Evolución de la microbiota orofaríngea y rectal tras un traumatismo craneoencefálico grave (BBAX)
Del cerebro a los bichos: evolución de la microbiota orofaríngea y rectal de pacientes con traumatismo craneoencefálico grave ingresados en UCI
Las modificaciones de la microbiota intestinal humana se han asociado con diferentes condiciones patológicas como la obesidad, las enfermedades inflamatorias intestinales y las enfermedades neurodegenerativas. Recientemente se ha descrito el "Eje Cerebro-Intestino", un eje de comunicación bidireccional entre el cerebro y el intestino. En estudios recientes con animales, una lesión cerebral aguda se asoció con modificaciones rápidas de la microbiota intestinal.
En los seres humanos, la lesión cerebral traumática (TBI, por sus siglas en inglés) es una de las principales causas de muerte y discapacidad. Se desconocen los patrones de la microbiota intestinal y orofaríngea después de una TBI. El objetivo principal de este estudio es caracterizar la microbiota intestinal y orofaríngea de pacientes con TCE grave.
Descripción general del estudio
Estado
Condiciones
Descripción detallada
Protocolo de estudio :
Estudio observacional prospectivo de cohortes.
Pacientes
Se incluirán pacientes ingresados en la UCI por trauma severo. Se estudiarán dos grupos de pacientes con trauma severo:
- Pacientes con traumatismo craneoencefálico (TBI) grave aislado: TBI con escala de coma de Glasgow (GCS) inicial ≤ 8 y puntuación AISextrahead ≤3
- Pacientes con traumatismo grave sin TCE (puntuación AISextrahead > 3)
Un grupo de individuos sanos servirá como población de control.
Inscripción total esperada 20 pacientes en cada grupo y 10 controles sanos.
Recopilación de datos del paciente
Para cada paciente, se recopilarán los siguientes datos:
- Datos demográficos: edad, sexo, altura, peso, fecha de ingreso en la UCI, puntaje simplificado de fisiología aguda II (SAPS II), puntaje de gravedad de la lesión (ISS), escala abreviada de lesiones (AIS) al ingreso en la UCI.
- Datos relacionados con el trauma: número y tipo de lesiones orgánicas relacionadas con el trauma, GCS inicial, presencia de midriasis en el manejo inicial.
- Factores con potencial impacto en la microbiota: terapia antimicrobiana, tipo de nutrición, medicamentos (inhibidores de la bomba de protones, opioides, sedantes, catecolaminas, esteroides), procedimiento quirúrgico durante la estancia en la UCI.
- Evolución: adquisición de bacterias multirresistentes durante la estancia en UCI, infecciones adquiridas en UCI. Duración de la ventilación mecánica, epuración extrarrenal, duración de la estancia en la UCI, resultado neurológico evaluado por escala de calificación de discapacidad (DRS-F) al alta de la UCI y a los 90 días posteriores al trauma, muerte al alta de la UCI y 90 días.
Coleccion de muestra
Se realizarán frotis orofaríngeos y rectales para cada paciente dentro de las primeras 24 horas posteriores al ingreso en la UCI (día 0), luego 48 horas (día 2) y 7 días (día 7) después del ingreso en la UCI y semanalmente a partir de entonces hasta el alta de la UCI. Los hisopados rectales y orofaríngeos serán realizados por personal paramédico capacitado utilizando hisopos estériles con medio de transporte ESwab® (Becton, Dickinson and Company, Nueva Jersey, EE. UU.). Los hisopos se almacenarán a -80 °C hasta la extracción de ADN.
Extracción de ADN
La extracción de ADN se realizará con el kit QIAamp PowerFecal Pro DNA® (Qiagen®, Courtaboeuf, Francia) para hisopos rectales y el kit Extracta DNA Prep® (Quanta Biosciences®, Beverly, EE. UU.) para hisopos orofaríngeos. El ADN se cuantificará con el kit de ensayo de alta sensibilidad Quantit® dsDNA (Fisher Scientific).
Amplificación y secuenciación de 16S rRNA
Las regiones V3 y V4 de las secuencias del gen 16S rRNA bacteriano se amplificarán mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) con cebadores universales (TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG y GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC), siguiendo el protocolo del sistema Illumina MiSeq® (Illumina®). Los amplicones se purificarán y luego se secuenciarán utilizando el sistema de secuenciación MiSeq® ((Illumina®).
Procesamiento de secuencias
El procesamiento de secuencias y el agrupamiento de unidades taxonómicas operativas (OTU) se realizarán utilizando el software SHAMAN (SHiny Application for Metagenomic ANalysis) basado en el software R® (paquete DESeq2), proporcionado por el Instituto Pasteur. La clasificación taxonómica se realizará utilizando la base de datos de referencia SILVA.
análisis estadístico
El análisis estadístico se realizará utilizando el software SHAMAN (Aplicación SHiny para análisis metagenómico). Se analizará la distribución de filos, familias y géneros bacterianos, y se comparará la abundancia relativa de géneros bacterianos entre las diferentes poblaciones. Se analizará la diversidad alfa utilizando diferentes parámetros (índice de Shannon, índice de diversidad de Simpson), así como la diversidad beta (análisis de componentes principales).
Se compararán las diferentes poblaciones de pacientes y voluntarios sanos, y se estudiará la evolución de la microbiota a lo largo del tiempo.
Tipo de estudio
Inscripción (Actual)
Contactos y Ubicaciones
Ubicaciones de estudio
-
-
-
Le Kremlin-Bicetre, Francia, 94270
- APHP Bicêtre Hospital
-
-
Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
Acepta Voluntarios Saludables
Método de muestreo
Población de estudio
Descripción
Criterios de inclusión:
- Ingreso en el Centro de Trauma del Hospital Bicêtre por trauma grave con:
lesión cerebral traumática grave aislada (TBI): TBI con escala de coma de Glasgow (GCS) inicial ≤ 8 y puntuación AISextrahead ≤3; ya sea trauma severo sin TBI (puntuación AISextrahead> 3)
- Duración estimada de la estancia en la UCI 48 horas o más
Criterio de exclusión:
- Tratamiento antimicrobiano en los 3 meses anteriores
- Uso prolongado de corticoides
- Cáncer activo
- Paciente institucionalizado
- Perforación gastrointestinal o cirugía gastrointestinal de emergencia después de un traumatismo
- Retiro del consentimiento
- Paciente bajo tutela
- Mujeres embarazadas o lactantes
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
- Modelos observacionales: Control de caso
- Perspectivas temporales: Futuro
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
Intervención / Tratamiento |
|---|---|
|
Pacientes con traumatismo craneoencefálico (TCE) grave aislado
TBI con escala de coma de Glasgow (GCS) inicial ≤ 8 y puntuación AISextrahead ≤3.
Se realizarán frotis orofaríngeos y rectales para cada paciente dentro de las primeras 24 horas posteriores al ingreso en la UCI (día 0), luego 48 horas (día 2) y 7 días (día 7) después del ingreso en la UCI y semanalmente a partir de entonces hasta el alta de la UCI.
|
Será realizado por personal paramédico capacitado utilizando hisopos estériles con medio de transporte ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, EE. UU.).
Los hisopos se almacenarán a -80 °C hasta la extracción de ADN.
Será realizado por personal paramédico capacitado utilizando hisopos estériles con medio de transporte ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, EE. UU.).
Los hisopos se almacenarán a -80 °C hasta la extracción de ADN.
Se evaluará al día 90 +/- 7 días.
|
|
Pacientes con trauma severo sin TCE
Pacientes con traumatismo grave sin TCE (puntuación AISextrahead > 3).
Se realizarán frotis orofaríngeos y rectales para cada paciente dentro de las primeras 24 horas posteriores al ingreso en la UCI (día 0), luego 48 horas (día 2) y 7 días (día 7) después del ingreso en la UCI y semanalmente a partir de entonces hasta el alta de la UCI.
|
Será realizado por personal paramédico capacitado utilizando hisopos estériles con medio de transporte ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, EE. UU.).
Los hisopos se almacenarán a -80 °C hasta la extracción de ADN.
Será realizado por personal paramédico capacitado utilizando hisopos estériles con medio de transporte ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, EE. UU.).
Los hisopos se almacenarán a -80 °C hasta la extracción de ADN.
Se evaluará al día 90 +/- 7 días.
|
|
Controles saludables
Personas que no han tenido las condiciones que se estudian o condiciones o síntomas relacionados, según se especifica en los requisitos de elegibilidad. Los frotis orofaríngeos y rectales se tomarán una sola vez, en el momento de la inclusión, después de lo cual se completará la participación del individuo control en el ensayo. |
Será realizado por personal paramédico capacitado utilizando hisopos estériles con medio de transporte ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, EE. UU.).
Los hisopos se almacenarán a -80 °C hasta la extracción de ADN.
Será realizado por personal paramédico capacitado utilizando hisopos estériles con medio de transporte ESwab® (Becton, Dickinson and Company, New Jersey, EE. UU.).
Los hisopos se almacenarán a -80 °C hasta la extracción de ADN.
|
¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
|---|---|---|
|
Cambio en la diversidad alfa de la microbiota medida por el índice de Shannon
Periodo de tiempo: Del día 0 al día 90
|
Los frotis orofaríngeos y rectales, realizados el día 0, el día 2, el día 7 después del ingreso en la UCI y semanalmente a partir de entonces hasta el alta de la UCI o a más tardar el día 90, se utilizarán para la extracción de ADN y la amplificación y secuenciación del ARNr 16S bacteriano para identificar las especies bacterianas que colonizan el intestino.
|
Del día 0 al día 90
|
Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
|---|---|---|
|
Diversidades alfa y beta de la microbiota orofaríngea y rectal en diferentes momentos postraumáticos.
Periodo de tiempo: Del día 0 al día 90
|
Los frotis orofaríngeos y rectales, realizados el día 0, el día 2, el día 7 después del ingreso en la UCI y semanalmente a partir de entonces hasta el alta de la UCI o a más tardar el día 90, se utilizarán para la extracción de ADN y la amplificación y secuenciación del ARNr 16S bacteriano para identificar la especie bacteriana.
|
Del día 0 al día 90
|
|
Infecciones adquiridas en la UCI
Periodo de tiempo: Del día 0 al día 90
|
Las tasas de infecciones adquiridas en la UCI durante la estancia en la UCI
|
Del día 0 al día 90
|
|
Número de pacientes que adquieren colonización o infección con bacterias multirresistentes durante la estancia en la UCI
Periodo de tiempo: Del día 0 al día 90
|
Colonización por bacterias multirresistentes o infección adquirida durante la estancia en la UCI
|
Del día 0 al día 90
|
|
Muerte al alta de la UCI y 90 días postraumatismo.
Periodo de tiempo: Del día 0 al día 90
|
Las tasas de muertes al alta de la UCI y 90 días después del trauma
|
Del día 0 al día 90
|
|
Puntuación de la escala de calificación de discapacidad (DRS-F) a los 90 días después del trauma
Periodo de tiempo: Del día 0 al día 90
|
Resultado neurológico a los 90 días después del trauma evaluado por la Disability Rating Scale, la traducción al francés (DRS-F) citado de 0 (sin discapacidad) a 29 (estado vegetativo extremo)
|
Del día 0 al día 90
|
Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Colaboradores
Investigadores
- Investigador principal: Samy Figueiredo, MD, PhD, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
Finalización primaria (Actual)
Finalización del estudio (Estimado)
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
Publicado por primera vez (Actual)
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
Última verificación
Más información
Términos relacionados con este estudio
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- APHP180537
- 2018-A02973-52 (Otro identificador: IDRCB)
Plan de datos de participantes individuales (IPD)
¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .