS II), alvorlighetsgradsskår for skade (ISS), forkortet skadeskala (AIS) ved innleggelse på intensivavdelingen.
- Traumerelaterte data: antall og type traumerelaterte organskader, initial GCS, tilstedeværelse av mydriasis ved førstegangsbehandling.
- Faktorer med potensiell innvirkning på mikrobiota: antimikrobiell behandling, ernæringstype, medisiner (protonpumpehemmere, opioider, sedasjoner, katekolaminer, steroider), kirurgisk prosedyre under opphold på intensivavdelingen.
- Evolusjon: multiresistente bakterieanskaffelse under intensivopphold, oppkjøpte infeksjoner på intensivavdelingen. Mekanisk ventilasjonsvarighet, ekstrarenal epuration, ICU-oppholdslengde, nevrologisk utfall evaluert ved funksjonshemmingsskala (DRS-F) ved ICU-utskrivning og 90 dager etter traume, død ved ICU-utskrivning og 90 dager.
Prøvesamling
Orofaryngeale og rektale vattpinner vil bli utført for hver pasient i løpet av de første 24 timene etter ICU-innleggelse (dag 0), deretter 48 timer (dag 2) og 7 dager (dag 7) etter ICU-innleggelse og ukentlig deretter frem til ICU-utskrivning. Rektale og orofaryngeale vattpinner vil bli utført av trent paramedisinsk personell som bruker sterile vattpinner med transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA). Vatter vil bli lagret ved -80 °C frem til DNA-ekstraksjon.
DNA-ekstraksjon
DNA-ekstraksjon vil bli utført ved bruk av QIAamp PowerFecal Pro DNA®-sett (Qiagen®, Courtaboeuf, Frankrike) for rektale vattpinner og Extracta DNA Prep®-sett (Quanta Biosciences®, Beverly, USA) for orofaryngeale vattpinner. DNA vil bli kvantifisert av Quantit® dsDNA HighSensitivity Assay Kit (Fisher Scientific).
16S rRNA amplifikasjon og sekvensering
V3- og V4-regioner av bakterielle 16S rRNA-gensekvenser vil bli amplifisert ved polymerasekjedereaksjon (PCR) med universelle primere (TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG og GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTI-systemet, etter Illum-protokollen). Amplikoner vil bli renset og deretter sekvensert ved hjelp av MiSeq®-sekvenseringssystem ((Illumina®).
Sekvensbehandling
Sekvensbehandling og operasjonell taksonomisk enhet (OTU) clustering vil bli utført ved hjelp av SHAMAN-programvare (SHiny Application for Metagenomic ANAlysis) basert på R®-programvare (pakke DESeq2), levert av Pasteur Institute. Taksonomisk klassifisering vil bli utført ved bruk av SILVA databasereferanse.
Statistisk analyse
Statistisk analyse vil bli utført ved bruk av SHAMAN-programvare (SHiny Application for Metagenomic ANAlysis). Bakteriefyla, familier og slektsfordeling vil bli analysert, og relativ overflod av bakterieslekter vil bli sammenlignet mellom de forskjellige populasjonene. Alfa-mangfold vil bli analysert ved hjelp av ulike parametere (Shannon-indeksen, Simpsons mangfoldsindeks), samt beta-mangfold (hovedkomponentanalyse).
De forskjellige populasjonene av pasienter og friske frivillige vil bli sammenlignet, og utviklingen av mikrobiota over tid vil bli studert.
Studietype
Registrering (Faktiske)
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
-
Le Kremlin-Bicetre, Frankrike, 94270
- APHP Bicêtre Hospital
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
Tar imot friske frivillige
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Innleggelse til Bicêtre Hospital Traumesenter for alvorlige traumer med:
enten isolert alvorlig traumatisk hjerneskade (TBI): TBI med initial Glasgow Coma Scale (GCS) ≤ 8 og AISextrahead-score ≤3; enten alvorlige traumer uten TBI (AISextrahead score > 3)
- Estimert liggetid på intensivavdelingen 48 timer eller mer
Ekskluderingskriterier:
- Antimikrobiell behandling i løpet av de siste 3 månedene
- Langsiktig bruk av kortikosteroider
- Aktiv kreft
- Institusjonalisert pasient
- Gastrointestinal perforering eller akutt gastrointestinal kirurgi etter traumer
- Tilbaketrekking av samtykke
- Pasient under vergemål
- Gravide eller ammende kvinner
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Observasjonsmodeller: Case-Control
- Tidsperspektiver: Potensielle
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Pasienter med isolert alvorlig traumatisk hjerneskade (TBI)
TBI med initial Glasgow Coma Scale (GCS) ≤ 8 og AISextrahead-score ≤3.
Orofaryngeale og rektale vattpinner vil bli utført for hver pasient i løpet av de første 24 timene etter ICU-innleggelse (dag 0), deretter 48 timer (dag 2) og 7 dager (dag 7) etter ICU-innleggelse og ukentlig deretter frem til ICU-utskrivning.
|
Vil bli utført av opplært paramedisinsk personale ved bruk av sterile vattpinner med transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Vatter vil bli lagret ved -80 °C frem til DNA-ekstraksjon.
Vil bli utført av opplært paramedisinsk personale ved bruk av sterile vattpinner med transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Vatter vil bli lagret ved -80 °C frem til DNA-ekstraksjon.
Vil bli vurdert på dag 90 +/- 7 dager.
|
|
Pasienter med alvorlige traumer uten TBI
Pasienter med alvorlig traume uten TBI (AISextrahead score > 3).
Orofaryngeale og rektale vattpinner vil bli utført for hver pasient i løpet av de første 24 timene etter ICU-innleggelse (dag 0), deretter 48 timer (dag 2) og 7 dager (dag 7) etter ICU-innleggelse og ukentlig deretter frem til ICU-utskrivning.
|
Vil bli utført av opplært paramedisinsk personale ved bruk av sterile vattpinner med transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Vatter vil bli lagret ved -80 °C frem til DNA-ekstraksjon.
Vil bli utført av opplært paramedisinsk personale ved bruk av sterile vattpinner med transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Vatter vil bli lagret ved -80 °C frem til DNA-ekstraksjon.
Vil bli vurdert på dag 90 +/- 7 dager.
|
|
Sunne kontroller
Personer som ikke har hatt tilstandene som studeres eller på annen måte relaterte tilstander eller symptomer, som spesifisert i kvalifikasjonskravene. Orofaryngeale og rektale vattpinner tas kun én gang, ved inkludering, etter det vil kontrollpersonens deltakelse i forsøket være fullført. |
Vil bli utført av opplært paramedisinsk personale ved bruk av sterile vattpinner med transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Vatter vil bli lagret ved -80 °C frem til DNA-ekstraksjon.
Vil bli utført av opplært paramedisinsk personale ved bruk av sterile vattpinner med transportmedium ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, USA).
Vatter vil bli lagret ved -80 °C frem til DNA-ekstraksjon.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Endring i mikrobiota alfa-diversitet målt ved Shannon-indeksen
Tidsramme: Fra dag 0 til dag 90
|
De orofaryngeale og rektale vattpinneprøvene, utført på dag 0, dag 2, dag 7 etter ICU-innleggelse og ukentlig deretter frem til ICU-utskrivning eller senest dag 90, vil bli brukt til DNA-ekstraksjon og bakteriell 16S rRNA-amplifisering og sekvensering for å identifisere bakteriearten som koloniserer tarmen.
|
Fra dag 0 til dag 90
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Alfa- og beta-diversiteter av orofaryngeal og rektal mikrobiota på forskjellige tidspunkter etter traumer.
Tidsramme: Fra dag 0 til dag 90
|
De orofaryngeale og rektale vattpinneprøvene, utført på dag 0, dag 2, dag 7 etter ICU-innleggelse og ukentlig deretter frem til ICU-utskrivning eller senest dag 90, vil bli brukt til DNA-ekstraksjon og bakteriell 16S rRNA-amplifisering og sekvensering for å identifisere bakteriearten.
|
Fra dag 0 til dag 90
|
|
ICU-ervervede infeksjoner
Tidsramme: Fra dag 0 til dag 90
|
Infeksjonsratene på intensivavdelingen under intensivoppholdet
|
Fra dag 0 til dag 90
|
|
Antall pasienter som får kolonisering eller infeksjon med multiresistente bakterier under intensivopphold
Tidsramme: Fra dag 0 til dag 90
|
Multiresistente bakterier kolonisering eller infeksjon ervervet under intensivavdelingen
|
Fra dag 0 til dag 90
|
|
Død ved utskrivning på intensivavdelingen og 90 dager etter traumer.
Tidsramme: Fra dag 0 til dag 90
|
Dødsraten ved utskrivning på intensivavdelingen og 90 dager etter traumer
|
Fra dag 0 til dag 90
|
|
Disability Rating Scale (DRS-F) score ved 90 dager etter traume
Tidsramme: Fra dag 0 til dag 90
|
Nevrologisk utfall 90 dager etter traume evaluert av Disability Rating Scale, den franske oversettelsen (DRS-F) sitert fra 0 (ingen funksjonshemming) til 29 (ekstrem vegetativ tilstand)
|
Fra dag 0 til dag 90
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Samarbeidspartnere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Samy Figueiredo, MD, PhD, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Faktiske)
Studiet fullført (Antatt)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- APHP180537
- 2018-A02973-52 (Annen identifikator: IDRCB)
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .